MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 109775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_019950	CCA	2	6	22494	22499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625108
503	NC_019950	GAC	2	6	22531	22536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625108
504	NC_019950	ACC	3	9	22565	22573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625108
505	NC_019950	CAG	3	9	22588	22596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625108
506	NC_019950	CACC	2	8	22629	22636	25 %	0 %	0 %	75 %	433625108
507	NC_019950	CCA	2	6	22737	22742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625108
508	NC_019950	CCG	2	6	22746	22751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625108
509	NC_019950	AGA	2	6	22755	22760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625108
510	NC_019950	CAG	3	9	22762	22770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625108
511	NC_019950	CGG	2	6	22785	22790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625108
512	NC_019950	TGC	2	6	22849	22854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625108
513	NC_019950	AGC	2	6	22859	22864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625108
514	NC_019950	GGT	2	6	22929	22934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625108
515	NC_019950	CAC	2	6	22948	22953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625108
516	NC_019950	CCA	2	6	22974	22979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625108
517	NC_019950	CTG	2	6	22993	22998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625108
518	NC_019950	CCA	2	6	23037	23042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625108
519	NC_019950	CCA	2	6	23088	23093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625108
520	NC_019950	CAG	2	6	23230	23235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625108
521	NC_019950	CGG	2	6	23253	23258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625108
522	NC_019950	CAG	4	12	23266	23277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625108
523	NC_019950	GTCGT	2	10	23331	23340	0 %	40 %	40 %	20 %	433625108
524	NC_019950	GCC	3	9	23344	23352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625109
525	NC_019950	TCG	2	6	23399	23404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625109
526	NC_019950	CGG	2	6	23430	23435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625109
527	NC_019950	AGT	2	6	23478	23483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625109
528	NC_019950	GGT	2	6	23505	23510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625109
529	NC_019950	GAG	2	6	23530	23535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433625109
530	NC_019950	TGG	3	9	23561	23569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625109
531	NC_019950	CGGG	2	8	23585	23592	0 %	0 %	75 %	25 %	433625109
532	NC_019950	GGC	2	6	23617	23622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625109
533	NC_019950	GCC	2	6	23635	23640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625109
534	NC_019950	GCCG	2	8	23676	23683	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
535	NC_019950	GC	3	6	23704	23709	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
536	NC_019950	CGG	2	6	23712	23717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625109
537	NC_019950	TCC	2	6	23725	23730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625109
538	NC_019950	TCA	2	6	23735	23740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625109
539	NC_019950	ATG	2	6	23869	23874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625109
540	NC_019950	GTA	2	6	23901	23906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625109
541	NC_019950	TGC	2	6	23909	23914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625109
542	NC_019950	GAT	2	6	23916	23921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625109
543	NC_019950	CG	3	6	23922	23927	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
544	NC_019950	TCA	2	6	23948	23953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625109
545	NC_019950	ACC	2	6	23996	24001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625109
546	NC_019950	GCTG	2	8	24056	24063	0 %	25 %	50 %	25 %	433625109
547	NC_019950	CGGC	2	8	24076	24083	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
548	NC_019950	GTC	3	9	24108	24116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625109
549	NC_019950	CGTAGT	2	12	24155	24166	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433625109
550	NC_019950	CGA	2	6	24167	24172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625109
551	NC_019950	CGA	3	9	24179	24187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625109
552	NC_019950	GCC	3	9	24204	24212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625109
553	NC_019950	CAG	2	6	24321	24326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625109
554	NC_019950	CCT	2	6	24428	24433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625109
555	NC_019950	TCG	2	6	24451	24456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625109
556	NC_019950	GTC	2	6	24477	24482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625109
557	NC_019950	GCA	2	6	24512	24517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625109
558	NC_019950	CG	3	6	24524	24529	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
559	NC_019950	GC	3	6	24649	24654	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
560	NC_019950	CAG	2	6	24675	24680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625109
561	NC_019950	TCG	2	6	24694	24699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625109
562	NC_019950	GCCG	2	8	24747	24754	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
563	NC_019950	CCCA	2	8	24759	24766	25 %	0 %	0 %	75 %	433625109
564	NC_019950	GTT	2	6	24816	24821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625109
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567	NC_019950	GC	3	6	24926	24931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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569	NC_019950	GTC	2	6	25040	25045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625110
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571	NC_019950	GTC	2	6	25171	25176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625110
572	NC_019950	GC	3	6	25178	25183	0 %	0 %	50 %	50 %	433625110
573	NC_019950	CG	3	6	25217	25222	0 %	0 %	50 %	50 %	433625110
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589	NC_019950	CGTAGT	2	12	25932	25943	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433625111
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594	NC_019950	CGGG	2	8	26121	26128	0 %	0 %	75 %	25 %	433625111
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599	NC_019950	GCCGG	2	10	26291	26300	0 %	0 %	60 %	40 %	433625111
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617	NC_019950	TCAA	2	8	27199	27206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
618	NC_019950	GAGC	2	8	27227	27234	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
619	NC_019950	GGCC	2	8	27241	27248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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622	NC_019950	TCC	2	6	27314	27319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_019950	GTT	2	6	27321	27326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_019950	TCG	3	9	27441	27449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_019950	GCC	2	6	27455	27460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_019950	GC	3	6	27605	27610	0 %	0 %	50 %	50 %	433625112
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628	NC_019950	TTG	2	6	27634	27639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625112
629	NC_019950	CGG	2	6	27660	27665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625112
630	NC_019950	CGG	2	6	27702	27707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625112
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658	NC_019950	CAC	2	6	28750	28755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625113
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722	NC_019950	GCC	2	6	31212	31217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625116
723	NC_019950	AC	3	6	31345	31350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
724	NC_019950	CACG	2	8	31430	31437	25 %	0 %	25 %	50 %	433625117
725	NC_019950	ACCG	2	8	31511	31518	25 %	0 %	25 %	50 %	433625117
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730	NC_019950	CGATC	2	10	31812	31821	20 %	20 %	20 %	40 %	433625117
731	NC_019950	CCGG	2	8	31830	31837	0 %	0 %	50 %	50 %	433625117
732	NC_019950	CG	3	6	31838	31843	0 %	0 %	50 %	50 %	433625117
733	NC_019950	GGT	2	6	31889	31894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625117
734	NC_019950	GCC	2	6	31938	31943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625117
735	NC_019950	GTCG	2	8	32006	32013	0 %	25 %	50 %	25 %	433625117
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743	NC_019950	GC	3	6	32257	32262	0 %	0 %	50 %	50 %	433625117
744	NC_019950	CTG	2	6	32286	32291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625117
745	NC_019950	CGA	2	6	32327	32332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625117
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747	NC_019950	CGA	2	6	32399	32404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625117
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749	NC_019950	CGA	2	6	32464	32469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625117
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751	NC_019950	GGC	3	9	32534	32542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625117
752	NC_019950	CGG	2	6	32543	32548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625117
753	NC_019950	CAA	2	6	32571	32576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625117
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755	NC_019950	GT	3	6	32656	32661	0 %	50 %	50 %	0 %	433625117
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