MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii 50594 plasmid 2

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021279	GGATT	2	10	2966	2975	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021279	TGGCG	2	10	5504	5513	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021279	GGCGC	2	10	5944	5953	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_021279	CCCGG	2	10	6700	6709	0 %	0 %	40 %	60 %	507418872
5	NC_021279	TCGGG	2	10	7981	7990	0 %	20 %	60 %	20 %	507418873
6	NC_021279	CCTCG	2	10	8518	8527	0 %	20 %	20 %	60 %	507418873
7	NC_021279	CGGAG	2	10	9099	9108	20 %	0 %	60 %	20 %	507418874
8	NC_021279	GGCCA	2	10	9578	9587	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_021279	TGCAC	2	10	16344	16353	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_021279	CCAGC	2	10	16677	16686	20 %	0 %	20 %	60 %	507418882
11	NC_021279	GTTGT	2	10	18797	18806	0 %	60 %	40 %	0 %	507418883
12	NC_021279	TGGGG	2	10	18910	18919	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021279	GGCAG	2	10	19182	19191	20 %	0 %	60 %	20 %	507418884
14	NC_021279	CCGGT	2	10	20222	20231	0 %	20 %	40 %	40 %	507418884
15	NC_021279	ATGGG	2	10	22121	22130	20 %	20 %	60 %	0 %	507418886
16	NC_021279	GTGTT	2	10	25589	25598	0 %	60 %	40 %	0 %	507418889
17	NC_021279	GAATC	2	10	25965	25974	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021279	GATCC	2	10	26703	26712	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_021279	CCCAG	2	10	30308	30317	20 %	0 %	20 %	60 %	507418892
20	NC_021279	CCAGC	2	10	32593	32602	20 %	0 %	20 %	60 %	507418893
21	NC_021279	GCTGC	2	10	33091	33100	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_021279	TCCCC	2	10	33277	33286	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
23	NC_021279	AAATG	2	10	33552	33561	60 %	20 %	20 %	0 %	507418894
24	NC_021279	GACCT	2	10	33895	33904	20 %	20 %	20 %	40 %	507418894
25	NC_021279	CGCCA	2	10	34005	34014	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_021279	AGCCA	2	10	35476	35485	40 %	0 %	20 %	40 %	507418895
27	NC_021279	GCCCG	2	10	37336	37345	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_021279	CCACG	2	10	37537	37546	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_021279	TGGAA	2	10	37611	37620	40 %	20 %	40 %	0 %	507418897
30	NC_021279	CTGTT	2	10	37883	37892	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021279	GGAAT	2	10	37893	37902	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021279	CGCCC	2	10	40312	40321	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
33	NC_021279	GGCTC	2	10	43428	43437	0 %	20 %	40 %	40 %	507418903
34	NC_021279	GCCTT	2	10	43683	43692	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_021279	CGCTG	2	10	43767	43776	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_021279	TCGGG	2	10	45347	45356	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021279	ACCGC	2	10	45547	45556	20 %	0 %	20 %	60 %	507418904
38	NC_021279	CCGCG	2	10	46544	46553	0 %	0 %	40 %	60 %	507418904
39	NC_021279	AAAGA	2	10	47406	47415	80 %	0 %	20 %	0 %	507418904
40	NC_021279	GATCT	2	10	47691	47700	20 %	40 %	20 %	20 %	507418904
41	NC_021279	CGTCG	2	10	48498	48507	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_021279	CGGGC	2	10	49826	49835	0 %	0 %	60 %	40 %	507418905
43	NC_021279	ACGTG	2	10	49988	49997	20 %	20 %	40 %	20 %	507418905
44	NC_021279	CCCGA	2	10	50762	50771	20 %	0 %	20 %	60 %	507418906
45	NC_021279	GCTGG	2	10	53120	53129	0 %	20 %	60 %	20 %	507418907
46	NC_021279	CGCCA	2	10	55408	55417	20 %	0 %	20 %	60 %	507418908
47	NC_021279	CCGTG	2	10	56177	56186	0 %	20 %	40 %	40 %	507418909
48	NC_021279	ATCGC	2	10	59779	59788	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_021279	TGAGT	2	10	59886	59895	20 %	40 %	40 %	0 %	507418912
50	NC_021279	GCTCG	2	10	60036	60045	0 %	20 %	40 %	40 %	507418912
51	NC_021279	GCGTG	2	10	60130	60139	0 %	20 %	60 %	20 %	507418912
52	NC_021279	GCCCG	2	10	62886	62895	0 %	0 %	40 %	60 %	507418915
53	NC_021279	TCATC	2	10	63871	63880	20 %	40 %	0 %	40 %	507418916
54	NC_021279	GATCA	2	10	64037	64046	40 %	20 %	20 %	20 %	507418916
55	NC_021279	ACTGC	2	10	67443	67452	20 %	20 %	20 %	40 %	507418920
56	NC_021279	CCACG	2	10	69989	69998	20 %	0 %	20 %	60 %	507418921
57	NC_021279	GGGTT	2	10	71621	71630	0 %	40 %	60 %	0 %	507418922
58	NC_021279	CAGCA	2	10	72919	72928	40 %	0 %	20 %	40 %	507418923
59	NC_021279	CTGCC	2	10	73279	73288	0 %	20 %	20 %	60 %	507418923
60	NC_021279	TTGCC	2	10	75036	75045	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_021279	GCTCA	2	10	77466	77475	20 %	20 %	20 %	40 %	507418926
62	NC_021279	CGCAG	2	10	77947	77956	20 %	0 %	40 %	40 %	507418926
63	NC_021279	CTTGC	2	10	81014	81023	0 %	40 %	20 %	40 %	507418931
64	NC_021279	GCTTC	2	10	87016	87025	0 %	40 %	20 %	40 %	507418932
65	NC_021279	CCCGG	2	10	87147	87156	0 %	0 %	40 %	60 %	507418932
66	NC_021279	GCCCG	2	10	89093	89102	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_021279	GCATC	2	10	89615	89624	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_021279	GGCCG	2	10	89826	89835	0 %	0 %	60 %	40 %	507418934
69	NC_021279	GTCCT	2	10	89991	90000	0 %	40 %	20 %	40 %	507418934
70	NC_021279	GTGCC	2	10	92550	92559	0 %	20 %	40 %	40 %	507418938
71	NC_021279	ATTGC	2	10	92721	92730	20 %	40 %	20 %	20 %	507418938
72	NC_021279	CAGGC	2	10	92917	92926	20 %	0 %	40 %	40 %	507418938

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.