MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 3042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021883	TA	3	6	299	304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021883	CT	3	6	343	348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021883	GT	3	6	1712	1717	0 %	50 %	50 %	0 %	526467398
4	NC_021883	AT	3	6	2423	2428	50 %	50 %	0 %	0 %	526467399
5	NC_021883	TA	3	6	3518	3523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021883	CT	3	6	4220	4225	0 %	50 %	0 %	50 %	526467401
7	NC_021883	CT	3	6	6121	6126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021883	AC	3	6	6134	6139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021883	AC	3	6	8099	8104	50 %	0 %	0 %	50 %	526467403
10	NC_021883	AT	3	6	8350	8355	50 %	50 %	0 %	0 %	526467403
11	NC_021883	AG	3	6	8376	8381	50 %	0 %	50 %	0 %	526467403
12	NC_021883	TG	3	6	8382	8387	0 %	50 %	50 %	0 %	526467403
13	NC_021883	CT	3	6	12072	12077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021883	GA	3	6	12461	12466	50 %	0 %	50 %	0 %	526467406
15	NC_021883	TG	3	6	13425	13430	0 %	50 %	50 %	0 %	526467406
16	NC_021883	GT	3	6	16643	16648	0 %	50 %	50 %	0 %	526467410
17	NC_021883	CT	3	6	17640	17645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021883	AC	3	6	19782	19787	50 %	0 %	0 %	50 %	526467413
19	NC_021883	CT	4	8	20029	20036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021883	TC	4	8	20068	20075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021883	CT	3	6	20872	20877	0 %	50 %	0 %	50 %	526467414
22	NC_021883	AG	3	6	21195	21200	50 %	0 %	50 %	0 %	526467414
23	NC_021883	TC	3	6	22326	22331	0 %	50 %	0 %	50 %	526467415
24	NC_021883	TC	3	6	22698	22703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021883	GA	3	6	24912	24917	50 %	0 %	50 %	0 %	526467417
26	NC_021883	AG	3	6	26445	26450	50 %	0 %	50 %	0 %	526467420
27	NC_021883	TC	3	6	27415	27420	0 %	50 %	0 %	50 %	526467421
28	NC_021883	CT	3	6	30262	30267	0 %	50 %	0 %	50 %	526467422
29	NC_021883	GT	3	6	30449	30454	0 %	50 %	50 %	0 %	526467422
30	NC_021883	GT	3	6	30712	30717	0 %	50 %	50 %	0 %	526467422
31	NC_021883	CT	3	6	31449	31454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021883	AC	3	6	31527	31532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021883	TA	3	6	32168	32173	50 %	50 %	0 %	0 %	526467423
34	NC_021883	AT	3	6	32830	32835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021883	AC	4	8	32913	32920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021883	TG	3	6	33114	33119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021883	AT	3	6	33572	33577	50 %	50 %	0 %	0 %	526467425
38	NC_021883	TA	3	6	37881	37886	50 %	50 %	0 %	0 %	526467430
39	NC_021883	GA	3	6	40014	40019	50 %	0 %	50 %	0 %	526467432
40	NC_021883	GT	3	6	40864	40869	0 %	50 %	50 %	0 %	526467433
41	NC_021883	GT	3	6	41610	41615	0 %	50 %	50 %	0 %	526467434
42	NC_021883	TC	3	6	42582	42587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021883	AG	3	6	43568	43573	50 %	0 %	50 %	0 %	526467437
44	NC_021883	CA	3	6	45805	45810	50 %	0 %	0 %	50 %	526467439
45	NC_021883	CA	3	6	46987	46992	50 %	0 %	0 %	50 %	526467440
46	NC_021883	AC	3	6	47078	47083	50 %	0 %	0 %	50 %	526467440
47	NC_021883	CT	3	6	47436	47441	0 %	50 %	0 %	50 %	526467440
48	NC_021883	CT	3	6	50054	50059	0 %	50 %	0 %	50 %	526467446
49	NC_021883	TG	3	6	50108	50113	0 %	50 %	50 %	0 %	526467446
50	NC_021883	TC	3	6	51049	51054	0 %	50 %	0 %	50 %	526467447
51	NC_021883	AG	3	6	51527	51532	50 %	0 %	50 %	0 %	526467448
52	NC_021883	TC	3	6	52162	52167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021883	CA	3	6	52292	52297	50 %	0 %	0 %	50 %	526467449
54	NC_021883	AC	3	6	52480	52485	50 %	0 %	0 %	50 %	526467449
55	NC_021883	AG	3	6	52916	52921	50 %	0 %	50 %	0 %	526467450
56	NC_021883	AG	3	6	54388	54393	50 %	0 %	50 %	0 %	526467452
57	NC_021883	CA	3	6	54553	54558	50 %	0 %	0 %	50 %	526467452
58	NC_021883	AG	3	6	55745	55750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021883	TC	3	6	55944	55949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021883	AC	3	6	56232	56237	50 %	0 %	0 %	50 %	526467454
61	NC_021883	TA	3	6	58346	58351	50 %	50 %	0 %	0 %	526467457
62	NC_021883	GT	3	6	59115	59120	0 %	50 %	50 %	0 %	526467458
63	NC_021883	TG	3	6	61158	61163	0 %	50 %	50 %	0 %	526467459
64	NC_021883	TA	3	6	61329	61334	50 %	50 %	0 %	0 %	526467459
65	NC_021883	AG	3	6	63283	63288	50 %	0 %	50 %	0 %	526467460
66	NC_021883	AT	3	6	63898	63903	50 %	50 %	0 %	0 %	526467460
67	NC_021883	GT	3	6	64411	64416	0 %	50 %	50 %	0 %	526467460
68	NC_021883	GA	3	6	65656	65661	50 %	0 %	50 %	0 %	526467462
69	NC_021883	AG	3	6	65859	65864	50 %	0 %	50 %	0 %	526467462
70	NC_021883	GA	3	6	66641	66646	50 %	0 %	50 %	0 %	526467463
71	NC_021883	GT	3	6	69162	69167	0 %	50 %	50 %	0 %	526467465
72	NC_021883	TC	3	6	70497	70502	0 %	50 %	0 %	50 %	526467466
73	NC_021883	CA	3	6	71112	71117	50 %	0 %	0 %	50 %	526467466
74	NC_021883	CA	3	6	71207	71212	50 %	0 %	0 %	50 %	526467466
75	NC_021883	GA	4	8	73048	73055	50 %	0 %	50 %	0 %	526467469
76	NC_021883	AG	3	6	73303	73308	50 %	0 %	50 %	0 %	526467469
77	NC_021883	AG	4	8	73423	73430	50 %	0 %	50 %	0 %	526467469
78	NC_021883	CA	3	6	73834	73839	50 %	0 %	0 %	50 %	526467469
79	NC_021883	TA	3	6	75338	75343	50 %	50 %	0 %	0 %	526467470
80	NC_021883	CT	4	8	76759	76766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021883	AG	4	8	76796	76803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021883	CA	3	6	77033	77038	50 %	0 %	0 %	50 %	526467473
83	NC_021883	AT	3	6	77109	77114	50 %	50 %	0 %	0 %	526467473
84	NC_021883	TG	3	6	78141	78146	0 %	50 %	50 %	0 %	526467473
85	NC_021883	AG	3	6	78284	78289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021883	AG	4	8	78320	78327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021883	GA	3	6	78343	78348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021883	TA	3	6	78446	78451	50 %	50 %	0 %	0 %	526467474
89	NC_021883	CA	3	6	78555	78560	50 %	0 %	0 %	50 %	526467474
90	NC_021883	CA	3	6	78624	78629	50 %	0 %	0 %	50 %	526467474
91	NC_021883	CA	3	6	80031	80036	50 %	0 %	0 %	50 %	526467474
92	NC_021883	TG	3	6	80759	80764	0 %	50 %	50 %	0 %	526467475
93	NC_021883	AT	3	6	81112	81117	50 %	50 %	0 %	0 %	526467475
94	NC_021883	AT	3	6	81287	81292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021883	GA	3	6	82028	82033	50 %	0 %	50 %	0 %	526467476
96	NC_021883	CA	3	6	82549	82554	50 %	0 %	0 %	50 %	526467476
97	NC_021883	CA	3	6	83092	83097	50 %	0 %	0 %	50 %	526467476
98	NC_021883	GT	3	6	88171	88176	0 %	50 %	50 %	0 %	526467478
99	NC_021883	TA	3	6	88345	88350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021883	TC	3	6	89426	89431	0 %	50 %	0 %	50 %	526467480
101	NC_021883	AT	3	6	90267	90272	50 %	50 %	0 %	0 %	526467481
102	NC_021883	GT	3	6	91820	91825	0 %	50 %	50 %	0 %	526467483
103	NC_021883	GA	4	8	91830	91837	50 %	0 %	50 %	0 %	526467483
104	NC_021883	GT	3	6	93132	93137	0 %	50 %	50 %	0 %	526467486
105	NC_021883	TA	3	6	94190	94195	50 %	50 %	0 %	0 %	526467487
106	NC_021883	AT	3	6	95323	95328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021883	TC	4	8	95801	95808	0 %	50 %	0 %	50 %	526467489
108	NC_021883	AG	3	6	95876	95881	50 %	0 %	50 %	0 %	526467489
109	NC_021883	AC	3	6	97335	97340	50 %	0 %	0 %	50 %	526467492
110	NC_021883	TC	3	6	97566	97571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021883	AC	3	6	99788	99793	50 %	0 %	0 %	50 %	526467496
112	NC_021883	GA	3	6	101423	101428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021883	CT	3	6	104324	104329	0 %	50 %	0 %	50 %	526467502
114	NC_021883	TA	3	6	104541	104546	50 %	50 %	0 %	0 %	526467502
115	NC_021883	TG	3	6	104562	104567	0 %	50 %	50 %	0 %	526467502
116	NC_021883	TG	4	8	104632	104639	0 %	50 %	50 %	0 %	526467502
117	NC_021883	GA	3	6	104692	104697	50 %	0 %	50 %	0 %	526467502
118	NC_021883	AT	3	6	105735	105740	50 %	50 %	0 %	0 %	526467504
119	NC_021883	GA	3	6	106490	106495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021883	TC	3	6	106557	106562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021883	GT	3	6	107162	107167	0 %	50 %	50 %	0 %	526467506
122	NC_021883	AG	3	6	109303	109308	50 %	0 %	50 %	0 %	526467507
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124	NC_021883	TG	3	6	111743	111748	0 %	50 %	50 %	0 %	526467509
125	NC_021883	AG	3	6	112319	112324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021883	CT	3	6	112994	112999	0 %	50 %	0 %	50 %	526467511
127	NC_021883	AC	3	6	113732	113737	50 %	0 %	0 %	50 %	526467513
128	NC_021883	AT	3	6	114321	114326	50 %	50 %	0 %	0 %	526467514
129	NC_021883	AG	4	8	115811	115818	50 %	0 %	50 %	0 %	526467515
130	NC_021883	TG	3	6	116146	116151	0 %	50 %	50 %	0 %	526467515
131	NC_021883	TG	3	6	116302	116307	0 %	50 %	50 %	0 %	526467515
132	NC_021883	CA	3	6	119761	119766	50 %	0 %	0 %	50 %	526467518
133	NC_021883	GT	3	6	120876	120881	0 %	50 %	50 %	0 %	526467518
134	NC_021883	GA	3	6	121373	121378	50 %	0 %	50 %	0 %	526467519
135	NC_021883	TG	3	6	123883	123888	0 %	50 %	50 %	0 %	526467522
136	NC_021883	AT	3	6	124554	124559	50 %	50 %	0 %	0 %	526467522
137	NC_021883	GT	3	6	125652	125657	0 %	50 %	50 %	0 %	526467524
138	NC_021883	AT	3	6	126067	126072	50 %	50 %	0 %	0 %	526467525
139	NC_021883	TG	3	6	126316	126321	0 %	50 %	50 %	0 %	526467525
140	NC_021883	TG	3	6	126358	126363	0 %	50 %	50 %	0 %	526467525
141	NC_021883	AT	3	6	126421	126426	50 %	50 %	0 %	0 %	526467525
142	NC_021883	CT	3	6	126801	126806	0 %	50 %	0 %	50 %	526467525
143	NC_021883	GA	3	6	128847	128852	50 %	0 %	50 %	0 %	526467527
144	NC_021883	GA	3	6	129082	129087	50 %	0 %	50 %	0 %	526467527
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