MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 109775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019950	CGA	2	6	63871	63876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625150
1502	NC_019950	CGT	2	6	63897	63902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625150
1503	NC_019950	CG	3	6	63927	63932	0 %	0 %	50 %	50 %	433625150
1504	NC_019950	GCG	2	6	63950	63955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625150
1505	NC_019950	TGGC	3	12	63956	63967	0 %	25 %	50 %	25 %	433625150
1506	NC_019950	GTT	2	6	64045	64050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625150
1507	NC_019950	TGG	2	6	64072	64077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625150
1508	NC_019950	CTA	2	6	64117	64122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625150
1509	NC_019950	CGA	2	6	64147	64152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625150
1510	NC_019950	TGC	2	6	64164	64169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625150
1511	NC_019950	T	6	6	64182	64187	0 %	100 %	0 %	0 %	433625150
1512	NC_019950	CA	3	6	64195	64200	50 %	0 %	0 %	50 %	433625150
1513	NC_019950	GGC	2	6	64214	64219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625150
1514	NC_019950	GGC	2	6	64230	64235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625150
1515	NC_019950	TCAGG	2	10	64258	64267	20 %	20 %	40 %	20 %	433625150
1516	NC_019950	GGC	2	6	64306	64311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625150
1517	NC_019950	TGC	2	6	64320	64325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625150
1518	NC_019950	GC	3	6	64365	64370	0 %	0 %	50 %	50 %	433625150
1519	NC_019950	A	6	6	64373	64378	100 %	0 %	0 %	0 %	433625150
1520	NC_019950	GAT	2	6	64417	64422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625150
1521	NC_019950	CGA	2	6	64443	64448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625150
1522	NC_019950	CG	3	6	64484	64489	0 %	0 %	50 %	50 %	433625150
1523	NC_019950	CGT	2	6	64552	64557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625150
1524	NC_019950	CA	4	8	64609	64616	50 %	0 %	0 %	50 %	433625150
1525	NC_019950	TCG	2	6	64620	64625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625150
1526	NC_019950	CTG	2	6	64679	64684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625150
1527	NC_019950	CGA	2	6	64708	64713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625150
1528	NC_019950	CGA	2	6	64764	64769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625150
1529	NC_019950	TG	3	6	64837	64842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_019950	ATG	2	6	64874	64879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_019950	CGG	2	6	64912	64917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_019950	CGT	2	6	64941	64946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_019950	GGT	2	6	65053	65058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625151
1534	NC_019950	ATC	2	6	65125	65130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625151
1535	NC_019950	CTG	2	6	65143	65148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625151
1536	NC_019950	CAG	2	6	65156	65161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625151
1537	NC_019950	CGA	2	6	65168	65173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625151
1538	NC_019950	GCC	2	6	65207	65212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625151
1539	NC_019950	GTC	2	6	65218	65223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625151
1540	NC_019950	CAG	2	6	65232	65237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625151
1541	NC_019950	GCG	2	6	65281	65286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625151
1542	NC_019950	CGT	2	6	65304	65309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625151
1543	NC_019950	CGG	2	6	65334	65339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625151
1544	NC_019950	CAT	2	6	65379	65384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625151
1545	NC_019950	GTG	2	6	65400	65405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625151
1546	NC_019950	TGC	2	6	65421	65426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625151
1547	NC_019950	GCC	2	6	65447	65452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625151
1548	NC_019950	TCG	2	6	65474	65479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625151
1549	NC_019950	GAC	2	6	65521	65526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625151
1550	NC_019950	GCC	2	6	65540	65545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625151
1551	NC_019950	GCC	2	6	65548	65553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625151
1552	NC_019950	GT	3	6	65599	65604	0 %	50 %	50 %	0 %	433625151
1553	NC_019950	TCA	2	6	65675	65680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625151
1554	NC_019950	TAC	2	6	65692	65697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625151
1555	NC_019950	AAGG	2	8	65699	65706	50 %	0 %	50 %	0 %	433625151
1556	NC_019950	AGG	3	9	65704	65712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_019950	CCT	2	6	65740	65745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625152
1558	NC_019950	CGC	2	6	65825	65830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625152
1559	NC_019950	TCG	3	9	65898	65906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625152
1560	NC_019950	CAT	2	6	65935	65940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625152
1561	NC_019950	CCA	2	6	65949	65954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625152
1562	NC_019950	CAG	2	6	66125	66130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625152
1563	NC_019950	C	6	6	66157	66162	0 %	0 %	0 %	100 %	433625152
1564	NC_019950	GC	3	6	66217	66222	0 %	0 %	50 %	50 %	433625152
1565	NC_019950	GCG	2	6	66241	66246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625152
1566	NC_019950	CAG	2	6	66254	66259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625152
1567	NC_019950	CGC	2	6	66260	66265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625152
1568	NC_019950	CCGATC	2	12	66342	66353	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433625152
1569	NC_019950	AACC	2	8	66476	66483	50 %	0 %	0 %	50 %	433625152
1570	NC_019950	ACT	2	6	66494	66499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625152
1571	NC_019950	GCT	2	6	66619	66624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625152
1572	NC_019950	CGA	2	6	66727	66732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625152
1573	NC_019950	TCG	2	6	66787	66792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_019950	GCT	2	6	66834	66839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625153
1575	NC_019950	CGGA	2	8	66840	66847	25 %	0 %	50 %	25 %	433625153
1576	NC_019950	ACC	2	6	66862	66867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625153
1577	NC_019950	GGC	2	6	66872	66877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625153
1578	NC_019950	CCG	2	6	66896	66901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625153
1579	NC_019950	ACTTCA	2	12	67146	67157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625153
1580	NC_019950	CGG	2	6	67188	67193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625153
1581	NC_019950	TGCCG	2	10	67289	67298	0 %	20 %	40 %	40 %	433625154
1582	NC_019950	GCC	2	6	67341	67346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625154
1583	NC_019950	GTC	2	6	67439	67444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_019950	ATT	2	6	67472	67477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_019950	TCA	2	6	67492	67497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625155
1586	NC_019950	CG	3	6	67512	67517	0 %	0 %	50 %	50 %	433625155
1587	NC_019950	CCT	2	6	67530	67535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625155
1588	NC_019950	CGG	2	6	67664	67669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625155
1589	NC_019950	CGC	2	6	67677	67682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625155
1590	NC_019950	GC	3	6	67681	67686	0 %	0 %	50 %	50 %	433625155
1591	NC_019950	CCG	2	6	67696	67701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625155
1592	NC_019950	CGG	2	6	67763	67768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625155
1593	NC_019950	CGG	2	6	67776	67781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625155
1594	NC_019950	CGGCG	2	10	67800	67809	0 %	0 %	60 %	40 %	433625155
1595	NC_019950	ATC	2	6	67960	67965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625155
1596	NC_019950	GCTG	2	8	68105	68112	0 %	25 %	50 %	25 %	433625155
1597	NC_019950	ACG	2	6	68141	68146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625155
1598	NC_019950	CG	5	10	68158	68167	0 %	0 %	50 %	50 %	433625155
1599	NC_019950	ACC	2	6	68197	68202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625155
1600	NC_019950	GGCGA	2	10	68221	68230	20 %	0 %	60 %	20 %	433625155
1601	NC_019950	CAC	2	6	68352	68357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625155
1602	NC_019950	GC	3	6	68369	68374	0 %	0 %	50 %	50 %	433625155
1603	NC_019950	CGTCGG	2	12	68544	68555	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_019950	GGT	2	6	68629	68634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_019950	TGC	2	6	68667	68672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_019950	GCC	2	6	68770	68775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625156
1607	NC_019950	GCC	2	6	68785	68790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625156
1608	NC_019950	CTGG	2	8	68837	68844	0 %	25 %	50 %	25 %	433625156
1609	NC_019950	TTC	2	6	68853	68858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625156
1610	NC_019950	GAC	2	6	68887	68892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625156
1611	NC_019950	CGG	2	6	68951	68956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625156
1612	NC_019950	AAC	2	6	69016	69021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625156
1613	NC_019950	ACG	2	6	69125	69130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625156
1614	NC_019950	CCA	2	6	69131	69136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625156
1615	NC_019950	CGGG	2	8	69138	69145	0 %	0 %	75 %	25 %	433625156
1616	NC_019950	CGCC	2	8	69155	69162	0 %	0 %	25 %	75 %	433625156
1617	NC_019950	CGGC	2	8	69197	69204	0 %	0 %	50 %	50 %	433625156
1618	NC_019950	CGGT	2	8	69233	69240	0 %	25 %	50 %	25 %	433625156
1619	NC_019950	GCG	2	6	69260	69265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625156
1620	NC_019950	CGTCGG	2	12	69314	69325	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433625156
1621	NC_019950	TGC	2	6	69329	69334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625156
1622	NC_019950	ACC	2	6	69368	69373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625156
1623	NC_019950	GCGGTG	2	12	69395	69406	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	433625156
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1625	NC_019950	CCG	2	6	69539	69544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625156
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