MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 1035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020834	CGATAC	2	12	2442724	2442735	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472337678
1002	NC_020834	ATCACC	2	12	2443642	2443653	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	472337679
1003	NC_020834	TTACCT	2	12	2449670	2449681	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	472337687
1004	NC_020834	TTCGAT	2	12	2453622	2453633	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	472337694
1005	NC_020834	ACTTAG	2	12	2457713	2457724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472337698
1006	NC_020834	TGCCGC	2	12	2459252	2459263	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	472337700
1007	NC_020834	ATTTCA	2	12	2463116	2463127	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1008	NC_020834	GCCTTC	2	12	2466430	2466441	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_020834	AATTAA	2	12	2467219	2467230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020834	AAAAAC	2	12	2467429	2467440	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1011	NC_020834	TGCATT	2	12	2470369	2470380	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	472337705
1012	NC_020834	GATTTG	2	12	2470842	2470853	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	472337705
1013	NC_020834	CACGAA	2	12	2480633	2480644	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	472337718
1014	NC_020834	CGCCAT	2	12	2481790	2481801	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	472337718
1015	NC_020834	TTATTT	2	12	2487645	2487656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472337725
1016	NC_020834	AAGCGG	2	12	2489574	2489585	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	472337726
1017	NC_020834	CTCTTT	2	12	2502876	2502887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_020834	AAACGG	2	12	2507655	2507666	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	472337745
1019	NC_020834	CACGCC	2	12	2508859	2508870	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	472337746
1020	NC_020834	TGAAAG	2	12	2512160	2512171	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	472337749
1021	NC_020834	AACCGC	2	12	2512239	2512250	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	472337749
1022	NC_020834	TGATTT	2	12	2515076	2515087	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	472337754
1023	NC_020834	AGCAAC	2	12	2517993	2518004	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	472337756
1024	NC_020834	ATTTCA	2	12	2520931	2520942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1025	NC_020834	GCCTTC	2	12	2524361	2524372	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_020834	AATTAA	2	12	2525150	2525161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020834	TTTAAA	2	12	2528419	2528430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020834	CTATTC	2	12	2532983	2532994	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_020834	CTAAGT	2	12	2533783	2533794	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472337768
1030	NC_020834	ATACCG	2	12	2535006	2535017	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472337768
1031	NC_020834	AATCGT	2	12	2535026	2535037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472337768
1032	NC_020834	ACACGC	2	12	2535060	2535071	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	472337768
1033	NC_020834	CAAAGA	2	12	2535883	2535894	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	472337770
1034	NC_020834	GAAAGT	2	12	2536669	2536680	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	472337771
1035	NC_020834	TGCTTT	2	12	2540772	2540783	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	472337773

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