MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii 50594 plasmid 2

Total Repeats: 248

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021279	CCCA	2	8	378	385	25 %	0 %	0 %	75 %	507418866
2	NC_021279	ACCC	2	8	966	973	25 %	0 %	0 %	75 %	507418866
3	NC_021279	CACC	2	8	1073	1080	25 %	0 %	0 %	75 %	507418866
4	NC_021279	GCCA	2	8	1264	1271	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021279	GCTT	2	8	1558	1565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021279	CACC	2	8	1691	1698	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_021279	TTCC	2	8	1732	1739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021279	TTCA	2	8	2159	2166	25 %	50 %	0 %	25 %	507418867
9	NC_021279	ATTC	2	8	2459	2466	25 %	50 %	0 %	25 %	507418867
10	NC_021279	CCAA	2	8	2569	2576	50 %	0 %	0 %	50 %	507418867
11	NC_021279	CAGT	2	8	3423	3430	25 %	25 %	25 %	25 %	507418869
12	NC_021279	ACCC	2	8	4411	4418	25 %	0 %	0 %	75 %	507418869
13	NC_021279	CACC	2	8	4518	4525	25 %	0 %	0 %	75 %	507418869
14	NC_021279	CAAC	2	8	4667	4674	50 %	0 %	0 %	50 %	507418870
15	NC_021279	ATCT	2	8	4920	4927	25 %	50 %	0 %	25 %	507418871
16	NC_021279	GCAC	2	8	5002	5009	25 %	0 %	25 %	50 %	507418871
17	NC_021279	TCAG	2	8	5592	5599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021279	TCGG	2	8	5673	5680	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021279	CGAA	2	8	5990	5997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021279	TCGG	2	8	6558	6565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021279	AGAT	2	8	6867	6874	50 %	25 %	25 %	0 %	507418872
22	NC_021279	GCCC	2	8	6958	6965	0 %	0 %	25 %	75 %	507418872
23	NC_021279	GTGG	2	8	7580	7587	0 %	25 %	75 %	0 %	507418872
24	NC_021279	ACGC	2	8	7751	7758	25 %	0 %	25 %	50 %	507418872
25	NC_021279	ATCG	2	8	7926	7933	25 %	25 %	25 %	25 %	507418873
26	NC_021279	GGCC	2	8	8133	8140	0 %	0 %	50 %	50 %	507418873
27	NC_021279	CGGC	2	8	9782	9789	0 %	0 %	50 %	50 %	507418875
28	NC_021279	TCCC	2	8	10389	10396	0 %	25 %	0 %	75 %	507418875
29	NC_021279	CGCC	2	8	10423	10430	0 %	0 %	25 %	75 %	507418875
30	NC_021279	ACGA	2	8	10566	10573	50 %	0 %	25 %	25 %	507418875
31	NC_021279	AGAA	2	8	10652	10659	75 %	0 %	25 %	0 %	507418875
32	NC_021279	CGCC	2	8	11711	11718	0 %	0 %	25 %	75 %	507418876
33	NC_021279	TCGG	2	8	11724	11731	0 %	25 %	50 %	25 %	507418876
34	NC_021279	GCGG	2	8	12272	12279	0 %	0 %	75 %	25 %	507418877
35	NC_021279	GTTC	2	8	13662	13669	0 %	50 %	25 %	25 %	507418879
36	NC_021279	GGGT	2	8	14039	14046	0 %	25 %	75 %	0 %	507418879
37	NC_021279	CTGC	2	8	14073	14080	0 %	25 %	25 %	50 %	507418879
38	NC_021279	ACGC	2	8	14769	14776	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021279	GAAG	2	8	15216	15223	50 %	0 %	50 %	0 %	507418880
40	NC_021279	CCGG	2	8	15372	15379	0 %	0 %	50 %	50 %	507418880
41	NC_021279	TGGT	2	8	15613	15620	0 %	50 %	50 %	0 %	507418880
42	NC_021279	GCGA	2	8	15701	15708	25 %	0 %	50 %	25 %	507418880
43	NC_021279	CCGA	2	8	15819	15826	25 %	0 %	25 %	50 %	507418880
44	NC_021279	CCGG	2	8	16060	16067	0 %	0 %	50 %	50 %	507418881
45	NC_021279	GGCA	2	8	16074	16081	25 %	0 %	50 %	25 %	507418881
46	NC_021279	CCCA	2	8	16909	16916	25 %	0 %	0 %	75 %	507418882
47	NC_021279	ACCG	2	8	16924	16931	25 %	0 %	25 %	50 %	507418882
48	NC_021279	ACCT	2	8	17178	17185	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021279	CCGC	2	8	17272	17279	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_021279	GAAA	2	8	17637	17644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021279	GGGC	2	8	18861	18868	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021279	GGCG	2	8	19008	19015	0 %	0 %	75 %	25 %	507418884
53	NC_021279	GATC	2	8	19881	19888	25 %	25 %	25 %	25 %	507418884
54	NC_021279	CAGC	2	8	19915	19922	25 %	0 %	25 %	50 %	507418884
55	NC_021279	GACC	2	8	20091	20098	25 %	0 %	25 %	50 %	507418884
56	NC_021279	AGCG	2	8	20512	20519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021279	AGCC	2	8	20799	20806	25 %	0 %	25 %	50 %	507418885
58	NC_021279	GGAG	2	8	21280	21287	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021279	ACTC	2	8	21489	21496	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021279	CAAA	2	8	22058	22065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021279	CCGT	2	8	22394	22401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021279	AGTG	2	8	22518	22525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021279	CTGG	2	8	23612	23619	0 %	25 %	50 %	25 %	507418887
64	NC_021279	GGGA	2	8	23642	23649	25 %	0 %	75 %	0 %	507418887
65	NC_021279	TCGA	2	8	23815	23822	25 %	25 %	25 %	25 %	507418887
66	NC_021279	CACG	2	8	23894	23901	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021279	GGTT	2	8	24496	24503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021279	TGAG	2	8	24709	24716	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021279	GTTG	2	8	25016	25023	0 %	50 %	50 %	0 %	507418889
70	NC_021279	AGGC	2	8	25268	25275	25 %	0 %	50 %	25 %	507418889
71	NC_021279	TTGT	2	8	26152	26159	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021279	CAGC	2	8	26212	26219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021279	TGGT	2	8	26352	26359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021279	AACA	2	8	27063	27070	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021279	CCGA	2	8	27148	27155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021279	GAGC	2	8	27418	27425	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021279	TGAC	2	8	28226	28233	25 %	25 %	25 %	25 %	507418890
78	NC_021279	ATGA	2	8	28501	28508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021279	CGCT	2	8	28646	28653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021279	CAGT	2	8	28794	28801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021279	CGAT	2	8	29318	29325	25 %	25 %	25 %	25 %	507418891
82	NC_021279	AGCA	2	8	29587	29594	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021279	GTTC	3	12	29596	29607	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021279	AGGG	2	8	29617	29624	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021279	CCAG	2	8	30237	30244	25 %	0 %	25 %	50 %	507418892
86	NC_021279	GTGG	2	8	30288	30295	0 %	25 %	75 %	0 %	507418892
87	NC_021279	CTCA	2	8	30772	30779	25 %	25 %	0 %	50 %	507418892
88	NC_021279	GCGA	2	8	30796	30803	25 %	0 %	50 %	25 %	507418892
89	NC_021279	GCCA	2	8	31538	31545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021279	CGAC	2	8	32027	32034	25 %	0 %	25 %	50 %	507418893
91	NC_021279	CCCA	2	8	32127	32134	25 %	0 %	0 %	75 %	507418893
92	NC_021279	TCAA	2	8	32171	32178	50 %	25 %	0 %	25 %	507418893
93	NC_021279	GCTC	2	8	32190	32197	0 %	25 %	25 %	50 %	507418893
94	NC_021279	GCCA	2	8	32508	32515	25 %	0 %	25 %	50 %	507418893
95	NC_021279	TTCC	2	8	33041	33048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021279	GGAA	2	8	33263	33270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021279	AAGA	2	8	33444	33451	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021279	TGAG	2	8	34314	34321	25 %	25 %	50 %	0 %	507418895
99	NC_021279	ACGA	2	8	35963	35970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021279	CGAT	2	8	35982	35989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021279	GACC	2	8	37003	37010	25 %	0 %	25 %	50 %	507418896
102	NC_021279	ACGC	2	8	37913	37920	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021279	CGCC	2	8	38162	38169	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_021279	CCAG	2	8	38642	38649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021279	AGGA	2	8	38728	38735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021279	GCCC	2	8	39795	39802	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_021279	GATT	2	8	41374	41381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021279	CACC	2	8	41787	41794	25 %	0 %	0 %	75 %	507418901
109	NC_021279	TCGT	2	8	42417	42424	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021279	GCCA	2	8	42548	42555	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021279	CGAC	2	8	42586	42593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021279	CCGA	2	8	42730	42737	25 %	0 %	25 %	50 %	507418902
113	NC_021279	TACC	2	8	42769	42776	25 %	25 %	0 %	50 %	507418902
114	NC_021279	CTAC	2	8	43458	43465	25 %	25 %	0 %	50 %	507418903
115	NC_021279	GCAA	2	8	43605	43612	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021279	CGAA	2	8	43930	43937	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021279	GCGA	2	8	44119	44126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021279	GTCG	2	8	44748	44755	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021279	CATT	2	8	44868	44875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021279	GCAC	2	8	45395	45402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021279	GCAC	2	8	45881	45888	25 %	0 %	25 %	50 %	507418904
122	NC_021279	GCAC	2	8	46563	46570	25 %	0 %	25 %	50 %	507418904
123	NC_021279	CGAC	2	8	46616	46623	25 %	0 %	25 %	50 %	507418904
124	NC_021279	TCGA	2	8	47721	47728	25 %	25 %	25 %	25 %	507418904
125	NC_021279	ACCG	2	8	47802	47809	25 %	0 %	25 %	50 %	507418904
126	NC_021279	AGCG	2	8	48324	48331	25 %	0 %	50 %	25 %	507418904
127	NC_021279	GTGG	2	8	48869	48876	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021279	CCGG	2	8	49049	49056	0 %	0 %	50 %	50 %	507418905
129	NC_021279	CGAT	2	8	49222	49229	25 %	25 %	25 %	25 %	507418905
130	NC_021279	CAGC	2	8	49409	49416	25 %	0 %	25 %	50 %	507418905
131	NC_021279	TGCG	2	8	49818	49825	0 %	25 %	50 %	25 %	507418905
132	NC_021279	CGGC	2	8	50089	50096	0 %	0 %	50 %	50 %	507418905
133	NC_021279	GCCG	2	8	51425	51432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021279	CGTG	2	8	52126	52133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021279	TAGG	2	8	52160	52167	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021279	CGCC	2	8	52234	52241	0 %	0 %	25 %	75 %	507418907
137	NC_021279	CCGT	2	8	52382	52389	0 %	25 %	25 %	50 %	507418907
138	NC_021279	CAGG	2	8	53549	53556	25 %	0 %	50 %	25 %	507418907
139	NC_021279	ATCG	2	8	53690	53697	25 %	25 %	25 %	25 %	507418907
140	NC_021279	GCCT	2	8	54469	54476	0 %	25 %	25 %	50 %	507418908
141	NC_021279	CACC	2	8	54597	54604	25 %	0 %	0 %	75 %	507418908
142	NC_021279	CCAA	2	8	54631	54638	50 %	0 %	0 %	50 %	507418908
143	NC_021279	GGCG	2	8	55080	55087	0 %	0 %	75 %	25 %	507418908
144	NC_021279	CATC	2	8	55233	55240	25 %	25 %	0 %	50 %	507418908
145	NC_021279	CCGG	2	8	55348	55355	0 %	0 %	50 %	50 %	507418908
146	NC_021279	ACCC	2	8	55709	55716	25 %	0 %	0 %	75 %	507418908
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.