MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 49585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020834	CAA	2	6	204422	204427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335448
4002	NC_020834	AGC	2	6	204517	204522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335448
4003	NC_020834	TTA	2	6	204768	204773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335448
4004	NC_020834	GGC	2	6	204848	204853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335448
4005	NC_020834	GT	3	6	204861	204866	0 %	50 %	50 %	0 %	472335448
4006	NC_020834	TTC	2	6	204878	204883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335448
4007	NC_020834	ACT	2	6	204960	204965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335448
4008	NC_020834	TTA	2	6	204984	204989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335448
4009	NC_020834	CA	3	6	205143	205148	50 %	0 %	0 %	50 %	472335448
4010	NC_020834	AT	3	6	205217	205222	50 %	50 %	0 %	0 %	472335448
4011	NC_020834	GTG	2	6	205296	205301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335448
4012	NC_020834	CTTG	2	8	205319	205326	0 %	50 %	25 %	25 %	472335448
4013	NC_020834	GAA	2	6	205347	205352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335448
4014	NC_020834	GTGC	2	8	205353	205360	0 %	25 %	50 %	25 %	472335448
4015	NC_020834	GAA	2	6	205407	205412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335448
4016	NC_020834	TGA	2	6	205448	205453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335448
4017	NC_020834	ACT	2	6	205490	205495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335448
4018	NC_020834	GTTA	2	8	205576	205583	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_020834	CTTA	2	8	205659	205666	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_020834	GTA	2	6	205714	205719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_020834	T	7	7	205771	205777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_020834	CGT	2	6	205884	205889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335449
4023	NC_020834	GCT	2	6	205893	205898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335449
4024	NC_020834	AAG	2	6	205927	205932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335449
4025	NC_020834	A	6	6	205953	205958	100 %	0 %	0 %	0 %	472335449
4026	NC_020834	GTT	2	6	205977	205982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335449
4027	NC_020834	AAG	2	6	205992	205997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335449
4028	NC_020834	TCG	2	6	206003	206008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335449
4029	NC_020834	ATC	2	6	206139	206144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335449
4030	NC_020834	GGTAA	2	10	206245	206254	40 %	20 %	40 %	0 %	472335450
4031	NC_020834	TTG	2	6	206282	206287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335450
4032	NC_020834	CAT	2	6	206298	206303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335450
4033	NC_020834	TGG	2	6	206343	206348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335450
4034	NC_020834	GAA	2	6	206355	206360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335450
4035	NC_020834	CAA	2	6	206409	206414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335450
4036	NC_020834	A	6	6	206449	206454	100 %	0 %	0 %	0 %	472335450
4037	NC_020834	TTC	2	6	206461	206466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335450
4038	NC_020834	TTAA	2	8	206487	206494	50 %	50 %	0 %	0 %	472335450
4039	NC_020834	TAC	2	6	206526	206531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_020834	AGT	2	6	206540	206545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_020834	ACT	2	6	206569	206574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_020834	TGGGTG	2	12	206620	206631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335451
4043	NC_020834	A	6	6	206646	206651	100 %	0 %	0 %	0 %	472335451
4044	NC_020834	AGC	2	6	206678	206683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335451
4045	NC_020834	GTG	2	6	206782	206787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335451
4046	NC_020834	GATT	2	8	206812	206819	25 %	50 %	25 %	0 %	472335451
4047	NC_020834	CAC	2	6	206975	206980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335451
4048	NC_020834	TGA	2	6	206993	206998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335451
4049	NC_020834	GCT	2	6	207018	207023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335451
4050	NC_020834	AGGT	2	8	207047	207054	25 %	25 %	50 %	0 %	472335451
4051	NC_020834	CAAT	2	8	207068	207075	50 %	25 %	0 %	25 %	472335452
4052	NC_020834	GAA	2	6	207131	207136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335452
4053	NC_020834	ATC	2	6	207146	207151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335452
4054	NC_020834	TGA	2	6	207169	207174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335452
4055	NC_020834	GCA	2	6	207185	207190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335452
4056	NC_020834	GCC	2	6	207249	207254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335452
4057	NC_020834	GTC	2	6	207261	207266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335452
4058	NC_020834	GCT	2	6	207317	207322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335452
4059	NC_020834	AAG	2	6	207347	207352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335452
4060	NC_020834	TAA	2	6	207362	207367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335452
4061	NC_020834	GAA	2	6	207524	207529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335453
4062	NC_020834	GTT	2	6	207551	207556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335453
4063	NC_020834	AAAC	2	8	207601	207608	75 %	0 %	0 %	25 %	472335453
4064	NC_020834	GGT	2	6	207689	207694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335453
4065	NC_020834	GTT	2	6	207707	207712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335453
4066	NC_020834	GACC	2	8	207733	207740	25 %	0 %	25 %	50 %	472335453
4067	NC_020834	TGC	2	6	207742	207747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335453
4068	NC_020834	CGG	2	6	207763	207768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335453
4069	NC_020834	ATA	2	6	207790	207795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335453
4070	NC_020834	AAG	2	6	207943	207948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335454
4071	NC_020834	ATA	2	6	208027	208032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335454
4072	NC_020834	TC	3	6	208135	208140	0 %	50 %	0 %	50 %	472335454
4073	NC_020834	AC	3	6	208151	208156	50 %	0 %	0 %	50 %	472335454
4074	NC_020834	CAG	2	6	208162	208167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335454
4075	NC_020834	ATT	2	6	208200	208205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335454
4076	NC_020834	GCA	2	6	208242	208247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335454
4077	NC_020834	TAAAGG	2	12	208280	208291	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	472335454
4078	NC_020834	TGA	2	6	208304	208309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335454
4079	NC_020834	AGT	2	6	208310	208315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335454
4080	NC_020834	GAA	2	6	208331	208336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335454
4081	NC_020834	AAAGT	2	10	208337	208346	60 %	20 %	20 %	0 %	472335454
4082	NC_020834	CGT	2	6	208382	208387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335455
4083	NC_020834	GA	3	6	208411	208416	50 %	0 %	50 %	0 %	472335455
4084	NC_020834	AGC	3	9	208501	208509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335455
4085	NC_020834	GCA	2	6	208568	208573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335455
4086	NC_020834	TGC	2	6	208681	208686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335455
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4088	NC_020834	TAT	2	6	208812	208817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335456
4089	NC_020834	AGT	2	6	208836	208841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335456
4090	NC_020834	CAG	2	6	208895	208900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335456
4091	NC_020834	TCG	2	6	208926	208931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335456
4092	NC_020834	ACA	2	6	208968	208973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335456
4093	NC_020834	ATC	2	6	209038	209043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335456
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4101	NC_020834	ATCA	2	8	209371	209378	50 %	25 %	0 %	25 %	472335457
4102	NC_020834	TGG	2	6	209503	209508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335458
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4105	NC_020834	GGT	2	6	209567	209572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335458
4106	NC_020834	TCG	2	6	209587	209592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335458
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4108	NC_020834	CAT	2	6	209710	209715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335458
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4112	NC_020834	GTA	2	6	209876	209881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_020834	TTGT	2	8	209917	209924	0 %	75 %	25 %	0 %	472335459
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4116	NC_020834	ACA	2	6	210009	210014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335459
4117	NC_020834	CAT	2	6	210024	210029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335459
4118	NC_020834	TGG	2	6	210051	210056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335459
4119	NC_020834	TAT	2	6	210090	210095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
4120	NC_020834	ATT	2	6	210115	210120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
4121	NC_020834	ATT	2	6	210126	210131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335459
4122	NC_020834	CACC	2	8	210142	210149	25 %	0 %	0 %	75 %	472335459
4123	NC_020834	AAAG	2	8	210162	210169	75 %	0 %	25 %	0 %	472335459
4124	NC_020834	GTC	2	6	210182	210187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335459
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4142	NC_020834	TA	3	6	210977	210982	50 %	50 %	0 %	0 %	472335459
4143	NC_020834	TGTT	2	8	210990	210997	0 %	75 %	25 %	0 %	472335459
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4149	NC_020834	GTT	2	6	211072	211077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335459
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4152	NC_020834	TAA	2	6	211179	211184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_020834	ACAA	2	8	211289	211296	75 %	0 %	0 %	25 %	472335460
4154	NC_020834	GCTCA	2	10	211352	211361	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4155	NC_020834	ATA	2	6	211430	211435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4219	NC_020834	ATTTT	2	10	214383	214392	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4220	NC_020834	GGA	2	6	214418	214423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4226	NC_020834	TTCA	2	8	214912	214919	25 %	50 %	0 %	25 %	472335466
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4230	NC_020834	TCTT	2	8	215120	215127	0 %	75 %	0 %	25 %	472335466
4231	NC_020834	CA	3	6	215132	215137	50 %	0 %	0 %	50 %	472335466
4232	NC_020834	TTA	2	6	215172	215177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335466
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4238	NC_020834	TG	3	6	215501	215506	0 %	50 %	50 %	0 %	472335466
4239	NC_020834	A	6	6	215544	215549	100 %	0 %	0 %	0 %	472335466
4240	NC_020834	AGT	2	6	215584	215589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335466
4241	NC_020834	ATT	2	6	215622	215627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_020834	AAATT	2	10	215653	215662	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_020834	T	6	6	215661	215666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_020834	TC	3	6	215854	215859	0 %	50 %	0 %	50 %	472335467
4245	NC_020834	AGC	2	6	216009	216014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335467
4246	NC_020834	GCT	2	6	216025	216030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335467
4247	NC_020834	TTATC	2	10	216051	216060	20 %	60 %	0 %	20 %	472335467
4248	NC_020834	CAC	2	6	216068	216073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335467
4249	NC_020834	GCG	2	6	216135	216140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335467
4250	NC_020834	CAA	2	6	216152	216157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335467
4251	NC_020834	GGT	2	6	216229	216234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335467
4252	NC_020834	CA	3	6	216318	216323	50 %	0 %	0 %	50 %	472335467
4253	NC_020834	TAC	2	6	216328	216333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335467
4254	NC_020834	TTC	2	6	216343	216348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335467
4255	NC_020834	T	6	6	216411	216416	0 %	100 %	0 %	0 %	472335467
4256	NC_020834	ATT	2	6	216445	216450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335467
4257	NC_020834	GCA	2	6	216481	216486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335467
4258	NC_020834	TCA	2	6	216552	216557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335467
4259	NC_020834	GCC	2	6	216584	216589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335467
4260	NC_020834	GCT	2	6	216595	216600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335467
4261	NC_020834	CAA	2	6	216623	216628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335467
4262	NC_020834	GT	3	6	216672	216677	0 %	50 %	50 %	0 %	472335467
4263	NC_020834	A	7	7	216703	216709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_020834	CCA	2	6	216720	216725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4265	NC_020834	CCA	2	6	216768	216773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335468
4266	NC_020834	TCAATA	2	12	216791	216802	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472335468
4267	NC_020834	CTGC	2	8	216822	216829	0 %	25 %	25 %	50 %	472335468
4268	NC_020834	GTT	2	6	216891	216896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335468
4269	NC_020834	TTC	2	6	216986	216991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335468
4270	NC_020834	T	6	6	217023	217028	0 %	100 %	0 %	0 %	472335468
4271	NC_020834	CAT	2	6	217083	217088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335468
4272	NC_020834	GTC	2	6	217138	217143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335468
4273	NC_020834	ATCA	2	8	217147	217154	50 %	25 %	0 %	25 %	472335468
4274	NC_020834	AAAT	2	8	217224	217231	75 %	25 %	0 %	0 %	472335468
4275	NC_020834	ATC	2	6	217312	217317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4276	NC_020834	TAAAA	2	10	217354	217363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4277	NC_020834	TGC	2	6	217455	217460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335469
4278	NC_020834	CAT	2	6	217461	217466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335469
4279	NC_020834	ATT	2	6	217519	217524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335469
4280	NC_020834	TTG	2	6	217582	217587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335469
4281	NC_020834	GTA	2	6	217598	217603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335469
4282	NC_020834	TGG	2	6	217625	217630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335469
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4294	NC_020834	A	6	6	218321	218326	100 %	0 %	0 %	0 %	472335469
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4329	NC_020834	TTAA	2	8	219446	219453	50 %	50 %	0 %	0 %	472335470
4330	NC_020834	ATA	2	6	219461	219466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335470
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4338	NC_020834	CTT	2	6	219651	219656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335470
4339	NC_020834	T	6	6	219702	219707	0 %	100 %	0 %	0 %	472335470
4340	NC_020834	CTG	2	6	219708	219713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335470
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4344	NC_020834	T	8	8	219872	219879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4345	NC_020834	CTAT	2	8	219880	219887	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4346	NC_020834	T	6	6	219904	219909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4347	NC_020834	T	6	6	219937	219942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4348	NC_020834	TTGT	2	8	219950	219957	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4349	NC_020834	TAAAT	2	10	219972	219981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4350	NC_020834	ATT	2	6	220011	220016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335471
4351	NC_020834	GCA	2	6	220041	220046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335471
4352	NC_020834	CAG	2	6	220048	220053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335471
4353	NC_020834	ATT	2	6	220112	220117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335471
4354	NC_020834	GA	3	6	220171	220176	50 %	0 %	50 %	0 %	472335471
4355	NC_020834	AT	3	6	220199	220204	50 %	50 %	0 %	0 %	472335471
4356	NC_020834	CAT	2	6	220235	220240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335471
4357	NC_020834	ATT	2	6	220261	220266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335471
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4359	NC_020834	TG	3	6	220320	220325	0 %	50 %	50 %	0 %	472335471
4360	NC_020834	TGA	2	6	220328	220333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335471
4361	NC_020834	TTG	2	6	220365	220370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335471
4362	NC_020834	A	6	6	220404	220409	100 %	0 %	0 %	0 %	472335471
4363	NC_020834	GACT	2	8	220426	220433	25 %	25 %	25 %	25 %	472335471
4364	NC_020834	TATT	2	8	220482	220489	25 %	75 %	0 %	0 %	472335471
4365	NC_020834	ACA	2	6	220529	220534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335471
4366	NC_020834	TGA	2	6	220538	220543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335471
4367	NC_020834	ATT	2	6	220569	220574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335471
4368	NC_020834	TAT	2	6	220595	220600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335471
4369	NC_020834	A	6	6	220662	220667	100 %	0 %	0 %	0 %	472335471
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4452	NC_020834	AAT	2	6	224533	224538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335474
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4454	NC_020834	TAT	2	6	224677	224682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4476	NC_020834	TGT	2	6	225952	225957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335475
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4478	NC_020834	GCGT	2	8	226185	226192	0 %	25 %	50 %	25 %	472335475
4479	NC_020834	TAA	2	6	226277	226282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335475
4480	NC_020834	T	6	6	226295	226300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4481	NC_020834	T	6	6	226328	226333	0 %	100 %	0 %	0 %	472335476
4482	NC_020834	A	6	6	226379	226384	100 %	0 %	0 %	0 %	472335476
4483	NC_020834	TTTGG	2	10	226458	226467	0 %	60 %	40 %	0 %	472335476
4484	NC_020834	AT	3	6	226481	226486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4485	NC_020834	ATTT	2	8	226500	226507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4486	NC_020834	TAT	2	6	226518	226523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4487	NC_020834	TTC	2	6	226802	226807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335477
4488	NC_020834	GTG	2	6	226846	226851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335477
4489	NC_020834	ATG	2	6	226876	226881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335477
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