MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021200	CTC	2	6	440905	440910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074788
12502	NC_021200	CAGCGA	2	12	440930	440941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074788
12503	NC_021200	CGC	2	6	440960	440965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074788
12504	NC_021200	CCG	2	6	440992	440997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074788
12505	NC_021200	GGT	2	6	441005	441010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074788
12506	NC_021200	CG	4	8	441047	441054	0 %	0 %	50 %	50 %	499074788
12507	NC_021200	CGC	2	6	441056	441061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074788
12508	NC_021200	CGGG	2	8	441062	441069	0 %	0 %	75 %	25 %	499074788
12509	NC_021200	ATC	2	6	441081	441086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074788
12510	NC_021200	GCC	2	6	441102	441107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074788
12511	NC_021200	CGC	2	6	441136	441141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074788
12512	NC_021200	GCT	2	6	441194	441199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074788
12513	NC_021200	CGG	2	6	441248	441253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074788
12514	NC_021200	CTG	2	6	441270	441275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074788
12515	NC_021200	TCG	2	6	441322	441327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074788
12516	NC_021200	AGG	2	6	441415	441420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_021200	GAG	2	6	441477	441482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074789
12518	NC_021200	CGC	2	6	441539	441544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074789
12519	NC_021200	AGG	2	6	441574	441579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074789
12520	NC_021200	CGG	2	6	441598	441603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074789
12521	NC_021200	GGA	2	6	441626	441631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074789
12522	NC_021200	CGG	2	6	441635	441640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074789
12523	NC_021200	GGC	2	6	441659	441664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074789
12524	NC_021200	GAG	2	6	441678	441683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074789
12525	NC_021200	CAA	2	6	441725	441730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074789
12526	NC_021200	CGA	2	6	441764	441769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074789
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12528	NC_021200	TGC	2	6	441784	441789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074789
12529	NC_021200	GAC	2	6	441891	441896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074789
12530	NC_021200	CGG	2	6	441932	441937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074789
12531	NC_021200	TCG	2	6	441999	442004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074789
12532	NC_021200	GAC	2	6	442020	442025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074789
12533	NC_021200	GAA	2	6	442052	442057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074789
12534	NC_021200	ACC	2	6	442080	442085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074789
12535	NC_021200	ATC	2	6	442125	442130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074789
12536	NC_021200	CCA	2	6	442186	442191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074789
12537	NC_021200	GC	3	6	442222	442227	0 %	0 %	50 %	50 %	499074789
12538	NC_021200	CGC	2	6	442232	442237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074789
12539	NC_021200	CGC	3	9	442358	442366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074789
12540	NC_021200	GCG	2	6	442378	442383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074789
12541	NC_021200	CGG	2	6	442472	442477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074789
12542	NC_021200	GAT	2	6	442511	442516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074789
12543	NC_021200	GTG	2	6	442569	442574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074789
12544	NC_021200	GGTG	2	8	442652	442659	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_021200	CA	3	6	442713	442718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12546	NC_021200	TGCAG	2	10	442748	442757	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12547	NC_021200	GCCG	2	8	442822	442829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12548	NC_021200	GTT	2	6	442861	442866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_021200	GAC	2	6	442874	442879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12550	NC_021200	TGG	2	6	442896	442901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_021200	GTG	2	6	442937	442942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_021200	TGC	2	6	443001	443006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12553	NC_021200	GTG	2	6	443084	443089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_021200	ACG	2	6	443103	443108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12555	NC_021200	GCC	2	6	443132	443137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12556	NC_021200	TGC	2	6	443181	443186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12557	NC_021200	CTG	2	6	443195	443200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_021200	CGC	2	6	443233	443238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12559	NC_021200	GCT	2	6	443278	443283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_021200	GCT	2	6	443293	443298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_021200	GCT	3	9	443308	443316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12562	NC_021200	GAC	2	6	443318	443323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_021200	TCG	2	6	443337	443342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_021200	GCT	2	6	443371	443376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12565	NC_021200	ACG	2	6	443391	443396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12569	NC_021200	TGC	2	6	443557	443562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12570	NC_021200	GCACCG	2	12	443572	443583	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12571	NC_021200	CGC	2	6	443617	443622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12572	NC_021200	TGC	3	9	443665	443673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12574	NC_021200	CCG	2	6	443703	443708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12575	NC_021200	GC	3	6	443729	443734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12580	NC_021200	TCG	2	6	443899	443904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12581	NC_021200	CG	3	6	443941	443946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12582	NC_021200	CCGCG	2	10	444000	444009	0 %	0 %	40 %	60 %	499074790
12583	NC_021200	TGGC	2	8	444044	444051	0 %	25 %	50 %	25 %	499074790
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12599	NC_021200	CCCG	2	8	444648	444655	0 %	0 %	25 %	75 %	499074790
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12621	NC_021200	CAC	2	6	445466	445471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074790
12622	NC_021200	GGC	2	6	445472	445477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074790
12623	NC_021200	CGA	2	6	445549	445554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074790
12624	NC_021200	GCA	2	6	445582	445587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074790
12625	NC_021200	TCG	2	6	445622	445627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074791
12626	NC_021200	GAC	2	6	445630	445635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074791
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12632	NC_021200	CTG	2	6	445780	445785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074791
12633	NC_021200	ACG	2	6	445805	445810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074791
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12635	NC_021200	GCT	2	6	445818	445823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074791
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12641	NC_021200	CGA	2	6	445986	445991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074791
12642	NC_021200	TTC	2	6	445993	445998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074791
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12645	NC_021200	GATT	2	8	446113	446120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12646	NC_021200	TGG	2	6	446127	446132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12647	NC_021200	GAG	2	6	446152	446157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12648	NC_021200	CTG	2	6	446195	446200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074792
12649	NC_021200	GCC	3	9	446201	446209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074792
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12652	NC_021200	GC	3	6	446262	446267	0 %	0 %	50 %	50 %	499074792
12653	NC_021200	GCG	2	6	446277	446282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074792
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12677	NC_021200	AGG	2	6	447301	447306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12678	NC_021200	GCCG	2	8	447328	447335	0 %	0 %	50 %	50 %	499074793
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12860	NC_021200	TGG	2	6	452827	452832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074796
12861	NC_021200	GGCGCG	2	12	452846	452857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074796
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12978	NC_021200	CGA	2	6	456664	456669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074800
12979	NC_021200	GGCG	2	8	456670	456677	0 %	0 %	75 %	25 %	499074800
12980	NC_021200	GGCC	2	8	456694	456701	0 %	0 %	50 %	50 %	499074800
12981	NC_021200	CG	3	6	456712	456717	0 %	0 %	50 %	50 %	499074800
12982	NC_021200	GC	5	10	456723	456732	0 %	0 %	50 %	50 %	499074800
12983	NC_021200	GCT	2	6	456742	456747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074800
12984	NC_021200	CGG	2	6	456772	456777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074800
12985	NC_021200	CCGG	2	8	456785	456792	0 %	0 %	50 %	50 %	499074800
12986	NC_021200	GCA	2	6	456858	456863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074800
12987	NC_021200	GGC	2	6	456889	456894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074800
12988	NC_021200	CGT	2	6	456916	456921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074800
12989	NC_021200	CGG	2	6	456946	456951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074800
12990	NC_021200	TCG	2	6	456966	456971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074800
12991	NC_021200	GGT	2	6	457012	457017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074800
12992	NC_021200	CGA	2	6	457018	457023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074800
12993	NC_021200	GGC	2	6	457057	457062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074800
12994	NC_021200	TGC	2	6	457068	457073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074800
12995	NC_021200	TCG	2	6	457077	457082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074800
12996	NC_021200	CGC	2	6	457111	457116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074800
12997	NC_021200	CG	3	6	457151	457156	0 %	0 %	50 %	50 %	499074800
12998	NC_021200	GCG	2	6	457170	457175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074800
12999	NC_021200	CGGC	2	8	457220	457227	0 %	0 %	50 %	50 %	499074800
13000	NC_021200	CCG	2	6	457266	457271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074800

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