MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 109775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019950	GCC	2	6	42811	42816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625129
1002	NC_019950	AAC	2	6	42859	42864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625129
1003	NC_019950	GCA	2	6	42896	42901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625129
1004	NC_019950	ACCG	2	8	42928	42935	25 %	0 %	25 %	50 %	433625129
1005	NC_019950	GCGT	2	8	42954	42961	0 %	25 %	50 %	25 %	433625129
1006	NC_019950	GCC	2	6	43028	43033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_019950	GGT	2	6	43089	43094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019950	GAT	2	6	43097	43102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019950	GTG	2	6	43106	43111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625130
1010	NC_019950	CGC	2	6	43147	43152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625130
1011	NC_019950	TGG	2	6	43179	43184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625130
1012	NC_019950	CGC	2	6	43214	43219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625130
1013	NC_019950	ACG	2	6	43245	43250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625130
1014	NC_019950	GCCAA	2	10	43331	43340	40 %	0 %	20 %	40 %	433625130
1015	NC_019950	GCG	2	6	43496	43501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625130
1016	NC_019950	CGA	2	6	43573	43578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625130
1017	NC_019950	TGT	2	6	43587	43592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625130
1018	NC_019950	TGG	2	6	43614	43619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625130
1019	NC_019950	TGC	2	6	43647	43652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625130
1020	NC_019950	GCCGCT	2	12	43660	43671	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433625130
1021	NC_019950	GCT	2	6	43675	43680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625130
1022	NC_019950	CCAC	2	8	43683	43690	25 %	0 %	0 %	75 %	433625130
1023	NC_019950	CGAT	2	8	43692	43699	25 %	25 %	25 %	25 %	433625130
1024	NC_019950	CCG	3	9	43721	43729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_019950	AGC	2	6	43740	43745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_019950	GCGTC	2	10	43746	43755	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1027	NC_019950	CAC	2	6	43947	43952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625131
1028	NC_019950	GCCACC	2	12	43978	43989	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	433625131
1029	NC_019950	CGG	2	6	43997	44002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625131
1030	NC_019950	CG	3	6	44040	44045	0 %	0 %	50 %	50 %	433625131
1031	NC_019950	CAGCGC	2	12	44046	44057	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433625131
1032	NC_019950	CGC	4	12	44112	44123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625131
1033	NC_019950	GCACA	2	10	44130	44139	40 %	0 %	20 %	40 %	433625131
1034	NC_019950	GCC	3	9	44170	44178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_019950	GCG	2	6	44240	44245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625132
1036	NC_019950	GGCC	2	8	44388	44395	0 %	0 %	50 %	50 %	433625132
1037	NC_019950	GGT	2	6	44421	44426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625132
1038	NC_019950	GAT	2	6	44526	44531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625132
1039	NC_019950	TGA	2	6	44532	44537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625132
1040	NC_019950	GT	3	6	44613	44618	0 %	50 %	50 %	0 %	433625132
1041	NC_019950	ACC	2	6	44659	44664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625132
1042	NC_019950	CAC	2	6	44712	44717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625132
1043	NC_019950	GCG	2	6	44759	44764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625132
1044	NC_019950	GGT	2	6	44840	44845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625132
1045	NC_019950	GGC	3	9	44878	44886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625132
1046	NC_019950	TGC	2	6	44972	44977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625132
1047	NC_019950	CCCG	2	8	44979	44986	0 %	0 %	25 %	75 %	433625132
1048	NC_019950	CGGG	2	8	45008	45015	0 %	0 %	75 %	25 %	433625132
1049	NC_019950	GGC	2	6	45049	45054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625132
1050	NC_019950	GCA	2	6	45059	45064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625132
1051	NC_019950	CGG	2	6	45086	45091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625132
1052	NC_019950	CAC	2	6	45099	45104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625132
1053	NC_019950	GCC	2	6	45126	45131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625132
1054	NC_019950	GC	3	6	45150	45155	0 %	0 %	50 %	50 %	433625132
1055	NC_019950	CGT	2	6	45205	45210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_019950	GTG	2	6	45282	45287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_019950	GGC	2	6	45391	45396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625133
1058	NC_019950	CGA	2	6	45408	45413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1059	NC_019950	CCG	2	6	45446	45451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1060	NC_019950	GAC	2	6	45565	45570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1061	NC_019950	CGAC	2	8	45647	45654	25 %	0 %	25 %	50 %	433625133
1062	NC_019950	TGG	2	6	45677	45682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625133
1063	NC_019950	TGC	2	6	45692	45697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1064	NC_019950	CCG	2	6	45728	45733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1065	NC_019950	CGT	2	6	45786	45791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1066	NC_019950	CGC	2	6	45799	45804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1067	NC_019950	CGA	2	6	45838	45843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1068	NC_019950	ACC	2	6	45853	45858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625133
1069	NC_019950	CAA	2	6	45930	45935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625133
1070	NC_019950	GC	3	6	45937	45942	0 %	0 %	50 %	50 %	433625133
1071	NC_019950	GGC	2	6	45994	45999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625133
1072	NC_019950	GAGC	2	8	46027	46034	25 %	0 %	50 %	25 %	433625133
1073	NC_019950	CGA	2	6	46044	46049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1074	NC_019950	CCG	2	6	46130	46135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1075	NC_019950	GAT	2	6	46191	46196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625133
1076	NC_019950	GCT	2	6	46221	46226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1077	NC_019950	CGA	2	6	46227	46232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1078	NC_019950	CAC	2	6	46368	46373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625133
1079	NC_019950	CGA	2	6	46434	46439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1080	NC_019950	CGC	2	6	46446	46451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1081	NC_019950	CGG	3	9	46488	46496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625133
1082	NC_019950	CGC	2	6	46515	46520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1083	NC_019950	CGC	2	6	46536	46541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1084	NC_019950	TCT	2	6	46586	46591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625133
1085	NC_019950	GGTAC	2	10	46664	46673	20 %	20 %	40 %	20 %	433625133
1086	NC_019950	GGGACT	2	12	46709	46720	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433625133
1087	NC_019950	CGG	2	6	46761	46766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625133
1088	NC_019950	CAG	2	6	46841	46846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1089	NC_019950	TCG	2	6	46859	46864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1090	NC_019950	TCGAA	2	10	46896	46905	40 %	20 %	20 %	20 %	433625133
1091	NC_019950	CGA	2	6	46998	47003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1092	NC_019950	ACT	2	6	47039	47044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625133
1093	NC_019950	CGA	2	6	47064	47069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1094	NC_019950	GGGC	2	8	47186	47193	0 %	0 %	75 %	25 %	433625133
1095	NC_019950	CGGC	2	8	47281	47288	0 %	0 %	50 %	50 %	433625133
1096	NC_019950	GAC	2	6	47302	47307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1097	NC_019950	CGG	2	6	47331	47336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625133
1098	NC_019950	CTG	2	6	47359	47364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1099	NC_019950	GCTTAC	2	12	47458	47469	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433625133
1100	NC_019950	GC	3	6	47476	47481	0 %	0 %	50 %	50 %	433625133
1101	NC_019950	GAA	2	6	47595	47600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625133
1102	NC_019950	TGT	2	6	47709	47714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625133
1103	NC_019950	GTC	2	6	47752	47757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1104	NC_019950	GCACC	2	10	47826	47835	20 %	0 %	20 %	60 %	433625133
1105	NC_019950	TCG	2	6	47837	47842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1106	NC_019950	AGA	2	6	47850	47855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625133
1107	NC_019950	ACC	2	6	47909	47914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625133
1108	NC_019950	AAG	2	6	47920	47925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625133
1109	NC_019950	GCC	2	6	47947	47952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1110	NC_019950	GAG	2	6	48001	48006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433625133
1111	NC_019950	ACC	2	6	48028	48033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625133
1112	NC_019950	GCC	2	6	48067	48072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1113	NC_019950	TCG	2	6	48077	48082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1114	NC_019950	GTG	3	9	48133	48141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625133
1115	NC_019950	GCC	2	6	48142	48147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1116	NC_019950	CGA	2	6	48153	48158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1117	NC_019950	GCC	2	6	48172	48177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625133
1118	NC_019950	CGA	2	6	48186	48191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625133
1119	NC_019950	GCCG	2	8	48244	48251	0 %	0 %	50 %	50 %	433625133
1120	NC_019950	CGG	2	6	48281	48286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_019950	CGG	2	6	48348	48353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_019950	TTGC	2	8	48408	48415	0 %	50 %	25 %	25 %	433625134
1123	NC_019950	AGC	2	6	48507	48512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625134
1124	NC_019950	CG	3	6	48524	48529	0 %	0 %	50 %	50 %	433625134
1125	NC_019950	CCGC	2	8	48556	48563	0 %	0 %	25 %	75 %	433625134
1126	NC_019950	GCG	2	6	48568	48573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625134
1127	NC_019950	CCGC	2	8	48589	48596	0 %	0 %	25 %	75 %	433625134
1128	NC_019950	TCT	2	6	48634	48639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625134
1129	NC_019950	GCC	2	6	48643	48648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625134
1130	NC_019950	GGT	3	9	48659	48667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625134
1131	NC_019950	GGTC	2	8	48697	48704	0 %	25 %	50 %	25 %	433625134
1132	NC_019950	GCA	2	6	48799	48804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625134
1133	NC_019950	CGGTG	2	10	48860	48869	0 %	20 %	60 %	20 %	433625134
1134	NC_019950	ACA	2	6	48999	49004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625134
1135	NC_019950	TCATG	2	10	49006	49015	20 %	40 %	20 %	20 %	433625134
1136	NC_019950	CTAC	2	8	49021	49028	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_019950	GCT	2	6	49138	49143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_019950	ATCGG	2	10	49153	49162	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1139	NC_019950	CGGG	2	8	49248	49255	0 %	0 %	75 %	25 %	433625135
1140	NC_019950	CGG	3	9	49265	49273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625135
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1142	NC_019950	GCG	2	6	49361	49366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625135
1143	NC_019950	CGT	2	6	49392	49397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625135
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1145	NC_019950	TCG	2	6	49487	49492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625135
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1151	NC_019950	CGC	2	6	50160	50165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625136
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1162	NC_019950	GCCG	2	8	50505	50512	0 %	0 %	50 %	50 %	433625136
1163	NC_019950	AGC	2	6	50549	50554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625136
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1186	NC_019950	CAGC	2	8	51690	51697	25 %	0 %	25 %	50 %	433625137
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1188	NC_019950	GTG	2	6	51802	51807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1189	NC_019950	GAT	2	6	51829	51834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625138
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1233	NC_019950	ACG	2	6	53568	53573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1234	NC_019950	AT	3	6	53605	53610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1235	NC_019950	ACA	2	6	53616	53621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1236	NC_019950	CCG	2	6	53688	53693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625140
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1238	NC_019950	GTG	2	6	53736	53741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625140
1239	NC_019950	CGA	2	6	53758	53763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625140
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1242	NC_019950	GGTA	2	8	53923	53930	25 %	25 %	50 %	0 %	433625140
1243	NC_019950	CGG	2	6	53943	53948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625140
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1246	NC_019950	CCG	2	6	54060	54065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625140
1247	NC_019950	CAC	2	6	54095	54100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625140
1248	NC_019950	CAG	2	6	54194	54199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625140
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1378	NC_019950	CGC	2	6	59060	59065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625143
1379	NC_019950	CGT	2	6	59089	59094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625143
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