MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. Gladysdale MU clone SC5

Total Repeats: 4613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021025	AATA	2	8	100	107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021025	GTAA	2	8	404	411	50 %	25 %	25 %	0 %	479184589
3	NC_021025	TTTA	2	8	440	447	25 %	75 %	0 %	0 %	479184589
4	NC_021025	AGTT	2	8	526	533	25 %	50 %	25 %	0 %	479184589
5	NC_021025	ATTA	2	8	634	641	50 %	50 %	0 %	0 %	479184589
6	NC_021025	ATTA	2	8	784	791	50 %	50 %	0 %	0 %	479184589
7	NC_021025	AATT	2	8	910	917	50 %	50 %	0 %	0 %	479184589
8	NC_021025	AAGT	2	8	1150	1157	50 %	25 %	25 %	0 %	479184589
9	NC_021025	GAAA	2	8	1274	1281	75 %	0 %	25 %	0 %	479184589
10	NC_021025	AATA	2	8	1533	1540	75 %	25 %	0 %	0 %	479183818
11	NC_021025	TATT	2	8	1617	1624	25 %	75 %	0 %	0 %	479183818
12	NC_021025	TTCT	2	8	1670	1677	0 %	75 %	0 %	25 %	479183818
13	NC_021025	AATT	2	8	1820	1827	50 %	50 %	0 %	0 %	479183818
14	NC_021025	AATG	2	8	1968	1975	50 %	25 %	25 %	0 %	479183818
15	NC_021025	ACTA	2	8	2016	2023	50 %	25 %	0 %	25 %	479183818
16	NC_021025	AAAT	2	8	2675	2682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021025	CAAA	2	8	2776	2783	75 %	0 %	0 %	25 %	479184663
18	NC_021025	TAAA	2	8	2795	2802	75 %	25 %	0 %	0 %	479184663
19	NC_021025	ATAA	2	8	2950	2957	75 %	25 %	0 %	0 %	479184663
20	NC_021025	TTTA	2	8	3083	3090	25 %	75 %	0 %	0 %	479184663
21	NC_021025	TGAA	2	8	3172	3179	50 %	25 %	25 %	0 %	479184663
22	NC_021025	AATT	2	8	3310	3317	50 %	50 %	0 %	0 %	479183934
23	NC_021025	TTTA	2	8	3560	3567	25 %	75 %	0 %	0 %	479183934
24	NC_021025	TTAC	2	8	3588	3595	25 %	50 %	0 %	25 %	479183934
25	NC_021025	AAGA	2	8	3857	3864	75 %	0 %	25 %	0 %	479183934
26	NC_021025	TAAT	2	8	4410	4417	50 %	50 %	0 %	0 %	479184798
27	NC_021025	TTTG	2	8	5096	5103	0 %	75 %	25 %	0 %	479184798
28	NC_021025	TTTC	2	8	5123	5130	0 %	75 %	0 %	25 %	479184798
29	NC_021025	TAAA	2	8	5165	5172	75 %	25 %	0 %	0 %	479184798
30	NC_021025	ATAA	2	8	5275	5282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021025	TAAT	2	8	5696	5703	50 %	50 %	0 %	0 %	479183841
32	NC_021025	TAAA	2	8	6116	6123	75 %	25 %	0 %	0 %	479183841
33	NC_021025	TTTA	2	8	6785	6792	25 %	75 %	0 %	0 %	479183841
34	NC_021025	TAAT	2	8	8855	8862	50 %	50 %	0 %	0 %	479184653
35	NC_021025	AATT	2	8	8942	8949	50 %	50 %	0 %	0 %	479184653
36	NC_021025	ATGA	2	8	9000	9007	50 %	25 %	25 %	0 %	479184653
37	NC_021025	AATT	2	8	9408	9415	50 %	50 %	0 %	0 %	479184653
38	NC_021025	AAAG	2	8	9508	9515	75 %	0 %	25 %	0 %	479184653
39	NC_021025	TTTA	2	8	9642	9649	25 %	75 %	0 %	0 %	479184653
40	NC_021025	TTAA	2	8	9799	9806	50 %	50 %	0 %	0 %	479184653
41	NC_021025	TATC	2	8	9999	10006	25 %	50 %	0 %	25 %	479184186
42	NC_021025	TAAA	2	8	10106	10113	75 %	25 %	0 %	0 %	479184186
43	NC_021025	TAAA	2	8	10280	10287	75 %	25 %	0 %	0 %	479184186
44	NC_021025	ACCA	2	8	10419	10426	50 %	0 %	0 %	50 %	479184186
45	NC_021025	TAAA	2	8	10964	10971	75 %	25 %	0 %	0 %	479184186
46	NC_021025	TGTT	2	8	11002	11009	0 %	75 %	25 %	0 %	479184867
47	NC_021025	TTGT	3	12	11389	11400	0 %	75 %	25 %	0 %	479184867
48	NC_021025	TTTA	2	8	11564	11571	25 %	75 %	0 %	0 %	479184867
49	NC_021025	TATT	2	8	11646	11653	25 %	75 %	0 %	0 %	479184867
50	NC_021025	TTTA	2	8	11762	11769	25 %	75 %	0 %	0 %	479184867
51	NC_021025	GTTT	2	8	11848	11855	0 %	75 %	25 %	0 %	479184867
52	NC_021025	CTTT	2	8	11916	11923	0 %	75 %	0 %	25 %	479184867
53	NC_021025	TGTT	2	8	11977	11984	0 %	75 %	25 %	0 %	479184867
54	NC_021025	TTTA	2	8	12101	12108	25 %	75 %	0 %	0 %	479184867
55	NC_021025	TAAA	2	8	12191	12198	75 %	25 %	0 %	0 %	479184867
56	NC_021025	AACC	2	8	12597	12604	50 %	0 %	0 %	50 %	479184867
57	NC_021025	ATGT	2	8	13067	13074	25 %	50 %	25 %	0 %	479184867
58	NC_021025	AATT	2	8	13351	13358	50 %	50 %	0 %	0 %	479184867
59	NC_021025	AAAT	2	8	13496	13503	75 %	25 %	0 %	0 %	479184867
60	NC_021025	TTTG	2	8	13592	13599	0 %	75 %	25 %	0 %	479183852
61	NC_021025	AATT	2	8	13674	13681	50 %	50 %	0 %	0 %	479183852
62	NC_021025	ATTT	2	8	14157	14164	25 %	75 %	0 %	0 %	479183852
63	NC_021025	ATAA	2	8	14169	14176	75 %	25 %	0 %	0 %	479183852
64	NC_021025	ATTA	2	8	14340	14347	50 %	50 %	0 %	0 %	479183852
65	NC_021025	TGTT	2	8	14808	14815	0 %	75 %	25 %	0 %	479183852
66	NC_021025	GTTG	2	8	14959	14966	0 %	50 %	50 %	0 %	479183852
67	NC_021025	TTAA	2	8	15795	15802	50 %	50 %	0 %	0 %	479184724
68	NC_021025	AATT	2	8	17081	17088	50 %	50 %	0 %	0 %	479184192
69	NC_021025	AATT	2	8	17367	17374	50 %	50 %	0 %	0 %	479184192
70	NC_021025	AATA	2	8	17493	17500	75 %	25 %	0 %	0 %	479184192
71	NC_021025	AGTA	2	8	18047	18054	50 %	25 %	25 %	0 %	479184192
72	NC_021025	AAAG	2	8	18393	18400	75 %	0 %	25 %	0 %	479184192
73	NC_021025	GTAA	2	8	18610	18617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021025	ATAA	2	8	19115	19122	75 %	25 %	0 %	0 %	479184098
75	NC_021025	GATA	2	8	19342	19349	50 %	25 %	25 %	0 %	479184098
76	NC_021025	GTTA	2	8	19736	19743	25 %	50 %	25 %	0 %	479184098
77	NC_021025	TAGC	2	8	19809	19816	25 %	25 %	25 %	25 %	479184098
78	NC_021025	TAAT	2	8	20181	20188	50 %	50 %	0 %	0 %	479184098
79	NC_021025	ATTT	2	8	20207	20214	25 %	75 %	0 %	0 %	479184098
80	NC_021025	ATTA	2	8	20373	20380	50 %	50 %	0 %	0 %	479184098
81	NC_021025	ACCA	2	8	20675	20682	50 %	0 %	0 %	50 %	479184711
82	NC_021025	ATCA	2	8	21020	21027	50 %	25 %	0 %	25 %	479184711
83	NC_021025	GAAT	2	8	21063	21070	50 %	25 %	25 %	0 %	479184711
84	NC_021025	ATTT	2	8	21137	21144	25 %	75 %	0 %	0 %	479184711
85	NC_021025	TTAT	2	8	21259	21266	25 %	75 %	0 %	0 %	479184711
86	NC_021025	GTTT	2	8	21465	21472	0 %	75 %	25 %	0 %	479184711
87	NC_021025	TCAA	2	8	21826	21833	50 %	25 %	0 %	25 %	479184711
88	NC_021025	AATA	2	8	22153	22160	75 %	25 %	0 %	0 %	479184583
89	NC_021025	GAAT	2	8	22359	22366	50 %	25 %	25 %	0 %	479184583
90	NC_021025	GTTT	2	8	22549	22556	0 %	75 %	25 %	0 %	479184583
91	NC_021025	TCAT	2	8	22841	22848	25 %	50 %	0 %	25 %	479184583
92	NC_021025	ATAA	2	8	23197	23204	75 %	25 %	0 %	0 %	479184139
93	NC_021025	ATTT	2	8	23382	23389	25 %	75 %	0 %	0 %	479184139
94	NC_021025	TATT	2	8	23549	23556	25 %	75 %	0 %	0 %	479184752
95	NC_021025	AAAC	2	8	23898	23905	75 %	0 %	0 %	25 %	479184752
96	NC_021025	ATAA	2	8	24036	24043	75 %	25 %	0 %	0 %	479184752
97	NC_021025	ACTA	2	8	24085	24092	50 %	25 %	0 %	25 %	479184752
98	NC_021025	AATA	2	8	24117	24124	75 %	25 %	0 %	0 %	479184752
99	NC_021025	GTTA	2	8	24355	24362	25 %	50 %	25 %	0 %	479184752
100	NC_021025	GTAT	2	8	24386	24393	25 %	50 %	25 %	0 %	479184752
101	NC_021025	TAAT	2	8	24396	24403	50 %	50 %	0 %	0 %	479184752
102	NC_021025	TATT	2	8	24411	24418	25 %	75 %	0 %	0 %	479184752
103	NC_021025	AATA	2	8	24450	24457	75 %	25 %	0 %	0 %	479184752
104	NC_021025	AAAT	3	12	24916	24927	75 %	25 %	0 %	0 %	479184276
105	NC_021025	ATTA	2	8	24940	24947	50 %	50 %	0 %	0 %	479184276
106	NC_021025	AATT	2	8	25072	25079	50 %	50 %	0 %	0 %	479184276
107	NC_021025	AATA	2	8	25247	25254	75 %	25 %	0 %	0 %	479184276
108	NC_021025	TAAA	2	8	25425	25432	75 %	25 %	0 %	0 %	479184280
109	NC_021025	AATT	2	8	26150	26157	50 %	50 %	0 %	0 %	479183816
110	NC_021025	AATT	2	8	26234	26241	50 %	50 %	0 %	0 %	479183816
111	NC_021025	TATT	2	8	26335	26342	25 %	75 %	0 %	0 %	479183816
112	NC_021025	ATTA	2	8	26361	26368	50 %	50 %	0 %	0 %	479183816
113	NC_021025	AATT	2	8	26588	26595	50 %	50 %	0 %	0 %	479184414
114	NC_021025	ATTA	2	8	27026	27033	50 %	50 %	0 %	0 %	479184414
115	NC_021025	TATC	2	8	27252	27259	25 %	50 %	0 %	25 %	479184414
116	NC_021025	ATTT	2	8	28066	28073	25 %	75 %	0 %	0 %	479184414
117	NC_021025	CTTC	2	8	28329	28336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021025	TTAT	2	8	28365	28372	25 %	75 %	0 %	0 %	479183973
119	NC_021025	GTAT	2	8	29038	29045	25 %	50 %	25 %	0 %	479183795
120	NC_021025	ATAA	2	8	29167	29174	75 %	25 %	0 %	0 %	479183795
121	NC_021025	ACCT	2	8	29750	29757	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021025	ATTA	2	8	29759	29766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021025	GGTT	2	8	30424	30431	0 %	50 %	50 %	0 %	479184602
124	NC_021025	CTAC	2	8	30760	30767	25 %	25 %	0 %	50 %	479184602
125	NC_021025	CTTT	2	8	30804	30811	0 %	75 %	0 %	25 %	479183967
126	NC_021025	TACT	2	8	31141	31148	25 %	50 %	0 %	25 %	479183967
127	NC_021025	TAAT	2	8	31395	31402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021025	TATT	2	8	31417	31424	25 %	75 %	0 %	0 %	479184449
129	NC_021025	AGAA	2	8	31738	31745	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021025	TAAC	2	8	31760	31767	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021025	TAAA	2	8	31941	31948	75 %	25 %	0 %	0 %	479184392
132	NC_021025	AAAG	2	8	32940	32947	75 %	0 %	25 %	0 %	479184319
133	NC_021025	TTAG	2	8	33228	33235	25 %	50 %	25 %	0 %	479184319
134	NC_021025	TTGG	2	8	33424	33431	0 %	50 %	50 %	0 %	479184319
135	NC_021025	TACT	2	8	34032	34039	25 %	50 %	0 %	25 %	479184803
136	NC_021025	CTAA	2	8	34408	34415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_021025	TAAA	2	8	34588	34595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021025	TAAT	2	8	34735	34742	50 %	50 %	0 %	0 %	479184172
139	NC_021025	ATAA	2	8	34745	34752	75 %	25 %	0 %	0 %	479184172
140	NC_021025	TCTA	2	8	35066	35073	25 %	50 %	0 %	25 %	479184172
141	NC_021025	ATAA	2	8	35377	35384	75 %	25 %	0 %	0 %	479184172
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143	NC_021025	TAAT	2	8	35605	35612	50 %	50 %	0 %	0 %	479184172
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