MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem

Total Repeats: 109893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_022350	AAC	2	6	248481	248486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197738186
6003	NC_022350	GCC	2	6	248498	248503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738186
6004	NC_022350	GAC	2	6	248543	248548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738186
6005	NC_022350	GCA	2	6	248557	248562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738186
6006	NC_022350	GCCG	2	8	248606	248613	0 %	0 %	50 %	50 %	197738186
6007	NC_022350	GGTC	2	8	248641	248648	0 %	25 %	50 %	25 %	197738186
6008	NC_022350	GCG	2	6	248649	248654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738186
6009	NC_022350	GCA	2	6	248656	248661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738186
6010	NC_022350	CAC	2	6	248662	248667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197738186
6011	NC_022350	TGG	2	6	248698	248703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738186
6012	NC_022350	GGC	2	6	248716	248721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738186
6013	NC_022350	TGG	2	6	248727	248732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738186
6014	NC_022350	GAA	2	6	248756	248761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197738186
6015	NC_022350	GCA	2	6	248803	248808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738186
6016	NC_022350	AGC	2	6	248877	248882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738186
6017	NC_022350	AGCC	2	8	248885	248892	25 %	0 %	25 %	50 %	197738186
6018	NC_022350	TCGCCA	2	12	248941	248952	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	197738186
6019	NC_022350	ACC	2	6	248988	248993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197738186
6020	NC_022350	CG	3	6	249037	249042	0 %	0 %	50 %	50 %	197738186
6021	NC_022350	AGG	2	6	249060	249065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197738186
6022	NC_022350	CCG	2	6	249122	249127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738186
6023	NC_022350	GT	3	6	249169	249174	0 %	50 %	50 %	0 %	197738186
6024	NC_022350	GCAT	2	8	249201	249208	25 %	25 %	25 %	25 %	197738186
6025	NC_022350	TGG	2	6	249216	249221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738186
6026	NC_022350	GCC	2	6	249241	249246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_022350	CGG	2	6	249279	249284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_022350	CTG	2	6	249296	249301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_022350	CGG	2	6	249312	249317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_022350	CCA	2	6	249326	249331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_022350	GAAC	2	8	249336	249343	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6032	NC_022350	TCG	2	6	249383	249388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161357
6033	NC_022350	CCA	2	6	249407	249412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	544161357
6034	NC_022350	CCG	2	6	249416	249421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161357
6035	NC_022350	GCC	2	6	249451	249456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161357
6036	NC_022350	GGGT	2	8	249491	249498	0 %	25 %	75 %	0 %	544161357
6037	NC_022350	GC	4	8	249511	249518	0 %	0 %	50 %	50 %	544161357
6038	NC_022350	TCG	2	6	249538	249543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161357
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6040	NC_022350	GTC	2	6	249595	249600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161357
6041	NC_022350	CGC	2	6	249645	249650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161357
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6043	NC_022350	GGCC	2	8	249693	249700	0 %	0 %	50 %	50 %	544161357
6044	NC_022350	GC	3	6	249743	249748	0 %	0 %	50 %	50 %	544161357
6045	NC_022350	CTC	2	6	249760	249765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	544161357
6046	NC_022350	CGA	2	6	249813	249818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161357
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6048	NC_022350	TGC	2	6	249842	249847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161357
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6050	NC_022350	GGC	2	6	249909	249914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161357
6051	NC_022350	CGGTTG	2	12	249940	249951	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	544161357
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6055	NC_022350	CGG	2	6	250173	250178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161357
6056	NC_022350	CGA	3	9	250200	250208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161357
6057	NC_022350	GGC	2	6	250227	250232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161357
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6059	NC_022350	GCGGT	2	10	250306	250315	0 %	20 %	60 %	20 %	544161357
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6061	NC_022350	CGG	2	6	250404	250409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161357
6062	NC_022350	CG	3	6	250446	250451	0 %	0 %	50 %	50 %	197738187
6063	NC_022350	TGA	2	6	250457	250462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197738187
6064	NC_022350	CCGG	2	8	250464	250471	0 %	0 %	50 %	50 %	197738187
6065	NC_022350	TGG	2	6	250483	250488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738187
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6070	NC_022350	GC	3	6	250589	250594	0 %	0 %	50 %	50 %	197738187
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6110	NC_022350	CGA	2	6	252139	252144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738188
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6122	NC_022350	TCGG	2	8	252645	252652	0 %	25 %	50 %	25 %	197738188
6123	NC_022350	CGC	2	6	252655	252660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738188
6124	NC_022350	TGGCC	2	10	252682	252691	0 %	20 %	40 %	40 %	197738188
6125	NC_022350	CGG	2	6	252761	252766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738188
6126	NC_022350	AAG	2	6	252783	252788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197738188
6127	NC_022350	GCTG	2	8	252832	252839	0 %	25 %	50 %	25 %	197738188
6128	NC_022350	TAC	2	6	252888	252893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197738188
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6151	NC_022350	CGC	2	6	253772	253777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738188
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6154	NC_022350	CGCA	2	8	253945	253952	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6155	NC_022350	GCG	2	6	253992	253997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738189
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6162	NC_022350	CGTC	2	8	254143	254150	0 %	25 %	25 %	50 %	197738189
6163	NC_022350	GTG	2	6	254176	254181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738189
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6223	NC_022350	CTG	2	6	256843	256848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738191
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6231	NC_022350	GTCCA	2	10	257330	257339	20 %	20 %	20 %	40 %	197738191
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6240	NC_022350	CGA	3	9	257643	257651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738191
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6242	NC_022350	CCA	2	6	257679	257684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197738191
6243	NC_022350	ATC	2	6	257689	257694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197738191
6244	NC_022350	CGG	2	6	257697	257702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738191
6245	NC_022350	AGG	2	6	257720	257725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197738191
6246	NC_022350	CGG	2	6	257765	257770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738191
6247	NC_022350	CGA	3	9	257784	257792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738191
6248	NC_022350	CCG	2	6	257834	257839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738191
6249	NC_022350	TGC	2	6	258002	258007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6250	NC_022350	CCA	2	6	258056	258061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6251	NC_022350	CCG	2	6	258106	258111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738192
6252	NC_022350	CGT	2	6	258117	258122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738192
6253	NC_022350	GTAGCC	2	12	258133	258144	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	197738192
6254	NC_022350	AAC	2	6	258197	258202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197738192
6255	NC_022350	CGG	2	6	258252	258257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738192
6256	NC_022350	TGC	2	6	258329	258334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738192
6257	NC_022350	TCGG	2	8	258339	258346	0 %	25 %	50 %	25 %	197738192
6258	NC_022350	GCC	2	6	258392	258397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738192
6259	NC_022350	CG	3	6	258416	258421	0 %	0 %	50 %	50 %	197738192
6260	NC_022350	TCA	2	6	258453	258458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197738192
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6262	NC_022350	CGA	2	6	258603	258608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738192
6263	NC_022350	GGTC	2	8	258648	258655	0 %	25 %	50 %	25 %	197738192
6264	NC_022350	CGG	2	6	258683	258688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738192
6265	NC_022350	CAA	2	6	258721	258726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197738192
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6267	NC_022350	TGG	2	6	258813	258818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738192
6268	NC_022350	CCG	2	6	258856	258861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738192
6269	NC_022350	CGA	2	6	258897	258902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738192
6270	NC_022350	GCCC	2	8	258909	258916	0 %	0 %	25 %	75 %	197738192
6271	NC_022350	CCG	2	6	258995	259000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738192
6272	NC_022350	TCG	2	6	259007	259012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738192
6273	NC_022350	ACGG	2	8	259090	259097	25 %	0 %	50 %	25 %	197738192
6274	NC_022350	TCG	3	9	259151	259159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738192
6275	NC_022350	CGG	2	6	259262	259267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738193
6276	NC_022350	GGC	2	6	259340	259345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738193
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6278	NC_022350	CGG	2	6	259405	259410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738193
6279	NC_022350	GGT	2	6	259574	259579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738193
6280	NC_022350	GACCG	2	10	259653	259662	20 %	0 %	40 %	40 %	197738193
6281	NC_022350	TGC	2	6	259696	259701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738193
6282	NC_022350	GAC	2	6	259740	259745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738193
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6284	NC_022350	CCG	2	6	259780	259785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738193
6285	NC_022350	CGGTG	2	10	259859	259868	0 %	20 %	60 %	20 %	197738193
6286	NC_022350	GGCTC	2	10	259910	259919	0 %	20 %	40 %	40 %	197738193
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6312	NC_022350	CGA	3	9	261043	261051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738194
6313	NC_022350	GACC	2	8	261082	261089	25 %	0 %	25 %	50 %	197738194
6314	NC_022350	GAC	2	6	261104	261109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738194
6315	NC_022350	TGG	2	6	261234	261239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6316	NC_022350	TGA	2	6	261242	261247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544161359
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6318	NC_022350	GCTG	2	8	261308	261315	0 %	25 %	50 %	25 %	544161359
6319	NC_022350	CCG	2	6	261328	261333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161359
6320	NC_022350	TGG	2	6	261410	261415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161359
6321	NC_022350	TCA	3	9	261428	261436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544161359
6322	NC_022350	GGCCA	2	10	261475	261484	20 %	0 %	40 %	40 %	544161359
6323	NC_022350	GGCT	2	8	261499	261506	0 %	25 %	50 %	25 %	544161359
6324	NC_022350	CGTC	2	8	261535	261542	0 %	25 %	25 %	50 %	544161359
6325	NC_022350	TGGGGC	2	12	261575	261586	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	544161359
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6327	NC_022350	TG	3	6	261642	261647	0 %	50 %	50 %	0 %	544161359
6328	NC_022350	GCC	2	6	261648	261653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161359
6329	NC_022350	GC	3	6	261655	261660	0 %	0 %	50 %	50 %	544161359
6330	NC_022350	CGAT	2	8	261868	261875	25 %	25 %	25 %	25 %	544161359
6331	NC_022350	TGC	2	6	262013	262018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161359
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6333	NC_022350	CTG	3	9	262075	262083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161359
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6335	NC_022350	CCG	5	15	262130	262144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161359
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6337	NC_022350	TGC	2	6	262184	262189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161359
6338	NC_022350	AGT	2	6	262206	262211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544161359
6339	NC_022350	GGCC	2	8	262230	262237	0 %	0 %	50 %	50 %	544161359
6340	NC_022350	GGT	2	6	262280	262285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161359
6341	NC_022350	GCG	2	6	262304	262309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161359
6342	NC_022350	GCT	2	6	262329	262334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161359
6343	NC_022350	GGCG	2	8	262335	262342	0 %	0 %	75 %	25 %	544161359
6344	NC_022350	CGG	2	6	262346	262351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161359
6345	NC_022350	GCG	2	6	262382	262387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161359
6346	NC_022350	GGCGA	2	10	262396	262405	20 %	0 %	60 %	20 %	544161359
6347	NC_022350	GGC	2	6	262410	262415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161359
6348	NC_022350	GCT	2	6	262440	262445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161359
6349	NC_022350	CAT	2	6	262500	262505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544161359
6350	NC_022350	CTG	2	6	262628	262633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161360
6351	NC_022350	CTG	2	6	262655	262660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161360
6352	NC_022350	TGG	2	6	262712	262717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161360
6353	NC_022350	CGC	2	6	262741	262746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161360
6354	NC_022350	CGT	2	6	262747	262752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161360
6355	NC_022350	CTG	2	6	262763	262768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161360
6356	NC_022350	CGC	3	9	262841	262849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161360
6357	NC_022350	GCT	2	6	262906	262911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161360
6358	NC_022350	CAT	2	6	262927	262932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544161360
6359	NC_022350	GGT	2	6	262995	263000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161360
6360	NC_022350	TGC	2	6	263001	263006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161360
6361	NC_022350	TGG	3	9	263055	263063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161360
6362	NC_022350	GGC	2	6	263073	263078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161360
6363	NC_022350	CGA	2	6	263110	263115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161360
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6434	NC_022350	TTG	2	6	266946	266951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197738200
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6481	NC_022350	CGG	2	6	268659	268664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738201
6482	NC_022350	TCA	2	6	268673	268678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197738201
6483	NC_022350	CGC	2	6	268746	268751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738201
6484	NC_022350	AGC	2	6	268760	268765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738201
6485	NC_022350	GGC	2	6	268778	268783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738201
6486	NC_022350	TG	3	6	268790	268795	0 %	50 %	50 %	0 %	197738201
6487	NC_022350	GCCA	2	8	268796	268803	25 %	0 %	25 %	50 %	197738201
6488	NC_022350	TGC	2	6	268819	268824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738201
6489	NC_022350	GCC	2	6	268832	268837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738201
6490	NC_022350	GCT	2	6	268866	268871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738201
6491	NC_022350	CAG	2	6	268888	268893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738201
6492	NC_022350	AGCG	2	8	268898	268905	25 %	0 %	50 %	25 %	197738201
6493	NC_022350	CG	3	6	268922	268927	0 %	0 %	50 %	50 %	197738201
6494	NC_022350	TCTGC	2	10	268986	268995	0 %	40 %	20 %	40 %	197738202
6495	NC_022350	TGC	2	6	269005	269010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738202
6496	NC_022350	G	6	6	269039	269044	0 %	0 %	100 %	0 %	197738202
6497	NC_022350	CGCT	2	8	269117	269124	0 %	25 %	25 %	50 %	197738202
6498	NC_022350	CGG	2	6	269177	269182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738202
6499	NC_022350	GTC	2	6	269271	269276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738202
6500	NC_022350	TGT	2	6	269311	269316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197738202

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