MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium kansasii ATCC 12478 plasmid pMK12478

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022654	GCAG	2	8	239	246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022654	GCCG	2	8	492	499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022654	CCGG	2	8	902	909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022654	CCGG	2	8	1625	1632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022654	CGGT	2	8	1843	1850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022654	AGCC	3	12	1984	1995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022654	GCTC	2	8	2094	2101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022654	CGCC	2	8	2145	2152	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_022654	GAGC	2	8	2280	2287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022654	TCGG	2	8	2350	2357	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022654	GGCA	2	8	2364	2371	25 %	0 %	50 %	25 %	556559713
12	NC_022654	GTCG	2	8	2517	2524	0 %	25 %	50 %	25 %	556559713
13	NC_022654	CCGG	2	8	2740	2747	0 %	0 %	50 %	50 %	556559713
14	NC_022654	TTCC	2	8	3215	3222	0 %	50 %	0 %	50 %	556559713
15	NC_022654	GCCG	2	8	3292	3299	0 %	0 %	50 %	50 %	556559713
16	NC_022654	CCCG	2	8	3546	3553	0 %	0 %	25 %	75 %	556559714
17	NC_022654	CCGA	2	8	3782	3789	25 %	0 %	25 %	50 %	556559714
18	NC_022654	AGGA	2	8	4450	4457	50 %	0 %	50 %	0 %	556559715
19	NC_022654	GGCT	2	8	4786	4793	0 %	25 %	50 %	25 %	556559715
20	NC_022654	AGCA	2	8	5001	5008	50 %	0 %	25 %	25 %	556559715
21	NC_022654	CCAA	3	12	5450	5461	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022654	CCAA	2	8	5468	5475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022654	GTGC	2	8	5959	5966	0 %	25 %	50 %	25 %	556559717
24	NC_022654	TGGC	2	8	6323	6330	0 %	25 %	50 %	25 %	556559717
25	NC_022654	CGGC	2	8	7321	7328	0 %	0 %	50 %	50 %	556559718
26	NC_022654	GGTC	2	8	8193	8200	0 %	25 %	50 %	25 %	556559719
27	NC_022654	CGAC	2	8	8298	8305	25 %	0 %	25 %	50 %	556559720
28	NC_022654	GGGC	2	8	9507	9514	0 %	0 %	75 %	25 %	556559721
29	NC_022654	CCGC	2	8	10227	10234	0 %	0 %	25 %	75 %	556559723
30	NC_022654	CAGG	2	8	10851	10858	25 %	0 %	50 %	25 %	556559723
31	NC_022654	CAGG	2	8	10893	10900	25 %	0 %	50 %	25 %	556559723
32	NC_022654	ACGG	2	8	10999	11006	25 %	0 %	50 %	25 %	556559723
33	NC_022654	CGTG	2	8	12042	12049	0 %	25 %	50 %	25 %	556559725
34	NC_022654	CACG	2	8	12178	12185	25 %	0 %	25 %	50 %	556559725
35	NC_022654	GTCA	2	8	13598	13605	25 %	25 %	25 %	25 %	556559726
36	NC_022654	TTGA	2	8	13665	13672	25 %	50 %	25 %	0 %	556559727
37	NC_022654	CTCG	2	8	13704	13711	0 %	25 %	25 %	50 %	556559727
38	NC_022654	TGCA	2	8	14130	14137	25 %	25 %	25 %	25 %	556559727
39	NC_022654	GGCG	2	8	15183	15190	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022654	GGTC	2	8	15913	15920	0 %	25 %	50 %	25 %	556559729
41	NC_022654	GTGG	2	8	16301	16308	0 %	25 %	75 %	0 %	556559729
42	NC_022654	CGGG	2	8	16404	16411	0 %	0 %	75 %	25 %	556559730
43	NC_022654	CCGG	2	8	16851	16858	0 %	0 %	50 %	50 %	556559730
44	NC_022654	AACG	2	8	16896	16903	50 %	0 %	25 %	25 %	556559730
45	NC_022654	CCAC	2	8	16957	16964	25 %	0 %	0 %	75 %	556559730
46	NC_022654	TCCA	2	8	17704	17711	25 %	25 %	0 %	50 %	556559731
47	NC_022654	GAGT	2	8	17734	17741	25 %	25 %	50 %	0 %	556559731
48	NC_022654	TTGC	2	8	18702	18709	0 %	50 %	25 %	25 %	556559846
49	NC_022654	GCCG	2	8	18854	18861	0 %	0 %	50 %	50 %	556559846
50	NC_022654	GATA	2	8	18918	18925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022654	GTTC	2	8	19955	19962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022654	TGCG	2	8	20213	20220	0 %	25 %	50 %	25 %	556559848
53	NC_022654	GCCG	2	8	20362	20369	0 %	0 %	50 %	50 %	556559848
54	NC_022654	ATCC	2	8	20848	20855	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022654	GGGC	2	8	21055	21062	0 %	0 %	75 %	25 %	556559732
56	NC_022654	CGGC	2	8	22395	22402	0 %	0 %	50 %	50 %	556559734
57	NC_022654	TCAA	2	8	22619	22626	50 %	25 %	0 %	25 %	556559734
58	NC_022654	CCCG	2	8	22878	22885	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_022654	CGCC	2	8	22915	22922	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_022654	AGCG	2	8	24600	24607	25 %	0 %	50 %	25 %	556559850
61	NC_022654	CGAC	2	8	24608	24615	25 %	0 %	25 %	50 %	556559850
62	NC_022654	TCGA	2	8	25151	25158	25 %	25 %	25 %	25 %	556559737
63	NC_022654	CGAT	2	8	26418	26425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022654	ATTC	2	8	26995	27002	25 %	50 %	0 %	25 %	556559738
65	NC_022654	CCGC	2	8	27203	27210	0 %	0 %	25 %	75 %	556559738
66	NC_022654	ATTC	2	8	27479	27486	25 %	50 %	0 %	25 %	556559739
67	NC_022654	CGCA	2	8	27498	27505	25 %	0 %	25 %	50 %	556559739
68	NC_022654	ACCC	2	8	27605	27612	25 %	0 %	0 %	75 %	556559739
69	NC_022654	CTGG	2	8	27629	27636	0 %	25 %	50 %	25 %	556559739
70	NC_022654	CTGC	2	8	28716	28723	0 %	25 %	25 %	50 %	556559739
71	NC_022654	CGGG	2	8	29269	29276	0 %	0 %	75 %	25 %	556559740
72	NC_022654	GATC	2	8	30504	30511	25 %	25 %	25 %	25 %	556559741
73	NC_022654	CCTC	2	8	30879	30886	0 %	25 %	0 %	75 %	556559741
74	NC_022654	CGGC	2	8	30955	30962	0 %	0 %	50 %	50 %	556559741
75	NC_022654	CACC	2	8	31055	31062	25 %	0 %	0 %	75 %	556559741
76	NC_022654	GATC	2	8	31349	31356	25 %	25 %	25 %	25 %	556559741
77	NC_022654	GCCA	2	8	32743	32750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022654	CTCC	2	8	33382	33389	0 %	25 %	0 %	75 %	556559854
79	NC_022654	CACG	2	8	33712	33719	25 %	0 %	25 %	50 %	556559854
80	NC_022654	GATC	2	8	34245	34252	25 %	25 %	25 %	25 %	556559855
81	NC_022654	GCCC	2	8	34380	34387	0 %	0 %	25 %	75 %	556559855
82	NC_022654	TGTC	2	8	34401	34408	0 %	50 %	25 %	25 %	556559855
83	NC_022654	GATG	2	8	34722	34729	25 %	25 %	50 %	0 %	556559855
84	NC_022654	TCCG	2	8	35742	35749	0 %	25 %	25 %	50 %	556559744
85	NC_022654	GGCC	2	8	36124	36131	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
86	NC_022654	CCCG	2	8	36742	36749	0 %	0 %	25 %	75 %	556559745
87	NC_022654	CGGC	2	8	36882	36889	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
88	NC_022654	CGGG	2	8	37017	37024	0 %	0 %	75 %	25 %	556559745
89	NC_022654	GACA	2	8	38054	38061	50 %	0 %	25 %	25 %	556559746
90	NC_022654	TGGC	2	8	38278	38285	0 %	25 %	50 %	25 %	556559746
91	NC_022654	GGCG	2	8	38333	38340	0 %	0 %	75 %	25 %	556559746
92	NC_022654	CTCA	2	8	38481	38488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022654	GGCC	2	8	38489	38496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022654	CGGT	2	8	38714	38721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_022654	CAGA	2	8	38932	38939	50 %	0 %	25 %	25 %	556559747
96	NC_022654	GAGC	2	8	39309	39316	25 %	0 %	50 %	25 %	556559747
97	NC_022654	GTTG	2	8	40386	40393	0 %	50 %	50 %	0 %	556559748
98	NC_022654	CCCG	2	8	40506	40513	0 %	0 %	25 %	75 %	556559748
99	NC_022654	GCAA	2	8	40661	40668	50 %	0 %	25 %	25 %	556559748
100	NC_022654	CGGC	2	8	41230	41237	0 %	0 %	50 %	50 %	556559749
101	NC_022654	AGAT	2	8	42192	42199	50 %	25 %	25 %	0 %	556559752
102	NC_022654	GCGT	2	8	42551	42558	0 %	25 %	50 %	25 %	556559752
103	NC_022654	GTCC	2	8	42572	42579	0 %	25 %	25 %	50 %	556559752
104	NC_022654	TCGG	2	8	42902	42909	0 %	25 %	50 %	25 %	556559753
105	NC_022654	TGGT	2	8	43312	43319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022654	CAGA	2	8	43812	43819	50 %	0 %	25 %	25 %	556559754
107	NC_022654	GATC	2	8	44111	44118	25 %	25 %	25 %	25 %	556559754
108	NC_022654	CGGC	2	8	44180	44187	0 %	0 %	50 %	50 %	556559754
109	NC_022654	CGGC	2	8	44697	44704	0 %	0 %	50 %	50 %	556559755
110	NC_022654	GCGG	2	8	45974	45981	0 %	0 %	75 %	25 %	556559757
111	NC_022654	GACC	2	8	46168	46175	25 %	0 %	25 %	50 %	556559757
112	NC_022654	ACCA	2	8	46338	46345	50 %	0 %	0 %	50 %	556559757
113	NC_022654	GCCC	2	8	46381	46388	0 %	0 %	25 %	75 %	556559757
114	NC_022654	ACAT	2	8	46530	46537	50 %	25 %	0 %	25 %	556559757
115	NC_022654	GGTG	2	8	46584	46591	0 %	25 %	75 %	0 %	556559758
116	NC_022654	CGGG	2	8	46659	46666	0 %	0 %	75 %	25 %	556559758
117	NC_022654	GCCA	2	8	46700	46707	25 %	0 %	25 %	50 %	556559758
118	NC_022654	GCCA	2	8	46811	46818	25 %	0 %	25 %	50 %	556559758
119	NC_022654	CGGT	2	8	47075	47082	0 %	25 %	50 %	25 %	556559758
120	NC_022654	CCGA	2	8	47310	47317	25 %	0 %	25 %	50 %	556559759
121	NC_022654	CTCC	2	8	48144	48151	0 %	25 %	0 %	75 %	556559761
122	NC_022654	GCGA	2	8	48220	48227	25 %	0 %	50 %	25 %	556559761
123	NC_022654	CTGC	2	8	48665	48672	0 %	25 %	25 %	50 %	556559761
124	NC_022654	GCCT	2	8	49144	49151	0 %	25 %	25 %	50 %	556559761
125	NC_022654	CCAG	2	8	50027	50034	25 %	0 %	25 %	50 %	556559762
126	NC_022654	TGGG	2	8	50527	50534	0 %	25 %	75 %	0 %	556559764
127	NC_022654	CTGG	2	8	51701	51708	0 %	25 %	50 %	25 %	556559766
128	NC_022654	GCCG	2	8	51723	51730	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
129	NC_022654	CGGC	2	8	52087	52094	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
130	NC_022654	CCTG	2	8	52888	52895	0 %	25 %	25 %	50 %	556559766
131	NC_022654	CTGG	2	8	53114	53121	0 %	25 %	50 %	25 %	556559766
132	NC_022654	GCCA	2	8	53352	53359	25 %	0 %	25 %	50 %	556559766
133	NC_022654	CCGC	2	8	54194	54201	0 %	0 %	25 %	75 %	556559767
134	NC_022654	GCTG	2	8	54357	54364	0 %	25 %	50 %	25 %	556559767
135	NC_022654	TGGC	2	8	54500	54507	0 %	25 %	50 %	25 %	556559767
136	NC_022654	ACCC	2	8	55343	55350	25 %	0 %	0 %	75 %	556559767
137	NC_022654	CCGG	2	8	55968	55975	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
138	NC_022654	CGCC	2	8	56267	56274	0 %	0 %	25 %	75 %	556559768
139	NC_022654	TCGG	2	8	56283	56290	0 %	25 %	50 %	25 %	556559768
140	NC_022654	GCCC	3	12	56472	56483	0 %	0 %	25 %	75 %	556559769
141	NC_022654	CGGG	2	8	57540	57547	0 %	0 %	75 %	25 %	556559770
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143	NC_022654	TCGG	2	8	58193	58200	0 %	25 %	50 %	25 %	556559770
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279	NC_022654	CCAG	2	8	107981	107988	25 %	0 %	25 %	50 %	556559815
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.