MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623

Total Repeats: 16098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019966	CCGC	2	8	192	199	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_019966	GACA	2	8	333	340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019966	TCGC	2	8	1086	1093	0 %	25 %	25 %	50 %	433644872
4	NC_019966	CTCC	2	8	1262	1269	0 %	25 %	0 %	75 %	433644872
5	NC_019966	AAGG	2	8	1353	1360	50 %	0 %	50 %	0 %	433644872
6	NC_019966	CGAT	2	8	2455	2462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019966	GGCG	2	8	2729	2736	0 %	0 %	75 %	25 %	433644873
8	NC_019966	CTGC	2	8	2880	2887	0 %	25 %	25 %	50 %	433644873
9	NC_019966	CGGC	2	8	3064	3071	0 %	0 %	50 %	50 %	433644873
10	NC_019966	GACC	2	8	3143	3150	25 %	0 %	25 %	50 %	433644873
11	NC_019966	AAGG	2	8	3309	3316	50 %	0 %	50 %	0 %	433644873
12	NC_019966	CGCA	2	8	4115	4122	25 %	0 %	25 %	50 %	433644874
13	NC_019966	GAAG	2	8	4188	4195	50 %	0 %	50 %	0 %	433644874
14	NC_019966	AGGT	2	8	4551	4558	25 %	25 %	50 %	0 %	433644874
15	NC_019966	GTTC	2	8	4731	4738	0 %	50 %	25 %	25 %	433644875
16	NC_019966	CGGA	2	8	4797	4804	25 %	0 %	50 %	25 %	433644875
17	NC_019966	GCCC	2	8	5929	5936	0 %	0 %	25 %	75 %	433644876
18	NC_019966	GTCG	2	8	6024	6031	0 %	25 %	50 %	25 %	433644876
19	NC_019966	CTGA	2	8	10265	10272	25 %	25 %	25 %	25 %	433644878
20	NC_019966	ACGC	2	8	10287	10294	25 %	0 %	25 %	50 %	433644878
21	NC_019966	CCGG	2	8	10743	10750	0 %	0 %	50 %	50 %	433644878
22	NC_019966	GACC	2	8	11596	11603	25 %	0 %	25 %	50 %	433644878
23	NC_019966	CCAG	2	8	11812	11819	25 %	0 %	25 %	50 %	433644878
24	NC_019966	CGGC	2	8	12186	12193	0 %	0 %	50 %	50 %	433644878
25	NC_019966	TCGG	2	8	12621	12628	0 %	25 %	50 %	25 %	433644879
26	NC_019966	CAGG	2	8	12723	12730	25 %	0 %	50 %	25 %	433644879
27	NC_019966	GTCG	2	8	13082	13089	0 %	25 %	50 %	25 %	433644879
28	NC_019966	TGAA	2	8	13820	13827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019966	CTTG	2	8	14141	14148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019966	ACTG	2	8	14537	14544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019966	GCGG	2	8	14696	14703	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019966	GCCC	2	8	14826	14833	0 %	0 %	25 %	75 %	433644881
33	NC_019966	ACCG	2	8	15010	15017	25 %	0 %	25 %	50 %	433644881
34	NC_019966	GCCC	2	8	15105	15112	0 %	0 %	25 %	75 %	433644881
35	NC_019966	CAGC	2	8	15474	15481	25 %	0 %	25 %	50 %	433644881
36	NC_019966	CGTC	2	8	16575	16582	0 %	25 %	25 %	50 %	433644882
37	NC_019966	CGGT	2	8	17061	17068	0 %	25 %	50 %	25 %	433644883
38	NC_019966	ACCG	2	8	17162	17169	25 %	0 %	25 %	50 %	433644883
39	NC_019966	CCGA	2	8	17180	17187	25 %	0 %	25 %	50 %	433644883
40	NC_019966	CCCG	2	8	17222	17229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_019966	GTCA	2	8	17262	17269	25 %	25 %	25 %	25 %	433644884
42	NC_019966	AGCA	2	8	17515	17522	50 %	0 %	25 %	25 %	433644884
43	NC_019966	CTGC	2	8	18222	18229	0 %	25 %	25 %	50 %	433644886
44	NC_019966	GCTG	2	8	18768	18775	0 %	25 %	50 %	25 %	433644886
45	NC_019966	CTGG	2	8	19596	19603	0 %	25 %	50 %	25 %	433644887
46	NC_019966	GCCG	2	8	20219	20226	0 %	0 %	50 %	50 %	433644888
47	NC_019966	CTTC	2	8	20593	20600	0 %	50 %	0 %	50 %	433644888
48	NC_019966	CTGT	2	8	21579	21586	0 %	50 %	25 %	25 %	433644889
49	NC_019966	GCAG	2	8	21632	21639	25 %	0 %	50 %	25 %	433644889
50	NC_019966	GCCC	2	8	21962	21969	0 %	0 %	25 %	75 %	433644889
51	NC_019966	GCCC	2	8	22025	22032	0 %	0 %	25 %	75 %	433644889
52	NC_019966	TTGG	2	8	22045	22052	0 %	50 %	50 %	0 %	433644889
53	NC_019966	CGCT	2	8	22911	22918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019966	CCCT	2	8	22980	22987	0 %	25 %	0 %	75 %	433644890
55	NC_019966	GAAC	2	8	23587	23594	50 %	0 %	25 %	25 %	433644890
56	NC_019966	CGGC	2	8	24511	24518	0 %	0 %	50 %	50 %	433644891
57	NC_019966	GTCG	2	8	24823	24830	0 %	25 %	50 %	25 %	433644891
58	NC_019966	TCGG	2	8	25054	25061	0 %	25 %	50 %	25 %	433644891
59	NC_019966	GAAG	2	8	25446	25453	50 %	0 %	50 %	0 %	433644891
60	NC_019966	GCCC	2	8	25539	25546	0 %	0 %	25 %	75 %	433644891
61	NC_019966	GTTC	2	8	25901	25908	0 %	50 %	25 %	25 %	433644892
62	NC_019966	AGCG	2	8	26949	26956	25 %	0 %	50 %	25 %	433644892
63	NC_019966	CCCA	2	8	27305	27312	25 %	0 %	0 %	75 %	433644892
64	NC_019966	GCTG	2	8	27642	27649	0 %	25 %	50 %	25 %	433644893
65	NC_019966	CGGT	2	8	27777	27784	0 %	25 %	50 %	25 %	433644893
66	NC_019966	GTGG	2	8	28601	28608	0 %	25 %	75 %	0 %	433644894
67	NC_019966	GCGG	2	8	28743	28750	0 %	0 %	75 %	25 %	433644894
68	NC_019966	GGGT	2	8	28913	28920	0 %	25 %	75 %	0 %	433644894
69	NC_019966	GCCG	2	8	28971	28978	0 %	0 %	50 %	50 %	433644894
70	NC_019966	CCGC	2	8	29460	29467	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_019966	CGGC	2	8	29912	29919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019966	AGCC	2	8	30113	30120	25 %	0 %	25 %	50 %	433644895
73	NC_019966	GGCG	2	8	30130	30137	0 %	0 %	75 %	25 %	433644895
74	NC_019966	GTTC	2	8	30150	30157	0 %	50 %	25 %	25 %	433644895
75	NC_019966	GCCA	2	8	30302	30309	25 %	0 %	25 %	50 %	433644895
76	NC_019966	GCCC	2	8	30463	30470	0 %	0 %	25 %	75 %	433644895
77	NC_019966	TCCG	2	8	30688	30695	0 %	25 %	25 %	50 %	433644895
78	NC_019966	CTGC	2	8	31003	31010	0 %	25 %	25 %	50 %	433644895
79	NC_019966	TCGA	2	8	31670	31677	25 %	25 %	25 %	25 %	433644896
80	NC_019966	TGGC	2	8	31878	31885	0 %	25 %	50 %	25 %	433644897
81	NC_019966	CGGC	2	8	31897	31904	0 %	0 %	50 %	50 %	433644897
82	NC_019966	GCTG	2	8	32817	32824	0 %	25 %	50 %	25 %	433644897
83	NC_019966	CGCC	2	8	33360	33367	0 %	0 %	25 %	75 %	433644897
84	NC_019966	CGGG	2	8	33876	33883	0 %	0 %	75 %	25 %	433644897
85	NC_019966	ATCG	2	8	34378	34385	25 %	25 %	25 %	25 %	433644898
86	NC_019966	ACGT	2	8	34924	34931	25 %	25 %	25 %	25 %	433644899
87	NC_019966	GACC	2	8	35049	35056	25 %	0 %	25 %	50 %	433644899
88	NC_019966	GGTC	2	8	35561	35568	0 %	25 %	50 %	25 %	433644900
89	NC_019966	CGAC	2	8	35939	35946	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019966	CCAC	2	8	37057	37064	25 %	0 %	0 %	75 %	433644902
91	NC_019966	CGCC	2	8	37126	37133	0 %	0 %	25 %	75 %	433644902
92	NC_019966	GGAC	2	8	37155	37162	25 %	0 %	50 %	25 %	433644902
93	NC_019966	AGCG	2	8	37323	37330	25 %	0 %	50 %	25 %	433644902
94	NC_019966	GCGG	2	8	37573	37580	0 %	0 %	75 %	25 %	433644903
95	NC_019966	CGGC	2	8	37944	37951	0 %	0 %	50 %	50 %	433644903
96	NC_019966	GTAG	2	8	38037	38044	25 %	25 %	50 %	0 %	433644903
97	NC_019966	GGGC	2	8	38658	38665	0 %	0 %	75 %	25 %	433644904
98	NC_019966	CAGC	2	8	39395	39402	25 %	0 %	25 %	50 %	433644905
99	NC_019966	CGAG	2	8	39779	39786	25 %	0 %	50 %	25 %	433644905
100	NC_019966	GCCG	2	8	40742	40749	0 %	0 %	50 %	50 %	433644905
101	NC_019966	CCGC	2	8	40768	40775	0 %	0 %	25 %	75 %	433644905
102	NC_019966	CGAT	2	8	41769	41776	25 %	25 %	25 %	25 %	433644906
103	NC_019966	CGGC	2	8	42225	42232	0 %	0 %	50 %	50 %	433644907
104	NC_019966	CGCC	2	8	42429	42436	0 %	0 %	25 %	75 %	433644907
105	NC_019966	GGGC	2	8	43254	43261	0 %	0 %	75 %	25 %	433644908
106	NC_019966	GACC	2	8	44076	44083	25 %	0 %	25 %	50 %	433644908
107	NC_019966	GCGG	2	8	44124	44131	0 %	0 %	75 %	25 %	433644908
108	NC_019966	CGGT	2	8	44150	44157	0 %	25 %	50 %	25 %	433644908
109	NC_019966	GCGT	2	8	44191	44198	0 %	25 %	50 %	25 %	433644908
110	NC_019966	CGCC	2	8	44783	44790	0 %	0 %	25 %	75 %	433644909
111	NC_019966	CCAC	2	8	44981	44988	25 %	0 %	0 %	75 %	433644909
112	NC_019966	TCGG	2	8	45094	45101	0 %	25 %	50 %	25 %	433644909
113	NC_019966	GATG	2	8	45300	45307	25 %	25 %	50 %	0 %	433644909
114	NC_019966	CGAG	2	8	45925	45932	25 %	0 %	50 %	25 %	433644911
115	NC_019966	GTAG	2	8	46857	46864	25 %	25 %	50 %	0 %	433644912
116	NC_019966	GGCA	2	8	47167	47174	25 %	0 %	50 %	25 %	433644912
117	NC_019966	GTGC	2	8	47389	47396	0 %	25 %	50 %	25 %	433644912
118	NC_019966	CCAA	2	8	48238	48245	50 %	0 %	0 %	50 %	433644913
119	NC_019966	CCGC	2	8	48491	48498	0 %	0 %	25 %	75 %	433644913
120	NC_019966	AGCC	2	8	49096	49103	25 %	0 %	25 %	50 %	433644913
121	NC_019966	CAGC	2	8	49347	49354	25 %	0 %	25 %	50 %	433644913
122	NC_019966	GCCG	2	8	49588	49595	0 %	0 %	50 %	50 %	433644913
123	NC_019966	GCCA	2	8	50266	50273	25 %	0 %	25 %	50 %	433644914
124	NC_019966	ACGG	2	8	51322	51329	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019966	GACC	2	8	51527	51534	25 %	0 %	25 %	50 %	433644916
126	NC_019966	GGCA	2	8	51809	51816	25 %	0 %	50 %	25 %	433644916
127	NC_019966	TGGC	2	8	51981	51988	0 %	25 %	50 %	25 %	433644916
128	NC_019966	GTCG	2	8	52304	52311	0 %	25 %	50 %	25 %	433644916
129	NC_019966	AAAC	2	8	52526	52533	75 %	0 %	0 %	25 %	433644917
130	NC_019966	TGGC	2	8	52874	52881	0 %	25 %	50 %	25 %	433644917
131	NC_019966	TGGG	2	8	53724	53731	0 %	25 %	75 %	0 %	433644917
132	NC_019966	TCCG	2	8	54208	54215	0 %	25 %	25 %	50 %	433644917
133	NC_019966	ACCG	2	8	54248	54255	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019966	CGGT	2	8	54308	54315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019966	GGTT	2	8	54353	54360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019966	AGGA	2	8	54386	54393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019966	CACC	2	8	54394	54401	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_019966	GCAA	2	8	54526	54533	50 %	0 %	25 %	25 %	433644918
139	NC_019966	TGGC	2	8	54627	54634	0 %	25 %	50 %	25 %	433644918
140	NC_019966	CGGC	2	8	55588	55595	0 %	0 %	50 %	50 %	433644918
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142	NC_019966	CAGA	2	8	56580	56587	50 %	0 %	25 %	25 %	433644919
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