MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021200	CG	3	6	322273	322278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9002	NC_021200	GCG	3	9	322304	322312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_021200	GCG	2	6	322355	322360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074683
9004	NC_021200	TC	3	6	322408	322413	0 %	50 %	0 %	50 %	499074683
9005	NC_021200	CGG	2	6	322454	322459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074683
9006	NC_021200	CG	3	6	322518	322523	0 %	0 %	50 %	50 %	499074683
9007	NC_021200	TCG	2	6	322568	322573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074683
9008	NC_021200	G	6	6	322593	322598	0 %	0 %	100 %	0 %	499074683
9009	NC_021200	CGT	2	6	322686	322691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074683
9010	NC_021200	CGG	2	6	322731	322736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074683
9011	NC_021200	GCCG	2	8	322776	322783	0 %	0 %	50 %	50 %	499074683
9012	NC_021200	GC	3	6	322881	322886	0 %	0 %	50 %	50 %	499074683
9013	NC_021200	CGC	2	6	322995	323000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074683
9014	NC_021200	CGA	2	6	323016	323021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074683
9015	NC_021200	CCTCGG	2	12	323064	323075	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	499074683
9016	NC_021200	CGGCG	2	10	323082	323091	0 %	0 %	60 %	40 %	499074683
9017	NC_021200	CGT	2	6	323193	323198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074684
9018	NC_021200	TCGGC	2	10	323256	323265	0 %	20 %	40 %	40 %	499074684
9019	NC_021200	GTC	2	6	323287	323292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074684
9020	NC_021200	ACC	2	6	323309	323314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074684
9021	NC_021200	GCG	2	6	323328	323333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074684
9022	NC_021200	GCCC	3	12	323345	323356	0 %	0 %	25 %	75 %	499074684
9023	NC_021200	CG	3	6	323358	323363	0 %	0 %	50 %	50 %	499074684
9024	NC_021200	CACG	2	8	323380	323387	25 %	0 %	25 %	50 %	499074684
9025	NC_021200	CGC	2	6	323466	323471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074684
9026	NC_021200	ACC	2	6	323483	323488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074684
9027	NC_021200	CAG	2	6	323500	323505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074684
9028	NC_021200	CGT	2	6	323506	323511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074684
9029	NC_021200	CGG	2	6	323517	323522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074684
9030	NC_021200	GCC	2	6	323528	323533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074684
9031	NC_021200	GC	3	6	323551	323556	0 %	0 %	50 %	50 %	499074684
9032	NC_021200	CGGCAG	2	12	323560	323571	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	499074684
9033	NC_021200	GCA	2	6	323577	323582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074684
9034	NC_021200	TCG	3	9	323591	323599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074684
9035	NC_021200	GCG	2	6	323649	323654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074684
9036	NC_021200	ACGC	2	8	323690	323697	25 %	0 %	25 %	50 %	499074684
9037	NC_021200	GGCG	2	8	323709	323716	0 %	0 %	75 %	25 %	499074684
9038	NC_021200	CGA	3	9	323724	323732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074684
9039	NC_021200	CGG	2	6	323760	323765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074684
9040	NC_021200	TGA	2	6	323766	323771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074684
9041	NC_021200	TGC	2	6	323778	323783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074684
9042	NC_021200	CCG	2	6	323805	323810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074684
9043	NC_021200	CGG	2	6	323814	323819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074684
9044	NC_021200	CCA	2	6	323829	323834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074684
9045	NC_021200	CCG	2	6	323843	323848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074684
9046	NC_021200	GAT	2	6	323875	323880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074684
9047	NC_021200	TCG	2	6	323882	323887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074684
9048	NC_021200	CGT	2	6	323919	323924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074684
9049	NC_021200	CGC	2	6	323984	323989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074684
9050	NC_021200	CAGCGC	2	12	324016	324027	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499074684
9051	NC_021200	CGG	2	6	324063	324068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074684
9052	NC_021200	CGC	2	6	324087	324092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074684
9053	NC_021200	CGC	2	6	324108	324113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074684
9054	NC_021200	CG	3	6	324123	324128	0 %	0 %	50 %	50 %	499074684
9055	NC_021200	GCCG	2	8	324155	324162	0 %	0 %	50 %	50 %	499074684
9056	NC_021200	CG	3	6	324210	324215	0 %	0 %	50 %	50 %	499074684
9057	NC_021200	CGCGG	2	10	324217	324226	0 %	0 %	60 %	40 %	499074684
9058	NC_021200	GGC	2	6	324256	324261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074684
9059	NC_021200	CGG	2	6	324318	324323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074684
9060	NC_021200	GCC	2	6	324335	324340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074684
9061	NC_021200	CGG	2	6	324348	324353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074684
9062	NC_021200	GCG	2	6	324360	324365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074684
9063	NC_021200	TTGCG	2	10	324371	324380	0 %	40 %	40 %	20 %	499074684
9064	NC_021200	GCG	2	6	324405	324410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074684
9065	NC_021200	CG	3	6	324425	324430	0 %	0 %	50 %	50 %	499074684
9066	NC_021200	CGG	2	6	324441	324446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074684
9067	NC_021200	CAG	2	6	324511	324516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074684
9068	NC_021200	GCCGG	2	10	324635	324644	0 %	0 %	60 %	40 %	499074685
9069	NC_021200	GTT	2	6	324673	324678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074685
9070	NC_021200	CTG	2	6	324695	324700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074685
9071	NC_021200	GGT	2	6	324702	324707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074685
9072	NC_021200	CAC	2	6	324712	324717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074685
9073	NC_021200	ACC	2	6	324764	324769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074685
9074	NC_021200	AGA	2	6	324771	324776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074685
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9078	NC_021200	ACC	2	6	324974	324979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074685
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9080	NC_021200	CGC	2	6	324997	325002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074685
9081	NC_021200	CAG	2	6	325003	325008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074685
9082	NC_021200	GGT	2	6	325015	325020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074685
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9085	NC_021200	CGG	2	6	325101	325106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074685
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9087	NC_021200	CTT	2	6	325123	325128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074685
9088	NC_021200	CAT	2	6	325225	325230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074685
9089	NC_021200	CGC	2	6	325245	325250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074685
9090	NC_021200	GCCG	2	8	325261	325268	0 %	0 %	50 %	50 %	499074685
9091	NC_021200	CGA	2	6	325290	325295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074685
9092	NC_021200	GGT	2	6	325342	325347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074685
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9094	NC_021200	GCGG	2	8	325368	325375	0 %	0 %	75 %	25 %	499074685
9095	NC_021200	CG	3	6	325392	325397	0 %	0 %	50 %	50 %	499074685
9096	NC_021200	GTC	2	6	325459	325464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074685
9097	NC_021200	GC	3	6	325565	325570	0 %	0 %	50 %	50 %	499074685
9098	NC_021200	GTC	2	6	325585	325590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074685
9099	NC_021200	CAA	2	6	325615	325620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074685
9100	NC_021200	CGG	2	6	325661	325666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9101	NC_021200	CGC	2	6	325686	325691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9102	NC_021200	TAT	2	6	325706	325711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_021200	GGC	2	6	325758	325763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9104	NC_021200	GCGG	2	8	325780	325787	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9105	NC_021200	GAG	2	6	325799	325804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_021200	CGGC	2	8	325830	325837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9107	NC_021200	CGA	2	6	325885	325890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074686
9108	NC_021200	CCGC	2	8	325899	325906	0 %	0 %	25 %	75 %	499074686
9109	NC_021200	GGTG	2	8	325908	325915	0 %	25 %	75 %	0 %	499074686
9110	NC_021200	CGG	2	6	325927	325932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074686
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9118	NC_021200	CCG	2	6	326192	326197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074686
9119	NC_021200	GGC	2	6	326290	326295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074686
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9122	NC_021200	GCA	3	9	326520	326528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074686
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9124	NC_021200	GGT	2	6	326569	326574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074686
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