MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM02

Total Repeats: 447

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019958	CG	3	6	77	82	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019958	GC	3	6	130	135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019958	AC	4	8	256	263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019958	GC	3	6	614	619	0 %	0 %	50 %	50 %	433644439
5	NC_019958	GC	3	6	714	719	0 %	0 %	50 %	50 %	433644439
6	NC_019958	CG	3	6	1123	1128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019958	TG	3	6	1437	1442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019958	GC	3	6	2229	2234	0 %	0 %	50 %	50 %	433644442
9	NC_019958	CG	3	6	2706	2711	0 %	0 %	50 %	50 %	433644443
10	NC_019958	GC	3	6	2750	2755	0 %	0 %	50 %	50 %	433644443
11	NC_019958	CA	3	6	3175	3180	50 %	0 %	0 %	50 %	433644444
12	NC_019958	GC	3	6	4116	4121	0 %	0 %	50 %	50 %	433644446
13	NC_019958	TG	3	6	4347	4352	0 %	50 %	50 %	0 %	433644446
14	NC_019958	CA	3	6	4505	4510	50 %	0 %	0 %	50 %	433644446
15	NC_019958	AC	3	6	5028	5033	50 %	0 %	0 %	50 %	433644447
16	NC_019958	CG	3	6	5051	5056	0 %	0 %	50 %	50 %	433644447
17	NC_019958	CG	3	6	5509	5514	0 %	0 %	50 %	50 %	433644448
18	NC_019958	CG	3	6	7200	7205	0 %	0 %	50 %	50 %	433644448
19	NC_019958	CG	3	6	8371	8376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019958	TG	3	6	9920	9925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019958	GC	3	6	10140	10145	0 %	0 %	50 %	50 %	433644454
22	NC_019958	GC	4	8	11084	11091	0 %	0 %	50 %	50 %	433644455
23	NC_019958	CT	3	6	11114	11119	0 %	50 %	0 %	50 %	433644455
24	NC_019958	GC	3	6	12492	12497	0 %	0 %	50 %	50 %	433644457
25	NC_019958	GT	3	6	13271	13276	0 %	50 %	50 %	0 %	433644457
26	NC_019958	GC	3	6	14210	14215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019958	CA	3	6	14948	14953	50 %	0 %	0 %	50 %	433644459
28	NC_019958	GC	3	6	15387	15392	0 %	0 %	50 %	50 %	433644460
29	NC_019958	CG	3	6	16967	16972	0 %	0 %	50 %	50 %	433644462
30	NC_019958	CG	3	6	17503	17508	0 %	0 %	50 %	50 %	433644463
31	NC_019958	GC	3	6	18070	18075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019958	CG	3	6	18833	18838	0 %	0 %	50 %	50 %	433644464
33	NC_019958	CG	3	6	19212	19217	0 %	0 %	50 %	50 %	433644465
34	NC_019958	GC	3	6	19656	19661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019958	CA	3	6	20272	20277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019958	CT	3	6	20665	20670	0 %	50 %	0 %	50 %	433644466
37	NC_019958	GC	3	6	20679	20684	0 %	0 %	50 %	50 %	433644466
38	NC_019958	GC	3	6	20906	20911	0 %	0 %	50 %	50 %	433644466
39	NC_019958	AC	3	6	20941	20946	50 %	0 %	0 %	50 %	433644466
40	NC_019958	AC	3	6	20985	20990	50 %	0 %	0 %	50 %	433644466
41	NC_019958	CT	3	6	21573	21578	0 %	50 %	0 %	50 %	433644468
42	NC_019958	CG	3	6	21739	21744	0 %	0 %	50 %	50 %	433644468
43	NC_019958	CG	3	6	21858	21863	0 %	0 %	50 %	50 %	433644468
44	NC_019958	GT	3	6	22095	22100	0 %	50 %	50 %	0 %	433644469
45	NC_019958	CG	3	6	23422	23427	0 %	0 %	50 %	50 %	433644470
46	NC_019958	CG	3	6	23553	23558	0 %	0 %	50 %	50 %	433644470
47	NC_019958	AC	4	8	24218	24225	50 %	0 %	0 %	50 %	433644472
48	NC_019958	GT	3	6	24240	24245	0 %	50 %	50 %	0 %	433644472
49	NC_019958	GC	3	6	24728	24733	0 %	0 %	50 %	50 %	433644473
50	NC_019958	CA	3	6	24829	24834	50 %	0 %	0 %	50 %	433644473
51	NC_019958	TG	3	6	25343	25348	0 %	50 %	50 %	0 %	433644473
52	NC_019958	GA	3	6	25676	25681	50 %	0 %	50 %	0 %	433644474
53	NC_019958	CG	3	6	25961	25966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019958	GT	3	6	26627	26632	0 %	50 %	50 %	0 %	433644475
55	NC_019958	CG	3	6	26964	26969	0 %	0 %	50 %	50 %	433644475
56	NC_019958	CG	3	6	26971	26976	0 %	0 %	50 %	50 %	433644475
57	NC_019958	AC	3	6	27020	27025	50 %	0 %	0 %	50 %	433644475
58	NC_019958	GC	3	6	27105	27110	0 %	0 %	50 %	50 %	433644475
59	NC_019958	CG	3	6	28135	28140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019958	AC	3	6	28160	28165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019958	CG	3	6	28408	28413	0 %	0 %	50 %	50 %	433644477
62	NC_019958	GC	3	6	28446	28451	0 %	0 %	50 %	50 %	433644477
63	NC_019958	GC	3	6	29438	29443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019958	TG	3	6	31784	31789	0 %	50 %	50 %	0 %	433644484
65	NC_019958	CT	3	6	32780	32785	0 %	50 %	0 %	50 %	433644487
66	NC_019958	GT	3	6	33251	33256	0 %	50 %	50 %	0 %	433644488
67	NC_019958	GC	3	6	33288	33293	0 %	0 %	50 %	50 %	433644488
68	NC_019958	GT	4	8	33316	33323	0 %	50 %	50 %	0 %	433644488
69	NC_019958	CG	3	6	33569	33574	0 %	0 %	50 %	50 %	433644489
70	NC_019958	GC	3	6	33584	33589	0 %	0 %	50 %	50 %	433644489
71	NC_019958	GA	3	6	33920	33925	50 %	0 %	50 %	0 %	433644490
72	NC_019958	CG	3	6	33968	33973	0 %	0 %	50 %	50 %	433644490
73	NC_019958	GC	3	6	34148	34153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019958	CG	3	6	34610	34615	0 %	0 %	50 %	50 %	433644492
75	NC_019958	GC	3	6	34859	34864	0 %	0 %	50 %	50 %	433644493
76	NC_019958	GC	3	6	35104	35109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019958	CG	3	6	36616	36621	0 %	0 %	50 %	50 %	433644495
78	NC_019958	CG	3	6	36667	36672	0 %	0 %	50 %	50 %	433644495
79	NC_019958	GC	3	6	36758	36763	0 %	0 %	50 %	50 %	433644495
80	NC_019958	GC	3	6	37313	37318	0 %	0 %	50 %	50 %	433644495
81	NC_019958	CG	4	8	37391	37398	0 %	0 %	50 %	50 %	433644495
82	NC_019958	CG	3	6	37423	37428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019958	CG	3	6	37746	37751	0 %	0 %	50 %	50 %	433644496
84	NC_019958	CA	3	6	38591	38596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019958	GC	3	6	38723	38728	0 %	0 %	50 %	50 %	433644497
86	NC_019958	CT	3	6	38943	38948	0 %	50 %	0 %	50 %	433644497
87	NC_019958	CG	3	6	39333	39338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019958	CA	3	6	39364	39369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019958	GC	4	8	40229	40236	0 %	0 %	50 %	50 %	433644499
90	NC_019958	CG	3	6	41011	41016	0 %	0 %	50 %	50 %	433644500
91	NC_019958	CG	3	6	41444	41449	0 %	0 %	50 %	50 %	433644500
92	NC_019958	CG	3	6	41641	41646	0 %	0 %	50 %	50 %	433644501
93	NC_019958	GC	3	6	41743	41748	0 %	0 %	50 %	50 %	433644501
94	NC_019958	AC	3	6	43661	43666	50 %	0 %	0 %	50 %	433644503
95	NC_019958	CG	3	6	43725	43730	0 %	0 %	50 %	50 %	433644503
96	NC_019958	CG	3	6	43755	43760	0 %	0 %	50 %	50 %	433644503
97	NC_019958	GC	3	6	43810	43815	0 %	0 %	50 %	50 %	433644503
98	NC_019958	GC	4	8	44040	44047	0 %	0 %	50 %	50 %	433644504
99	NC_019958	GC	3	6	44349	44354	0 %	0 %	50 %	50 %	433644504
100	NC_019958	GC	3	6	45650	45655	0 %	0 %	50 %	50 %	433644505
101	NC_019958	GC	3	6	46126	46131	0 %	0 %	50 %	50 %	433644505
102	NC_019958	GC	4	8	46234	46241	0 %	0 %	50 %	50 %	433644505
103	NC_019958	GC	3	6	46378	46383	0 %	0 %	50 %	50 %	433644505
104	NC_019958	CG	3	6	46775	46780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019958	AC	3	6	47164	47169	50 %	0 %	0 %	50 %	433644506
106	NC_019958	CG	3	6	47541	47546	0 %	0 %	50 %	50 %	433644506
107	NC_019958	GC	3	6	48008	48013	0 %	0 %	50 %	50 %	433644506
108	NC_019958	GC	3	6	48134	48139	0 %	0 %	50 %	50 %	433644507
109	NC_019958	GC	5	10	48643	48652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019958	CG	3	6	48951	48956	0 %	0 %	50 %	50 %	433644508
111	NC_019958	CT	3	6	49153	49158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019958	GC	3	6	49178	49183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019958	CT	3	6	50118	50123	0 %	50 %	0 %	50 %	433644510
114	NC_019958	CG	3	6	50820	50825	0 %	0 %	50 %	50 %	433644512
115	NC_019958	CG	3	6	51353	51358	0 %	0 %	50 %	50 %	433644514
116	NC_019958	GC	3	6	51400	51405	0 %	0 %	50 %	50 %	433644514
117	NC_019958	CG	3	6	51589	51594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019958	GC	3	6	52064	52069	0 %	0 %	50 %	50 %	433644515
119	NC_019958	GC	3	6	52322	52327	0 %	0 %	50 %	50 %	433644515
120	NC_019958	GC	3	6	52493	52498	0 %	0 %	50 %	50 %	433644515
121	NC_019958	GT	3	6	52714	52719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019958	CG	3	6	53077	53082	0 %	0 %	50 %	50 %	433644516
123	NC_019958	CG	3	6	53194	53199	0 %	0 %	50 %	50 %	433644516
124	NC_019958	GC	3	6	53714	53719	0 %	0 %	50 %	50 %	433644517
125	NC_019958	CA	3	6	56044	56049	50 %	0 %	0 %	50 %	433644520
126	NC_019958	AC	3	6	56361	56366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019958	GT	3	6	56591	56596	0 %	50 %	50 %	0 %	433644521
128	NC_019958	CG	3	6	56985	56990	0 %	0 %	50 %	50 %	433644521
129	NC_019958	GC	3	6	56999	57004	0 %	0 %	50 %	50 %	433644521
130	NC_019958	CA	3	6	57080	57085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_019958	CG	3	6	57431	57436	0 %	0 %	50 %	50 %	433644522
132	NC_019958	GT	3	6	57735	57740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019958	GC	3	6	58180	58185	0 %	0 %	50 %	50 %	433644523
134	NC_019958	GC	3	6	58328	58333	0 %	0 %	50 %	50 %	433644523
135	NC_019958	CG	3	6	59313	59318	0 %	0 %	50 %	50 %	433644525
136	NC_019958	CG	3	6	59843	59848	0 %	0 %	50 %	50 %	433644527
137	NC_019958	CG	3	6	59992	59997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019958	CG	3	6	60102	60107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019958	CA	3	6	60383	60388	50 %	0 %	0 %	50 %	433644528
140	NC_019958	CG	3	6	60494	60499	0 %	0 %	50 %	50 %	433644528
141	NC_019958	CG	3	6	61086	61091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019958	CG	3	6	61809	61814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019958	CG	3	6	61862	61867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019958	TC	3	6	62444	62449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019958	CG	3	6	63140	63145	0 %	0 %	50 %	50 %	433644535
146	NC_019958	GC	3	6	64140	64145	0 %	0 %	50 %	50 %	433644536
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.