MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8505	NC_021200	CGG	2	6	305563	305568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074669
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8623	NC_021200	TGG	2	6	309842	309847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074673
8624	NC_021200	CGG	2	6	309939	309944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074673
8625	NC_021200	GCG	2	6	309991	309996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074673
8626	NC_021200	GGT	3	9	310002	310010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074673
8627	NC_021200	TGCGG	2	10	310107	310116	0 %	20 %	60 %	20 %	499074673
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8631	NC_021200	CGC	2	6	310250	310255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074673
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8633	NC_021200	GCT	3	9	310296	310304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074673
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8636	NC_021200	TGA	2	6	310358	310363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074673
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8642	NC_021200	CG	3	6	310528	310533	0 %	0 %	50 %	50 %	499074673
8643	NC_021200	GTC	2	6	310534	310539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074673
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8650	NC_021200	TGC	2	6	310715	310720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074673
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8658	NC_021200	CTG	2	6	310903	310908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074673
8659	NC_021200	GTC	2	6	310939	310944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074673
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8662	NC_021200	GCT	2	6	311034	311039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074673
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8717	NC_021200	GTC	2	6	312979	312984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074675
8718	NC_021200	GCG	2	6	313035	313040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074675
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8720	NC_021200	CT	3	6	313123	313128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8721	NC_021200	GATCCG	2	12	313286	313297	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499074676
8722	NC_021200	CGG	2	6	313315	313320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074676
8723	NC_021200	CCG	2	6	313321	313326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074676
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8725	NC_021200	CG	3	6	313397	313402	0 %	0 %	50 %	50 %	499074676
8726	NC_021200	CAG	2	6	313406	313411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074676
8727	NC_021200	CGA	2	6	313525	313530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074676
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8729	NC_021200	CTG	2	6	313604	313609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074676
8730	NC_021200	CAC	2	6	313631	313636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074676
8731	NC_021200	CCA	2	6	313637	313642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074676
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8733	NC_021200	GGCC	2	8	313694	313701	0 %	0 %	50 %	50 %	499074677
8734	NC_021200	CG	4	8	313703	313710	0 %	0 %	50 %	50 %	499074677
8735	NC_021200	T	6	6	313725	313730	0 %	100 %	0 %	0 %	499074677
8736	NC_021200	CCGG	2	8	313774	313781	0 %	0 %	50 %	50 %	499074677
8737	NC_021200	CGA	2	6	313854	313859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074677
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8739	NC_021200	CGG	2	6	314044	314049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074677
8740	NC_021200	GCG	2	6	314078	314083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074677
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8742	NC_021200	TTC	2	6	314110	314115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074677
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8984	NC_021200	ACC	2	6	321928	321933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074682
8985	NC_021200	CGG	3	9	321947	321955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074682
8986	NC_021200	GGC	2	6	321959	321964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074682
8987	NC_021200	GC	3	6	321963	321968	0 %	0 %	50 %	50 %	499074682
8988	NC_021200	TCGCC	2	10	321971	321980	0 %	20 %	20 %	60 %	499074682
8989	NC_021200	AGG	2	6	321989	321994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074682
8990	NC_021200	GCC	2	6	322017	322022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074682
8991	NC_021200	GGTCCG	2	12	322040	322051	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499074682
8992	NC_021200	CGC	3	9	322131	322139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074682
8993	NC_021200	TTCG	2	8	322141	322148	0 %	50 %	25 %	25 %	499074682
8994	NC_021200	GCC	2	6	322150	322155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074682
8995	NC_021200	CGGC	2	8	322182	322189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8996	NC_021200	CGT	2	6	322190	322195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8997	NC_021200	CCCGG	2	10	322198	322207	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8998	NC_021200	GCG	2	6	322227	322232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8999	NC_021200	CCG	2	6	322258	322263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9000	NC_021200	GC	3	6	322267	322272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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