MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_021200	CGA	2	6	424329	424334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074768
12003	NC_021200	TCG	2	6	424349	424354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074768
12004	NC_021200	GCC	2	6	424360	424365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074768
12005	NC_021200	CGG	2	6	424368	424373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074768
12006	NC_021200	CCGGGC	2	12	424381	424392	0 %	0 %	50 %	50 %	499074768
12007	NC_021200	GC	3	6	424445	424450	0 %	0 %	50 %	50 %	499074768
12008	NC_021200	CAC	2	6	424558	424563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074768
12009	NC_021200	GCG	2	6	424582	424587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074768
12010	NC_021200	GTA	2	6	424594	424599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074768
12011	NC_021200	CG	3	6	424642	424647	0 %	0 %	50 %	50 %	499074768
12012	NC_021200	CGG	2	6	424689	424694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074768
12013	NC_021200	CGG	2	6	424800	424805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074768
12014	NC_021200	CGGC	2	8	424867	424874	0 %	0 %	50 %	50 %	499074768
12015	NC_021200	CCG	2	6	424885	424890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12016	NC_021200	TGAG	2	8	424910	424917	25 %	25 %	50 %	0 %	499074769
12017	NC_021200	CGA	2	6	424923	424928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074769
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12019	NC_021200	CGG	2	6	425015	425020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074769
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12021	NC_021200	CTC	2	6	425129	425134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074769
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12120	NC_021200	CGA	2	6	428310	428315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074774
12121	NC_021200	CGACG	2	10	428349	428358	20 %	0 %	40 %	40 %	499074774
12122	NC_021200	TCG	2	6	428363	428368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074774
12123	NC_021200	GAC	2	6	428383	428388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074774
12124	NC_021200	ACG	2	6	428426	428431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074774
12125	NC_021200	TGG	2	6	428432	428437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074774
12126	NC_021200	CGA	2	6	428478	428483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074774
12127	NC_021200	GGC	2	6	428559	428564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074774
12128	NC_021200	CAG	2	6	428568	428573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074774
12129	NC_021200	CGG	2	6	428591	428596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074775
12130	NC_021200	CGAA	2	8	428611	428618	50 %	0 %	25 %	25 %	499074775
12131	NC_021200	TCG	2	6	428701	428706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074775
12132	NC_021200	TGCC	2	8	428712	428719	0 %	25 %	25 %	50 %	499074775
12133	NC_021200	GC	3	6	428736	428741	0 %	0 %	50 %	50 %	499074775
12134	NC_021200	CGA	2	6	428768	428773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074775
12135	NC_021200	GGT	2	6	428810	428815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074775
12136	NC_021200	TCGACG	2	12	428821	428832	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499074775
12137	NC_021200	CAT	2	6	428867	428872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074775
12138	NC_021200	ACA	2	6	428899	428904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074775
12139	NC_021200	CGG	2	6	428925	428930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074775
12140	NC_021200	CCG	2	6	428965	428970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074775
12141	NC_021200	CGACCG	2	12	428998	429009	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499074775
12142	NC_021200	GGT	2	6	429044	429049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074775
12143	NC_021200	ACA	2	6	429076	429081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074775
12144	NC_021200	GCG	3	9	429097	429105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074775
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12146	NC_021200	GC	3	6	429125	429130	0 %	0 %	50 %	50 %	499074775
12147	NC_021200	CGAACG	2	12	429218	429229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074775
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12149	NC_021200	GCT	2	6	429317	429322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074775
12150	NC_021200	TCG	3	9	429376	429384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074776
12151	NC_021200	CGC	2	6	429391	429396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074776
12152	NC_021200	CAG	2	6	429402	429407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074776
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12155	NC_021200	ACG	2	6	429500	429505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074776
12156	NC_021200	GCC	2	6	429511	429516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074776
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12161	NC_021200	TGC	2	6	429730	429735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074776
12162	NC_021200	CGG	2	6	429817	429822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12163	NC_021200	GCCT	2	8	429837	429844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12164	NC_021200	GGC	2	6	429866	429871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12165	NC_021200	TC	3	6	429937	429942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12166	NC_021200	GGC	2	6	429988	429993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074777
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12188	NC_021200	CCGGG	2	10	430668	430677	0 %	0 %	60 %	40 %	499074777
12189	NC_021200	CG	3	6	430737	430742	0 %	0 %	50 %	50 %	499074777
12190	NC_021200	CTG	2	6	430792	430797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074777
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12193	NC_021200	GTA	2	6	430921	430926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074777
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12219	NC_021200	TGC	2	6	431782	431787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12220	NC_021200	TAC	2	6	431811	431816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12229	NC_021200	CAG	3	9	432214	432222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074778
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12231	NC_021200	CGC	2	6	432297	432302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12232	NC_021200	CCG	2	6	432313	432318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074779
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12239	NC_021200	CG	3	6	432524	432529	0 %	0 %	50 %	50 %	499074779
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12331	NC_021200	CACC	2	8	435751	435758	25 %	0 %	0 %	75 %	499074782
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12337	NC_021200	GCG	2	6	435889	435894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12338	NC_021200	TGG	2	6	435951	435956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074783
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12345	NC_021200	CGA	2	6	436119	436124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074783
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12348	NC_021200	GCG	2	6	436205	436210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074783
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12354	NC_021200	ACT	2	6	436424	436429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074783
12355	NC_021200	GCGAC	2	10	436497	436506	20 %	0 %	40 %	40 %	499074783
12356	NC_021200	GGT	2	6	436542	436547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074783
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12358	NC_021200	CGG	2	6	436566	436571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074783
12359	NC_021200	GCGCC	2	10	436575	436584	0 %	0 %	40 %	60 %	499074783
12360	NC_021200	TGC	2	6	436604	436609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074783
12361	NC_021200	GCC	2	6	436612	436617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074783
12362	NC_021200	GCGCC	2	10	436644	436653	0 %	0 %	40 %	60 %	499074783
12363	NC_021200	GGC	2	6	436687	436692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074783
12364	NC_021200	CTG	2	6	436750	436755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074783
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12367	NC_021200	GCCG	2	8	436888	436895	0 %	0 %	50 %	50 %	499074783
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12423	NC_021200	CCCG	2	8	438314	438321	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12424	NC_021200	CGG	2	6	438342	438347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12432	NC_021200	TCG	2	6	438558	438563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074785
12433	NC_021200	GCTG	2	8	438564	438571	0 %	25 %	50 %	25 %	499074785
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12461	NC_021200	CGG	2	6	439565	439570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12464	NC_021200	ATG	2	6	439609	439614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074787
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12478	NC_021200	CGG	2	6	440077	440082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074787
12479	NC_021200	CGG	2	6	440085	440090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074787
12480	NC_021200	GGT	3	9	440094	440102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074787
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12482	NC_021200	ACG	2	6	440123	440128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074787
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