MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 7031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021883	TAAA	2	8	30	37	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021883	AAAT	2	8	41	48	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021883	GTGC	2	8	706	713	0 %	25 %	50 %	25 %	526467398
4	NC_021883	AACC	2	8	1493	1500	50 %	0 %	0 %	50 %	526467398
5	NC_021883	AAGA	2	8	1856	1863	75 %	0 %	25 %	0 %	526467398
6	NC_021883	AAGC	2	8	1949	1956	50 %	0 %	25 %	25 %	526467398
7	NC_021883	CAAG	2	8	2037	2044	50 %	0 %	25 %	25 %	526467398
8	NC_021883	GGCA	2	8	2228	2235	25 %	0 %	50 %	25 %	526467398
9	NC_021883	GGTT	2	8	2337	2344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021883	GCTT	2	8	2676	2683	0 %	50 %	25 %	25 %	526467400
11	NC_021883	AAAT	2	8	2694	2701	75 %	25 %	0 %	0 %	526467400
12	NC_021883	AGTT	2	8	2724	2731	25 %	50 %	25 %	0 %	526467400
13	NC_021883	CTGC	2	8	3326	3333	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021883	ATTT	2	8	3408	3415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021883	ACTT	2	8	3662	3669	25 %	50 %	0 %	25 %	526467401
16	NC_021883	AAGC	2	8	3775	3782	50 %	0 %	25 %	25 %	526467401
17	NC_021883	TTTG	2	8	4039	4046	0 %	75 %	25 %	0 %	526467401
18	NC_021883	TCTA	2	8	4521	4528	25 %	50 %	0 %	25 %	526467401
19	NC_021883	TACT	2	8	5075	5082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021883	TCTT	2	8	5237	5244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021883	TGGT	2	8	5262	5269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021883	ACTA	2	8	5313	5320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021883	TGGT	2	8	5855	5862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021883	ATTG	2	8	6106	6113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021883	TAAC	2	8	6237	6244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021883	TCAC	2	8	6253	6260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021883	GAAA	2	8	6427	6434	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021883	ATTC	2	8	6450	6457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021883	GCTG	2	8	6565	6572	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021883	CACT	2	8	7617	7624	25 %	25 %	0 %	50 %	526467402
31	NC_021883	TAAG	2	8	8256	8263	50 %	25 %	25 %	0 %	526467403
32	NC_021883	AACT	2	8	9663	9670	50 %	25 %	0 %	25 %	526467404
33	NC_021883	TCCT	2	8	10407	10414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021883	TTAT	2	8	10424	10431	25 %	75 %	0 %	0 %	526467405
35	NC_021883	GTTT	2	8	11078	11085	0 %	75 %	25 %	0 %	526467405
36	NC_021883	CATA	2	8	11553	11560	50 %	25 %	0 %	25 %	526467405
37	NC_021883	CGGT	2	8	11579	11586	0 %	25 %	50 %	25 %	526467405
38	NC_021883	TCAA	2	8	11707	11714	50 %	25 %	0 %	25 %	526467405
39	NC_021883	GCAC	2	8	11740	11747	25 %	0 %	25 %	50 %	526467405
40	NC_021883	AGAA	2	8	12090	12097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021883	AGCT	2	8	12250	12257	25 %	25 %	25 %	25 %	526467406
42	NC_021883	ATTT	2	8	12508	12515	25 %	75 %	0 %	0 %	526467406
43	NC_021883	TCAA	2	8	12856	12863	50 %	25 %	0 %	25 %	526467406
44	NC_021883	ATGA	2	8	12915	12922	50 %	25 %	25 %	0 %	526467406
45	NC_021883	GACG	2	8	13044	13051	25 %	0 %	50 %	25 %	526467406
46	NC_021883	TATT	2	8	13794	13801	25 %	75 %	0 %	0 %	526467406
47	NC_021883	AAGC	2	8	13838	13845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021883	TGTT	2	8	14069	14076	0 %	75 %	25 %	0 %	526467407
49	NC_021883	GTTT	2	8	14768	14775	0 %	75 %	25 %	0 %	526467409
50	NC_021883	TTAA	2	8	15004	15011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021883	GCTT	2	8	15756	15763	0 %	50 %	25 %	25 %	526467410
52	NC_021883	CCTG	2	8	16534	16541	0 %	25 %	25 %	50 %	526467410
53	NC_021883	CAAT	2	8	16630	16637	50 %	25 %	0 %	25 %	526467410
54	NC_021883	GACC	2	8	17299	17306	25 %	0 %	25 %	50 %	526467411
55	NC_021883	ATTT	2	8	17714	17721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021883	GTTG	2	8	18525	18532	0 %	50 %	50 %	0 %	526467412
57	NC_021883	GTCC	2	8	18690	18697	0 %	25 %	25 %	50 %	526467412
58	NC_021883	CCAA	2	8	19091	19098	50 %	0 %	0 %	50 %	526467413
59	NC_021883	AGTA	2	8	19106	19113	50 %	25 %	25 %	0 %	526467413
60	NC_021883	CATA	2	8	19269	19276	50 %	25 %	0 %	25 %	526467413
61	NC_021883	ACCA	2	8	19304	19311	50 %	0 %	0 %	50 %	526467413
62	NC_021883	GATA	2	8	19852	19859	50 %	25 %	25 %	0 %	526467413
63	NC_021883	GTTT	2	8	19888	19895	0 %	75 %	25 %	0 %	526467413
64	NC_021883	GAGG	2	8	19951	19958	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021883	GGAG	2	8	19978	19985	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021883	GACT	2	8	20110	20117	25 %	25 %	25 %	25 %	526467414
67	NC_021883	TCAA	2	8	21256	21263	50 %	25 %	0 %	25 %	526467414
68	NC_021883	ATCA	2	8	22381	22388	50 %	25 %	0 %	25 %	526467415
69	NC_021883	GGAG	2	8	22739	22746	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021883	TGGT	2	8	23061	23068	0 %	50 %	50 %	0 %	526467416
71	NC_021883	TGGT	2	8	23238	23245	0 %	50 %	50 %	0 %	526467416
72	NC_021883	ATCA	2	8	23438	23445	50 %	25 %	0 %	25 %	526467416
73	NC_021883	CACG	2	8	23512	23519	25 %	0 %	25 %	50 %	526467416
74	NC_021883	TGCC	2	8	24082	24089	0 %	25 %	25 %	50 %	526467417
75	NC_021883	CAGC	2	8	24263	24270	25 %	0 %	25 %	50 %	526467417
76	NC_021883	AAAC	2	8	24370	24377	75 %	0 %	0 %	25 %	526467417
77	NC_021883	TGCC	2	8	24557	24564	0 %	25 %	25 %	50 %	526467417
78	NC_021883	CAAG	2	8	25102	25109	50 %	0 %	25 %	25 %	526467417
79	NC_021883	GAAA	2	8	25113	25120	75 %	0 %	25 %	0 %	526467417
80	NC_021883	CCAA	2	8	25450	25457	50 %	0 %	0 %	50 %	526467418
81	NC_021883	TTAG	2	8	28236	28243	25 %	50 %	25 %	0 %	526467422
82	NC_021883	GGCT	2	8	28919	28926	0 %	25 %	50 %	25 %	526467422
83	NC_021883	GTTT	2	8	29023	29030	0 %	75 %	25 %	0 %	526467422
84	NC_021883	GCCC	2	8	31166	31173	0 %	0 %	25 %	75 %	526467422
85	NC_021883	GGTC	2	8	31271	31278	0 %	25 %	50 %	25 %	526467422
86	NC_021883	AAAT	2	8	31581	31588	75 %	25 %	0 %	0 %	526467423
87	NC_021883	GGCT	2	8	31610	31617	0 %	25 %	50 %	25 %	526467423
88	NC_021883	TTTC	2	8	32786	32793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021883	TAAA	2	8	32980	32987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021883	TGGT	2	8	33389	33396	0 %	50 %	50 %	0 %	526467424
91	NC_021883	CATT	2	8	34060	34067	25 %	50 %	0 %	25 %	526467425
92	NC_021883	ATAG	2	8	35683	35690	50 %	25 %	25 %	0 %	526467428
93	NC_021883	TGAT	2	8	35732	35739	25 %	50 %	25 %	0 %	526467428
94	NC_021883	GTGA	2	8	35866	35873	25 %	25 %	50 %	0 %	526467429
95	NC_021883	AAGC	2	8	36595	36602	50 %	0 %	25 %	25 %	526467429
96	NC_021883	TCTA	2	8	36674	36681	25 %	50 %	0 %	25 %	526467429
97	NC_021883	GCGT	2	8	36699	36706	0 %	25 %	50 %	25 %	526467429
98	NC_021883	ATTT	2	8	37650	37657	25 %	75 %	0 %	0 %	526467430
99	NC_021883	GAAA	2	8	37678	37685	75 %	0 %	25 %	0 %	526467430
100	NC_021883	CAAG	2	8	38180	38187	50 %	0 %	25 %	25 %	526467430
101	NC_021883	GAAT	2	8	38194	38201	50 %	25 %	25 %	0 %	526467430
102	NC_021883	GAAC	2	8	38877	38884	50 %	0 %	25 %	25 %	526467431
103	NC_021883	TGGT	2	8	39293	39300	0 %	50 %	50 %	0 %	526467431
104	NC_021883	AGTG	2	8	39684	39691	25 %	25 %	50 %	0 %	526467432
105	NC_021883	GCGT	2	8	39725	39732	0 %	25 %	50 %	25 %	526467432
106	NC_021883	ACCG	2	8	39876	39883	25 %	0 %	25 %	50 %	526467432
107	NC_021883	TGAT	2	8	43502	43509	25 %	50 %	25 %	0 %	526467437
108	NC_021883	ATTT	2	8	44408	44415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021883	AAAC	2	8	44478	44485	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021883	TGCT	16	64	44575	44638	0 %	50 %	25 %	25 %	526467438
111	NC_021883	TGGC	2	8	44856	44863	0 %	25 %	50 %	25 %	526467232
112	NC_021883	ATTG	2	8	45025	45032	25 %	50 %	25 %	0 %	526467439
113	NC_021883	TCTT	2	8	45091	45098	0 %	75 %	0 %	25 %	526467439
114	NC_021883	TTAT	2	8	45107	45114	25 %	75 %	0 %	0 %	526467439
115	NC_021883	TGCT	2	8	46264	46271	0 %	50 %	25 %	25 %	526467439
116	NC_021883	TTCA	2	8	46958	46965	25 %	50 %	0 %	25 %	526467439
117	NC_021883	GCCA	2	8	47067	47074	25 %	0 %	25 %	50 %	526467440
118	NC_021883	GCCC	2	8	47619	47626	0 %	0 %	25 %	75 %	526467441
119	NC_021883	TGGC	2	8	47950	47957	0 %	25 %	50 %	25 %	526467441
120	NC_021883	CGCT	2	8	48347	48354	0 %	25 %	25 %	50 %	526467441
121	NC_021883	TCAA	2	8	48819	48826	50 %	25 %	0 %	25 %	526467443
122	NC_021883	CAAT	2	8	49265	49272	50 %	25 %	0 %	25 %	526467444
123	NC_021883	AAGT	2	8	49557	49564	50 %	25 %	25 %	0 %	526467445
124	NC_021883	CAAC	2	8	50158	50165	50 %	0 %	0 %	50 %	526467446
125	NC_021883	GCCT	2	8	50239	50246	0 %	25 %	25 %	50 %	526467446
126	NC_021883	ATAA	2	8	51194	51201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021883	AGAA	2	8	51301	51308	75 %	0 %	25 %	0 %	526467448
128	NC_021883	TGGC	2	8	51470	51477	0 %	25 %	50 %	25 %	526467448
129	NC_021883	AATT	2	8	51876	51883	50 %	50 %	0 %	0 %	526467448
130	NC_021883	TTAC	2	8	52254	52261	25 %	50 %	0 %	25 %	526467449
131	NC_021883	AACA	2	8	52829	52836	75 %	0 %	0 %	25 %	526467449
132	NC_021883	CTGC	2	8	54768	54775	0 %	25 %	25 %	50 %	526467452
133	NC_021883	CGGG	2	8	55259	55266	0 %	0 %	75 %	25 %	526467453
134	NC_021883	ACCC	2	8	55824	55831	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
135	NC_021883	TTTA	2	8	55917	55924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021883	CTCG	2	8	55989	55996	0 %	25 %	25 %	50 %	526467454
137	NC_021883	ATTT	2	8	56097	56104	25 %	75 %	0 %	0 %	526467454
138	NC_021883	TGAG	2	8	56183	56190	25 %	25 %	50 %	0 %	526467454
139	NC_021883	CCTG	2	8	56715	56722	0 %	25 %	25 %	50 %	526467454
140	NC_021883	ACTC	2	8	57027	57034	25 %	25 %	0 %	50 %	526467454
141	NC_021883	TTGA	2	8	57322	57329	25 %	50 %	25 %	0 %	526467454
142	NC_021883	TGAG	2	8	57497	57504	25 %	25 %	50 %	0 %	526467455
143	NC_021883	CAAT	2	8	57506	57513	50 %	25 %	0 %	25 %	526467455
144	NC_021883	GCGA	2	8	57808	57815	25 %	0 %	50 %	25 %	526467455
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