MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_021200	GCC	2	6	286876	286881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074654
8003	NC_021200	ACG	2	6	286940	286945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074654
8004	NC_021200	TGC	2	6	287021	287026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074654
8005	NC_021200	CGT	2	6	287088	287093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074654
8006	NC_021200	GGT	2	6	287196	287201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074654
8007	NC_021200	CGT	2	6	287280	287285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074654
8008	NC_021200	CAA	2	6	287292	287297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074654
8009	NC_021200	CGG	2	6	287298	287303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074654
8010	NC_021200	CGA	2	6	287316	287321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074654
8011	NC_021200	CGG	2	6	287397	287402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074654
8012	NC_021200	CGG	2	6	287423	287428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074654
8013	NC_021200	GCGG	2	8	287436	287443	0 %	0 %	75 %	25 %	499074654
8014	NC_021200	CGG	2	6	287466	287471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074654
8015	NC_021200	CCG	2	6	287504	287509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074654
8016	NC_021200	GCG	2	6	287551	287556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074654
8017	NC_021200	GCCG	2	8	287559	287566	0 %	0 %	50 %	50 %	499074654
8018	NC_021200	CAG	2	6	287591	287596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074655
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8020	NC_021200	GCCG	2	8	287626	287633	0 %	0 %	50 %	50 %	499074655
8021	NC_021200	CG	3	6	287652	287657	0 %	0 %	50 %	50 %	499074655
8022	NC_021200	TGG	2	6	287683	287688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074655
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8025	NC_021200	CCG	2	6	287800	287805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074655
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8028	NC_021200	TGG	2	6	287959	287964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074655
8029	NC_021200	CAG	2	6	287978	287983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074655
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8031	NC_021200	GTC	2	6	288047	288052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074655
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8035	NC_021200	CAG	3	9	288176	288184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074655
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8044	NC_021200	TGC	2	6	288777	288782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074656
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8050	NC_021200	CAC	2	6	289019	289024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074656
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8052	NC_021200	CGT	2	6	289117	289122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074656
8053	NC_021200	GCC	2	6	289161	289166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074656
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8056	NC_021200	CGG	2	6	289300	289305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074656
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8059	NC_021200	CGG	2	6	289433	289438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074657
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8061	NC_021200	TCG	2	6	289525	289530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074657
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8122	NC_021200	GCT	2	6	291490	291495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074659
8123	NC_021200	TGC	2	6	291498	291503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074659
8124	NC_021200	GC	4	8	291553	291560	0 %	0 %	50 %	50 %	499074659
8125	NC_021200	GTC	2	6	291566	291571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074659
8126	NC_021200	GGC	2	6	291613	291618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074659
8127	NC_021200	CGGA	2	8	291621	291628	25 %	0 %	50 %	25 %	499074659
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8363	NC_021200	GGCCG	2	10	300149	300158	0 %	0 %	60 %	40 %	499074665
8364	NC_021200	GAT	2	6	300194	300199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074665
8365	NC_021200	TCG	2	6	300201	300206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074665
8366	NC_021200	GCC	2	6	300326	300331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074665
8367	NC_021200	CCA	2	6	300355	300360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074665
8368	NC_021200	GC	3	6	300361	300366	0 %	0 %	50 %	50 %	499074665
8369	NC_021200	CGC	2	6	300446	300451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074665
8370	NC_021200	GTG	2	6	300479	300484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074665
8371	NC_021200	ACC	2	6	300492	300497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074665
8372	NC_021200	TCG	2	6	300720	300725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074666
8373	NC_021200	CCGGC	2	10	300748	300757	0 %	0 %	40 %	60 %	499074666
8374	NC_021200	CCCGG	2	10	300760	300769	0 %	0 %	40 %	60 %	499074666
8375	NC_021200	GTC	2	6	300863	300868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074666
8376	NC_021200	GC	3	6	300874	300879	0 %	0 %	50 %	50 %	499074666
8377	NC_021200	GCG	2	6	300892	300897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074666
8378	NC_021200	CGG	2	6	300937	300942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074666
8379	NC_021200	CCA	2	6	300967	300972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074666
8380	NC_021200	GCGCG	2	10	300994	301003	0 %	0 %	60 %	40 %	499074666
8381	NC_021200	CGG	2	6	301037	301042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074666
8382	NC_021200	GCG	2	6	301092	301097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074666
8383	NC_021200	GCG	2	6	301124	301129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074666
8384	NC_021200	GCG	2	6	301168	301173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074666
8385	NC_021200	CGA	2	6	301201	301206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074666
8386	NC_021200	ACCTCC	2	12	301239	301250	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	499074666
8387	NC_021200	AAC	2	6	301278	301283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074666
8388	NC_021200	TCG	3	9	301288	301296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074666
8389	NC_021200	ATG	2	6	301332	301337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074666
8390	NC_021200	GTC	2	6	301364	301369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074666
8391	NC_021200	GGCGG	2	10	301373	301382	0 %	0 %	80 %	20 %	499074666
8392	NC_021200	GCCG	2	8	301399	301406	0 %	0 %	50 %	50 %	499074666
8393	NC_021200	GAC	2	6	301427	301432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074666
8394	NC_021200	CGT	3	9	301453	301461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074666
8395	NC_021200	AGCCGA	2	12	301462	301473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074666
8396	NC_021200	GC	3	6	301491	301496	0 %	0 %	50 %	50 %	499074666
8397	NC_021200	CGG	2	6	301516	301521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074666
8398	NC_021200	CGA	2	6	301525	301530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074666
8399	NC_021200	GC	3	6	301540	301545	0 %	0 %	50 %	50 %	499074666
8400	NC_021200	CAC	2	6	301574	301579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074666
8401	NC_021200	GTTGAC	2	12	301595	301606	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	499074666
8402	NC_021200	GCG	2	6	301666	301671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074666
8403	NC_021200	GC	3	6	301878	301883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8404	NC_021200	GC	3	6	301919	301924	0 %	0 %	50 %	50 %	499074667
8405	NC_021200	ACC	2	6	301973	301978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074667
8406	NC_021200	GCG	2	6	301989	301994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074667
8407	NC_021200	GCCA	2	8	302147	302154	25 %	0 %	25 %	50 %	499074667
8408	NC_021200	CAC	2	6	302158	302163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074667
8409	NC_021200	CGA	2	6	302169	302174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074667
8410	NC_021200	CGG	2	6	302188	302193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074667
8411	NC_021200	CGGC	2	8	302235	302242	0 %	0 %	50 %	50 %	499074667
8412	NC_021200	GCACC	2	10	302254	302263	20 %	0 %	20 %	60 %	499074667
8413	NC_021200	CGG	2	6	302268	302273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074667
8414	NC_021200	GCG	2	6	302285	302290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074667
8415	NC_021200	GGC	2	6	302320	302325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074667
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8417	NC_021200	GCCC	2	8	302395	302402	0 %	0 %	25 %	75 %	499074667
8418	NC_021200	GCA	2	6	302427	302432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074667
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8420	NC_021200	GACG	2	8	302508	302515	25 %	0 %	50 %	25 %	499074667
8421	NC_021200	GGC	2	6	302544	302549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074667
8422	NC_021200	GAT	2	6	302572	302577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074667
8423	NC_021200	CCG	2	6	302630	302635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074667
8424	NC_021200	TCG	2	6	302648	302653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074667
8425	NC_021200	ACC	2	6	302654	302659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074667
8426	NC_021200	GCG	2	6	302663	302668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074667
8427	NC_021200	CCG	2	6	302702	302707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074667
8428	NC_021200	CGT	2	6	302709	302714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074667
8429	NC_021200	ACC	3	9	302717	302725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074667
8430	NC_021200	CG	4	8	302733	302740	0 %	0 %	50 %	50 %	499074667
8431	NC_021200	CGGC	2	8	302774	302781	0 %	0 %	50 %	50 %	499074667
8432	NC_021200	CAC	2	6	302788	302793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074667
8433	NC_021200	GTC	2	6	302803	302808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074667
8434	NC_021200	GCA	2	6	302888	302893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074668
8435	NC_021200	CGC	3	9	302960	302968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074668
8436	NC_021200	GTT	2	6	302973	302978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074668
8437	NC_021200	GTG	2	6	303040	303045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074668
8438	NC_021200	CAC	2	6	303046	303051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074668
8439	NC_021200	TGC	2	6	303055	303060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074668
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8441	NC_021200	GAT	2	6	303111	303116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074668
8442	NC_021200	GGC	2	6	303150	303155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074668
8443	NC_021200	AGT	2	6	303254	303259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074668
8444	NC_021200	TCGA	2	8	303295	303302	25 %	25 %	25 %	25 %	499074668
8445	NC_021200	GGT	2	6	303321	303326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074668
8446	NC_021200	GAT	2	6	303348	303353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074668
8447	NC_021200	CCA	2	6	303383	303388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074668
8448	NC_021200	GTC	2	6	303474	303479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074668
8449	NC_021200	GTA	2	6	303510	303515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074668
8450	NC_021200	CGG	2	6	303530	303535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074668
8451	NC_021200	GTC	2	6	303543	303548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074668
8452	NC_021200	GCG	3	9	303564	303572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074668
8453	NC_021200	TCC	4	12	303595	303606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074668
8454	NC_021200	GTC	2	6	303645	303650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074668
8455	NC_021200	GTTGC	2	10	303756	303765	0 %	40 %	40 %	20 %	499074668
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8458	NC_021200	GC	3	6	303882	303887	0 %	0 %	50 %	50 %	499074668
8459	NC_021200	CGA	2	6	303926	303931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074668
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8461	NC_021200	GTAGTC	2	12	303987	303998	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	499074668
8462	NC_021200	CGA	2	6	304005	304010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074668
8463	NC_021200	CCG	2	6	304024	304029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074668
8464	NC_021200	CAC	2	6	304089	304094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074668
8465	NC_021200	GTC	2	6	304110	304115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074668
8466	NC_021200	CTT	2	6	304263	304268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074668
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8468	NC_021200	CGC	2	6	304373	304378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074668
8469	NC_021200	GAT	2	6	304386	304391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074668
8470	NC_021200	CGT	2	6	304397	304402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074668
8471	NC_021200	CGCC	2	8	304406	304413	0 %	0 %	25 %	75 %	499074668
8472	NC_021200	TTC	2	6	304414	304419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074668
8473	NC_021200	GCC	2	6	304426	304431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074668
8474	NC_021200	CAG	2	6	304434	304439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074668
8475	NC_021200	CGC	2	6	304451	304456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074668
8476	NC_021200	CG	3	6	304493	304498	0 %	0 %	50 %	50 %	499074668
8477	NC_021200	GTA	2	6	304527	304532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074668
8478	NC_021200	GTC	2	6	304542	304547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074668
8479	NC_021200	GTCGAT	2	12	304626	304637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	499074668
8480	NC_021200	GTC	2	6	304638	304643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074668
8481	NC_021200	TCGG	2	8	304651	304658	0 %	25 %	50 %	25 %	499074668
8482	NC_021200	CTG	2	6	304671	304676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074668
8483	NC_021200	TGC	2	6	304780	304785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074669
8484	NC_021200	CTG	2	6	304838	304843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074669
8485	NC_021200	CGG	2	6	304846	304851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074669
8486	NC_021200	GCA	2	6	304873	304878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074669
8487	NC_021200	ACCG	2	8	304898	304905	25 %	0 %	25 %	50 %	499074669
8488	NC_021200	GC	3	6	305023	305028	0 %	0 %	50 %	50 %	499074669
8489	NC_021200	CGGG	2	8	305098	305105	0 %	0 %	75 %	25 %	499074669
8490	NC_021200	CGC	2	6	305122	305127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074669
8491	NC_021200	GC	3	6	305126	305131	0 %	0 %	50 %	50 %	499074669
8492	NC_021200	TCG	3	9	305133	305141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074669
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8494	NC_021200	GCCA	2	8	305154	305161	25 %	0 %	25 %	50 %	499074669
8495	NC_021200	TCG	2	6	305202	305207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074669
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8499	NC_021200	CGG	2	6	305284	305289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074669
8500	NC_021200	TGG	2	6	305335	305340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074669

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