MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 109775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019950	TGC	2	6	228510	228515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625292
5502	NC_019950	GC	3	6	228514	228519	0 %	0 %	50 %	50 %	433625292
5503	NC_019950	CAC	2	6	228554	228559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625292
5504	NC_019950	GAT	2	6	228595	228600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625292
5505	NC_019950	CCTACA	2	12	228624	228635	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	433625292
5506	NC_019950	GTG	2	6	228638	228643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625292
5507	NC_019950	ATC	2	6	228644	228649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625292
5508	NC_019950	CGT	2	6	228655	228660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625292
5509	NC_019950	CTGGC	2	10	228680	228689	0 %	20 %	40 %	40 %	433625292
5510	NC_019950	CGC	2	6	228694	228699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625292
5511	NC_019950	TGG	2	6	228732	228737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625292
5512	NC_019950	TCG	2	6	228774	228779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625292
5513	NC_019950	CGG	2	6	228795	228800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625292
5514	NC_019950	CTG	2	6	228857	228862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625292
5515	NC_019950	CCG	2	6	228900	228905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625292
5516	NC_019950	TGC	2	6	228915	228920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625292
5517	NC_019950	GCG	2	6	228926	228931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625292
5518	NC_019950	GCG	3	9	228939	228947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625292
5519	NC_019950	CAT	2	6	228997	229002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625292
5520	NC_019950	CTG	2	6	229013	229018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625292
5521	NC_019950	GCT	2	6	229024	229029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625292
5522	NC_019950	GAT	2	6	229048	229053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625292
5523	NC_019950	CGG	2	6	229065	229070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625292
5524	NC_019950	GTT	2	6	229087	229092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625292
5525	NC_019950	CAG	2	6	229156	229161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_019950	GAA	2	6	229202	229207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_019950	CGC	2	6	229271	229276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625293
5528	NC_019950	CCG	2	6	229404	229409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625293
5529	NC_019950	GCC	2	6	229427	229432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625293
5530	NC_019950	ACCCG	2	10	229433	229442	20 %	0 %	20 %	60 %	433625293
5531	NC_019950	GCC	2	6	229451	229456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625293
5532	NC_019950	GCC	3	9	229475	229483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625293
5533	NC_019950	CGC	2	6	229498	229503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625293
5534	NC_019950	AGC	2	6	229532	229537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625293
5535	NC_019950	TTG	2	6	229570	229575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625293
5536	NC_019950	CGC	2	6	229579	229584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625293
5537	NC_019950	GCC	2	6	229592	229597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625293
5538	NC_019950	ATC	3	9	229644	229652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625293
5539	NC_019950	CCCG	2	8	229715	229722	0 %	0 %	25 %	75 %	433625293
5540	NC_019950	CGGC	2	8	229813	229820	0 %	0 %	50 %	50 %	433625293
5541	NC_019950	TGG	2	6	229852	229857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625293
5542	NC_019950	CCG	2	6	229861	229866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625293
5543	NC_019950	ACG	2	6	229867	229872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625293
5544	NC_019950	CGT	2	6	229904	229909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625293
5545	NC_019950	CGG	2	6	229946	229951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625293
5546	NC_019950	CCA	2	6	229952	229957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625293
5547	NC_019950	CTA	2	6	229973	229978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625293
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5549	NC_019950	ACA	2	6	230086	230091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625293
5550	NC_019950	GC	3	6	230110	230115	0 %	0 %	50 %	50 %	433625293
5551	NC_019950	GTC	2	6	230223	230228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625293
5552	NC_019950	GAA	2	6	230231	230236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625293
5553	NC_019950	ACA	2	6	230251	230256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625293
5554	NC_019950	ACG	2	6	230260	230265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625293
5555	NC_019950	CG	3	6	230293	230298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_019950	AGC	2	6	230388	230393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625294
5557	NC_019950	CGG	2	6	230394	230399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625294
5558	NC_019950	CAC	2	6	230411	230416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625294
5559	NC_019950	GGC	2	6	230444	230449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625294
5560	NC_019950	CGCAG	2	10	230503	230512	20 %	0 %	40 %	40 %	433625294
5561	NC_019950	GC	3	6	230552	230557	0 %	0 %	50 %	50 %	433625294
5562	NC_019950	CGG	2	6	230599	230604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625294
5563	NC_019950	GGTCTT	2	12	230608	230619	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	433625294
5564	NC_019950	CGGG	2	8	230690	230697	0 %	0 %	75 %	25 %	433625294
5565	NC_019950	GCT	2	6	230698	230703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625294
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5567	NC_019950	CTG	2	6	230746	230751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625294
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5569	NC_019950	GAA	2	6	230867	230872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625294
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5572	NC_019950	CG	3	6	230976	230981	0 %	0 %	50 %	50 %	433625294
5573	NC_019950	TTC	2	6	231033	231038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625294
5574	NC_019950	GAG	2	6	231044	231049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433625294
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5576	NC_019950	TAA	2	6	231088	231093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433625294
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5578	NC_019950	TCG	2	6	231111	231116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625294
5579	NC_019950	GCTC	2	8	231136	231143	0 %	25 %	25 %	50 %	433625294
5580	NC_019950	ATG	2	6	231219	231224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625294
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5585	NC_019950	TCG	2	6	231549	231554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625294
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5592	NC_019950	CGC	2	6	231738	231743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625294
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5594	NC_019950	TCG	2	6	231795	231800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625294
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5602	NC_019950	CGG	2	6	232093	232098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625294
5603	NC_019950	GGT	2	6	232145	232150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625294
5604	NC_019950	GGC	2	6	232269	232274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_019950	ACC	2	6	232459	232464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5606	NC_019950	TGG	2	6	232517	232522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625296
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5608	NC_019950	GCG	2	6	232577	232582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625296
5609	NC_019950	GAC	2	6	232637	232642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625296
5610	NC_019950	CGC	3	9	232693	232701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625296
5611	NC_019950	ACGT	2	8	232721	232728	25 %	25 %	25 %	25 %	433625296
5612	NC_019950	TAC	2	6	232736	232741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625296
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5620	NC_019950	GCT	2	6	233035	233040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625296
5621	NC_019950	CCAC	2	8	233049	233056	25 %	0 %	0 %	75 %	433625296
5622	NC_019950	GTC	2	6	233090	233095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625296
5623	NC_019950	GCG	2	6	233099	233104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625296
5624	NC_019950	GTC	2	6	233120	233125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625296
5625	NC_019950	AGG	2	6	233139	233144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433625296
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5627	NC_019950	GCT	2	6	233233	233238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625296
5628	NC_019950	CGG	2	6	233281	233286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625296
5629	NC_019950	ATGG	2	8	233287	233294	25 %	25 %	50 %	0 %	433625296
5630	NC_019950	GCA	2	6	233304	233309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625296
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5633	NC_019950	GCA	2	6	233398	233403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625296
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5635	NC_019950	CCGG	2	8	233572	233579	0 %	0 %	50 %	50 %	433625296
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5641	NC_019950	GCC	2	6	233750	233755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625296
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5647	NC_019950	CGG	2	6	233917	233922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625296
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5654	NC_019950	CGA	2	6	234157	234162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625296
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5657	NC_019950	CGC	2	6	234350	234355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625296
5658	NC_019950	CTG	2	6	234356	234361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625296
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5661	NC_019950	CTG	2	6	234425	234430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625296
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5688	NC_019950	CGG	2	6	235290	235295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625296
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5706	NC_019950	CAC	2	6	236433	236438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5710	NC_019950	GGT	2	6	236553	236558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625297
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5723	NC_019950	GCC	2	6	236965	236970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625297
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5726	NC_019950	CGCA	2	8	237115	237122	25 %	0 %	25 %	50 %	433625297
5727	NC_019950	TGCGC	2	10	237135	237144	0 %	20 %	40 %	40 %	433625297
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5729	NC_019950	ACGT	2	8	237177	237184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5730	NC_019950	GGCCG	2	10	237187	237196	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5731	NC_019950	GTG	2	6	237208	237213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5732	NC_019950	ACAT	2	8	237244	237251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5733	NC_019950	TGGA	2	8	237258	237265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5734	NC_019950	GCG	2	6	237266	237271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5735	NC_019950	TGG	2	6	237294	237299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625298
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5737	NC_019950	GCG	2	6	237369	237374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625298
5738	NC_019950	ACT	2	6	237396	237401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625298
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5740	NC_019950	GCT	2	6	237496	237501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625298
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5851	NC_019950	CAGC	3	12	242032	242043	25 %	0 %	25 %	50 %	433625300
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5853	NC_019950	AAG	2	6	242211	242216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625301
5854	NC_019950	GAC	3	9	242222	242230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625301
5855	NC_019950	GCCGAA	2	12	242261	242272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625301
5856	NC_019950	ACT	2	6	242317	242322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625301
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5859	NC_019950	TACC	2	8	242398	242405	25 %	25 %	0 %	50 %	433625301
5860	NC_019950	GCC	2	6	242423	242428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625301
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