MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D153

Total Repeats: 1979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021743	TGAAT	2	10	3954	3963	40 %	40 %	20 %	0 %	525701279
2	NC_021743	GATCG	2	10	10352	10361	20 %	20 %	40 %	20 %	525701284
3	NC_021743	ATTCA	2	10	14111	14120	40 %	40 %	0 %	20 %	525701287
4	NC_021743	CTGTA	2	10	14302	14311	20 %	40 %	20 %	20 %	525701287
5	NC_021743	AATAC	2	10	15855	15864	60 %	20 %	0 %	20 %	525701100
6	NC_021743	TGAAT	2	10	19149	19158	40 %	40 %	20 %	0 %	525701290
7	NC_021743	ATACC	2	10	20072	20081	40 %	20 %	0 %	40 %	525701290
8	NC_021743	AAATT	2	10	20885	20894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021743	ATTTT	2	10	20988	20997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021743	TTGGC	2	10	21765	21774	0 %	40 %	40 %	20 %	525701291
11	NC_021743	AGCTG	2	10	23973	23982	20 %	20 %	40 %	20 %	525701295
12	NC_021743	AAGTG	2	10	24276	24285	40 %	20 %	40 %	0 %	525701295
13	NC_021743	TTCAC	2	10	24946	24955	20 %	40 %	0 %	40 %	525701295
14	NC_021743	CTTAT	2	10	25418	25427	20 %	60 %	0 %	20 %	525701296
15	NC_021743	TTTTA	2	10	26665	26674	20 %	80 %	0 %	0 %	525701298
16	NC_021743	GTTTC	2	10	26994	27003	0 %	60 %	20 %	20 %	525701298
17	NC_021743	AATCC	2	10	28527	28536	40 %	20 %	0 %	40 %	525701299
18	NC_021743	GTTTC	2	10	28680	28689	0 %	60 %	20 %	20 %	525701299
19	NC_021743	GCAAC	2	10	29812	29821	40 %	0 %	20 %	40 %	525701301
20	NC_021743	GTGGC	2	10	32328	32337	0 %	20 %	60 %	20 %	525701303
21	NC_021743	TTAAA	2	10	37668	37677	60 %	40 %	0 %	0 %	525701305
22	NC_021743	AAACT	2	10	38664	38673	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021743	CATTT	2	10	39008	39017	20 %	60 %	0 %	20 %	525701306
24	NC_021743	GTTTT	2	10	39442	39451	0 %	80 %	20 %	0 %	525701306
25	NC_021743	GTTTT	2	10	41153	41162	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021743	TTGCA	2	10	42365	42374	20 %	40 %	20 %	20 %	525701309
27	NC_021743	TAAAT	2	10	42462	42471	60 %	40 %	0 %	0 %	525701309
28	NC_021743	ATTAA	2	10	42857	42866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021743	CCAAG	2	10	45161	45170	40 %	0 %	20 %	40 %	525701312
30	NC_021743	CGTTT	2	10	46746	46755	0 %	60 %	20 %	20 %	525701313
31	NC_021743	AATGA	2	10	46943	46952	60 %	20 %	20 %	0 %	525701313
32	NC_021743	ACCCA	2	10	47231	47240	40 %	0 %	0 %	60 %	525701313
33	NC_021743	AATCA	2	10	48398	48407	60 %	20 %	0 %	20 %	525701314
34	NC_021743	AGCAC	2	10	51344	51353	40 %	0 %	20 %	40 %	525701317
35	NC_021743	TAAGT	2	10	51403	51412	40 %	40 %	20 %	0 %	525701317
36	NC_021743	TAAAA	2	10	51982	51991	80 %	20 %	0 %	0 %	525701317
37	NC_021743	ACATC	2	10	52673	52682	40 %	20 %	0 %	40 %	525701318
38	NC_021743	GTAAT	2	10	52724	52733	40 %	40 %	20 %	0 %	525701318
39	NC_021743	AAATT	2	10	53348	53357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021743	ATAGA	2	10	53554	53563	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021743	CCGGC	2	10	53618	53627	0 %	0 %	40 %	60 %	525701319
42	NC_021743	ACCCA	2	10	56847	56856	40 %	0 %	0 %	60 %	525701321
43	NC_021743	TAAAT	2	10	58442	58451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021743	AAATC	2	10	58950	58959	60 %	20 %	0 %	20 %	525701322
45	NC_021743	TCCAA	2	10	59745	59754	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_021743	ATACC	2	10	61042	61051	40 %	20 %	0 %	40 %	525701324
47	NC_021743	TTTGG	2	10	61736	61745	0 %	60 %	40 %	0 %	525701325
48	NC_021743	TACCG	2	10	61979	61988	20 %	20 %	20 %	40 %	525701325
49	NC_021743	TAAGA	2	10	62017	62026	60 %	20 %	20 %	0 %	525701325
50	NC_021743	TTTAA	2	10	64016	64025	40 %	60 %	0 %	0 %	525701326
51	NC_021743	TCAAA	2	10	64774	64783	60 %	20 %	0 %	20 %	525701328
52	NC_021743	AAATG	2	10	65888	65897	60 %	20 %	20 %	0 %	525701330
53	NC_021743	GTTTT	2	10	66340	66349	0 %	80 %	20 %	0 %	525701330
54	NC_021743	CATAA	2	10	67130	67139	60 %	20 %	0 %	20 %	525701330
55	NC_021743	ATCTC	2	10	67398	67407	20 %	40 %	0 %	40 %	525701330
56	NC_021743	AAATC	2	10	67653	67662	60 %	20 %	0 %	20 %	525701330
57	NC_021743	ATTTA	2	10	68339	68348	40 %	60 %	0 %	0 %	525701330
58	NC_021743	ATTGC	2	10	69106	69115	20 %	40 %	20 %	20 %	525701330
59	NC_021743	ATTGT	2	10	69179	69188	20 %	60 %	20 %	0 %	525701330
60	NC_021743	TGTAA	2	10	74766	74775	40 %	40 %	20 %	0 %	525701337
61	NC_021743	GGATA	2	10	77408	77417	40 %	20 %	40 %	0 %	525701339
62	NC_021743	ATTTA	2	10	78390	78399	40 %	60 %	0 %	0 %	525701340
63	NC_021743	AAAGT	2	10	79273	79282	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021743	GCTTT	2	10	80798	80807	0 %	60 %	20 %	20 %	525701342
65	NC_021743	ACACC	2	10	83353	83362	40 %	0 %	0 %	60 %	525701345
66	NC_021743	TAGAA	2	10	87077	87086	60 %	20 %	20 %	0 %	525701351
67	NC_021743	CGGTA	2	10	87543	87552	20 %	20 %	40 %	20 %	525701352
68	NC_021743	CTTCA	2	10	88209	88218	20 %	40 %	0 %	40 %	525701352
69	NC_021743	ACCGA	2	10	88447	88456	40 %	0 %	20 %	40 %	525701352
70	NC_021743	TAAAA	2	10	89513	89522	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021743	GATTG	2	10	90855	90864	20 %	40 %	40 %	0 %	525701354
72	NC_021743	TAAGC	2	10	92549	92558	40 %	20 %	20 %	20 %	525701357
73	NC_021743	AATTA	2	10	92691	92700	60 %	40 %	0 %	0 %	525701358
74	NC_021743	ACCAT	2	10	97199	97208	40 %	20 %	0 %	40 %	525701361
75	NC_021743	TATAA	2	10	97477	97486	60 %	40 %	0 %	0 %	525701361
76	NC_021743	ATTTT	2	10	98357	98366	20 %	80 %	0 %	0 %	525701362
77	NC_021743	AATAA	2	10	98729	98738	80 %	20 %	0 %	0 %	525701363
78	NC_021743	AATAG	2	10	99477	99486	60 %	20 %	20 %	0 %	525701364
79	NC_021743	TTAAT	2	10	99653	99662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021743	CGCTA	2	10	102717	102726	20 %	20 %	20 %	40 %	525701369
81	NC_021743	GGCAA	2	10	102906	102915	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021743	TTTGA	2	10	103303	103312	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021743	ATAAA	2	10	103629	103638	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021743	TCTAT	2	10	103750	103759	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021743	TGGTT	2	10	107810	107819	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021743	ATTTG	2	10	108792	108801	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021743	AAATA	2	10	109976	109985	80 %	20 %	0 %	0 %	525701380
88	NC_021743	TTGTT	2	10	111745	111754	0 %	80 %	20 %	0 %	525701383
89	NC_021743	TTGGT	2	10	113430	113439	0 %	60 %	40 %	0 %	525701384
90	NC_021743	AACTG	2	10	114683	114692	40 %	20 %	20 %	20 %	525701386
91	NC_021743	TTAGC	2	10	117405	117414	20 %	40 %	20 %	20 %	525701389
92	NC_021743	TAGAT	2	10	118147	118156	40 %	40 %	20 %	0 %	525701389
93	NC_021743	TTAGA	2	10	118547	118556	40 %	40 %	20 %	0 %	525701390
94	NC_021743	ACGCT	2	10	118557	118566	20 %	20 %	20 %	40 %	525701390
95	NC_021743	AGTTA	2	10	118582	118591	40 %	40 %	20 %	0 %	525701390
96	NC_021743	GCACG	2	10	122086	122095	20 %	0 %	40 %	40 %	525701393
97	NC_021743	AACCC	2	10	123129	123138	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_021743	TCAAA	2	10	123883	123892	60 %	20 %	0 %	20 %	525701396
99	NC_021743	AAAAG	2	10	127646	127655	80 %	0 %	20 %	0 %	525701103
100	NC_021743	CACGA	2	10	127680	127689	40 %	0 %	20 %	40 %	525701103
101	NC_021743	AAATT	2	10	128834	128843	60 %	40 %	0 %	0 %	525701400
102	NC_021743	ATTCC	2	10	132157	132166	20 %	40 %	0 %	40 %	525701406
103	NC_021743	TGAAG	2	10	133621	133630	40 %	20 %	40 %	0 %	525701408
104	NC_021743	TTTCA	2	10	134266	134275	20 %	60 %	0 %	20 %	525701409
105	NC_021743	TCAAT	2	10	136625	136634	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021743	GAAAA	2	10	137470	137479	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021743	GTCCG	2	10	138724	138733	0 %	20 %	40 %	40 %	525701418
108	NC_021743	ATTTT	2	10	140791	140800	20 %	80 %	0 %	0 %	525701422
109	NC_021743	GCAAT	2	10	142237	142246	40 %	20 %	20 %	20 %	525701423
110	NC_021743	ATTCT	2	10	142405	142414	20 %	60 %	0 %	20 %	525701106
111	NC_021743	AGTTG	2	10	142694	142703	20 %	40 %	40 %	0 %	525701106
112	NC_021743	GGATT	2	10	146070	146079	20 %	40 %	40 %	0 %	525701428
113	NC_021743	AGAAA	2	10	146310	146319	80 %	0 %	20 %	0 %	525701428
114	NC_021743	CAAAC	2	10	148576	148585	60 %	0 %	0 %	40 %	525701111
115	NC_021743	TTTTG	2	10	148649	148658	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021743	GTGAT	2	10	148732	148741	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021743	GAGAA	2	10	149145	149154	60 %	0 %	40 %	0 %	525701112
118	NC_021743	GCTAC	2	10	150659	150668	20 %	20 %	20 %	40 %	525701113
119	NC_021743	GCGAA	2	10	152640	152649	40 %	0 %	40 %	20 %	525701434
120	NC_021743	GTAAT	2	10	154338	154347	40 %	40 %	20 %	0 %	525701114
121	NC_021743	CGTTT	2	10	154551	154560	0 %	60 %	20 %	20 %	525701435
122	NC_021743	CGGTT	2	10	155046	155055	0 %	40 %	40 %	20 %	525701436
123	NC_021743	CCGAT	2	10	156701	156710	20 %	20 %	20 %	40 %	525701439
124	NC_021743	GTACG	2	10	157620	157629	20 %	20 %	40 %	20 %	525701441
125	NC_021743	CTTGG	2	10	158602	158611	0 %	40 %	40 %	20 %	525701443
126	NC_021743	AATCA	2	10	163336	163345	60 %	20 %	0 %	20 %	525701448
127	NC_021743	CCCGA	2	10	166402	166411	20 %	0 %	20 %	60 %	525701118
128	NC_021743	TACAA	2	10	170486	170495	60 %	20 %	0 %	20 %	525701118
129	NC_021743	TGGTA	2	10	172354	172363	20 %	40 %	40 %	0 %	525701118
130	NC_021743	TTATC	2	10	173273	173282	20 %	60 %	0 %	20 %	525701452
131	NC_021743	ACTCA	2	10	173642	173651	40 %	20 %	0 %	40 %	525701453
132	NC_021743	TGTAG	2	10	173874	173883	20 %	40 %	40 %	0 %	525701453
133	NC_021743	ATTTT	2	10	174383	174392	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021743	CGATG	2	10	176558	176567	20 %	20 %	40 %	20 %	525701458
135	NC_021743	CGAGC	2	10	177282	177291	20 %	0 %	40 %	40 %	525701458
136	NC_021743	ACGAT	2	10	178295	178304	40 %	20 %	20 %	20 %	525701460
137	NC_021743	CGCTA	2	10	178748	178757	20 %	20 %	20 %	40 %	525701460
138	NC_021743	ATTTC	2	10	179650	179659	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_021743	TAAAT	2	10	179668	179677	60 %	40 %	0 %	0 %	525701461
140	NC_021743	CATTT	2	10	180277	180286	20 %	60 %	0 %	20 %	525701461
141	NC_021743	TTTTG	2	10	181787	181796	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021743	ATTAA	2	10	185220	185229	60 %	40 %	0 %	0 %	525701466
143	NC_021743	GCGTA	2	10	186024	186033	20 %	20 %	40 %	20 %	525701466
144	NC_021743	AAAAG	2	10	187441	187450	80 %	0 %	20 %	0 %	525701468
145	NC_021743	ATTTT	2	10	187730	187739	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021743	TTTGT	2	10	188960	188969	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021743	TCCAA	2	10	189863	189872	40 %	20 %	0 %	40 %	525701471
148	NC_021743	GTTTA	2	10	191240	191249	20 %	60 %	20 %	0 %	525701473
149	NC_021743	GCTTT	2	10	194302	194311	0 %	60 %	20 %	20 %	525701475
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151	NC_021743	AATTA	2	10	204680	204689	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021743	ATTTT	2	10	204729	204738	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021743	ATTTA	2	10	205905	205914	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021743	AGAAA	2	10	207153	207162	80 %	0 %	20 %	0 %	525701487
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156	NC_021743	GCTCG	2	10	207790	207799	0 %	20 %	40 %	40 %	525701488
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162	NC_021743	CTTGG	2	10	215062	215071	0 %	40 %	40 %	20 %	525701493
163	NC_021743	ATTTT	2	10	215196	215205	20 %	80 %	0 %	0 %	525701493
164	NC_021743	ATTTT	2	10	215304	215313	20 %	80 %	0 %	0 %	525701493
165	NC_021743	GTTTT	2	10	215397	215406	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021743	TGGTG	2	10	218286	218295	0 %	40 %	60 %	0 %	525701496
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170	NC_021743	TGCAT	2	10	222212	222221	20 %	40 %	20 %	20 %	525701501
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172	NC_021743	AGTGC	2	10	229183	229192	20 %	20 %	40 %	20 %	525701505
173	NC_021743	GATTG	2	10	233250	233259	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021743	TCGAA	2	10	235817	235826	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_021743	AGTTT	2	10	236687	236696	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021743	AAAAT	2	10	237775	237784	80 %	20 %	0 %	0 %	525701513
177	NC_021743	AAAAG	2	10	238035	238044	80 %	0 %	20 %	0 %	525701514
178	NC_021743	TACAT	2	10	239121	239130	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
179	NC_021743	GATAA	2	10	240463	240472	60 %	20 %	20 %	0 %	525701516
180	NC_021743	TGCCC	2	10	244523	244532	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
181	NC_021743	TGCCC	2	10	245580	245589	0 %	20 %	20 %	60 %	525701523
182	NC_021743	CGGCT	2	10	245929	245938	0 %	20 %	40 %	40 %	525701523
183	NC_021743	CCATT	2	10	246232	246241	20 %	40 %	0 %	40 %	525701523
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188	NC_021743	CAACC	2	10	250747	250756	40 %	0 %	0 %	60 %	525701525
189	NC_021743	TCCAA	2	10	254209	254218	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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204	NC_021743	TTTGC	2	10	273058	273067	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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224	NC_021743	AAAAT	2	10	298417	298426	80 %	20 %	0 %	0 %	525701555
225	NC_021743	CTTCG	2	10	301263	301272	0 %	40 %	20 %	40 %	525701555
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237	NC_021743	CACTG	2	10	315559	315568	20 %	20 %	20 %	40 %	525701566
238	NC_021743	TCCAT	2	10	315632	315641	20 %	40 %	0 %	40 %	525701566
239	NC_021743	ATAGA	2	10	316427	316436	60 %	20 %	20 %	0 %	525701566
240	NC_021743	TTTCC	2	10	317116	317125	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
241	NC_021743	CAATA	2	10	317389	317398	60 %	20 %	0 %	20 %	525701567
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249	NC_021743	TGGAT	2	10	324967	324976	20 %	40 %	40 %	0 %	525701572
250	NC_021743	ATTGA	2	10	326027	326036	40 %	40 %	20 %	0 %	525701573
251	NC_021743	ATTTA	2	10	326469	326478	40 %	60 %	0 %	0 %	525701573
252	NC_021743	TATCG	2	10	327818	327827	20 %	40 %	20 %	20 %	525701574
253	NC_021743	AATTT	2	10	329326	329335	40 %	60 %	0 %	0 %	525701575
254	NC_021743	ATTTC	2	10	330303	330312	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
255	NC_021743	AAATG	2	10	330468	330477	60 %	20 %	20 %	0 %	525701576
256	NC_021743	AACCA	2	10	332464	332473	60 %	0 %	0 %	40 %	525701577
257	NC_021743	ATAAA	2	10	332812	332821	80 %	20 %	0 %	0 %	525701577
258	NC_021743	AGGTA	2	10	333912	333921	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
259	NC_021743	GTTAA	2	10	333948	333957	40 %	40 %	20 %	0 %	525701578
260	NC_021743	TTTGC	2	10	337553	337562	0 %	60 %	20 %	20 %	525701580
261	NC_021743	CTTCT	2	10	338094	338103	0 %	60 %	0 %	40 %	525701581
262	NC_021743	AAAAC	2	10	340046	340055	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_021743	CGCTT	2	10	341097	341106	0 %	40 %	20 %	40 %	525701583
264	NC_021743	ACCTC	2	10	344508	344517	20 %	20 %	0 %	60 %	525701586
265	NC_021743	TTGAT	2	10	346071	346080	20 %	60 %	20 %	0 %	525701588
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267	NC_021743	AGTTA	2	10	346327	346336	40 %	40 %	20 %	0 %	525701588
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269	NC_021743	TTTAC	2	10	346841	346850	20 %	60 %	0 %	20 %	525701588
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271	NC_021743	ACTTT	2	10	349433	349442	20 %	60 %	0 %	20 %	525701591
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398	NC_021743	AAATA	2	10	521765	521774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_021743	TGCCT	2	10	523015	523024	0 %	40 %	20 %	40 %	525701727
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