MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 3494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019950	TCATC	2	10	1122	1131	20 %	40 %	0 %	40 %	433625089
2	NC_019950	CGGCA	2	10	2412	2421	20 %	0 %	40 %	40 %	433625091
3	NC_019950	CGTTT	2	10	3847	3856	0 %	60 %	20 %	20 %	433625093
4	NC_019950	CGGTT	2	10	4996	5005	0 %	40 %	40 %	20 %	433625093
5	NC_019950	GTCGG	2	10	6345	6354	0 %	20 %	60 %	20 %	433625095
6	NC_019950	GCAGC	2	10	9129	9138	20 %	0 %	40 %	40 %	433625097
7	NC_019950	CGGTG	2	10	11037	11046	0 %	20 %	60 %	20 %	433625097
8	NC_019950	CAGAC	2	10	11555	11564	40 %	0 %	20 %	40 %	433625097
9	NC_019950	CCGGC	2	10	12005	12014	0 %	0 %	40 %	60 %	433625098
10	NC_019950	CGCAA	2	10	12026	12035	40 %	0 %	20 %	40 %	433625098
11	NC_019950	CGGCG	2	10	12152	12161	0 %	0 %	60 %	40 %	433625098
12	NC_019950	ACCCG	2	10	12982	12991	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_019950	CGACC	2	10	15375	15384	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_019950	GGCGT	2	10	15857	15866	0 %	20 %	60 %	20 %	433625103
15	NC_019950	GGGCC	2	10	16140	16149	0 %	0 %	60 %	40 %	433625103
16	NC_019950	GCGTT	2	10	16885	16894	0 %	40 %	40 %	20 %	433625104
17	NC_019950	CCAGC	2	10	17425	17434	20 %	0 %	20 %	60 %	433625105
18	NC_019950	ACCGA	2	10	18188	18197	40 %	0 %	20 %	40 %	433625105
19	NC_019950	ATCGG	2	10	18580	18589	20 %	20 %	40 %	20 %	433625105
20	NC_019950	CGGCC	2	10	19589	19598	0 %	0 %	40 %	60 %	433625106
21	NC_019950	TTAGC	2	10	20740	20749	20 %	40 %	20 %	20 %	433625107
22	NC_019950	GGTCC	2	10	20812	20821	0 %	20 %	40 %	40 %	433625107
23	NC_019950	GTCGT	2	10	23331	23340	0 %	40 %	40 %	20 %	433625108
24	NC_019950	ATCAC	2	10	25604	25613	40 %	20 %	0 %	40 %	433625111
25	NC_019950	GCCGG	2	10	26291	26300	0 %	0 %	60 %	40 %	433625111
26	NC_019950	CGAGC	2	10	28653	28662	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_019950	GGCAA	2	10	30986	30995	40 %	0 %	40 %	20 %	433625116
28	NC_019950	CGATC	2	10	31812	31821	20 %	20 %	20 %	40 %	433625117
29	NC_019950	CGACG	2	10	33999	34008	20 %	0 %	40 %	40 %	433625121
30	NC_019950	GCGTC	2	10	34054	34063	0 %	20 %	40 %	40 %	433625121
31	NC_019950	GACAC	2	10	34151	34160	40 %	0 %	20 %	40 %	433625121
32	NC_019950	TCCTG	2	10	39156	39165	0 %	40 %	20 %	40 %	433625127
33	NC_019950	CTCGG	2	10	39249	39258	0 %	20 %	40 %	40 %	433625127
34	NC_019950	GGCGC	2	10	39792	39801	0 %	0 %	60 %	40 %	433625127
35	NC_019950	TGGCC	2	10	39940	39949	0 %	20 %	40 %	40 %	433625127
36	NC_019950	CGGCG	2	10	40472	40481	0 %	0 %	60 %	40 %	433625127
37	NC_019950	GTCCA	2	10	41197	41206	20 %	20 %	20 %	40 %	433625128
38	NC_019950	GCCAA	2	10	43331	43340	40 %	0 %	20 %	40 %	433625130
39	NC_019950	GCGTC	2	10	43746	43755	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_019950	GCACA	2	10	44130	44139	40 %	0 %	20 %	40 %	433625131
41	NC_019950	GGTAC	2	10	46664	46673	20 %	20 %	40 %	20 %	433625133
42	NC_019950	TCGAA	2	10	46896	46905	40 %	20 %	20 %	20 %	433625133
43	NC_019950	GCACC	2	10	47826	47835	20 %	0 %	20 %	60 %	433625133
44	NC_019950	CGGTG	2	10	48860	48869	0 %	20 %	60 %	20 %	433625134
45	NC_019950	TCATG	2	10	49006	49015	20 %	40 %	20 %	20 %	433625134
46	NC_019950	ATCGG	2	10	49153	49162	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019950	GCAGC	2	10	50400	50409	20 %	0 %	40 %	40 %	433625136
48	NC_019950	CCCGA	2	10	50483	50492	20 %	0 %	20 %	60 %	433625136
49	NC_019950	CAGCG	2	10	51608	51617	20 %	0 %	40 %	40 %	433625137
50	NC_019950	CTCCC	2	10	58048	58057	0 %	20 %	0 %	80 %	433625143
51	NC_019950	CGGCG	2	10	58497	58506	0 %	0 %	60 %	40 %	433625143
52	NC_019950	CGACC	2	10	60029	60038	20 %	0 %	20 %	60 %	433625145
53	NC_019950	CTTCG	2	10	60716	60725	0 %	40 %	20 %	40 %	433625146
54	NC_019950	CGGTG	2	10	61772	61781	0 %	20 %	60 %	20 %	433625149
55	NC_019950	TCAGG	2	10	64258	64267	20 %	20 %	40 %	20 %	433625150
56	NC_019950	TGCCG	2	10	67289	67298	0 %	20 %	40 %	40 %	433625154
57	NC_019950	CGGCG	2	10	67800	67809	0 %	0 %	60 %	40 %	433625155
58	NC_019950	GGCGA	2	10	68221	68230	20 %	0 %	60 %	20 %	433625155
59	NC_019950	CGGCC	2	10	71065	71074	0 %	0 %	40 %	60 %	433625158
60	NC_019950	GGTGT	2	10	72769	72778	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019950	ATCGG	2	10	73406	73415	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019950	CCGCG	2	10	73943	73952	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_019950	GGCAA	2	10	74294	74303	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019950	CGACC	2	10	74583	74592	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_019950	CGGGT	2	10	75037	75046	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_019950	TGCCT	2	10	75837	75846	0 %	40 %	20 %	40 %	433625162
67	NC_019950	GTCCA	2	10	76708	76717	20 %	20 %	20 %	40 %	433625163
68	NC_019950	TGACC	2	10	79332	79341	20 %	20 %	20 %	40 %	433625165
69	NC_019950	GCCAA	2	10	79646	79655	40 %	0 %	20 %	40 %	433625165
70	NC_019950	GTCGC	2	10	79723	79732	0 %	20 %	40 %	40 %	433625165
71	NC_019950	GCGCG	2	10	80811	80820	0 %	0 %	60 %	40 %	433625166
72	NC_019950	CACGA	2	10	83686	83695	40 %	0 %	20 %	40 %	433625168
73	NC_019950	GCACC	2	10	84126	84135	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_019950	CCACC	2	10	84319	84328	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
75	NC_019950	GAGCA	2	10	86224	86233	40 %	0 %	40 %	20 %	433625170
76	NC_019950	GCCGG	2	10	86323	86332	0 %	0 %	60 %	40 %	433625170
77	NC_019950	GCGAC	2	10	86399	86408	20 %	0 %	40 %	40 %	433625170
78	NC_019950	ATCCG	2	10	87169	87178	20 %	20 %	20 %	40 %	433625171
79	NC_019950	CACCG	2	10	87949	87958	20 %	0 %	20 %	60 %	433625172
80	NC_019950	TGGTC	2	10	90084	90093	0 %	40 %	40 %	20 %	433625174
81	NC_019950	GCTGG	2	10	90721	90730	0 %	20 %	60 %	20 %	433625175
82	NC_019950	TGGGT	2	10	93759	93768	0 %	40 %	60 %	0 %	433625180
83	NC_019950	TCGCC	2	10	93966	93975	0 %	20 %	20 %	60 %	433625180
84	NC_019950	GGGCC	2	10	94939	94948	0 %	0 %	60 %	40 %	433625181
85	NC_019950	GGCCG	2	10	96258	96267	0 %	0 %	60 %	40 %	433625182
86	NC_019950	GCGCC	2	10	96910	96919	0 %	0 %	40 %	60 %	433625182
87	NC_019950	CGCAC	2	10	98235	98244	20 %	0 %	20 %	60 %	433625184
88	NC_019950	GGTTG	2	10	98633	98642	0 %	40 %	60 %	0 %	433625184
89	NC_019950	CGTGT	2	10	99374	99383	0 %	40 %	40 %	20 %	433625185
90	NC_019950	TCAGT	2	10	101319	101328	20 %	40 %	20 %	20 %	433625187
91	NC_019950	CGGCG	2	10	104584	104593	0 %	0 %	60 %	40 %	433625191
92	NC_019950	GCGCG	2	10	104713	104722	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_019950	AGGTC	2	10	104957	104966	20 %	20 %	40 %	20 %	433625192
94	NC_019950	GTCGA	2	10	106043	106052	20 %	20 %	40 %	20 %	433625194
95	NC_019950	GCGCC	2	10	108475	108484	0 %	0 %	40 %	60 %	433625195
96	NC_019950	GTCGA	2	10	108848	108857	20 %	20 %	40 %	20 %	433625195
97	NC_019950	CTGGC	2	10	110867	110876	0 %	20 %	40 %	40 %	433625197
98	NC_019950	GCACA	2	10	111988	111997	40 %	0 %	20 %	40 %	433625197
99	NC_019950	CTGAA	2	10	114318	114327	40 %	20 %	20 %	20 %	433625200
100	NC_019950	ATCGC	2	10	114813	114822	20 %	20 %	20 %	40 %	433625200
101	NC_019950	TCTGA	2	10	116147	116156	20 %	40 %	20 %	20 %	433625202
102	NC_019950	CGGTC	2	10	116422	116431	0 %	20 %	40 %	40 %	433625202
103	NC_019950	GACCA	2	10	117560	117569	40 %	0 %	20 %	40 %	433625202
104	NC_019950	GGCTG	2	10	120124	120133	0 %	20 %	60 %	20 %	433625202
105	NC_019950	CCGCG	2	10	124044	124053	0 %	0 %	40 %	60 %	433625203
106	NC_019950	TCGTG	2	10	127997	128006	0 %	40 %	40 %	20 %	433625205
107	NC_019950	GCACG	2	10	129652	129661	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_019950	CCGGA	2	10	129777	129786	20 %	0 %	40 %	40 %	433625207
109	NC_019950	GGCCG	2	10	132138	132147	0 %	0 %	60 %	40 %	433625208
110	NC_019950	TGCGC	2	10	132250	132259	0 %	20 %	40 %	40 %	433625208
111	NC_019950	GCGAG	2	10	132761	132770	20 %	0 %	60 %	20 %	433625208
112	NC_019950	GGGGT	2	10	133770	133779	0 %	20 %	80 %	0 %	433625208
113	NC_019950	CCCAC	2	10	134332	134341	20 %	0 %	0 %	80 %	433625208
114	NC_019950	CCGGC	2	10	134842	134851	0 %	0 %	40 %	60 %	433625208
115	NC_019950	TGCGG	2	10	135252	135261	0 %	20 %	60 %	20 %	433625208
116	NC_019950	ATCAC	2	10	136731	136740	40 %	20 %	0 %	40 %	433625210
117	NC_019950	ATCGG	2	10	136779	136788	20 %	20 %	40 %	20 %	433625210
118	NC_019950	CGGGC	2	10	137870	137879	0 %	0 %	60 %	40 %	433625210
119	NC_019950	GCGAT	2	10	139675	139684	20 %	20 %	40 %	20 %	433625212
120	NC_019950	GTTCG	2	10	139896	139905	0 %	40 %	40 %	20 %	433625212
121	NC_019950	CCTGG	2	10	140288	140297	0 %	20 %	40 %	40 %	433625212
122	NC_019950	GGCCC	2	10	140394	140403	0 %	0 %	40 %	60 %	433625212
123	NC_019950	CGTTG	2	10	140906	140915	0 %	40 %	40 %	20 %	433625212
124	NC_019950	CGACC	2	10	140978	140987	20 %	0 %	20 %	60 %	433625212
125	NC_019950	GAGAT	2	10	143998	144007	40 %	20 %	40 %	0 %	433625216
126	NC_019950	CGGCG	2	10	146153	146162	0 %	0 %	60 %	40 %	433625218
127	NC_019950	TGCGG	2	10	146786	146795	0 %	20 %	60 %	20 %	433625219
128	NC_019950	CGCTG	2	10	147493	147502	0 %	20 %	40 %	40 %	433625220
129	NC_019950	GTTGC	2	10	148039	148048	0 %	40 %	40 %	20 %	433625220
130	NC_019950	CCGAT	2	10	148787	148796	20 %	20 %	20 %	40 %	433625220
131	NC_019950	ATCGC	2	10	149478	149487	20 %	20 %	20 %	40 %	433625221
132	NC_019950	AACCG	2	10	150217	150226	40 %	0 %	20 %	40 %	433625221
133	NC_019950	CCGCC	2	10	150804	150813	0 %	0 %	20 %	80 %	433625221
134	NC_019950	CCGCC	2	10	151447	151456	0 %	0 %	20 %	80 %	433625222
135	NC_019950	GGGTC	2	10	153201	153210	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019950	ATCGG	2	10	154931	154940	20 %	20 %	40 %	20 %	433625226
137	NC_019950	ATTGG	2	10	157766	157775	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019950	AGCGA	2	10	159669	159678	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019950	AGCGA	2	10	159722	159731	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_019950	AGCGA	2	10	159775	159784	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_019950	TCGTC	2	10	160122	160131	0 %	40 %	20 %	40 %	433625229
142	NC_019950	CACGC	2	10	160586	160595	20 %	0 %	20 %	60 %	433625229
143	NC_019950	ATTCT	2	10	161430	161439	20 %	60 %	0 %	20 %	433625230
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149	NC_019950	CCGCA	2	10	166556	166565	20 %	0 %	20 %	60 %	433625235
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152	NC_019950	GTCGC	2	10	167124	167133	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
153	NC_019950	GCCGG	2	10	167423	167432	0 %	0 %	60 %	40 %	433625236
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163	NC_019950	ACCAA	2	10	180248	180257	60 %	0 %	0 %	40 %	433625249
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175	NC_019950	GTCGC	2	10	189278	189287	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
176	NC_019950	ACGGC	2	10	193439	193448	20 %	0 %	40 %	40 %	433625260
177	NC_019950	CGGCT	2	10	196298	196307	0 %	20 %	40 %	40 %	433625262
178	NC_019950	GGCTG	2	10	196529	196538	0 %	20 %	60 %	20 %	433625262
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195	NC_019950	GCCGA	2	10	220551	220560	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
196	NC_019950	CCTCG	2	10	220987	220996	0 %	20 %	20 %	60 %	433625285
197	NC_019950	TCGGT	3	15	221487	221501	0 %	40 %	40 %	20 %	433625286
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199	NC_019950	CGGCG	2	10	224796	224805	0 %	0 %	60 %	40 %	433625288
200	NC_019950	CAGCG	2	10	226039	226048	20 %	0 %	40 %	40 %	433625290
201	NC_019950	GAATC	2	10	226091	226100	40 %	20 %	20 %	20 %	433625290
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205	NC_019950	GGTGC	2	10	227824	227833	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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233	NC_019950	GGCCA	2	10	266811	266820	20 %	0 %	40 %	40 %	433625320
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239	NC_019950	GTCGA	2	10	274742	274751	20 %	20 %	40 %	20 %	433625327
240	NC_019950	CGAGT	2	10	278337	278346	20 %	20 %	40 %	20 %	433625329
241	NC_019950	TCGAT	2	10	280171	280180	20 %	40 %	20 %	20 %	433625331
242	NC_019950	GCCGC	2	10	281062	281071	0 %	0 %	40 %	60 %	433625333
243	NC_019950	GCCCG	2	10	281281	281290	0 %	0 %	40 %	60 %	433625333
244	NC_019950	GCAGT	2	10	281659	281668	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
245	NC_019950	GATCC	2	10	284101	284110	20 %	20 %	20 %	40 %	433625335
246	NC_019950	GACCG	2	10	285534	285543	20 %	0 %	40 %	40 %	433625337
247	NC_019950	AACCG	2	10	286207	286216	40 %	0 %	20 %	40 %	433625337
248	NC_019950	GGCGA	2	10	286835	286844	20 %	0 %	60 %	20 %	433625338
249	NC_019950	CAGCG	2	10	288446	288455	20 %	0 %	40 %	40 %	433625339
250	NC_019950	GCCGA	2	10	289629	289638	20 %	0 %	40 %	40 %	433625339
251	NC_019950	CGAAC	2	10	295596	295605	40 %	0 %	20 %	40 %	433625344
252	NC_019950	TGGCC	2	10	296335	296344	0 %	20 %	40 %	40 %	433625345
253	NC_019950	GCGGT	2	10	298017	298026	0 %	20 %	60 %	20 %	433625346
254	NC_019950	ACGCC	2	10	299883	299892	20 %	0 %	20 %	60 %	433625347
255	NC_019950	CGGCC	2	10	307800	307809	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
256	NC_019950	TGCGC	2	10	307847	307856	0 %	20 %	40 %	40 %	433625354
257	NC_019950	TGCGC	2	10	309056	309065	0 %	20 %	40 %	40 %	433625355
258	NC_019950	TCGAC	2	10	311005	311014	20 %	20 %	20 %	40 %	433625355
259	NC_019950	TGGGG	2	10	314047	314056	0 %	20 %	80 %	0 %	433625359
260	NC_019950	TGCGG	2	10	314696	314705	0 %	20 %	60 %	20 %	433625359
261	NC_019950	TGCCA	2	10	316460	316469	20 %	20 %	20 %	40 %	433625362
262	NC_019950	CGCAG	2	10	317616	317625	20 %	0 %	40 %	40 %	433625363
263	NC_019950	CGGCG	2	10	318250	318259	0 %	0 %	60 %	40 %	433625363
264	NC_019950	CGGCC	2	10	318824	318833	0 %	0 %	40 %	60 %	433625364
265	NC_019950	CAGAT	2	10	319731	319740	40 %	20 %	20 %	20 %	433625364
266	NC_019950	AGCGG	2	10	319955	319964	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
267	NC_019950	CGGAC	2	10	320069	320078	20 %	0 %	40 %	40 %	433625365
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