MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 51682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_021883	GC	3	6	253587	253592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_021883	ATG	2	6	253639	253644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021883	ATG	2	6	253650	253655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021883	TGA	2	6	253672	253677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021883	T	6	6	253927	253932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021883	TTC	2	6	254052	254057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467644
5008	NC_021883	ATG	2	6	254093	254098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467644
5009	NC_021883	TCAC	2	8	254173	254180	25 %	25 %	0 %	50 %	526467644
5010	NC_021883	GCAT	2	8	254221	254228	25 %	25 %	25 %	25 %	526467644
5011	NC_021883	TCC	2	6	254322	254327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_021883	TGA	2	6	254518	254523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467645
5013	NC_021883	TGA	2	6	254656	254661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467645
5014	NC_021883	TACC	2	8	254686	254693	25 %	25 %	0 %	50 %	526467645
5015	NC_021883	AT	3	6	254753	254758	50 %	50 %	0 %	0 %	526467645
5016	NC_021883	ACT	2	6	254787	254792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467645
5017	NC_021883	A	7	7	254826	254832	100 %	0 %	0 %	0 %	526467645
5018	NC_021883	TGGATT	2	12	254869	254880	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	526467645
5019	NC_021883	GATT	2	8	254889	254896	25 %	50 %	25 %	0 %	526467645
5020	NC_021883	AAC	2	6	255045	255050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467645
5021	NC_021883	GTA	2	6	255116	255121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467645
5022	NC_021883	TTA	2	6	255132	255137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467645
5023	NC_021883	AGA	2	6	255217	255222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467645
5024	NC_021883	ATT	2	6	255290	255295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467645
5025	NC_021883	TGA	2	6	255388	255393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467645
5026	NC_021883	TTAA	2	8	255461	255468	50 %	50 %	0 %	0 %	526467645
5027	NC_021883	CAG	2	6	255521	255526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467645
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5029	NC_021883	ATT	2	6	255560	255565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467645
5030	NC_021883	G	6	6	255571	255576	0 %	0 %	100 %	0 %	526467645
5031	NC_021883	GAT	2	6	255590	255595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467645
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5033	NC_021883	TAC	2	6	255767	255772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467645
5034	NC_021883	T	6	6	255869	255874	0 %	100 %	0 %	0 %	526467645
5035	NC_021883	TTC	2	6	255934	255939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467645
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5037	NC_021883	GCT	2	6	256226	256231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467646
5038	NC_021883	TCA	2	6	256330	256335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467646
5039	NC_021883	AAC	2	6	256435	256440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467646
5040	NC_021883	ATC	2	6	256562	256567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467646
5041	NC_021883	ATG	2	6	256626	256631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467646
5042	NC_021883	CAAG	2	8	256634	256641	50 %	0 %	25 %	25 %	526467646
5043	NC_021883	ATG	2	6	256648	256653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467646
5044	NC_021883	CT	3	6	256662	256667	0 %	50 %	0 %	50 %	526467646
5045	NC_021883	TCTTG	2	10	256672	256681	0 %	60 %	20 %	20 %	526467646
5046	NC_021883	TAAA	2	8	256684	256691	75 %	25 %	0 %	0 %	526467646
5047	NC_021883	AAC	2	6	256777	256782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467646
5048	NC_021883	TGA	2	6	256851	256856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467647
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5050	NC_021883	A	6	6	256869	256874	100 %	0 %	0 %	0 %	526467647
5051	NC_021883	TTG	2	6	256943	256948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467647
5052	NC_021883	GTC	2	6	256957	256962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467647
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5054	NC_021883	AT	3	6	256983	256988	50 %	50 %	0 %	0 %	526467647
5055	NC_021883	GAT	2	6	257065	257070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467647
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5057	NC_021883	CCG	2	6	257108	257113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467647
5058	NC_021883	AAAAT	2	10	257120	257129	80 %	20 %	0 %	0 %	526467647
5059	NC_021883	TGA	2	6	257132	257137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467647
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5061	NC_021883	GTT	2	6	257245	257250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467647
5062	NC_021883	AT	3	6	257252	257257	50 %	50 %	0 %	0 %	526467647
5063	NC_021883	ATG	2	6	257338	257343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467647
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5071	NC_021883	AAG	2	6	257639	257644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467647
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5073	NC_021883	ATA	2	6	257663	257668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021883	TAA	2	6	257675	257680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021883	ATT	2	6	257686	257691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_021883	AAGA	2	8	258235	258242	75 %	0 %	25 %	0 %	526467648
5090	NC_021883	CAA	2	6	258346	258351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467648
5091	NC_021883	TGC	2	6	258417	258422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467648
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5093	NC_021883	ACGAAA	2	12	258571	258582	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	526467648
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5095	NC_021883	TAT	2	6	258721	258726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467648
5096	NC_021883	GACA	2	8	258838	258845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5097	NC_021883	TCT	2	6	258884	258889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_021883	ATT	2	6	258894	258899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5102	NC_021883	TGTT	2	8	259132	259139	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021883	AC	3	6	259142	259147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_021883	ATT	2	6	259165	259170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021883	ATT	2	6	259191	259196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021883	AAAAAT	2	12	259214	259225	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021883	GAC	2	6	259227	259232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_021883	T	6	6	259278	259283	0 %	100 %	0 %	0 %	526467650
5109	NC_021883	TAG	2	6	259297	259302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467650
5110	NC_021883	T	6	6	259332	259337	0 %	100 %	0 %	0 %	526467650
5111	NC_021883	TGT	2	6	259355	259360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467650
5112	NC_021883	CTTG	2	8	259418	259425	0 %	50 %	25 %	25 %	526467650
5113	NC_021883	TGCT	2	8	259449	259456	0 %	50 %	25 %	25 %	526467650
5114	NC_021883	TTTC	2	8	259469	259476	0 %	75 %	0 %	25 %	526467650
5115	NC_021883	GGT	2	6	259532	259537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467650
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5119	NC_021883	TGT	2	6	259705	259710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467650
5120	NC_021883	GTA	2	6	259719	259724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467650
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5122	NC_021883	A	6	6	259944	259949	100 %	0 %	0 %	0 %	526467650
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5124	NC_021883	T	6	6	259968	259973	0 %	100 %	0 %	0 %	526467650
5125	NC_021883	A	6	6	260009	260014	100 %	0 %	0 %	0 %	526467650
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5131	NC_021883	T	6	6	260532	260537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021883	TAGCA	2	10	260549	260558	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5216	NC_021883	A	6	6	265061	265066	100 %	0 %	0 %	0 %	526467654
5217	NC_021883	ATA	2	6	265187	265192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467654
5218	NC_021883	AAT	2	6	265219	265224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5242	NC_021883	AT	3	6	267042	267047	50 %	50 %	0 %	0 %	526467657
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5244	NC_021883	CAC	2	6	267167	267172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467657
5245	NC_021883	GCAAT	2	10	267205	267214	40 %	20 %	20 %	20 %	526467657
5246	NC_021883	TGCC	2	8	267286	267293	0 %	25 %	25 %	50 %	526467657
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5252	NC_021883	TTG	2	6	267482	267487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467657
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5497	NC_021883	CCA	2	6	280761	280766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467668
5498	NC_021883	CGC	2	6	280810	280815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467668
5499	NC_021883	TGCC	2	8	280902	280909	0 %	25 %	25 %	50 %	526467668
5500	NC_021883	CTA	2	6	280971	280976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467668

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