MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021200	ACG	2	6	408438	408443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074755
11502	NC_021200	CA	3	6	408449	408454	50 %	0 %	0 %	50 %	499074755
11503	NC_021200	CG	3	6	408463	408468	0 %	0 %	50 %	50 %	499074755
11504	NC_021200	CCG	2	6	408471	408476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074755
11505	NC_021200	GTG	3	9	408488	408496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074755
11506	NC_021200	GGT	2	6	408511	408516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074755
11507	NC_021200	CTG	2	6	408521	408526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074755
11508	NC_021200	GGGTGC	2	12	408549	408560	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	499074755
11509	NC_021200	TGG	2	6	408603	408608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074755
11510	NC_021200	CGA	2	6	408631	408636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074755
11511	NC_021200	AGC	2	6	408654	408659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074755
11512	NC_021200	GTG	3	9	408698	408706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074755
11513	NC_021200	CG	3	6	408708	408713	0 %	0 %	50 %	50 %	499074755
11514	NC_021200	ATC	2	6	408737	408742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074755
11515	NC_021200	ATC	2	6	408794	408799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074755
11516	NC_021200	ACC	2	6	408803	408808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074755
11517	NC_021200	CCA	2	6	408846	408851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074755
11518	NC_021200	GCT	2	6	408949	408954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074755
11519	NC_021200	TGG	2	6	409023	409028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074755
11520	NC_021200	CGG	2	6	409036	409041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074755
11521	NC_021200	ACC	2	6	409049	409054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074755
11522	NC_021200	TGC	2	6	409084	409089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074755
11523	NC_021200	ATTC	2	8	409096	409103	25 %	50 %	0 %	25 %	499074755
11524	NC_021200	CTG	2	6	409142	409147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074755
11525	NC_021200	GC	3	6	409164	409169	0 %	0 %	50 %	50 %	499074755
11526	NC_021200	ATCA	2	8	409172	409179	50 %	25 %	0 %	25 %	499074755
11527	NC_021200	CTG	2	6	409232	409237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074755
11528	NC_021200	GCTGGC	2	12	409267	409278	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499074755
11529	NC_021200	CCG	2	6	409356	409361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074755
11530	NC_021200	GGA	2	6	409378	409383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074755
11531	NC_021200	CCG	2	6	409393	409398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074755
11532	NC_021200	CGGC	2	8	409485	409492	0 %	0 %	50 %	50 %	499074755
11533	NC_021200	CGA	2	6	409561	409566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074755
11534	NC_021200	CGA	2	6	409576	409581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074755
11535	NC_021200	GC	3	6	409585	409590	0 %	0 %	50 %	50 %	499074755
11536	NC_021200	GC	3	6	409593	409598	0 %	0 %	50 %	50 %	499074755
11537	NC_021200	GC	4	8	409604	409611	0 %	0 %	50 %	50 %	499074755
11538	NC_021200	CCCG	2	8	409678	409685	0 %	0 %	25 %	75 %	499074756
11539	NC_021200	GCG	2	6	409697	409702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074756
11540	NC_021200	GCC	2	6	409762	409767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074756
11541	NC_021200	CCG	2	6	409778	409783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074756
11542	NC_021200	GGT	2	6	409791	409796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074756
11543	NC_021200	CGA	2	6	409797	409802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074756
11544	NC_021200	GCCG	2	8	409815	409822	0 %	0 %	50 %	50 %	499074756
11545	NC_021200	GT	3	6	409829	409834	0 %	50 %	50 %	0 %	499074756
11546	NC_021200	CGA	2	6	409854	409859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074756
11547	NC_021200	GGT	3	9	409860	409868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074756
11548	NC_021200	TGC	2	6	409886	409891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074756
11549	NC_021200	CGA	3	9	409896	409904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074756
11550	NC_021200	TCG	4	12	409907	409918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074756
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11552	NC_021200	CG	3	6	409946	409951	0 %	0 %	50 %	50 %	499074756
11553	NC_021200	CCG	2	6	410042	410047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074756
11554	NC_021200	TGC	2	6	410051	410056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074756
11555	NC_021200	CG	3	6	410064	410069	0 %	0 %	50 %	50 %	499074756
11556	NC_021200	GCG	2	6	410081	410086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074756
11557	NC_021200	TGG	2	6	410114	410119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074756
11558	NC_021200	GCC	2	6	410140	410145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074756
11559	NC_021200	GGCC	2	8	410178	410185	0 %	0 %	50 %	50 %	499074756
11560	NC_021200	GCC	2	6	410232	410237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074756
11561	NC_021200	TGT	2	6	410261	410266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074756
11562	NC_021200	ATC	2	6	410350	410355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074756
11563	NC_021200	CAT	2	6	410376	410381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074756
11564	NC_021200	GCCG	2	8	410388	410395	0 %	0 %	50 %	50 %	499074756
11565	NC_021200	GCT	2	6	410418	410423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074756
11566	NC_021200	CGA	2	6	410442	410447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074756
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11568	NC_021200	CGA	2	6	410493	410498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074756
11569	NC_021200	GC	3	6	410521	410526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11570	NC_021200	TGG	2	6	410542	410547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_021200	ACG	2	6	410585	410590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074757
11572	NC_021200	GCT	2	6	410601	410606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074757
11573	NC_021200	GCT	2	6	410625	410630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074757
11574	NC_021200	CTG	2	6	410653	410658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074757
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11577	NC_021200	ATG	2	6	410731	410736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074757
11578	NC_021200	CTG	2	6	410767	410772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074757
11579	NC_021200	CGA	2	6	410798	410803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074757
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11585	NC_021200	CTGC	2	8	410949	410956	0 %	25 %	25 %	50 %	499074757
11586	NC_021200	CGG	2	6	411039	411044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11587	NC_021200	CGC	2	6	411051	411056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11588	NC_021200	CGC	3	9	411060	411068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11589	NC_021200	GCC	2	6	411073	411078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11590	NC_021200	TCG	2	6	411083	411088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_021200	GAG	2	6	411100	411105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_021200	GACC	2	8	411126	411133	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11593	NC_021200	CGCTG	2	10	411137	411146	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11594	NC_021200	ACCC	2	8	411154	411161	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11595	NC_021200	GCACG	2	10	411164	411173	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11596	NC_021200	GGCAC	2	10	411219	411228	20 %	0 %	40 %	40 %	499074758
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11599	NC_021200	CTG	3	9	411248	411256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074758
11600	NC_021200	GCC	2	6	411257	411262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074758
11601	NC_021200	CGC	2	6	411271	411276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074758
11602	NC_021200	CCG	2	6	411281	411286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074758
11603	NC_021200	CGG	2	6	411307	411312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074758
11604	NC_021200	CCCG	2	8	411481	411488	0 %	0 %	25 %	75 %	499074758
11605	NC_021200	GCG	2	6	411524	411529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_021200	CCG	2	6	411531	411536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11607	NC_021200	GGGA	2	8	411620	411627	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_021200	C	6	6	411749	411754	0 %	0 %	0 %	100 %	499074759
11609	NC_021200	CCGGG	2	10	411780	411789	0 %	0 %	60 %	40 %	499074759
11610	NC_021200	GCC	4	12	411809	411820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074759
11611	NC_021200	GTC	2	6	411877	411882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074759
11612	NC_021200	GGCGAT	2	12	411910	411921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	499074759
11613	NC_021200	CTG	2	6	411944	411949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074759
11614	NC_021200	GCA	2	6	411967	411972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074759
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11617	NC_021200	GTCG	2	8	412048	412055	0 %	25 %	50 %	25 %	499074759
11618	NC_021200	CCA	2	6	412092	412097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074759
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11620	NC_021200	CCGAGA	2	12	412128	412139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074759
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11979	NC_021200	GCC	2	6	423866	423871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074768
11980	NC_021200	AGT	2	6	423894	423899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074768
11981	NC_021200	GTC	2	6	423919	423924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074768
11982	NC_021200	GGC	2	6	423925	423930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074768
11983	NC_021200	CGT	2	6	423939	423944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074768
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