MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanomethylovorans hollandica DSM 15978 plasmid pMETHO01

Total Repeats: 861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019972	TACA	2	8	236	243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019972	TAAA	2	8	315	322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019972	TAAA	2	8	364	371	75 %	25 %	0 %	0 %	435849689
4	NC_019972	GATA	2	8	812	819	50 %	25 %	25 %	0 %	435849689
5	NC_019972	ATAA	2	8	840	847	75 %	25 %	0 %	0 %	435849689
6	NC_019972	TTTC	2	8	1272	1279	0 %	75 %	0 %	25 %	435849689
7	NC_019972	AACA	2	8	1307	1314	75 %	0 %	0 %	25 %	435849689
8	NC_019972	TTTA	2	8	1342	1349	25 %	75 %	0 %	0 %	435849689
9	NC_019972	TGGT	2	8	1483	1490	0 %	50 %	50 %	0 %	435849689
10	NC_019972	TGTT	2	8	2781	2788	0 %	75 %	25 %	0 %	435849690
11	NC_019972	AGCA	2	8	2994	3001	50 %	0 %	25 %	25 %	435849690
12	NC_019972	CTTG	2	8	3414	3421	0 %	50 %	25 %	25 %	435849690
13	NC_019972	TGAT	2	8	3607	3614	25 %	50 %	25 %	0 %	435849690
14	NC_019972	TTAT	2	8	3640	3647	25 %	75 %	0 %	0 %	435849690
15	NC_019972	TAAT	2	8	3953	3960	50 %	50 %	0 %	0 %	435849690
16	NC_019972	TTCA	2	8	3999	4006	25 %	50 %	0 %	25 %	435849690
17	NC_019972	ATAG	2	8	4087	4094	50 %	25 %	25 %	0 %	435849690
18	NC_019972	TACT	2	8	4279	4286	25 %	50 %	0 %	25 %	435849690
19	NC_019972	GTTT	2	8	5483	5490	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019972	CTGG	2	8	5772	5779	0 %	25 %	50 %	25 %	435849693
21	NC_019972	TGCT	2	8	5895	5902	0 %	50 %	25 %	25 %	435849693
22	NC_019972	ATTG	2	8	6024	6031	25 %	50 %	25 %	0 %	435849693
23	NC_019972	GCAT	2	8	6092	6099	25 %	25 %	25 %	25 %	435849694
24	NC_019972	TTTC	2	8	6439	6446	0 %	75 %	0 %	25 %	435849694
25	NC_019972	CATA	2	8	6796	6803	50 %	25 %	0 %	25 %	435849694
26	NC_019972	TAAT	2	8	6951	6958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019972	TGAA	2	8	7258	7265	50 %	25 %	25 %	0 %	435849695
28	NC_019972	TATG	2	8	8538	8545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019972	CCCT	2	8	8606	8613	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_019972	AGGA	2	8	8632	8639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019972	TACA	2	8	8887	8894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019972	TCTT	2	8	8968	8975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019972	TGTT	2	8	9343	9350	0 %	75 %	25 %	0 %	435849698
34	NC_019972	CTTT	2	8	9453	9460	0 %	75 %	0 %	25 %	435849698
35	NC_019972	TTGA	2	8	10001	10008	25 %	50 %	25 %	0 %	435849698
36	NC_019972	TTCT	2	8	10653	10660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019972	TGTT	2	8	11169	11176	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019972	AGGA	2	8	11231	11238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019972	GTTT	2	8	11911	11918	0 %	75 %	25 %	0 %	435849702
40	NC_019972	TTCT	2	8	12059	12066	0 %	75 %	0 %	25 %	435849702
41	NC_019972	GATG	2	8	12109	12116	25 %	25 %	50 %	0 %	435849702
42	NC_019972	CTGA	2	8	12239	12246	25 %	25 %	25 %	25 %	435849702
43	NC_019972	TTCT	2	8	12313	12320	0 %	75 %	0 %	25 %	435849702
44	NC_019972	AGAT	2	8	12525	12532	50 %	25 %	25 %	0 %	435849702
45	NC_019972	ATCT	2	8	12564	12571	25 %	50 %	0 %	25 %	435849702
46	NC_019972	TTTG	2	8	12741	12748	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019972	TTTG	2	8	13090	13097	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019972	TGTT	2	8	13205	13212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019972	GTCT	2	8	13302	13309	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019972	GTTG	2	8	13431	13438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019972	GATA	2	8	13495	13502	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019972	AGGA	2	8	13581	13588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019972	GATA	2	8	14367	14374	50 %	25 %	25 %	0 %	435849704
54	NC_019972	TCAA	2	8	14417	14424	50 %	25 %	0 %	25 %	435849704
55	NC_019972	GATG	2	8	14459	14466	25 %	25 %	50 %	0 %	435849704
56	NC_019972	AGAT	2	8	14875	14882	50 %	25 %	25 %	0 %	435849704
57	NC_019972	ATCT	2	8	14914	14921	25 %	50 %	0 %	25 %	435849704
58	NC_019972	TTTG	2	8	15352	15359	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019972	ATTT	2	8	15495	15502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019972	ACAG	2	8	15948	15955	50 %	0 %	25 %	25 %	435849706
61	NC_019972	GATT	2	8	16069	16076	25 %	50 %	25 %	0 %	435849706
62	NC_019972	ACAT	2	8	16364	16371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019972	TAAA	2	8	16469	16476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019972	AATT	2	8	16740	16747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019972	TTCA	2	8	16822	16829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019972	ATGT	2	8	16845	16852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019972	TAAA	2	8	17480	17487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019972	ACAA	2	8	17760	17767	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019972	TTAA	2	8	18379	18386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019972	AAAT	2	8	18847	18854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019972	TACA	2	8	19271	19278	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019972	TAAA	2	8	19311	19318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019972	GATT	2	8	19792	19799	25 %	50 %	25 %	0 %	435849707
74	NC_019972	ACAT	2	8	19873	19880	50 %	25 %	0 %	25 %	435849707
75	NC_019972	AATC	2	8	20137	20144	50 %	25 %	0 %	25 %	435849707
76	NC_019972	ATAA	2	8	20279	20286	75 %	25 %	0 %	0 %	435849707
77	NC_019972	ACAT	2	8	20406	20413	50 %	25 %	0 %	25 %	435849707
78	NC_019972	ATTA	2	8	20569	20576	50 %	50 %	0 %	0 %	435849707
79	NC_019972	GTTC	2	8	20585	20592	0 %	50 %	25 %	25 %	435849707
80	NC_019972	TCAT	2	8	20861	20868	25 %	50 %	0 %	25 %	435849707
81	NC_019972	ATTC	2	8	20962	20969	25 %	50 %	0 %	25 %	435849707
82	NC_019972	AGAA	2	8	21306	21313	75 %	0 %	25 %	0 %	435849707
83	NC_019972	CATT	2	8	21573	21580	25 %	50 %	0 %	25 %	435849708
84	NC_019972	AATG	2	8	22569	22576	50 %	25 %	25 %	0 %	435849708
85	NC_019972	TACA	2	8	23360	23367	50 %	25 %	0 %	25 %	435849708
86	NC_019972	GGTT	2	8	23640	23647	0 %	50 %	50 %	0 %	435849708
87	NC_019972	TGCC	2	8	24489	24496	0 %	25 %	25 %	50 %	435849709
88	NC_019972	TCTT	2	8	24533	24540	0 %	75 %	0 %	25 %	435849709
89	NC_019972	AGTT	2	8	24604	24611	25 %	50 %	25 %	0 %	435849709
90	NC_019972	CCTG	2	8	24827	24834	0 %	25 %	25 %	50 %	435849709
91	NC_019972	GAAT	2	8	25213	25220	50 %	25 %	25 %	0 %	435849709
92	NC_019972	GGTT	2	8	25368	25375	0 %	50 %	50 %	0 %	435849709
93	NC_019972	TCTT	2	8	26118	26125	0 %	75 %	0 %	25 %	435849710
94	NC_019972	TCCT	2	8	26420	26427	0 %	50 %	0 %	50 %	435849710
95	NC_019972	TTGT	2	8	26584	26591	0 %	75 %	25 %	0 %	435849710
96	NC_019972	ATCA	2	8	26696	26703	50 %	25 %	0 %	25 %	435849710
97	NC_019972	ATTT	2	8	26980	26987	25 %	75 %	0 %	0 %	435849710
98	NC_019972	TACA	2	8	27425	27432	50 %	25 %	0 %	25 %	435849711
99	NC_019972	AAAC	2	8	27545	27552	75 %	0 %	0 %	25 %	435849711
100	NC_019972	TACT	2	8	28622	28629	25 %	50 %	0 %	25 %	435849716
101	NC_019972	CCAA	2	8	28642	28649	50 %	0 %	0 %	50 %	435849716
102	NC_019972	CTTC	2	8	28684	28691	0 %	50 %	0 %	50 %	435849716
103	NC_019972	AGAT	2	8	28938	28945	50 %	25 %	25 %	0 %	435849717
104	NC_019972	TAGA	2	8	29036	29043	50 %	25 %	25 %	0 %	435849718
105	NC_019972	AAAG	2	8	29139	29146	75 %	0 %	25 %	0 %	435849718
106	NC_019972	ACTA	2	8	29156	29163	50 %	25 %	0 %	25 %	435849718
107	NC_019972	TTCA	2	8	29539	29546	25 %	50 %	0 %	25 %	435849719
108	NC_019972	TCTG	2	8	29927	29934	0 %	50 %	25 %	25 %	435849720
109	NC_019972	TTTA	2	8	29977	29984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019972	TTAA	2	8	30036	30043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019972	TGAA	2	8	30511	30518	50 %	25 %	25 %	0 %	435849721
112	NC_019972	TTGA	2	8	30849	30856	25 %	50 %	25 %	0 %	435849721
113	NC_019972	TGAT	2	8	31180	31187	25 %	50 %	25 %	0 %	435849721
114	NC_019972	GAAA	2	8	31198	31205	75 %	0 %	25 %	0 %	435849721
115	NC_019972	TGGT	2	8	31516	31523	0 %	50 %	50 %	0 %	435849721
116	NC_019972	ATGG	2	8	31674	31681	25 %	25 %	50 %	0 %	435849721
117	NC_019972	GATA	2	8	32222	32229	50 %	25 %	25 %	0 %	435849721
118	NC_019972	AAGA	2	8	32697	32704	75 %	0 %	25 %	0 %	435849721
119	NC_019972	TTCA	2	8	34022	34029	25 %	50 %	0 %	25 %	435849722
120	NC_019972	TGAT	2	8	34305	34312	25 %	50 %	25 %	0 %	435849722
121	NC_019972	GTTT	2	8	34690	34697	0 %	75 %	25 %	0 %	435849722
122	NC_019972	CAAA	2	8	34701	34708	75 %	0 %	0 %	25 %	435849722
123	NC_019972	ACGA	2	8	35530	35537	50 %	0 %	25 %	25 %	435849724
124	NC_019972	TGAT	2	8	35830	35837	25 %	50 %	25 %	0 %	435849724
125	NC_019972	TTGC	2	8	36253	36260	0 %	50 %	25 %	25 %	435849724
126	NC_019972	TAGG	2	8	36500	36507	25 %	25 %	50 %	0 %	435849724
127	NC_019972	TATT	2	8	36793	36800	25 %	75 %	0 %	0 %	435849725
128	NC_019972	AAGT	2	8	38163	38170	50 %	25 %	25 %	0 %	435849727
129	NC_019972	ATGA	2	8	39511	39518	50 %	25 %	25 %	0 %	435849729
130	NC_019972	ATTG	2	8	40531	40538	25 %	50 %	25 %	0 %	435849730
131	NC_019972	TATC	2	8	41130	41137	25 %	50 %	0 %	25 %	435849730
132	NC_019972	ATTT	2	8	41512	41519	25 %	75 %	0 %	0 %	435849730
133	NC_019972	TAAG	2	8	41608	41615	50 %	25 %	25 %	0 %	435849730
134	NC_019972	TTGT	2	8	42129	42136	0 %	75 %	25 %	0 %	435849730
135	NC_019972	TAGA	2	8	42343	42350	50 %	25 %	25 %	0 %	435849730
136	NC_019972	ATAA	2	8	42516	42523	75 %	25 %	0 %	0 %	435849730
137	NC_019972	CAAA	2	8	42616	42623	75 %	0 %	0 %	25 %	435849731
138	NC_019972	GTTT	2	8	42868	42875	0 %	75 %	25 %	0 %	435849731
139	NC_019972	AGTG	2	8	43657	43664	25 %	25 %	50 %	0 %	435849731
140	NC_019972	ATCA	2	8	43742	43749	50 %	25 %	0 %	25 %	435849731
141	NC_019972	TTTG	2	8	44084	44091	0 %	75 %	25 %	0 %	435849732
142	NC_019972	GACT	2	8	44128	44135	25 %	25 %	25 %	25 %	435849732
143	NC_019972	ACTG	2	8	44698	44705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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145	NC_019972	AGAA	2	8	44808	44815	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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