MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM01

Total Repeats: 9483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_019957	CCCG	2	8	309502	309509	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7502	NC_019957	GAC	2	6	309646	309651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644365
7503	NC_019957	CGG	2	6	309669	309674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644365
7504	NC_019957	CCGC	2	8	309719	309726	0 %	0 %	25 %	75 %	433644365
7505	NC_019957	GAC	2	6	309727	309732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644365
7506	NC_019957	GGC	2	6	309758	309763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644365
7507	NC_019957	AAC	2	6	309875	309880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644365
7508	NC_019957	CTG	2	6	309924	309929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644365
7509	NC_019957	CCT	2	6	309943	309948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7510	NC_019957	CAC	2	6	309950	309955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7511	NC_019957	ACAA	2	8	309972	309979	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7512	NC_019957	CTG	2	6	309986	309991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7513	NC_019957	ACA	2	6	310065	310070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_019957	CGA	2	6	310109	310114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644366
7515	NC_019957	CAG	2	6	310118	310123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644366
7516	NC_019957	GC	3	6	310135	310140	0 %	0 %	50 %	50 %	433644366
7517	NC_019957	CGC	2	6	310152	310157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644366
7518	NC_019957	CGA	2	6	310161	310166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644366
7519	NC_019957	TAC	2	6	310246	310251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644366
7520	NC_019957	CGG	2	6	310257	310262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644366
7521	NC_019957	CGC	2	6	310278	310283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644366
7522	NC_019957	ACGA	2	8	310301	310308	50 %	0 %	25 %	25 %	433644366
7523	NC_019957	CAG	2	6	310315	310320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644366
7524	NC_019957	CGA	2	6	310344	310349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644366
7525	NC_019957	CGC	2	6	310521	310526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644366
7526	NC_019957	CG	3	6	310619	310624	0 %	0 %	50 %	50 %	433644366
7527	NC_019957	CCG	2	6	310625	310630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644366
7528	NC_019957	GCG	2	6	310669	310674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644366
7529	NC_019957	AAG	2	6	310703	310708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_019957	GGGC	2	8	310711	310718	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7531	NC_019957	GGC	3	9	310716	310724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_019957	CG	3	6	310734	310739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7533	NC_019957	CA	3	6	310745	310750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7534	NC_019957	GGC	3	9	310765	310773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_019957	GGC	2	6	310783	310788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_019957	C	6	6	310825	310830	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7537	NC_019957	GGACTT	2	12	310878	310889	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7538	NC_019957	CCA	2	6	310950	310955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7539	NC_019957	CGG	2	6	311027	311032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7540	NC_019957	GCG	2	6	311063	311068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644367
7541	NC_019957	GTCT	2	8	311085	311092	0 %	50 %	25 %	25 %	433644367
7542	NC_019957	GAC	2	6	311147	311152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644367
7543	NC_019957	CGT	2	6	311242	311247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644367
7544	NC_019957	CCT	2	6	311249	311254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7545	NC_019957	TGG	2	6	311286	311291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644368
7546	NC_019957	GCG	2	6	311295	311300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644368
7547	NC_019957	CGA	2	6	311310	311315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644368
7548	NC_019957	GTCG	2	8	311319	311326	0 %	25 %	50 %	25 %	433644368
7549	NC_019957	GTC	2	6	311344	311349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644368
7550	NC_019957	TCT	2	6	311378	311383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644368
7551	NC_019957	CTG	2	6	311399	311404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644368
7552	NC_019957	CGG	2	6	311421	311426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644368
7553	NC_019957	GAGC	2	8	311436	311443	25 %	0 %	50 %	25 %	433644368
7554	NC_019957	CGG	2	6	311457	311462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644368
7555	NC_019957	CGT	2	6	311475	311480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644368
7556	NC_019957	GCC	2	6	311557	311562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644368
7557	NC_019957	GGC	2	6	311614	311619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644368
7558	NC_019957	AGC	2	6	311660	311665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644368
7559	NC_019957	CAG	2	6	311680	311685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644368
7560	NC_019957	TGA	2	6	311766	311771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644368
7561	NC_019957	GCGG	2	8	311815	311822	0 %	0 %	75 %	25 %	433644368
7562	NC_019957	GCCA	2	8	311834	311841	25 %	0 %	25 %	50 %	433644368
7563	NC_019957	ACGAAG	2	12	311876	311887	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	433644368
7564	NC_019957	TCGA	2	8	311924	311931	25 %	25 %	25 %	25 %	433644368
7565	NC_019957	GAC	2	6	311962	311967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644368
7566	NC_019957	GCC	2	6	311976	311981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644368
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7570	NC_019957	CGG	2	6	312388	312393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644369
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7572	NC_019957	CGA	2	6	312400	312405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644369
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7575	NC_019957	CCA	2	6	312487	312492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644369
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7577	NC_019957	TGC	2	6	312707	312712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7578	NC_019957	CCGG	2	8	312717	312724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7579	NC_019957	CCG	2	6	312731	312736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7580	NC_019957	CTG	2	6	312742	312747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7581	NC_019957	CG	3	6	312801	312806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7582	NC_019957	GCG	2	6	312847	312852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644370
7583	NC_019957	GGTCGC	2	12	312983	312994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433644370
7584	NC_019957	GGGTG	2	10	313011	313020	0 %	20 %	80 %	0 %	433644370
7585	NC_019957	CGA	2	6	313043	313048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644370
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7590	NC_019957	CCG	2	6	313215	313220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644370
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7593	NC_019957	CGC	2	6	313412	313417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644370
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7595	NC_019957	GC	3	6	313505	313510	0 %	0 %	50 %	50 %	433644370
7596	NC_019957	GCA	2	6	313541	313546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644370
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7601	NC_019957	GCGCG	2	10	313782	313791	0 %	0 %	60 %	40 %	433644370
7602	NC_019957	CCT	2	6	313807	313812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7606	NC_019957	GCG	4	12	313957	313968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644371
7607	NC_019957	TTC	2	6	313971	313976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644371
7608	NC_019957	GGC	2	6	313979	313984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644371
7609	NC_019957	CGC	2	6	314004	314009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644371
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7611	NC_019957	CGG	2	6	314039	314044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644371
7612	NC_019957	CGGT	2	8	314104	314111	0 %	25 %	50 %	25 %	433644371
7613	NC_019957	TGG	2	6	314156	314161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644371
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7615	NC_019957	CTC	2	6	314331	314336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644371
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7618	NC_019957	GGC	3	9	314498	314506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644371
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7621	NC_019957	GCC	2	6	314574	314579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644371
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7623	NC_019957	GCCA	2	8	314598	314605	25 %	0 %	25 %	50 %	433644371
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7864	NC_019957	AGCG	2	8	325645	325652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7865	NC_019957	ACCGA	2	10	325668	325677	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7866	NC_019957	CGA	2	6	325681	325686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7867	NC_019957	GAG	2	6	325694	325699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7868	NC_019957	CGT	3	9	325822	325830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7993	NC_019957	GGT	2	6	331677	331682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7994	NC_019957	ATC	2	6	331733	331738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7995	NC_019957	CGG	2	6	331775	331780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7996	NC_019957	CTG	2	6	331924	331929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644389
7997	NC_019957	CGC	2	6	331932	331937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644389
7998	NC_019957	CGGG	2	8	331953	331960	0 %	0 %	75 %	25 %	433644389
7999	NC_019957	TGGAC	2	10	331964	331973	20 %	20 %	40 %	20 %	433644389
8000	NC_019957	CCG	2	6	332000	332005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644389

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