MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070017 complete genome

Total Repeats: 11673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019952	CGAC	2	8	604	611	25 %	0 %	25 %	50 %	433633013
2	NC_019952	CGTT	2	8	820	827	0 %	50 %	25 %	25 %	433633013
3	NC_019952	CCCG	2	8	882	889	0 %	0 %	25 %	75 %	433633013
4	NC_019952	GGCA	2	8	953	960	25 %	0 %	50 %	25 %	433633013
5	NC_019952	CCCA	2	8	1211	1218	25 %	0 %	0 %	75 %	433633013
6	NC_019952	CCGA	2	8	2017	2024	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019952	GTGG	2	8	2424	2431	0 %	25 %	75 %	0 %	433633014
8	NC_019952	GCCA	2	8	2442	2449	25 %	0 %	25 %	50 %	433633014
9	NC_019952	TCAG	2	8	2786	2793	25 %	25 %	25 %	25 %	433633014
10	NC_019952	CGTT	2	8	3012	3019	0 %	50 %	25 %	25 %	433633014
11	NC_019952	ACGG	2	8	3364	3371	25 %	0 %	50 %	25 %	433633014
12	NC_019952	GCCT	2	8	3426	3433	0 %	25 %	25 %	50 %	433633014
13	NC_019952	CGTC	2	8	3577	3584	0 %	25 %	25 %	50 %	433633015
14	NC_019952	GGTA	2	8	3757	3764	25 %	25 %	50 %	0 %	433633015
15	NC_019952	GGTT	2	8	3939	3946	0 %	50 %	50 %	0 %	433633015
16	NC_019952	CCGC	2	8	4167	4174	0 %	0 %	25 %	75 %	433633015
17	NC_019952	CCAC	2	8	5791	5798	25 %	0 %	0 %	75 %	433633017
18	NC_019952	ACCG	2	8	5810	5817	25 %	0 %	25 %	50 %	433633017
19	NC_019952	CAAG	2	8	6005	6012	50 %	0 %	25 %	25 %	433633017
20	NC_019952	CGCC	2	8	6101	6108	0 %	0 %	25 %	75 %	433633017
21	NC_019952	CGGC	2	8	6916	6923	0 %	0 %	50 %	50 %	433633017
22	NC_019952	GACA	2	8	7596	7603	50 %	0 %	25 %	25 %	433633018
23	NC_019952	CGGT	2	8	7816	7823	0 %	25 %	50 %	25 %	433633018
24	NC_019952	CGAG	2	8	8748	8755	25 %	0 %	50 %	25 %	433633018
25	NC_019952	CCAC	2	8	9278	9285	25 %	0 %	0 %	75 %	433633018
26	NC_019952	CGAC	2	8	9647	9654	25 %	0 %	25 %	50 %	433633018
27	NC_019952	GGTT	2	8	9875	9882	0 %	50 %	50 %	0 %	433633018
28	NC_019952	CCCG	2	8	10424	10431	0 %	0 %	25 %	75 %	433633019
29	NC_019952	GCAC	2	8	11900	11907	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019952	GAGC	2	8	12384	12391	25 %	0 %	50 %	25 %	433633021
31	NC_019952	CTCA	2	8	12595	12602	25 %	25 %	0 %	50 %	433633021
32	NC_019952	TGCG	2	8	12710	12717	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019952	GCCC	2	8	12745	12752	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_019952	AACC	2	8	13630	13637	50 %	0 %	0 %	50 %	433633023
35	NC_019952	CCCG	2	8	13739	13746	0 %	0 %	25 %	75 %	433633023
36	NC_019952	ATTC	2	8	13983	13990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019952	ACCC	2	8	14390	14397	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_019952	TGAT	2	8	14427	14434	25 %	50 %	25 %	0 %	433633025
39	NC_019952	TGCT	2	8	14474	14481	0 %	50 %	25 %	25 %	433633025
40	NC_019952	GCCC	2	8	14961	14968	0 %	0 %	25 %	75 %	433633025
41	NC_019952	GGGC	2	8	15742	15749	0 %	0 %	75 %	25 %	433633026
42	NC_019952	CTGA	2	8	16197	16204	25 %	25 %	25 %	25 %	433633027
43	NC_019952	TGGC	2	8	16340	16347	0 %	25 %	50 %	25 %	433633027
44	NC_019952	GCTT	2	8	16399	16406	0 %	50 %	25 %	25 %	433633027
45	NC_019952	CAGT	2	8	16427	16434	25 %	25 %	25 %	25 %	433633027
46	NC_019952	CGGT	2	8	16798	16805	0 %	25 %	50 %	25 %	433633027
47	NC_019952	GCCG	2	8	16857	16864	0 %	0 %	50 %	50 %	433633027
48	NC_019952	CGGG	2	8	18092	18099	0 %	0 %	75 %	25 %	433633028
49	NC_019952	CTGG	2	8	18200	18207	0 %	25 %	50 %	25 %	433633028
50	NC_019952	GTGC	2	8	18700	18707	0 %	25 %	50 %	25 %	433633028
51	NC_019952	GCCG	2	8	18718	18725	0 %	0 %	50 %	50 %	433633028
52	NC_019952	CCGC	2	8	19083	19090	0 %	0 %	25 %	75 %	433633029
53	NC_019952	GCCG	2	8	20547	20554	0 %	0 %	50 %	50 %	433633030
54	NC_019952	CCAG	2	8	21035	21042	25 %	0 %	25 %	50 %	433633030
55	NC_019952	CACC	2	8	21218	21225	25 %	0 %	0 %	75 %	433633030
56	NC_019952	CGGG	2	8	22174	22181	0 %	0 %	75 %	25 %	433633031
57	NC_019952	GCCG	2	8	22265	22272	0 %	0 %	50 %	50 %	433633031
58	NC_019952	GCTG	2	8	22645	22652	0 %	25 %	50 %	25 %	433633031
59	NC_019952	CGGC	2	8	22665	22672	0 %	0 %	50 %	50 %	433633031
60	NC_019952	GCCG	2	8	23336	23343	0 %	0 %	50 %	50 %	433633031
61	NC_019952	CCCA	2	8	23348	23355	25 %	0 %	0 %	75 %	433633031
62	NC_019952	GCTG	2	8	24487	24494	0 %	25 %	50 %	25 %	433633033
63	NC_019952	CGGC	2	8	24535	24542	0 %	0 %	50 %	50 %	433633033
64	NC_019952	GCCG	2	8	24635	24642	0 %	0 %	50 %	50 %	433633033
65	NC_019952	GAGC	2	8	25816	25823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019952	GGCC	2	8	25830	25837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019952	GCTC	2	8	26779	26786	0 %	25 %	25 %	50 %	433633034
68	NC_019952	CCAA	2	8	26996	27003	50 %	0 %	0 %	50 %	433633034
69	NC_019952	CAGC	2	8	27062	27069	25 %	0 %	25 %	50 %	433633034
70	NC_019952	CGGC	2	8	27882	27889	0 %	0 %	50 %	50 %	433633036
71	NC_019952	CCGG	2	8	28368	28375	0 %	0 %	50 %	50 %	433633036
72	NC_019952	GCTC	2	8	28924	28931	0 %	25 %	25 %	50 %	433633037
73	NC_019952	TGCG	2	8	29063	29070	0 %	25 %	50 %	25 %	433633037
74	NC_019952	CCGG	2	8	29328	29335	0 %	0 %	50 %	50 %	433633037
75	NC_019952	CGTC	2	8	29659	29666	0 %	25 %	25 %	50 %	433633038
76	NC_019952	CACG	2	8	30019	30026	25 %	0 %	25 %	50 %	433633039
77	NC_019952	ACCG	2	8	30100	30107	25 %	0 %	25 %	50 %	433633039
78	NC_019952	CCGG	2	8	30419	30426	0 %	0 %	50 %	50 %	433633039
79	NC_019952	GTCG	2	8	30595	30602	0 %	25 %	50 %	25 %	433633039
80	NC_019952	CCCG	2	8	31217	31224	0 %	0 %	25 %	75 %	433633039
81	NC_019952	ACCA	2	8	31402	31409	50 %	0 %	0 %	50 %	433633039
82	NC_019952	CGAG	2	8	31733	31740	25 %	0 %	50 %	25 %	433633040
83	NC_019952	CGAC	2	8	32030	32037	25 %	0 %	25 %	50 %	433633041
84	NC_019952	GCCG	2	8	32757	32764	0 %	0 %	50 %	50 %	433633043
85	NC_019952	CGGA	2	8	33677	33684	25 %	0 %	50 %	25 %	433633044
86	NC_019952	AGCT	2	8	33995	34002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019952	GGCC	2	8	34745	34752	0 %	0 %	50 %	50 %	433633045
88	NC_019952	ATCG	2	8	35238	35245	25 %	25 %	25 %	25 %	433633045
89	NC_019952	GATC	2	8	35576	35583	25 %	25 %	25 %	25 %	433633045
90	NC_019952	CCAC	2	8	36397	36404	25 %	0 %	0 %	75 %	433633045
91	NC_019952	CGGC	2	8	36434	36441	0 %	0 %	50 %	50 %	433633045
92	NC_019952	ACCG	2	8	36791	36798	25 %	0 %	25 %	50 %	433633046
93	NC_019952	GCAC	2	8	37124	37131	25 %	0 %	25 %	50 %	433633047
94	NC_019952	CTGG	2	8	37135	37142	0 %	25 %	50 %	25 %	433633047
95	NC_019952	GCAT	2	8	37530	37537	25 %	25 %	25 %	25 %	433633048
96	NC_019952	GCTG	2	8	38044	38051	0 %	25 %	50 %	25 %	433633048
97	NC_019952	CCAT	2	8	38311	38318	25 %	25 %	0 %	50 %	433633048
98	NC_019952	GGGC	2	8	38591	38598	0 %	0 %	75 %	25 %	433633048
99	NC_019952	GAAC	2	8	38798	38805	50 %	0 %	25 %	25 %	433633048
100	NC_019952	CCGA	2	8	38860	38867	25 %	0 %	25 %	50 %	433633048
101	NC_019952	CCAC	2	8	39016	39023	25 %	0 %	0 %	75 %	433633048
102	NC_019952	CAGC	2	8	39345	39352	25 %	0 %	25 %	50 %	433633049
103	NC_019952	GCCG	2	8	39840	39847	0 %	0 %	50 %	50 %	433633049
104	NC_019952	GGCC	2	8	40372	40379	0 %	0 %	50 %	50 %	433633050
105	NC_019952	CGAT	2	8	40822	40829	25 %	25 %	25 %	25 %	433633050
106	NC_019952	GCCG	2	8	41122	41129	0 %	0 %	50 %	50 %	433633050
107	NC_019952	CACC	2	8	41147	41154	25 %	0 %	0 %	75 %	433633050
108	NC_019952	ACCG	2	8	41370	41377	25 %	0 %	25 %	50 %	433633050
109	NC_019952	GCGT	2	8	41396	41403	0 %	25 %	50 %	25 %	433633050
110	NC_019952	CCAC	2	8	42125	42132	25 %	0 %	0 %	75 %	433633051
111	NC_019952	CGAT	2	8	42134	42141	25 %	25 %	25 %	25 %	433633051
112	NC_019952	GGCC	2	8	42830	42837	0 %	0 %	50 %	50 %	433633053
113	NC_019952	CCCG	2	8	43421	43428	0 %	0 %	25 %	75 %	433633053
114	NC_019952	CGGG	2	8	43450	43457	0 %	0 %	75 %	25 %	433633053
115	NC_019952	CGAC	2	8	44089	44096	25 %	0 %	25 %	50 %	433633054
116	NC_019952	GAGC	2	8	44469	44476	25 %	0 %	50 %	25 %	433633054
117	NC_019952	GGGC	2	8	45628	45635	0 %	0 %	75 %	25 %	433633054
118	NC_019952	CGGC	2	8	45723	45730	0 %	0 %	50 %	50 %	433633054
119	NC_019952	GCCG	2	8	46686	46693	0 %	0 %	50 %	50 %	433633054
120	NC_019952	TTGC	2	8	46855	46862	0 %	50 %	25 %	25 %	433633055
121	NC_019952	CCGC	2	8	47036	47043	0 %	0 %	25 %	75 %	433633055
122	NC_019952	GGTC	2	8	47144	47151	0 %	25 %	50 %	25 %	433633055
123	NC_019952	CTAC	2	8	47468	47475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_019952	CGGG	2	8	47695	47702	0 %	0 %	75 %	25 %	433633056
125	NC_019952	GCAG	2	8	47768	47775	25 %	0 %	50 %	25 %	433633056
126	NC_019952	GTGC	2	8	48668	48675	0 %	25 %	50 %	25 %	433633057
127	NC_019952	GCCG	2	8	48952	48959	0 %	0 %	50 %	50 %	433633057
128	NC_019952	CAGC	2	8	50137	50144	25 %	0 %	25 %	50 %	433633058
129	NC_019952	CGGG	2	8	50326	50333	0 %	0 %	75 %	25 %	433633059
130	NC_019952	GCCG	2	8	50426	50433	0 %	0 %	50 %	50 %	433633059
131	NC_019952	GGTG	2	8	50749	50756	0 %	25 %	75 %	0 %	433633059
132	NC_019952	CTCA	2	8	51365	51372	25 %	25 %	0 %	50 %	433633059
133	NC_019952	CGCT	2	8	51504	51511	0 %	25 %	25 %	50 %	433633060
134	NC_019952	GGTA	2	8	52370	52377	25 %	25 %	50 %	0 %	433633061
135	NC_019952	GGCA	2	8	52862	52869	25 %	0 %	50 %	25 %	433633061
136	NC_019952	CTGG	2	8	52965	52972	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019952	GCCG	2	8	53819	53826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019952	ACCA	2	8	53990	53997	50 %	0 %	0 %	50 %	433633063
139	NC_019952	GTGC	2	8	54875	54882	0 %	25 %	50 %	25 %	433633063
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141	NC_019952	GGTG	2	8	55762	55769	0 %	25 %	75 %	0 %	433633063
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