MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021200	CCTG	2	8	19707	19714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
502	NC_021200	TCGC	2	8	19778	19785	0 %	25 %	25 %	50 %	499074430
503	NC_021200	TGG	2	6	19799	19804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074430
504	NC_021200	GAC	2	6	19833	19838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074430
505	NC_021200	AAGT	2	8	19877	19884	50 %	25 %	25 %	0 %	499074430
506	NC_021200	CGG	2	6	19895	19900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074430
507	NC_021200	GTT	2	6	19905	19910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074430
508	NC_021200	CGA	2	6	19949	19954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074430
509	NC_021200	CCG	2	6	19994	19999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074430
510	NC_021200	TCGAT	2	10	20030	20039	20 %	40 %	20 %	20 %	499074430
511	NC_021200	GTC	2	6	20040	20045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074430
512	NC_021200	GAT	2	6	20094	20099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074430
513	NC_021200	AAT	2	6	20101	20106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499074430
514	NC_021200	GAA	3	9	20115	20123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074430
515	NC_021200	GCCG	2	8	20163	20170	0 %	0 %	50 %	50 %	499074430
516	NC_021200	CCG	2	6	20231	20236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074430
517	NC_021200	CGA	2	6	20306	20311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074430
518	NC_021200	GAC	2	6	20418	20423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074430
519	NC_021200	CGC	2	6	20539	20544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074430
520	NC_021200	CGC	2	6	20637	20642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074430
521	NC_021200	GCC	2	6	20665	20670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074430
522	NC_021200	TTG	2	6	20686	20691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074430
523	NC_021200	CATC	2	8	20703	20710	25 %	25 %	0 %	50 %	499074430
524	NC_021200	AAG	2	6	20725	20730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074430
525	NC_021200	CGG	2	6	20841	20846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074430
526	NC_021200	AGT	2	6	20870	20875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074430
527	NC_021200	AGA	2	6	20902	20907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074430
528	NC_021200	CGG	2	6	20938	20943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074430
529	NC_021200	TCGATC	2	12	21031	21042	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	499074430
530	NC_021200	CGA	2	6	21095	21100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074430
531	NC_021200	TGA	2	6	21102	21107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074430
532	NC_021200	GAG	2	6	21114	21119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074430
533	NC_021200	GCC	2	6	21171	21176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074430
534	NC_021200	AGG	2	6	21180	21185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074430
535	NC_021200	GCG	2	6	21232	21237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074430
536	NC_021200	CG	3	6	21270	21275	0 %	0 %	50 %	50 %	499074430
537	NC_021200	CGC	2	6	21278	21283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074430
538	NC_021200	CAA	2	6	21386	21391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074430
539	NC_021200	GCG	2	6	21400	21405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074430
540	NC_021200	GC	3	6	21424	21429	0 %	0 %	50 %	50 %	499074430
541	NC_021200	GCA	2	6	21434	21439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074430
542	NC_021200	AGA	2	6	21450	21455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074430
543	NC_021200	GCG	2	6	21495	21500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_021200	GGC	2	6	21560	21565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_021200	CAG	2	6	21665	21670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074431
546	NC_021200	GCA	2	6	21703	21708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074431
547	NC_021200	CTGG	2	8	21710	21717	0 %	25 %	50 %	25 %	499074431
548	NC_021200	TGC	2	6	21735	21740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074431
549	NC_021200	CCA	2	6	21743	21748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074431
550	NC_021200	CAT	2	6	21782	21787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074431
551	NC_021200	TGG	2	6	21832	21837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074431
552	NC_021200	GGC	2	6	21890	21895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074431
553	NC_021200	CAC	2	6	21917	21922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074431
554	NC_021200	GAT	2	6	21947	21952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074431
555	NC_021200	CGG	2	6	21967	21972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074431
556	NC_021200	TCC	2	6	21978	21983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074431
557	NC_021200	CAG	3	9	21998	22006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074431
558	NC_021200	GAT	2	6	22079	22084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074431
559	NC_021200	TGA	2	6	22177	22182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074431
560	NC_021200	ATG	2	6	22188	22193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074431
561	NC_021200	GCC	2	6	22209	22214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074431
562	NC_021200	ATC	2	6	22227	22232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074431
563	NC_021200	GAT	2	6	22400	22405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074431
564	NC_021200	CGG	2	6	22481	22486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074431
565	NC_021200	GTC	2	6	22499	22504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074431
566	NC_021200	TTC	2	6	22506	22511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074431
567	NC_021200	TCA	2	6	22552	22557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074431
568	NC_021200	CGA	2	6	22577	22582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074431
569	NC_021200	CAT	2	6	22604	22609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074431
570	NC_021200	TCG	2	6	22618	22623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074431
571	NC_021200	ATC	2	6	22635	22640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074431
572	NC_021200	GGC	2	6	22641	22646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074431
573	NC_021200	CAG	2	6	22767	22772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074431
574	NC_021200	TCGG	2	8	22819	22826	0 %	25 %	50 %	25 %	499074431
575	NC_021200	AAG	2	6	22827	22832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074431
576	NC_021200	TGT	2	6	22849	22854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074431
577	NC_021200	GT	3	6	22886	22891	0 %	50 %	50 %	0 %	499074431
578	NC_021200	GT	3	6	22907	22912	0 %	50 %	50 %	0 %	499074431
579	NC_021200	TGT	2	6	22936	22941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074431
580	NC_021200	CTG	2	6	22967	22972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074431
581	NC_021200	CTG	2	6	22985	22990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074431
582	NC_021200	GCT	2	6	23008	23013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074431
583	NC_021200	CG	3	6	23119	23124	0 %	0 %	50 %	50 %	499074431
584	NC_021200	CCAGCA	2	12	23164	23175	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	499074431
585	NC_021200	CCG	2	6	23179	23184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074431
586	NC_021200	CGG	2	6	23257	23262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074431
587	NC_021200	CGT	2	6	23263	23268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074431
588	NC_021200	CAA	2	6	23350	23355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074431
589	NC_021200	GCGACC	2	12	23358	23369	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499074431
590	NC_021200	CGC	2	6	23418	23423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074431
591	NC_021200	GCG	2	6	23508	23513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074431
592	NC_021200	CGA	2	6	23521	23526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074431
593	NC_021200	GTA	2	6	23657	23662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074431
594	NC_021200	CG	3	6	23689	23694	0 %	0 %	50 %	50 %	499074431
595	NC_021200	CTT	2	6	23695	23700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074431
596	NC_021200	GCCG	2	8	23735	23742	0 %	0 %	50 %	50 %	499074431
597	NC_021200	CAG	2	6	23750	23755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074431
598	NC_021200	CAG	2	6	23759	23764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074431
599	NC_021200	ATG	2	6	23790	23795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074431
600	NC_021200	AGA	2	6	23808	23813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074431
601	NC_021200	CGC	2	6	23828	23833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074431
602	NC_021200	CAT	2	6	23852	23857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074431
603	NC_021200	CAG	2	6	23897	23902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074431
604	NC_021200	GAT	2	6	23909	23914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074431
605	NC_021200	ATC	2	6	23928	23933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074431
606	NC_021200	C	6	6	23947	23952	0 %	0 %	0 %	100 %	499074431
607	NC_021200	CAG	2	6	23978	23983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074431
608	NC_021200	CGG	2	6	24017	24022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074431
609	NC_021200	GGC	2	6	24116	24121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074431
610	NC_021200	GGT	2	6	24259	24264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074431
611	NC_021200	ATC	2	6	24279	24284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074431
612	NC_021200	CGCTGT	2	12	24289	24300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074431
613	NC_021200	GC	3	6	24324	24329	0 %	0 %	50 %	50 %	499074431
614	NC_021200	CGA	3	9	24424	24432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074431
615	NC_021200	ACG	2	6	24450	24455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074431
616	NC_021200	CG	3	6	24476	24481	0 %	0 %	50 %	50 %	499074431
617	NC_021200	G	6	6	24500	24505	0 %	0 %	100 %	0 %	499074431
618	NC_021200	GC	3	6	24557	24562	0 %	0 %	50 %	50 %	499074432
619	NC_021200	CAC	2	6	24589	24594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074432
620	NC_021200	GAT	2	6	24604	24609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074432
621	NC_021200	CTGC	2	8	24633	24640	0 %	25 %	25 %	50 %	499074432
622	NC_021200	CGT	2	6	24670	24675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074432
623	NC_021200	CGG	2	6	24766	24771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074432
624	NC_021200	ACC	2	6	24788	24793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074432
625	NC_021200	GTC	2	6	24817	24822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074432
626	NC_021200	GCT	2	6	24832	24837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074432
627	NC_021200	GTC	2	6	24847	24852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074432
628	NC_021200	GGC	2	6	24865	24870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074432
629	NC_021200	CTT	2	6	24937	24942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074432
630	NC_021200	CGA	2	6	24996	25001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_021200	GCT	2	6	25119	25124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074433
632	NC_021200	TCG	2	6	25145	25150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074433
633	NC_021200	GCA	2	6	25299	25304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074433
634	NC_021200	CTG	2	6	25348	25353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074433
635	NC_021200	CTT	2	6	25399	25404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074433
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639	NC_021200	GAC	2	6	25552	25557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074433
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641	NC_021200	GCC	2	6	25654	25659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074433
642	NC_021200	GAG	2	6	25681	25686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074433
643	NC_021200	GACC	2	8	25695	25702	25 %	0 %	25 %	50 %	499074433
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649	NC_021200	GTT	2	6	25975	25980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
650	NC_021200	TGC	2	6	25987	25992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_021200	GGGT	2	8	25998	26005	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
652	NC_021200	GCC	2	6	26058	26063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
653	NC_021200	GCCT	2	8	26066	26073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
654	NC_021200	GCT	2	6	26113	26118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
655	NC_021200	CGGTG	2	10	26257	26266	0 %	20 %	60 %	20 %	499074434
656	NC_021200	ACG	2	6	26289	26294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074434
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659	NC_021200	GCG	2	6	26378	26383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074434
660	NC_021200	TTG	3	9	26384	26392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074434
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664	NC_021200	CGA	2	6	26560	26565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074434
665	NC_021200	CCGCAC	2	12	26623	26634	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	499074434
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674	NC_021200	GCC	2	6	27047	27052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074434
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680	NC_021200	CTA	2	6	27241	27246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074434
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682	NC_021200	CTT	2	6	27392	27397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
683	NC_021200	ACA	2	6	27455	27460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
684	NC_021200	AGG	2	6	27513	27518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
685	NC_021200	GTG	2	6	27534	27539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074435
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703	NC_021200	GCC	2	6	28199	28204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074435
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720	NC_021200	AGG	2	6	28803	28808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
721	NC_021200	GCT	2	6	28905	28910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
722	NC_021200	CCT	2	6	28962	28967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
723	NC_021200	TGCC	2	8	29103	29110	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
724	NC_021200	CGC	2	6	29118	29123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
725	NC_021200	TCG	2	6	29568	29573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074436
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730	NC_021200	GAC	2	6	29937	29942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074437
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732	NC_021200	ATGG	2	8	30075	30082	25 %	25 %	50 %	0 %	499074437
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736	NC_021200	CCG	2	6	30162	30167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074437
737	NC_021200	GCA	2	6	30241	30246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074437
738	NC_021200	CGA	2	6	30353	30358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074437
739	NC_021200	CGA	2	6	30396	30401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074437
740	NC_021200	GAT	2	6	30405	30410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074437
741	NC_021200	TCG	2	6	30469	30474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074437
742	NC_021200	AGC	2	6	30475	30480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074437
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744	NC_021200	GGC	2	6	30533	30538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074437
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746	NC_021200	TCGGT	2	10	30608	30617	0 %	40 %	40 %	20 %	499074437
747	NC_021200	GC	3	6	30768	30773	0 %	0 %	50 %	50 %	499074438
748	NC_021200	CGAT	2	8	30781	30788	25 %	25 %	25 %	25 %	499074438
749	NC_021200	GGC	2	6	30803	30808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074438
750	NC_021200	CCGTCG	2	12	30844	30855	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	499074438
751	NC_021200	CAA	2	6	31007	31012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074438
752	NC_021200	CAG	2	6	31058	31063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074438
753	NC_021200	CCGG	2	8	31091	31098	0 %	0 %	50 %	50 %	499074438
754	NC_021200	CGA	2	6	31099	31104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074438
755	NC_021200	CCGGG	2	10	31136	31145	0 %	0 %	60 %	40 %	499074438
756	NC_021200	CGA	2	6	31156	31161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074438
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758	NC_021200	CGC	2	6	31393	31398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074438
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761	NC_021200	CG	3	6	31477	31482	0 %	0 %	50 %	50 %	499074438
762	NC_021200	CGG	2	6	31534	31539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074438
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769	NC_021200	GC	3	6	31698	31703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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794	NC_021200	TCC	2	6	32918	32923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
795	NC_021200	CGC	2	6	32949	32954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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823	NC_021200	TGG	2	6	34095	34100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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825	NC_021200	GC	3	6	34200	34205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
826	NC_021200	TGC	2	6	34232	34237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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868	NC_021200	CAT	2	6	36217	36222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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875	NC_021200	GGC	2	6	36457	36462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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878	NC_021200	G	6	6	36730	36735	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
879	NC_021200	CG	3	6	36814	36819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
880	NC_021200	CGG	2	6	36831	36836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
881	NC_021200	CAG	2	6	36904	36909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
882	NC_021200	GAG	2	6	36915	36920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
883	NC_021200	CAA	2	6	36952	36957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
884	NC_021200	ACG	2	6	37010	37015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
885	NC_021200	GTC	3	9	37033	37041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
886	NC_021200	CGC	2	6	37071	37076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
887	NC_021200	GGT	2	6	37078	37083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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