MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D174

Total Repeats: 7114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021739	TCGG	2	8	500	507	0 %	25 %	50 %	25 %	525662556
2	NC_021739	CGTT	2	8	785	792	0 %	50 %	25 %	25 %	525662556
3	NC_021739	CCAA	2	8	1244	1251	50 %	0 %	0 %	50 %	525662557
4	NC_021739	TCAA	2	8	1662	1669	50 %	25 %	0 %	25 %	525662559
5	NC_021739	CTGA	2	8	2131	2138	25 %	25 %	25 %	25 %	525662559
6	NC_021739	GCTG	2	8	2598	2605	0 %	25 %	50 %	25 %	525662559
7	NC_021739	CTTT	2	8	3401	3408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021739	TAAA	2	8	4202	4209	75 %	25 %	0 %	0 %	525662562
9	NC_021739	GGTT	2	8	4315	4322	0 %	50 %	50 %	0 %	525662562
10	NC_021739	AGGA	2	8	4328	4335	50 %	0 %	50 %	0 %	525662562
11	NC_021739	CTTA	2	8	4376	4383	25 %	50 %	0 %	25 %	525662562
12	NC_021739	ATTC	2	8	5239	5246	25 %	50 %	0 %	25 %	525662562
13	NC_021739	TTAT	2	8	5727	5734	25 %	75 %	0 %	0 %	525662563
14	NC_021739	GAAA	2	8	5752	5759	75 %	0 %	25 %	0 %	525662563
15	NC_021739	AAAC	2	8	6051	6058	75 %	0 %	0 %	25 %	525662563
16	NC_021739	ATTT	2	8	6085	6092	25 %	75 %	0 %	0 %	525662563
17	NC_021739	CTCA	2	8	6870	6877	25 %	25 %	0 %	50 %	525662564
18	NC_021739	CATT	2	8	6986	6993	25 %	50 %	0 %	25 %	525662564
19	NC_021739	ACAT	2	8	7090	7097	50 %	25 %	0 %	25 %	525662564
20	NC_021739	AATC	2	8	7408	7415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021739	AAGA	2	8	7878	7885	75 %	0 %	25 %	0 %	525662565
22	NC_021739	TTTA	2	8	8185	8192	25 %	75 %	0 %	0 %	525662565
23	NC_021739	GACA	2	8	8481	8488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021739	TGCC	2	8	8748	8755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021739	TTTC	2	8	8964	8971	0 %	75 %	0 %	25 %	525662566
26	NC_021739	CTGT	2	8	9065	9072	0 %	50 %	25 %	25 %	525662566
27	NC_021739	CTAG	2	8	9836	9843	25 %	25 %	25 %	25 %	525662566
28	NC_021739	CGGA	2	8	10662	10669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021739	ATTA	2	8	10985	10992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021739	ATTA	2	8	10994	11001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021739	CGCC	2	8	11983	11990	0 %	0 %	25 %	75 %	525662568
32	NC_021739	GGAA	2	8	12232	12239	50 %	0 %	50 %	0 %	525662568
33	NC_021739	GTTT	2	8	12871	12878	0 %	75 %	25 %	0 %	525662568
34	NC_021739	AGAA	2	8	13152	13159	75 %	0 %	25 %	0 %	525662568
35	NC_021739	GCCA	2	8	13292	13299	25 %	0 %	25 %	50 %	525662568
36	NC_021739	ATGT	2	8	13325	13332	25 %	50 %	25 %	0 %	525662568
37	NC_021739	GCAA	2	8	13581	13588	50 %	0 %	25 %	25 %	525662568
38	NC_021739	GGTT	2	8	13693	13700	0 %	50 %	50 %	0 %	525662568
39	NC_021739	GAAC	2	8	15400	15407	50 %	0 %	25 %	25 %	525662569
40	NC_021739	ATTT	2	8	16445	16452	25 %	75 %	0 %	0 %	525662569
41	NC_021739	TGGC	2	8	16906	16913	0 %	25 %	50 %	25 %	525662570
42	NC_021739	TTGC	2	8	16993	17000	0 %	50 %	25 %	25 %	525662570
43	NC_021739	GTTT	2	8	17174	17181	0 %	75 %	25 %	0 %	525662570
44	NC_021739	TTAT	2	8	17651	17658	25 %	75 %	0 %	0 %	525662571
45	NC_021739	TGGC	2	8	17901	17908	0 %	25 %	50 %	25 %	525662571
46	NC_021739	AATT	2	8	18425	18432	50 %	50 %	0 %	0 %	525662571
47	NC_021739	AGAA	2	8	18545	18552	75 %	0 %	25 %	0 %	525662572
48	NC_021739	GCAT	2	8	18947	18954	25 %	25 %	25 %	25 %	525662574
49	NC_021739	AGTT	2	8	19420	19427	25 %	50 %	25 %	0 %	525662574
50	NC_021739	GCCA	2	8	19641	19648	25 %	0 %	25 %	50 %	525662574
51	NC_021739	TTGG	2	8	20113	20120	0 %	50 %	50 %	0 %	525662574
52	NC_021739	TTTA	2	8	20975	20982	25 %	75 %	0 %	0 %	525662575
53	NC_021739	TTCC	2	8	21133	21140	0 %	50 %	0 %	50 %	525662575
54	NC_021739	ACTT	2	8	21468	21475	25 %	50 %	0 %	25 %	525662576
55	NC_021739	TATC	2	8	22200	22207	25 %	50 %	0 %	25 %	525662577
56	NC_021739	TTGT	2	8	22534	22541	0 %	75 %	25 %	0 %	525662577
57	NC_021739	TTCA	2	8	22917	22924	25 %	50 %	0 %	25 %	525662577
58	NC_021739	TCAC	2	8	22969	22976	25 %	25 %	0 %	50 %	525662577
59	NC_021739	TTTC	2	8	23156	23163	0 %	75 %	0 %	25 %	525662577
60	NC_021739	TTGG	2	8	23191	23198	0 %	50 %	50 %	0 %	525662577
61	NC_021739	TGAC	2	8	23255	23262	25 %	25 %	25 %	25 %	525662577
62	NC_021739	TGAA	2	8	24372	24379	50 %	25 %	25 %	0 %	525662578
63	NC_021739	AAGC	2	8	24429	24436	50 %	0 %	25 %	25 %	525662578
64	NC_021739	AATT	2	8	24698	24705	50 %	50 %	0 %	0 %	525662579
65	NC_021739	AGAC	2	8	25699	25706	50 %	0 %	25 %	25 %	525662580
66	NC_021739	GCGT	2	8	25707	25714	0 %	25 %	50 %	25 %	525662580
67	NC_021739	TAGA	2	8	25773	25780	50 %	25 %	25 %	0 %	525662580
68	NC_021739	TAAA	2	8	26262	26269	75 %	25 %	0 %	0 %	525662580
69	NC_021739	TGTA	2	8	26434	26441	25 %	50 %	25 %	0 %	525662581
70	NC_021739	TTTG	2	8	26894	26901	0 %	75 %	25 %	0 %	525662581
71	NC_021739	CTAT	2	8	27521	27528	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021739	CAAA	3	12	27742	27753	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021739	TTAT	2	8	27770	27777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021739	TATG	2	8	28155	28162	25 %	50 %	25 %	0 %	525662582
75	NC_021739	GTAT	2	8	28247	28254	25 %	50 %	25 %	0 %	525662582
76	NC_021739	TATG	2	8	29832	29839	25 %	50 %	25 %	0 %	525662582
77	NC_021739	CGTG	2	8	30018	30025	0 %	25 %	50 %	25 %	525662582
78	NC_021739	TCCC	2	8	30627	30634	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_021739	ATCA	2	8	30763	30770	50 %	25 %	0 %	25 %	525662583
80	NC_021739	ATTA	2	8	31472	31479	50 %	50 %	0 %	0 %	525662583
81	NC_021739	TGAT	2	8	32692	32699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021739	GATT	2	8	33021	33028	25 %	50 %	25 %	0 %	525662584
83	NC_021739	CAAA	2	8	33453	33460	75 %	0 %	0 %	25 %	525662584
84	NC_021739	AATT	2	8	33614	33621	50 %	50 %	0 %	0 %	525662584
85	NC_021739	GTTT	2	8	34675	34682	0 %	75 %	25 %	0 %	525662585
86	NC_021739	CGTG	2	8	35215	35222	0 %	25 %	50 %	25 %	525662586
87	NC_021739	AAAT	2	8	35273	35280	75 %	25 %	0 %	0 %	525662586
88	NC_021739	TTAT	2	8	35329	35336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021739	ATAC	2	8	38188	38195	50 %	25 %	0 %	25 %	525662588
90	NC_021739	TGTT	2	8	38368	38375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021739	ACAA	2	8	38568	38575	75 %	0 %	0 %	25 %	525662589
92	NC_021739	TATC	2	8	38686	38693	25 %	50 %	0 %	25 %	525662589
93	NC_021739	GTTA	2	8	39189	39196	25 %	50 %	25 %	0 %	525662589
94	NC_021739	ATTA	2	8	39211	39218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021739	AATT	2	8	39291	39298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021739	ACCG	2	8	39443	39450	25 %	0 %	25 %	50 %	525662590
97	NC_021739	CGCT	2	8	39845	39852	0 %	25 %	25 %	50 %	525662590
98	NC_021739	CAAG	2	8	39945	39952	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021739	CAAC	2	8	40959	40966	50 %	0 %	0 %	50 %	525662591
100	NC_021739	ATTG	2	8	41680	41687	25 %	50 %	25 %	0 %	525662591
101	NC_021739	AGCA	2	8	41807	41814	50 %	0 %	25 %	25 %	525662591
102	NC_021739	GGTG	2	8	41842	41849	0 %	25 %	75 %	0 %	525662591
103	NC_021739	TCTT	2	8	42193	42200	0 %	75 %	0 %	25 %	525662592
104	NC_021739	GCAA	2	8	43432	43439	50 %	0 %	25 %	25 %	525662592
105	NC_021739	TTTC	2	8	43670	43677	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021739	CGAA	2	8	43883	43890	50 %	0 %	25 %	25 %	525662593
107	NC_021739	AATT	2	8	44234	44241	50 %	50 %	0 %	0 %	525662593
108	NC_021739	AATG	2	8	44568	44575	50 %	25 %	25 %	0 %	525662593
109	NC_021739	AACT	2	8	44912	44919	50 %	25 %	0 %	25 %	525662594
110	NC_021739	ACCG	2	8	45940	45947	25 %	0 %	25 %	50 %	525662594
111	NC_021739	ACTT	2	8	46165	46172	25 %	50 %	0 %	25 %	525662594
112	NC_021739	ATTG	2	8	48173	48180	25 %	50 %	25 %	0 %	525662596
113	NC_021739	ATAA	2	8	48651	48658	75 %	25 %	0 %	0 %	525662597
114	NC_021739	GTTT	2	8	48998	49005	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021739	AATG	2	8	50099	50106	50 %	25 %	25 %	0 %	525662598
116	NC_021739	TCAC	2	8	50712	50719	25 %	25 %	0 %	50 %	525662599
117	NC_021739	AAAT	2	8	51383	51390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021739	AAAT	2	8	51403	51410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021739	GACA	2	8	52223	52230	50 %	0 %	25 %	25 %	525662600
120	NC_021739	TTGT	2	8	52439	52446	0 %	75 %	25 %	0 %	525662600
121	NC_021739	TAAT	2	8	53871	53878	50 %	50 %	0 %	0 %	525662600
122	NC_021739	TGAA	2	8	54004	54011	50 %	25 %	25 %	0 %	525662600
123	NC_021739	ATTA	2	8	54163	54170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021739	ATAA	2	8	54989	54996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021739	TGCC	2	8	55067	55074	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021739	AATA	2	8	55934	55941	75 %	25 %	0 %	0 %	525662603
127	NC_021739	GCAG	2	8	56063	56070	25 %	0 %	50 %	25 %	525662603
128	NC_021739	TTTG	2	8	56205	56212	0 %	75 %	25 %	0 %	525662603
129	NC_021739	GTTA	2	8	56983	56990	25 %	50 %	25 %	0 %	525662604
130	NC_021739	ACAA	2	8	57155	57162	75 %	0 %	0 %	25 %	525662604
131	NC_021739	TTAA	2	8	57971	57978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021739	CTCG	2	8	58584	58591	0 %	25 %	25 %	50 %	525662381
133	NC_021739	ACCG	2	8	59030	59037	25 %	0 %	25 %	50 %	525662381
134	NC_021739	CGAG	2	8	59049	59056	25 %	0 %	50 %	25 %	525662381
135	NC_021739	TTTA	2	8	59322	59329	25 %	75 %	0 %	0 %	525662381
136	NC_021739	AACC	2	8	59492	59499	50 %	0 %	0 %	50 %	525662381
137	NC_021739	GTGC	2	8	59665	59672	0 %	25 %	50 %	25 %	525662605
138	NC_021739	TAAA	2	8	60007	60014	75 %	25 %	0 %	0 %	525662606
139	NC_021739	TATT	2	8	60173	60180	25 %	75 %	0 %	0 %	525662606
140	NC_021739	GCTT	2	8	60587	60594	0 %	50 %	25 %	25 %	525662608
141	NC_021739	CGGT	2	8	60792	60799	0 %	25 %	50 %	25 %	525662608
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143	NC_021739	CTTT	2	8	61283	61290	0 %	75 %	0 %	25 %	525662609
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