MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanomethylovorans hollandica DSM 15978

Total Repeats: 30106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_019977	GAA	2	6	2421681	2421686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852539
30002	NC_019977	ATT	2	6	2421764	2421769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852539
30003	NC_019977	GCA	2	6	2421783	2421788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852539
30004	NC_019977	GGA	2	6	2421800	2421805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435852539
30005	NC_019977	CAG	2	6	2421816	2421821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852539
30006	NC_019977	AAG	2	6	2421924	2421929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852539
30007	NC_019977	ATA	2	6	2422261	2422266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852540
30008	NC_019977	CGC	2	6	2422290	2422295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435852540
30009	NC_019977	AGT	2	6	2422335	2422340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852540
30010	NC_019977	GAA	2	6	2422366	2422371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852540
30011	NC_019977	TTC	2	6	2422472	2422477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852540
30012	NC_019977	TGA	2	6	2422548	2422553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852540
30013	NC_019977	TGA	2	6	2422575	2422580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852540
30014	NC_019977	ATG	2	6	2422655	2422660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852540
30015	NC_019977	CTT	3	9	2422727	2422735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852540
30016	NC_019977	GGA	2	6	2422770	2422775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435852540
30017	NC_019977	CAA	2	6	2422849	2422854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852540
30018	NC_019977	ATG	2	6	2422889	2422894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852540
30019	NC_019977	TCT	2	6	2423141	2423146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852540
30020	NC_019977	AGC	2	6	2423254	2423259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852540
30021	NC_019977	CGG	2	6	2423269	2423274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435852540
30022	NC_019977	GCA	2	6	2423298	2423303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852540
30023	NC_019977	TTA	2	6	2423361	2423366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852541
30024	NC_019977	TAG	2	6	2423501	2423506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852541
30025	NC_019977	ATT	2	6	2423543	2423548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30026	NC_019977	TTA	2	6	2423562	2423567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30027	NC_019977	CTA	2	6	2423627	2423632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30028	NC_019977	CAT	2	6	2423671	2423676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30029	NC_019977	CAG	2	6	2423801	2423806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852542
30030	NC_019977	CAA	2	6	2423807	2423812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852542
30031	NC_019977	CGA	2	6	2423910	2423915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852542
30032	NC_019977	ACT	2	6	2424025	2424030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852542
30033	NC_019977	TTC	2	6	2424091	2424096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852542
30034	NC_019977	GGT	2	6	2424211	2424216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435852542
30035	NC_019977	CTT	2	6	2424219	2424224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852542
30036	NC_019977	TTG	2	6	2424326	2424331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435852542
30037	NC_019977	GAA	2	6	2424487	2424492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852542
30038	NC_019977	AAG	2	6	2424499	2424504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852542
30039	NC_019977	AAG	2	6	2424550	2424555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852542
30040	NC_019977	CTG	2	6	2424560	2424565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435852542
30041	NC_019977	TAC	2	6	2424765	2424770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852543
30042	NC_019977	AAG	2	6	2424805	2424810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852543
30043	NC_019977	GAA	2	6	2424817	2424822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852543
30044	NC_019977	ATT	2	6	2424823	2424828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852543
30045	NC_019977	TCA	2	6	2424831	2424836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852543
30046	NC_019977	TGA	2	6	2425038	2425043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852543
30047	NC_019977	ACC	2	6	2425047	2425052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435852543
30048	NC_019977	TTC	2	6	2425169	2425174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852543
30049	NC_019977	AAT	2	6	2425224	2425229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435852543
30050	NC_019977	CTA	2	6	2425257	2425262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852543
30051	NC_019977	CCA	2	6	2425283	2425288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435852543
30052	NC_019977	CCA	2	6	2425380	2425385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435852543
30053	NC_019977	CTG	2	6	2425455	2425460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435852543
30054	NC_019977	TTC	2	6	2425570	2425575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852543
30055	NC_019977	AGC	2	6	2425576	2425581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852543
30056	NC_019977	ATC	2	6	2425595	2425600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852543
30057	NC_019977	TCA	2	6	2425625	2425630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852543
30058	NC_019977	CAG	2	6	2425654	2425659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852543
30059	NC_019977	GCC	2	6	2425687	2425692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435852543
30060	NC_019977	GTT	2	6	2425727	2425732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435852543
30061	NC_019977	CAA	2	6	2425776	2425781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852543
30062	NC_019977	TAT	2	6	2425852	2425857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852543
30063	NC_019977	GAT	2	6	2425858	2425863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852543
30064	NC_019977	TAT	2	6	2425876	2425881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435852543
30065	NC_019977	GAA	2	6	2425895	2425900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852543
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30068	NC_019977	CTA	2	6	2426229	2426234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852544
30069	NC_019977	CAA	2	6	2426250	2426255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852544
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30071	NC_019977	CAT	2	6	2426281	2426286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852544
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30080	NC_019977	CGA	2	6	2426983	2426988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435852544
30081	NC_019977	ACC	2	6	2426992	2426997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435852544
30082	NC_019977	TAG	2	6	2427096	2427101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435852544
30083	NC_019977	TTA	2	6	2427309	2427314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30084	NC_019977	TCT	2	6	2427350	2427355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30085	NC_019977	TAA	2	6	2427378	2427383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30086	NC_019977	AGA	2	6	2427620	2427625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852545
30087	NC_019977	TTG	2	6	2427632	2427637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435852545
30088	NC_019977	TCT	2	6	2427678	2427683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852545
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30091	NC_019977	GTT	2	6	2427721	2427726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435852545
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30095	NC_019977	CTT	2	6	2427910	2427915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435852545
30096	NC_019977	ACT	2	6	2427989	2427994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852545
30097	NC_019977	CAT	2	6	2428031	2428036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435852545
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30099	NC_019977	GAA	3	9	2428162	2428170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852545
30100	NC_019977	CAA	2	6	2428279	2428284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852545
30101	NC_019977	CAA	2	6	2428333	2428338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435852545
30102	NC_019977	GAA	2	6	2428345	2428350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435852545
30103	NC_019977	TCC	2	6	2428496	2428501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435852545
30104	NC_019977	TGT	2	6	2428502	2428507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435852545
30105	NC_019977	TAT	2	6	2428803	2428808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30106	NC_019977	CAT	2	6	2428873	2428878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.