MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanomethylovorans hollandica DSM 15978 plasmid pMETHO01

Total Repeats: 3888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019972	ATA	2	6	89	94	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019972	TTC	2	6	95	100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019972	TAT	2	6	104	109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019972	ATA	2	6	118	123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019972	TAT	2	6	149	154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019972	TAT	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019972	TAC	2	6	479	484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849689
8	NC_019972	TTC	2	6	515	520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849689
9	NC_019972	TCT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849689
10	NC_019972	ATG	2	6	576	581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
11	NC_019972	TTA	2	6	586	591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849689
12	NC_019972	AAT	2	6	732	737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849689
13	NC_019972	CAT	2	6	791	796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849689
14	NC_019972	TAT	2	6	797	802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849689
15	NC_019972	TGA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
16	NC_019972	ATG	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
17	NC_019972	ATG	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
18	NC_019972	TGA	2	6	1055	1060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
19	NC_019972	TCT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849689
20	NC_019972	GAG	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849689
21	NC_019972	TTG	2	6	1284	1289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849689
22	NC_019972	TTA	2	6	1290	1295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849689
23	NC_019972	TTC	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019972	CTA	2	6	1629	1634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019972	TTG	2	6	1670	1675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019972	ATT	2	6	1755	1760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019972	TTG	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019972	ATT	2	6	1879	1884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019972	TTG	3	9	1915	1923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019972	ATT	2	6	1938	1943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019972	ATT	2	6	2003	2008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019972	TTG	2	6	2042	2047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019972	ATT	2	6	2127	2132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019972	GTT	2	6	2165	2170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019972	ATT	2	6	2251	2256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019972	TTG	3	9	2287	2295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019972	ATT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019972	GTT	2	6	2413	2418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019972	ATT	2	6	2499	2504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019972	GTT	2	6	2537	2542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019972	ATT	2	6	2623	2628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
42	NC_019972	TAA	2	6	2706	2711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849690
43	NC_019972	ACT	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849690
44	NC_019972	GAT	2	6	2959	2964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849690
45	NC_019972	TGT	3	9	2979	2987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849690
46	NC_019972	ATT	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
47	NC_019972	CTT	2	6	3286	3291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
48	NC_019972	GAT	3	9	3294	3302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849690
49	NC_019972	TTC	2	6	3313	3318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
50	NC_019972	TCA	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849690
51	NC_019972	AAT	2	6	3397	3402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849690
52	NC_019972	TTA	2	6	3422	3427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
53	NC_019972	TTC	2	6	3515	3520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
54	NC_019972	GTT	2	6	3544	3549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849690
55	NC_019972	GGA	2	6	3599	3604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849690
56	NC_019972	TAA	2	6	3654	3659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849690
57	NC_019972	CTT	2	6	3898	3903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
58	NC_019972	TTA	2	6	3944	3949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
59	NC_019972	TTC	2	6	4068	4073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
60	NC_019972	TTC	2	6	4104	4109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
61	NC_019972	CTG	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849690
62	NC_019972	GTA	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849690
63	NC_019972	CTT	2	6	4379	4384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
64	NC_019972	AAG	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849690
65	NC_019972	TCA	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849690
66	NC_019972	AAC	2	6	4512	4517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849690
67	NC_019972	CAT	2	6	4526	4531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849690
68	NC_019972	GAT	2	6	4587	4592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849690
69	NC_019972	TAT	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
70	NC_019972	TTC	2	6	4732	4737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
71	NC_019972	GGA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849690
72	NC_019972	AGA	2	6	5002	5007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019972	GAA	2	6	5139	5144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849691
74	NC_019972	TCA	2	6	5156	5161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849691
75	NC_019972	TTC	2	6	5164	5169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849691
76	NC_019972	ATA	2	6	5277	5282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849692
77	NC_019972	TGT	2	6	5363	5368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849692
78	NC_019972	AGA	2	6	5420	5425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019972	GTT	2	6	5572	5577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849693
80	NC_019972	ATT	2	6	5675	5680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849693
81	NC_019972	GAT	2	6	5719	5724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849693
82	NC_019972	CTT	2	6	5964	5969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849693
83	NC_019972	TTC	2	6	5981	5986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849693
84	NC_019972	TTC	2	6	5989	5994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849693
85	NC_019972	TTA	2	6	6039	6044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019972	CTA	2	6	6265	6270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849694
87	NC_019972	CAT	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849694
88	NC_019972	TGT	2	6	6342	6347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849694
89	NC_019972	TTG	2	6	6498	6503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849694
90	NC_019972	ACA	2	6	6540	6545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849694
91	NC_019972	CTT	2	6	6568	6573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849694
92	NC_019972	ATT	2	6	6656	6661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849694
93	NC_019972	CTT	2	6	6662	6667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849694
94	NC_019972	TCA	2	6	6831	6836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849694
95	NC_019972	AAG	2	6	7130	7135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849695
96	NC_019972	TCT	2	6	7173	7178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849695
97	NC_019972	TCC	2	6	7184	7189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849695
98	NC_019972	TGA	2	6	7308	7313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849695
99	NC_019972	CAC	2	6	7418	7423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019972	ATC	2	6	7540	7545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849696
101	NC_019972	CCA	2	6	7589	7594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849696
102	NC_019972	AAG	2	6	7623	7628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849696
103	NC_019972	TGA	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849696
104	NC_019972	TTC	2	6	7763	7768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849696
105	NC_019972	TTC	2	6	7856	7861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849696
106	NC_019972	TGA	2	6	7863	7868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849696
107	NC_019972	CAG	2	6	7884	7889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849696
108	NC_019972	TAT	2	6	7980	7985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019972	TAA	2	6	8057	8062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849697
110	NC_019972	CTT	2	6	8070	8075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849697
111	NC_019972	AGA	2	6	8121	8126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849697
112	NC_019972	CAT	2	6	8156	8161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849697
113	NC_019972	CAT	2	6	8171	8176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849697
114	NC_019972	GGA	2	6	8183	8188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849697
115	NC_019972	GAT	2	6	8214	8219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849697
116	NC_019972	TTC	2	6	8326	8331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849697
117	NC_019972	AAG	3	9	8406	8414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849697
118	NC_019972	TCA	2	6	8470	8475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849697
119	NC_019972	CCA	2	6	8479	8484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849697
120	NC_019972	ATG	2	6	8589	8594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019972	ACA	2	6	8716	8721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019972	TCA	2	6	8804	8809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019972	TTG	2	6	8850	8855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019972	ATA	2	6	8996	9001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019972	CAA	2	6	9126	9131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849698
126	NC_019972	GCA	2	6	9311	9316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849698
127	NC_019972	AAG	2	6	9427	9432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849698
128	NC_019972	TAA	2	6	9499	9504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849698
129	NC_019972	TAA	2	6	9535	9540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849698
130	NC_019972	ATT	2	6	9550	9555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849698
131	NC_019972	AAT	2	6	9762	9767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849698
132	NC_019972	TAT	2	6	9862	9867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849698
133	NC_019972	TCT	2	6	9887	9892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849698
134	NC_019972	TCT	2	6	9930	9935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849698
135	NC_019972	ATT	2	6	10033	10038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849698
136	NC_019972	TGT	2	6	10063	10068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849698
137	NC_019972	GTT	2	6	10127	10132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849699
138	NC_019972	TAT	2	6	10213	10218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849699
139	NC_019972	TCA	2	6	10230	10235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849699
140	NC_019972	TAT	2	6	10236	10241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849699
141	NC_019972	ATT	2	6	10255	10260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849700
142	NC_019972	TTA	2	6	10333	10338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849700
143	NC_019972	TCA	2	6	10377	10382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849700
144	NC_019972	TCA	2	6	10467	10472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849700
145	NC_019972	ATT	2	6	10551	10556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849700
146	NC_019972	CAC	2	6	10569	10574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_019972	TTC	2	6	10612	10617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_019972	TAA	2	6	10646	10651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019972	GAT	2	6	10662	10667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019972	GAA	2	6	10675	10680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019972	AAG	2	6	10682	10687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019972	ATT	2	6	10826	10831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849701
153	NC_019972	TCA	2	6	10835	10840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849701
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156	NC_019972	TTA	2	6	11107	11112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019972	ACT	2	6	11200	11205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_019972	AGA	2	6	11634	11639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849702
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176	NC_019972	CAT	2	6	12476	12481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849702
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178	NC_019972	AAT	2	6	12812	12817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_019972	AAT	2	6	13161	13166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_019972	TGG	4	12	13378	13389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_019972	TAC	2	6	13529	13534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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187	NC_019972	CCT	2	6	13555	13560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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209	NC_019972	TAA	2	6	15163	15168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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212	NC_019972	CCT	2	6	15400	15405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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226	NC_019972	CAA	2	6	16522	16527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
227	NC_019972	TAA	2	6	16671	16676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_019972	ATC	2	6	16810	16815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
232	NC_019972	ATT	2	6	16816	16821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_019972	AAT	2	6	16873	16878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_019972	TAA	2	6	16958	16963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_019972	AGT	2	6	16965	16970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
236	NC_019972	TTA	2	6	16983	16988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_019972	AAT	2	6	17380	17385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_019972	AAG	3	9	17425	17433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
240	NC_019972	TTA	2	6	17463	17468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_019972	AAC	2	6	17488	17493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_019972	ATC	2	6	17511	17516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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247	NC_019972	TTC	2	6	17700	17705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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249	NC_019972	ATA	2	6	18013	18018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_019972	AAT	2	6	18097	18102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_019972	ACT	2	6	18259	18264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_019972	AGA	2	6	18316	18321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_019972	TCT	2	6	18344	18349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_019972	CAA	2	6	18361	18366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_019972	TAT	2	6	18450	18455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_019972	TAT	2	6	18491	18496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_019972	TCA	3	9	18584	18592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_019972	CTA	2	6	18614	18619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_019972	TAC	2	6	18634	18639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_019972	TAA	2	6	18769	18774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_019972	ATT	2	6	19106	19111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_019972	AAC	2	6	19148	19153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_019972	CTG	2	6	19196	19201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_019972	ACC	2	6	19341	19346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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266	NC_019972	TTA	2	6	19776	19781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849707
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385	NC_019972	TAG	2	6	27335	27340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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