MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM03

Total Repeats: 328

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019959	GC	3	6	260	265	0 %	0 %	50 %	50 %	433644685
2	NC_019959	GC	3	6	967	972	0 %	0 %	50 %	50 %	433644687
3	NC_019959	CG	3	6	1465	1470	0 %	0 %	50 %	50 %	433644688
4	NC_019959	CG	3	6	2516	2521	0 %	0 %	50 %	50 %	433644690
5	NC_019959	GC	3	6	2899	2904	0 %	0 %	50 %	50 %	433644691
6	NC_019959	GC	3	6	4014	4019	0 %	0 %	50 %	50 %	433644692
7	NC_019959	CG	3	6	5014	5019	0 %	0 %	50 %	50 %	433644693
8	NC_019959	TG	3	6	5138	5143	0 %	50 %	50 %	0 %	433644694
9	NC_019959	CG	3	6	6015	6020	0 %	0 %	50 %	50 %	433644695
10	NC_019959	CG	3	6	7034	7039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019959	GC	3	6	7106	7111	0 %	0 %	50 %	50 %	433644698
12	NC_019959	CG	3	6	8007	8012	0 %	0 %	50 %	50 %	433644699
13	NC_019959	GC	3	6	8820	8825	0 %	0 %	50 %	50 %	433644700
14	NC_019959	CG	3	6	9575	9580	0 %	0 %	50 %	50 %	433644701
15	NC_019959	TG	3	6	10422	10427	0 %	50 %	50 %	0 %	433644701
16	NC_019959	GC	3	6	10793	10798	0 %	0 %	50 %	50 %	433644701
17	NC_019959	GC	3	6	10834	10839	0 %	0 %	50 %	50 %	433644701
18	NC_019959	CG	3	6	11056	11061	0 %	0 %	50 %	50 %	433644701
19	NC_019959	GC	3	6	11075	11080	0 %	0 %	50 %	50 %	433644701
20	NC_019959	CG	3	6	12069	12074	0 %	0 %	50 %	50 %	433644701
21	NC_019959	CG	3	6	13922	13927	0 %	0 %	50 %	50 %	433644702
22	NC_019959	GC	3	6	13944	13949	0 %	0 %	50 %	50 %	433644702
23	NC_019959	GC	3	6	14742	14747	0 %	0 %	50 %	50 %	433644702
24	NC_019959	GT	3	6	15519	15524	0 %	50 %	50 %	0 %	433644703
25	NC_019959	GC	3	6	15885	15890	0 %	0 %	50 %	50 %	433644703
26	NC_019959	CG	3	6	15897	15902	0 %	0 %	50 %	50 %	433644703
27	NC_019959	CG	3	6	15965	15970	0 %	0 %	50 %	50 %	433644703
28	NC_019959	CA	3	6	16008	16013	50 %	0 %	0 %	50 %	433644703
29	NC_019959	CG	3	6	16217	16222	0 %	0 %	50 %	50 %	433644703
30	NC_019959	GC	3	6	16400	16405	0 %	0 %	50 %	50 %	433644703
31	NC_019959	CG	3	6	16520	16525	0 %	0 %	50 %	50 %	433644703
32	NC_019959	CA	3	6	17964	17969	50 %	0 %	0 %	50 %	433644703
33	NC_019959	GC	3	6	18246	18251	0 %	0 %	50 %	50 %	433644703
34	NC_019959	CA	3	6	20041	20046	50 %	0 %	0 %	50 %	433644705
35	NC_019959	GC	3	6	20109	20114	0 %	0 %	50 %	50 %	433644705
36	NC_019959	CG	4	8	20115	20122	0 %	0 %	50 %	50 %	433644705
37	NC_019959	CG	3	6	20187	20192	0 %	0 %	50 %	50 %	433644705
38	NC_019959	GT	3	6	20384	20389	0 %	50 %	50 %	0 %	433644705
39	NC_019959	CG	3	6	21137	21142	0 %	0 %	50 %	50 %	433644705
40	NC_019959	CA	3	6	21225	21230	50 %	0 %	0 %	50 %	433644705
41	NC_019959	CG	3	6	21239	21244	0 %	0 %	50 %	50 %	433644705
42	NC_019959	GC	3	6	21290	21295	0 %	0 %	50 %	50 %	433644705
43	NC_019959	CG	3	6	21652	21657	0 %	0 %	50 %	50 %	433644706
44	NC_019959	GC	4	8	21702	21709	0 %	0 %	50 %	50 %	433644706
45	NC_019959	GC	3	6	21797	21802	0 %	0 %	50 %	50 %	433644706
46	NC_019959	CT	3	6	22378	22383	0 %	50 %	0 %	50 %	433644707
47	NC_019959	CG	3	6	22704	22709	0 %	0 %	50 %	50 %	433644708
48	NC_019959	CG	3	6	23488	23493	0 %	0 %	50 %	50 %	433644710
49	NC_019959	GC	3	6	23914	23919	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
50	NC_019959	CG	3	6	24472	24477	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
51	NC_019959	CG	3	6	24605	24610	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
52	NC_019959	CG	3	6	24708	24713	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
53	NC_019959	GC	3	6	24871	24876	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
54	NC_019959	GC	3	6	25280	25285	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
55	NC_019959	AC	3	6	25313	25318	50 %	0 %	0 %	50 %	433644711
56	NC_019959	GC	3	6	26107	26112	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
57	NC_019959	TC	3	6	26200	26205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019959	CG	4	8	26240	26247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019959	CG	4	8	27873	27880	0 %	0 %	50 %	50 %	433644714
60	NC_019959	GC	3	6	27897	27902	0 %	0 %	50 %	50 %	433644714
61	NC_019959	CA	3	6	28741	28746	50 %	0 %	0 %	50 %	433644715
62	NC_019959	GC	3	6	28800	28805	0 %	0 %	50 %	50 %	433644715
63	NC_019959	CG	3	6	29344	29349	0 %	0 %	50 %	50 %	433644717
64	NC_019959	GC	3	6	29521	29526	0 %	0 %	50 %	50 %	433644717
65	NC_019959	GC	3	6	29776	29781	0 %	0 %	50 %	50 %	433644718
66	NC_019959	CG	3	6	30776	30781	0 %	0 %	50 %	50 %	433644720
67	NC_019959	CA	3	6	31341	31346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019959	CG	3	6	31552	31557	0 %	0 %	50 %	50 %	433644723
69	NC_019959	GC	3	6	32827	32832	0 %	0 %	50 %	50 %	433644724
70	NC_019959	GT	3	6	34265	34270	0 %	50 %	50 %	0 %	433644728
71	NC_019959	CG	3	6	34369	34374	0 %	0 %	50 %	50 %	433644728
72	NC_019959	GC	3	6	34803	34808	0 %	0 %	50 %	50 %	433644729
73	NC_019959	GC	3	6	35026	35031	0 %	0 %	50 %	50 %	433644729
74	NC_019959	CG	3	6	35316	35321	0 %	0 %	50 %	50 %	433644729
75	NC_019959	CG	3	6	35340	35345	0 %	0 %	50 %	50 %	433644729
76	NC_019959	CG	3	6	36855	36860	0 %	0 %	50 %	50 %	433644729
77	NC_019959	TC	3	6	36993	36998	0 %	50 %	0 %	50 %	433644729
78	NC_019959	GC	4	8	38149	38156	0 %	0 %	50 %	50 %	433644731
79	NC_019959	GC	3	6	40205	40210	0 %	0 %	50 %	50 %	433644734
80	NC_019959	CG	4	8	40239	40246	0 %	0 %	50 %	50 %	433644734
81	NC_019959	CG	3	6	40384	40389	0 %	0 %	50 %	50 %	433644734
82	NC_019959	TG	3	6	41039	41044	0 %	50 %	50 %	0 %	433644734
83	NC_019959	GC	3	6	41098	41103	0 %	0 %	50 %	50 %	433644734
84	NC_019959	CG	3	6	41218	41223	0 %	0 %	50 %	50 %	433644734
85	NC_019959	GC	3	6	41303	41308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019959	GC	3	6	41330	41335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019959	GC	3	6	41377	41382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019959	CG	3	6	41665	41670	0 %	0 %	50 %	50 %	433644735
89	NC_019959	GC	3	6	41728	41733	0 %	0 %	50 %	50 %	433644735
90	NC_019959	GC	3	6	41739	41744	0 %	0 %	50 %	50 %	433644735
91	NC_019959	GT	3	6	41957	41962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019959	AG	3	6	42264	42269	50 %	0 %	50 %	0 %	433644737
93	NC_019959	CG	3	6	42878	42883	0 %	0 %	50 %	50 %	433644738
94	NC_019959	GC	3	6	43396	43401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019959	TG	3	6	43673	43678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019959	GT	3	6	43683	43688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019959	GC	3	6	44090	44095	0 %	0 %	50 %	50 %	433644739
98	NC_019959	GC	3	6	45658	45663	0 %	0 %	50 %	50 %	433644743
99	NC_019959	TC	3	6	47206	47211	0 %	50 %	0 %	50 %	433644744
100	NC_019959	GC	3	6	48249	48254	0 %	0 %	50 %	50 %	433644746
101	NC_019959	GC	3	6	48287	48292	0 %	0 %	50 %	50 %	433644746
102	NC_019959	CG	3	6	48601	48606	0 %	0 %	50 %	50 %	433644746
103	NC_019959	GC	3	6	48653	48658	0 %	0 %	50 %	50 %	433644746
104	NC_019959	GC	3	6	48684	48689	0 %	0 %	50 %	50 %	433644746
105	NC_019959	CG	3	6	49821	49826	0 %	0 %	50 %	50 %	433644748
106	NC_019959	GT	3	6	50189	50194	0 %	50 %	50 %	0 %	433644748
107	NC_019959	CG	3	6	50283	50288	0 %	0 %	50 %	50 %	433644748
108	NC_019959	CG	3	6	50649	50654	0 %	0 %	50 %	50 %	433644748
109	NC_019959	CG	3	6	50787	50792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019959	GC	3	6	51385	51390	0 %	0 %	50 %	50 %	433644749
111	NC_019959	CG	3	6	52542	52547	0 %	0 %	50 %	50 %	433644750
112	NC_019959	CG	3	6	52983	52988	0 %	0 %	50 %	50 %	433644750
113	NC_019959	GC	3	6	53039	53044	0 %	0 %	50 %	50 %	433644750
114	NC_019959	GC	3	6	53932	53937	0 %	0 %	50 %	50 %	433644752
115	NC_019959	AC	3	6	54312	54317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019959	GC	4	8	54487	54494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019959	GC	3	6	54703	54708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019959	GT	3	6	55282	55287	0 %	50 %	50 %	0 %	433644755
119	NC_019959	CA	3	6	55979	55984	50 %	0 %	0 %	50 %	433644755
120	NC_019959	GC	3	6	56628	56633	0 %	0 %	50 %	50 %	433644756
121	NC_019959	GC	4	8	56719	56726	0 %	0 %	50 %	50 %	433644756
122	NC_019959	GC	3	6	57110	57115	0 %	0 %	50 %	50 %	433644756
123	NC_019959	GC	3	6	57532	57537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_019959	CG	3	6	58067	58072	0 %	0 %	50 %	50 %	433644757
125	NC_019959	GC	3	6	58878	58883	0 %	0 %	50 %	50 %	433644758
126	NC_019959	TC	3	6	59359	59364	0 %	50 %	0 %	50 %	433644759
127	NC_019959	AC	4	8	59783	59790	50 %	0 %	0 %	50 %	433644760
128	NC_019959	GC	3	6	60350	60355	0 %	0 %	50 %	50 %	433644761
129	NC_019959	CG	3	6	61104	61109	0 %	0 %	50 %	50 %	433644761
130	NC_019959	TC	3	6	61249	61254	0 %	50 %	0 %	50 %	433644761
131	NC_019959	GC	3	6	62616	62621	0 %	0 %	50 %	50 %	433644762
132	NC_019959	AC	3	6	67842	67847	50 %	0 %	0 %	50 %	433644767
133	NC_019959	CG	4	8	68313	68320	0 %	0 %	50 %	50 %	433644767
134	NC_019959	GC	3	6	68750	68755	0 %	0 %	50 %	50 %	433644767
135	NC_019959	CG	3	6	68958	68963	0 %	0 %	50 %	50 %	433644767
136	NC_019959	GC	3	6	69123	69128	0 %	0 %	50 %	50 %	433644767
137	NC_019959	CG	5	10	69466	69475	0 %	0 %	50 %	50 %	433644767
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139	NC_019959	CG	3	6	70547	70552	0 %	0 %	50 %	50 %	433644768
140	NC_019959	CG	3	6	70895	70900	0 %	0 %	50 %	50 %	433644769
141	NC_019959	CG	3	6	71994	71999	0 %	0 %	50 %	50 %	433644771
142	NC_019959	TG	3	6	72401	72406	0 %	50 %	50 %	0 %	433644771
143	NC_019959	GC	3	6	73346	73351	0 %	0 %	50 %	50 %	433644771
144	NC_019959	GC	3	6	73410	73415	0 %	0 %	50 %	50 %	433644771
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.