MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma cynos C142 complete genome

Total Repeats: 683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019949	AATATA	2	12	604	615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433624205
2	NC_019949	TAAAAA	3	18	2672	2689	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	433624206
3	NC_019949	GTTTTT	2	12	5322	5333	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	433624211
4	NC_019949	ATTTAT	2	12	7330	7341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433624212
5	NC_019949	ATATTT	2	12	7838	7849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433624212
6	NC_019949	TAAAAA	2	12	11976	11987	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	433624218
7	NC_019949	TAATTC	2	12	15072	15083	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	433624221
8	NC_019949	TTCTTT	2	12	15953	15964	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	433624222
9	NC_019949	ATTTAA	2	12	16179	16190	50 %	50 %	0 %	0 %	433624222
10	NC_019949	ACTTTT	2	12	17822	17833	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	433624226
11	NC_019949	AAGGAA	2	12	18954	18965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433624226
12	NC_019949	ATCTTT	2	12	19549	19560	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	433624226
13	NC_019949	AAGGAA	2	12	20400	20411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433624226
14	NC_019949	TTTTTA	2	12	20618	20629	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	433624226
15	NC_019949	TTCAGA	2	12	23922	23933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019949	AAAAGA	2	12	26612	26623	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	433624233
17	NC_019949	TAAATA	2	12	26970	26981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433624234
18	NC_019949	GTTAAT	2	12	27811	27822	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	433624235
19	NC_019949	AAAATT	2	12	28039	28050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433624235
20	NC_019949	ATTTAA	2	12	30983	30994	50 %	50 %	0 %	0 %	433624239
21	NC_019949	ATTGTT	2	12	33284	33295	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	433624241
22	NC_019949	TGATTG	2	12	35612	35623	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	433624243
23	NC_019949	CCTAAT	2	12	35833	35844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433624243
24	NC_019949	AATTTC	2	12	37587	37598	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	433624243
25	NC_019949	AAAGGA	2	12	37768	37779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433624243
26	NC_019949	ATGATC	2	12	38360	38371	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	433624243
27	NC_019949	GAAAAA	2	12	38545	38556	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	433624244
28	NC_019949	TACTAA	2	12	41195	41206	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	433624246
29	NC_019949	TTTTTC	2	12	42308	42319	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	433624247
30	NC_019949	CTGGAG	2	12	47879	47890	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019949	AAGTGT	2	12	48185	48196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019949	TTTAAA	2	12	50829	50840	50 %	50 %	0 %	0 %	433624254
33	NC_019949	TTTTTC	2	12	53288	53299	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	433624256
34	NC_019949	TAATGA	2	12	56160	56171	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	433624261
35	NC_019949	TTTTAG	2	12	59737	59748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	433624264
36	NC_019949	AACAAA	2	12	59779	59790	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	433624264
37	NC_019949	AGATCA	2	12	60163	60174	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	433624266
38	NC_019949	TTAGTA	2	12	60772	60783	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	433624266
39	NC_019949	TTTTGC	2	12	61072	61083	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	433624266
40	NC_019949	TTTGGT	2	12	62112	62123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433624267
41	NC_019949	TTTATA	2	12	62444	62455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433624267
42	NC_019949	TGTCAT	2	12	63783	63794	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433624269
43	NC_019949	CATTAA	2	12	65014	65025	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	433624271
44	NC_019949	ATTTAA	2	12	65701	65712	50 %	50 %	0 %	0 %	433624271
45	NC_019949	ATTTAA	2	12	66056	66067	50 %	50 %	0 %	0 %	433624271
46	NC_019949	TAAAAT	2	12	67618	67629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433624274
47	NC_019949	GAAAAA	2	12	67817	67828	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	433624274
48	NC_019949	AGATAA	2	12	68857	68868	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	433624274
49	NC_019949	AAAGAA	2	12	70689	70700	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	433624276
50	NC_019949	GAATAT	2	12	71140	71151	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	433624276
51	NC_019949	AAAAAG	2	12	71163	71174	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	433624276
52	NC_019949	AAAAGG	2	12	71327	71338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433624276
53	NC_019949	AAAAAG	2	12	71786	71797	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	433624276
54	NC_019949	AATTTG	2	12	73684	73695	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	433624278
55	NC_019949	TATTAA	2	12	75858	75869	50 %	50 %	0 %	0 %	433624282
56	NC_019949	TTTTTC	2	12	79094	79105	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	433624285
57	NC_019949	GGGATA	2	12	81637	81648	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	433624289
58	NC_019949	ATTCAT	2	12	82178	82189	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	433624289
59	NC_019949	AAAATG	2	12	84952	84963	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	433624291
60	NC_019949	TGAATT	2	12	86814	86825	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	433624291
61	NC_019949	TTATCT	2	12	87070	87081	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	433624292
62	NC_019949	AAGAAA	2	12	88097	88108	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019949	GTTAAA	2	12	89065	89076	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	433624293
64	NC_019949	ATTGAT	2	12	92231	92242	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	433624294
65	NC_019949	ATAAAT	2	12	92382	92393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433624294
66	NC_019949	GATTTT	2	12	92424	92435	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	433624294
67	NC_019949	GAATAT	2	12	95020	95031	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	433624295
68	NC_019949	CTAAAA	2	12	97054	97065	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	433624296
69	NC_019949	AAAAAT	2	12	97538	97549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019949	TTTTTC	2	12	98905	98916	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_019949	TTTATA	2	12	100670	100681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433624302
72	NC_019949	AAATAA	2	12	100916	100927	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	433624302
73	NC_019949	TTAATT	2	12	101725	101736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433624303
74	NC_019949	TTTTTA	2	12	108243	108254	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	433624310
75	NC_019949	ATATTA	2	12	108462	108473	50 %	50 %	0 %	0 %	433624310
76	NC_019949	AATACA	2	12	111802	111813	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	433624312
77	NC_019949	TATCTT	2	12	112278	112289	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	433624313
78	NC_019949	GTTTTA	2	12	113917	113928	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019949	AATACA	2	12	117413	117424	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	433624316
80	NC_019949	GTTTTA	2	12	119624	119635	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019949	GTTTTA	2	12	121180	121191	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019949	ATTTTC	2	12	122854	122865	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019949	TGTTTT	2	12	123168	123179	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	433624321
84	NC_019949	CTTCAT	2	12	126970	126981	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	433624323
85	NC_019949	TTTATT	2	12	127712	127723	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019949	TTAAAT	2	12	128293	128304	50 %	50 %	0 %	0 %	433624324
87	NC_019949	TGATTT	2	12	130107	130118	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019949	TAGAAT	2	12	131027	131038	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	433624328
89	NC_019949	TTGGTT	2	12	131480	131491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433624328
90	NC_019949	AGGTTC	2	12	133318	133329	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433624329
91	NC_019949	TTTTTA	2	12	136263	136274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	433624332
92	NC_019949	ATATTG	2	12	137221	137232	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	433624332
93	NC_019949	ATACCA	2	12	138243	138254	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	433624332
94	NC_019949	TAGTTT	2	12	140057	140068	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019949	TCTTAG	2	12	144776	144787	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433624335
96	NC_019949	TAAATA	2	12	146961	146972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019949	TAAATA	2	12	147093	147104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019949	AAAAGA	2	12	147362	147373	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	433624338
99	NC_019949	CTAATC	2	12	150928	150939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433624339
100	NC_019949	TATAAT	2	12	152707	152718	50 %	50 %	0 %	0 %	433624342
101	NC_019949	ATTAAG	2	12	152746	152757	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019949	GTTGAT	2	12	152937	152948	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	433624343
103	NC_019949	AAAATA	2	12	154791	154802	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	433624346
104	NC_019949	TTACAT	2	12	155196	155207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019949	ATATTT	2	12	156549	156560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433624347
106	NC_019949	TGAAAT	2	12	156768	156779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	433624347
107	NC_019949	ATTTTT	2	12	157811	157822	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	433624350
108	NC_019949	AAAATA	2	12	159057	159068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	433624353
109	NC_019949	TATGTA	2	12	160007	160018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	433624356
110	NC_019949	GATTTT	2	12	160947	160958	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	433624356
111	NC_019949	TTATAT	2	12	161583	161594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433624356
112	NC_019949	AAATTA	2	12	164689	164700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433624358
113	NC_019949	ATTTTT	2	12	167228	167239	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	433624362
114	NC_019949	TTTAAT	2	12	167406	167417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433624362
115	NC_019949	AGAAAT	2	12	169289	169300	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	433624365
116	NC_019949	AAAGCA	2	12	170124	170135	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	433624365
117	NC_019949	AGTTAA	2	12	171406	171417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	433624367
118	NC_019949	TGCATT	2	12	172092	172103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433624368
119	NC_019949	TTTTCA	2	12	172559	172570	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	433624369
120	NC_019949	AAATCC	2	12	175906	175917	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	433624373
121	NC_019949	TGATTT	2	12	177308	177319	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	433624374
122	NC_019949	GATTTT	2	12	178688	178699	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	433624375
123	NC_019949	TTCTGA	2	12	179051	179062	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433624375
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241	NC_019949	AACCAA	2	12	339371	339382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433624537
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354	NC_019949	ACACAA	2	12	527889	527900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433624700
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356	NC_019949	CAGGTT	2	12	530525	530536	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433624702
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