MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM01

Total Repeats: 9483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_019957	CGG	2	6	46070	46075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644145
1003	NC_019957	GCG	2	6	46079	46084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644145
1004	NC_019957	GGCA	2	8	46155	46162	25 %	0 %	50 %	25 %	433644145
1005	NC_019957	TCG	2	6	46195	46200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644145
1006	NC_019957	TGC	3	9	46234	46242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644145
1007	NC_019957	CGT	3	9	46268	46276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644145
1008	NC_019957	TCG	2	6	46372	46377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644145
1009	NC_019957	CGG	2	6	46407	46412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644145
1010	NC_019957	GTCGG	2	10	46441	46450	0 %	20 %	60 %	20 %	433644145
1011	NC_019957	GGC	2	6	46467	46472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644145
1012	NC_019957	GTC	2	6	46509	46514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644145
1013	NC_019957	TGG	2	6	46520	46525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644145
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1015	NC_019957	GCCG	2	8	46617	46624	0 %	0 %	50 %	50 %	433644145
1016	NC_019957	CTG	2	6	46674	46679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644145
1017	NC_019957	CGT	2	6	46718	46723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644145
1018	NC_019957	CCA	2	6	46781	46786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644145
1019	NC_019957	CG	3	6	46814	46819	0 %	0 %	50 %	50 %	433644145
1020	NC_019957	GGC	2	6	46829	46834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644145
1021	NC_019957	GAT	2	6	46848	46853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644145
1022	NC_019957	CGG	2	6	46893	46898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644145
1023	NC_019957	GGC	2	6	46915	46920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644145
1024	NC_019957	CGG	2	6	47009	47014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644145
1025	NC_019957	CGT	2	6	47024	47029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644145
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1027	NC_019957	CTG	2	6	47061	47066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644145
1028	NC_019957	CTC	2	6	47127	47132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644145
1029	NC_019957	TCCA	2	8	47136	47143	25 %	25 %	0 %	50 %	433644145
1030	NC_019957	GGC	2	6	47164	47169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644145
1031	NC_019957	CGC	2	6	47211	47216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644145
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1033	NC_019957	CTG	2	6	47289	47294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644145
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1035	NC_019957	CAC	2	6	47472	47477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644145
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1041	NC_019957	GTC	2	6	47670	47675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644145
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1043	NC_019957	AGT	2	6	47795	47800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644145
1044	NC_019957	CACC	2	8	47813	47820	25 %	0 %	0 %	75 %	433644145
1045	NC_019957	GCGG	2	8	47836	47843	0 %	0 %	75 %	25 %	433644145
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1051	NC_019957	CG	3	6	48067	48072	0 %	0 %	50 %	50 %	433644145
1052	NC_019957	TGA	2	6	48086	48091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644145
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1055	NC_019957	GTC	2	6	48180	48185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644145
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1058	NC_019957	GGCG	2	8	48283	48290	0 %	0 %	75 %	25 %	433644145
1059	NC_019957	GCGG	2	8	48358	48365	0 %	0 %	75 %	25 %	433644145
1060	NC_019957	GCGG	2	8	48376	48383	0 %	0 %	75 %	25 %	433644145
1061	NC_019957	CGG	2	6	48392	48397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644145
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1064	NC_019957	GTA	2	6	48534	48539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644145
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1088	NC_019957	TG	3	6	49323	49328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_019957	TCG	2	6	49514	49519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1095	NC_019957	CGT	2	6	49678	49683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_019957	TGA	2	6	49697	49702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_019957	AGGG	2	8	49727	49734	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1105	NC_019957	AC	3	6	50208	50213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_019957	CGG	2	6	50216	50221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_019957	GCA	2	6	50225	50230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1109	NC_019957	CGG	2	6	50410	50415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644148
1110	NC_019957	CTT	2	6	50456	50461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644148
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1120	NC_019957	TCT	2	6	51022	51027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644148
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1318	NC_019957	GCA	2	6	57976	57981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644150
1319	NC_019957	CTG	2	6	58060	58065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644150
1320	NC_019957	GCCGC	2	10	58080	58089	0 %	0 %	40 %	60 %	433644150
1321	NC_019957	GCC	2	6	58094	58099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644150
1322	NC_019957	CGA	2	6	58102	58107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644150
1323	NC_019957	GTG	2	6	58128	58133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644150
1324	NC_019957	CGG	2	6	58207	58212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644150
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1341	NC_019957	GCG	3	9	58537	58545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644150
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1343	NC_019957	CGA	2	6	58591	58596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644150
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1345	NC_019957	GCC	2	6	58638	58643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644150
1346	NC_019957	GTT	2	6	58646	58651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644150
1347	NC_019957	TTG	3	9	58676	58684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644150
1348	NC_019957	TCG	2	6	58692	58697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644150
1349	NC_019957	CTC	2	6	58743	58748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1350	NC_019957	CCG	2	6	58752	58757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1351	NC_019957	G	6	6	59027	59032	0 %	0 %	100 %	0 %	433644151
1352	NC_019957	GGC	2	6	59078	59083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644151
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1356	NC_019957	CAG	2	6	59151	59156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644151
1357	NC_019957	GTC	2	6	59170	59175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644151
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1359	NC_019957	GCG	2	6	59227	59232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644151
1360	NC_019957	GC	3	6	59243	59248	0 %	0 %	50 %	50 %	433644151
1361	NC_019957	GCG	2	6	59251	59256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644151
1362	NC_019957	GCC	2	6	59289	59294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644151
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1364	NC_019957	CGA	2	6	59321	59326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644151
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1367	NC_019957	GCC	2	6	59538	59543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644151
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1370	NC_019957	CGG	2	6	59666	59671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644151
1371	NC_019957	GAT	2	6	59683	59688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644151
1372	NC_019957	GGC	2	6	59709	59714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644151
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1374	NC_019957	CGG	2	6	59741	59746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644151
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1497	NC_019957	CGACGC	2	12	63893	63904	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433644152
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1499	NC_019957	AGGC	2	8	63981	63988	25 %	0 %	50 %	25 %	433644152
1500	NC_019957	CTC	2	6	63989	63994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644152

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