MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021200	GTT	2	6	357379	357384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074711
10003	NC_021200	GAG	2	6	357389	357394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074711
10004	NC_021200	GGCC	2	8	357425	357432	0 %	0 %	50 %	50 %	499074711
10005	NC_021200	AGC	2	6	357538	357543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074711
10006	NC_021200	CGG	2	6	357561	357566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074711
10007	NC_021200	CGA	2	6	357579	357584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074711
10008	NC_021200	GGC	2	6	357597	357602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074711
10009	NC_021200	GGC	2	6	357610	357615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074711
10010	NC_021200	GGT	2	6	357655	357660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074711
10011	NC_021200	CGG	2	6	357692	357697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074711
10012	NC_021200	CGA	2	6	357718	357723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074711
10013	NC_021200	CGC	2	6	357760	357765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074711
10014	NC_021200	CGA	2	6	357770	357775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074711
10015	NC_021200	ACG	2	6	357837	357842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074711
10016	NC_021200	GGA	2	6	357868	357873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074711
10017	NC_021200	TGG	2	6	357894	357899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074711
10018	NC_021200	CGC	2	6	357957	357962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074711
10019	NC_021200	GCT	2	6	357965	357970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074711
10020	NC_021200	GTT	2	6	357982	357987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074711
10021	NC_021200	GCA	2	6	358060	358065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074711
10022	NC_021200	CCG	2	6	358132	358137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074711
10023	NC_021200	ATC	2	6	358184	358189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074711
10024	NC_021200	GCG	2	6	358215	358220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074711
10025	NC_021200	CGT	2	6	358237	358242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074711
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10027	NC_021200	GCC	2	6	358314	358319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074711
10028	NC_021200	GGC	2	6	358322	358327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074711
10029	NC_021200	ACCGCT	2	12	358361	358372	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499074711
10030	NC_021200	CGA	2	6	358403	358408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074711
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10032	NC_021200	ATT	2	6	358580	358585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499074711
10033	NC_021200	GC	3	6	358586	358591	0 %	0 %	50 %	50 %	499074711
10034	NC_021200	TCGCG	2	10	358595	358604	0 %	20 %	40 %	40 %	499074711
10035	NC_021200	TGG	2	6	358651	358656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074711
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10039	NC_021200	GCT	2	6	358766	358771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074711
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10045	NC_021200	CGC	2	6	358921	358926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_021200	CGCCC	2	10	358941	358950	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10047	NC_021200	A	6	6	358952	358957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10052	NC_021200	CCAG	2	8	359180	359187	25 %	0 %	25 %	50 %	499074712
10053	NC_021200	GGTG	2	8	359210	359217	0 %	25 %	75 %	0 %	499074712
10054	NC_021200	GCC	2	6	359229	359234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074712
10055	NC_021200	CAT	2	6	359250	359255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074712
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10065	NC_021200	CGG	2	6	359406	359411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074712
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10072	NC_021200	GCCG	2	8	359643	359650	0 %	0 %	50 %	50 %	499074712
10073	NC_021200	GC	3	6	359696	359701	0 %	0 %	50 %	50 %	499074712
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10080	NC_021200	CG	3	6	359845	359850	0 %	0 %	50 %	50 %	499074712
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10091	NC_021200	GCA	2	6	360089	360094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074712
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10120	NC_021200	GCG	3	9	360983	360991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074712
10121	NC_021200	CG	3	6	361010	361015	0 %	0 %	50 %	50 %	499074712
10122	NC_021200	CGG	2	6	361026	361031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074712
10123	NC_021200	GCGCT	2	10	361036	361045	0 %	20 %	40 %	40 %	499074712
10124	NC_021200	CGG	2	6	361074	361079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074712
10125	NC_021200	GCG	3	9	361106	361114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074712
10126	NC_021200	CCG	2	6	361214	361219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074712
10127	NC_021200	GCCG	2	8	361226	361233	0 %	0 %	50 %	50 %	499074712
10128	NC_021200	GTT	2	6	361257	361262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074712
10129	NC_021200	CCGC	2	8	361268	361275	0 %	0 %	25 %	75 %	499074712
10130	NC_021200	GCA	3	9	361295	361303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074712
10131	NC_021200	GC	3	6	361345	361350	0 %	0 %	50 %	50 %	499074712
10132	NC_021200	CGA	2	6	361361	361366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074712
10133	NC_021200	TCA	2	6	361442	361447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10134	NC_021200	CGGC	4	16	361466	361481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10135	NC_021200	CAG	2	6	361534	361539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074713
10136	NC_021200	TGC	2	6	361580	361585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074713
10137	NC_021200	TGG	2	6	361599	361604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074713
10138	NC_021200	CTTGAC	2	12	361612	361623	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	499074713
10139	NC_021200	TCGA	2	8	361637	361644	25 %	25 %	25 %	25 %	499074713
10140	NC_021200	GCCAG	2	10	361683	361692	20 %	0 %	40 %	40 %	499074713
10141	NC_021200	ACC	2	6	361763	361768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074713
10142	NC_021200	AGC	2	6	361769	361774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074713
10143	NC_021200	CAG	3	9	361810	361818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074713
10144	NC_021200	GAA	2	6	361885	361890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074713
10145	NC_021200	GC	3	6	361908	361913	0 %	0 %	50 %	50 %	499074713
10146	NC_021200	GAT	2	6	361930	361935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074713
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10149	NC_021200	GGT	2	6	362002	362007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074713
10150	NC_021200	TCG	2	6	362029	362034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074713
10151	NC_021200	CAG	2	6	362104	362109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074713
10152	NC_021200	ATG	2	6	362114	362119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074713
10153	NC_021200	GCA	2	6	362217	362222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074713
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10157	NC_021200	TCG	2	6	362283	362288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074713
10158	NC_021200	GCC	2	6	362295	362300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074713
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10226	NC_021200	CAGCG	2	10	364484	364493	20 %	0 %	40 %	40 %	499074714
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10231	NC_021200	CCT	2	6	364707	364712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074714
10232	NC_021200	CCGC	2	8	364719	364726	0 %	0 %	25 %	75 %	499074714
10233	NC_021200	CCG	2	6	364778	364783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074714
10234	NC_021200	TCG	2	6	364787	364792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074714
10235	NC_021200	GAAC	2	8	364819	364826	50 %	0 %	25 %	25 %	499074714
10236	NC_021200	CG	3	6	364889	364894	0 %	0 %	50 %	50 %	499074714
10237	NC_021200	GCG	2	6	364907	364912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074714
10238	NC_021200	TCG	2	6	364919	364924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074714
10239	NC_021200	GTC	2	6	364927	364932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074714
10240	NC_021200	CTT	2	6	364942	364947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074714
10241	NC_021200	GAA	2	6	364972	364977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074714
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10244	NC_021200	GC	3	6	365046	365051	0 %	0 %	50 %	50 %	499074714
10245	NC_021200	CCG	2	6	365055	365060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074714
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10259	NC_021200	CGA	2	6	365495	365500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074715
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10262	NC_021200	CCG	2	6	365596	365601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074715
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10270	NC_021200	GCT	3	9	365897	365905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074715
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10476	NC_021200	ATC	2	6	373523	373528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074723
10477	NC_021200	GAT	2	6	373645	373650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074723
10478	NC_021200	CGG	2	6	373657	373662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074723
10479	NC_021200	GGC	2	6	373683	373688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074723
10480	NC_021200	ATC	2	6	373745	373750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074723
10481	NC_021200	GCA	2	6	373822	373827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074723
10482	NC_021200	TCG	2	6	373890	373895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074723
10483	NC_021200	CTG	2	6	373916	373921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074723
10484	NC_021200	CGA	2	6	373969	373974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074723
10485	NC_021200	CGG	2	6	374031	374036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074723
10486	NC_021200	CTGG	2	8	374041	374048	0 %	25 %	50 %	25 %	499074723
10487	NC_021200	AAG	2	6	374081	374086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074723
10488	NC_021200	GACC	2	8	374233	374240	25 %	0 %	25 %	50 %	499074723
10489	NC_021200	CGG	3	9	374302	374310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074723
10490	NC_021200	CGG	2	6	374329	374334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074723
10491	NC_021200	TCG	2	6	374361	374366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074723
10492	NC_021200	GCT	2	6	374464	374469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074723
10493	NC_021200	GCC	2	6	374486	374491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074723
10494	NC_021200	AAC	2	6	374510	374515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074723
10495	NC_021200	CGC	2	6	374596	374601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074723
10496	NC_021200	ACG	4	12	374607	374618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074723
10497	NC_021200	CGC	2	6	374635	374640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074723
10498	NC_021200	CGT	2	6	374649	374654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074723
10499	NC_021200	AGC	2	6	374667	374672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074723
10500	NC_021200	TCG	2	6	374676	374681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074723

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