MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica D174

Total Repeats: 52571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021739	ATA	3	9	258561	258569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021739	TATTT	2	10	258659	258668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021739	CTTT	2	8	258690	258697	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_021739	T	6	6	258695	258700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021739	A	7	7	258704	258710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021739	AGA	2	6	258774	258779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662790
5007	NC_021739	AAG	2	6	258824	258829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662790
5008	NC_021739	GTA	2	6	258851	258856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662790
5009	NC_021739	AAG	2	6	258863	258868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662790
5010	NC_021739	CTTTA	2	10	258895	258904	20 %	60 %	0 %	20 %	525662790
5011	NC_021739	GAT	2	6	258913	258918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662790
5012	NC_021739	A	6	6	259027	259032	100 %	0 %	0 %	0 %	525662790
5013	NC_021739	TGA	2	6	259092	259097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662790
5014	NC_021739	TGA	2	6	259119	259124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662790
5015	NC_021739	AATT	2	8	259142	259149	50 %	50 %	0 %	0 %	525662790
5016	NC_021739	ATT	2	6	259171	259176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662790
5017	NC_021739	ATCT	2	8	259181	259188	25 %	50 %	0 %	25 %	525662790
5018	NC_021739	TGG	2	6	259223	259228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662790
5019	NC_021739	ATT	2	6	259288	259293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662790
5020	NC_021739	TTA	2	6	259332	259337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021739	ATTG	2	8	259422	259429	25 %	50 %	25 %	0 %	525662791
5022	NC_021739	TGC	2	6	259434	259439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662791
5023	NC_021739	A	6	6	259454	259459	100 %	0 %	0 %	0 %	525662791
5024	NC_021739	A	6	6	259471	259476	100 %	0 %	0 %	0 %	525662791
5025	NC_021739	AGC	2	6	259482	259487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662791
5026	NC_021739	GAC	2	6	259533	259538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662791
5027	NC_021739	ACCA	2	8	259551	259558	50 %	0 %	0 %	50 %	525662791
5028	NC_021739	CGGT	2	8	259565	259572	0 %	25 %	50 %	25 %	525662791
5029	NC_021739	A	6	6	259660	259665	100 %	0 %	0 %	0 %	525662791
5030	NC_021739	TAG	2	6	259676	259681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662791
5031	NC_021739	CAG	2	6	259689	259694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662791
5032	NC_021739	CTAC	2	8	259820	259827	25 %	25 %	0 %	50 %	525662791
5033	NC_021739	ATT	2	6	259833	259838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662791
5034	NC_021739	GTGAAT	2	12	259915	259926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662791
5035	NC_021739	TTAA	2	8	260131	260138	50 %	50 %	0 %	0 %	525662791
5036	NC_021739	GAA	2	6	260155	260160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662791
5037	NC_021739	TCG	2	6	260231	260236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662791
5038	NC_021739	TATG	2	8	260262	260269	25 %	50 %	25 %	0 %	525662791
5039	NC_021739	TGC	2	6	260285	260290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662791
5040	NC_021739	TGA	2	6	260301	260306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662791
5041	NC_021739	TAA	2	6	260484	260489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662791
5042	NC_021739	GAGT	2	8	260562	260569	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021739	TTA	2	6	260592	260597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662792
5044	NC_021739	GCAA	2	8	260650	260657	50 %	0 %	25 %	25 %	525662792
5045	NC_021739	AGA	2	6	260773	260778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662792
5046	NC_021739	ATA	2	6	260796	260801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662792
5047	NC_021739	TCA	2	6	260816	260821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662792
5048	NC_021739	TGA	2	6	260941	260946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662792
5049	NC_021739	ATG	2	6	260976	260981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662792
5050	NC_021739	TGA	2	6	261007	261012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662792
5051	NC_021739	GTA	2	6	261050	261055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662792
5052	NC_021739	TAT	2	6	261177	261182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662792
5053	NC_021739	AGA	2	6	261289	261294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662792
5054	NC_021739	ACC	2	6	261308	261313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525662792
5055	NC_021739	GCA	2	6	261377	261382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662792
5056	NC_021739	TGCT	2	8	261414	261421	0 %	50 %	25 %	25 %	525662792
5057	NC_021739	A	6	6	261493	261498	100 %	0 %	0 %	0 %	525662792
5058	NC_021739	AAG	2	6	261564	261569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662792
5059	NC_021739	GTA	2	6	261608	261613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662792
5060	NC_021739	TAT	2	6	261687	261692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662792
5061	NC_021739	AAG	2	6	261813	261818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662792
5062	NC_021739	TATT	2	8	261981	261988	25 %	75 %	0 %	0 %	525662792
5063	NC_021739	GAT	2	6	262018	262023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662792
5064	NC_021739	AAG	2	6	262050	262055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662792
5065	NC_021739	GTG	2	6	262079	262084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662792
5066	NC_021739	GCT	2	6	262110	262115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662792
5067	NC_021739	TAT	2	6	262135	262140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662792
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5069	NC_021739	TGGT	2	8	262251	262258	0 %	50 %	50 %	0 %	525662792
5070	NC_021739	AGC	2	6	262300	262305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662792
5071	NC_021739	ATT	2	6	262400	262405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662792
5072	NC_021739	TGC	2	6	262441	262446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662792
5073	NC_021739	ATG	2	6	262455	262460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662792
5074	NC_021739	A	6	6	262475	262480	100 %	0 %	0 %	0 %	525662792
5075	NC_021739	GTG	2	6	262481	262486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662792
5076	NC_021739	TAC	2	6	262561	262566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662792
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5079	NC_021739	A	6	6	262701	262706	100 %	0 %	0 %	0 %	525662792
5080	NC_021739	GCA	2	6	262729	262734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662792
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5082	NC_021739	TCT	2	6	262940	262945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525662792
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5084	NC_021739	TGG	2	6	262981	262986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662792
5085	NC_021739	GTA	2	6	262988	262993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662792
5086	NC_021739	GTG	2	6	263076	263081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662792
5087	NC_021739	GTTC	2	8	263092	263099	0 %	50 %	25 %	25 %	525662792
5088	NC_021739	AAG	2	6	263100	263105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662792
5089	NC_021739	TATC	2	8	263146	263153	25 %	50 %	0 %	25 %	525662792
5090	NC_021739	CAATT	2	10	263163	263172	40 %	40 %	0 %	20 %	525662792
5091	NC_021739	GTG	2	6	263226	263231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662792
5092	NC_021739	TTG	2	6	263234	263239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662792
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5094	NC_021739	ATG	2	6	263309	263314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662792
5095	NC_021739	TG	3	6	263418	263423	0 %	50 %	50 %	0 %	525662792
5096	NC_021739	AGA	2	6	263434	263439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662792
5097	NC_021739	ATG	2	6	263510	263515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662792
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5099	NC_021739	GGTG	2	8	263560	263567	0 %	25 %	75 %	0 %	525662792
5100	NC_021739	GTATGG	2	12	263589	263600	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525662792
5101	NC_021739	AAG	2	6	263730	263735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662792
5102	NC_021739	T	6	6	263774	263779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021739	T	6	6	263799	263804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021739	A	6	6	263819	263824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021739	T	6	6	263948	263953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021739	AAT	2	6	263958	263963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021739	AAG	2	6	263984	263989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662793
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5109	NC_021739	TTC	2	6	264008	264013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525662793
5110	NC_021739	CTG	2	6	264047	264052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662793
5111	NC_021739	CTG	2	6	264104	264109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662793
5112	NC_021739	AAG	2	6	264155	264160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662793
5113	NC_021739	A	6	6	264226	264231	100 %	0 %	0 %	0 %	525662793
5114	NC_021739	TGAT	2	8	264335	264342	25 %	50 %	25 %	0 %	525662793
5115	NC_021739	ATT	2	6	264364	264369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662793
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5119	NC_021739	GAA	2	6	264658	264663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662793
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5123	NC_021739	GCC	2	6	265021	265026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525662793
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5222	NC_021739	CAGAG	2	10	270237	270246	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5228	NC_021739	TTAT	2	8	270626	270633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5229	NC_021739	AGTA	2	8	270654	270661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5230	NC_021739	AGT	2	6	270711	270716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_021739	AGT	2	6	270755	270760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5236	NC_021739	GA	3	6	271037	271042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5239	NC_021739	ATAG	2	8	271232	271239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_021739	AGA	2	6	271349	271354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5246	NC_021739	CAA	2	6	272015	272020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662798
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5494	NC_021739	GTAAA	2	10	285418	285427	60 %	20 %	20 %	0 %	525662814
5495	NC_021739	AAC	2	6	285567	285572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662814
5496	NC_021739	GTA	3	9	285573	285581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662814
5497	NC_021739	TCG	2	6	285584	285589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662814
5498	NC_021739	TTA	2	6	285726	285731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662814
5499	NC_021739	AAGTG	2	10	285770	285779	40 %	20 %	40 %	0 %	525662814
5500	NC_021739	GACAAA	2	12	285822	285833	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525662814

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