MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.03

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019740	TG	3	6	969	974	0 %	50 %	50 %	0 %	428314596
2	NC_019740	GA	3	6	1343	1348	50 %	0 %	50 %	0 %	428314596
3	NC_019740	TG	3	6	1674	1679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019740	GA	4	8	2719	2726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019740	CT	3	6	3470	3475	0 %	50 %	0 %	50 %	428314601
6	NC_019740	AG	3	6	4156	4161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019740	CA	3	6	4423	4428	50 %	0 %	0 %	50 %	428314603
8	NC_019740	TA	3	6	4798	4803	50 %	50 %	0 %	0 %	428314603
9	NC_019740	AG	4	8	5072	5079	50 %	0 %	50 %	0 %	428314603
10	NC_019740	TC	3	6	5421	5426	0 %	50 %	0 %	50 %	428314603
11	NC_019740	AG	3	6	6681	6686	50 %	0 %	50 %	0 %	428314603
12	NC_019740	CT	3	6	7301	7306	0 %	50 %	0 %	50 %	428314603
13	NC_019740	GT	3	6	8118	8123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019740	AT	3	6	8845	8850	50 %	50 %	0 %	0 %	428314604
15	NC_019740	GA	3	6	11026	11031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019740	CT	3	6	11105	11110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019740	CT	3	6	11208	11213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019740	AT	3	6	12144	12149	50 %	50 %	0 %	0 %	428314605
19	NC_019740	AG	3	6	12299	12304	50 %	0 %	50 %	0 %	428314605
20	NC_019740	AG	6	12	13411	13422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019740	GA	3	6	15387	15392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019740	TC	3	6	15464	15469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019740	CT	3	6	15538	15543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019740	CT	3	6	16533	16538	0 %	50 %	0 %	50 %	428314610
25	NC_019740	AG	3	6	16788	16793	50 %	0 %	50 %	0 %	428314610
26	NC_019740	CG	3	6	17427	17432	0 %	0 %	50 %	50 %	428314611
27	NC_019740	GA	3	6	18074	18079	50 %	0 %	50 %	0 %	428314611
28	NC_019740	CA	3	6	18585	18590	50 %	0 %	0 %	50 %	428314612
29	NC_019740	GT	3	6	19291	19296	0 %	50 %	50 %	0 %	428314613
30	NC_019740	AG	3	6	21361	21366	50 %	0 %	50 %	0 %	428314615
31	NC_019740	AT	3	6	22051	22056	50 %	50 %	0 %	0 %	428314616
32	NC_019740	AT	3	6	22155	22160	50 %	50 %	0 %	0 %	428314616
33	NC_019740	AT	3	6	22699	22704	50 %	50 %	0 %	0 %	428314617
34	NC_019740	TA	3	6	23881	23886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019740	AG	4	8	24293	24300	50 %	0 %	50 %	0 %	428314619
36	NC_019740	AG	3	6	25245	25250	50 %	0 %	50 %	0 %	428314620
37	NC_019740	CT	3	6	26433	26438	0 %	50 %	0 %	50 %	428314621
38	NC_019740	AG	3	6	26613	26618	50 %	0 %	50 %	0 %	428314621
39	NC_019740	TC	3	6	27233	27238	0 %	50 %	0 %	50 %	428314622
40	NC_019740	TC	3	6	28614	28619	0 %	50 %	0 %	50 %	428314623
41	NC_019740	GT	3	6	28960	28965	0 %	50 %	50 %	0 %	428314623
42	NC_019740	TG	3	6	31097	31102	0 %	50 %	50 %	0 %	428314624
43	NC_019740	CA	3	6	32407	32412	50 %	0 %	0 %	50 %	428314624
44	NC_019740	GT	3	6	32535	32540	0 %	50 %	50 %	0 %	428314624
45	NC_019740	AG	3	6	34458	34463	50 %	0 %	50 %	0 %	428314625
46	NC_019740	TC	3	6	35443	35448	0 %	50 %	0 %	50 %	428314625
47	NC_019740	AT	3	6	35932	35937	50 %	50 %	0 %	0 %	428314626
48	NC_019740	CT	3	6	36033	36038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019740	GA	3	6	36047	36052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019740	GA	3	6	36059	36064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019740	TC	3	6	36314	36319	0 %	50 %	0 %	50 %	428314627
52	NC_019740	CA	3	6	36659	36664	50 %	0 %	0 %	50 %	428314627
53	NC_019740	GA	3	6	37410	37415	50 %	0 %	50 %	0 %	428314627
54	NC_019740	AC	3	6	40079	40084	50 %	0 %	0 %	50 %	428314631
55	NC_019740	TC	3	6	40683	40688	0 %	50 %	0 %	50 %	428314632
56	NC_019740	TC	3	6	40759	40764	0 %	50 %	0 %	50 %	428314632
57	NC_019740	AT	3	6	44016	44021	50 %	50 %	0 %	0 %	428314633
58	NC_019740	TC	3	6	44492	44497	0 %	50 %	0 %	50 %	428314634
59	NC_019740	AG	3	6	45429	45434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019740	GA	3	6	45560	45565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019740	TC	3	6	46118	46123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019740	GA	3	6	46545	46550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019740	GA	3	6	46565	46570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019740	GT	3	6	46874	46879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019740	AG	3	6	47673	47678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019740	CT	3	6	47709	47714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019740	AT	3	6	47763	47768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019740	GA	3	6	48502	48507	50 %	0 %	50 %	0 %	428314635
69	NC_019740	AT	4	8	49383	49390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019740	CA	3	6	49876	49881	50 %	0 %	0 %	50 %	428314636
71	NC_019740	CT	4	8	50500	50507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019740	GA	3	6	50889	50894	50 %	0 %	50 %	0 %	428314637
73	NC_019740	AT	3	6	51904	51909	50 %	50 %	0 %	0 %	428314637
74	NC_019740	GA	3	6	52187	52192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019740	CA	3	6	52440	52445	50 %	0 %	0 %	50 %	428314638
76	NC_019740	AG	3	6	52508	52513	50 %	0 %	50 %	0 %	428314638
77	NC_019740	TG	3	6	52995	53000	0 %	50 %	50 %	0 %	428314639
78	NC_019740	TG	3	6	55713	55718	0 %	50 %	50 %	0 %	428314641
79	NC_019740	CA	3	6	57023	57028	50 %	0 %	0 %	50 %	428314641
80	NC_019740	GT	3	6	57151	57156	0 %	50 %	50 %	0 %	428314641
81	NC_019740	AG	3	6	59074	59079	50 %	0 %	50 %	0 %	428314642
82	NC_019740	TC	3	6	60059	60064	0 %	50 %	0 %	50 %	428314642
83	NC_019740	TC	3	6	63409	63414	0 %	50 %	0 %	50 %	428314645
84	NC_019740	CT	3	6	63987	63992	0 %	50 %	0 %	50 %	428314646
85	NC_019740	TA	3	6	65040	65045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019740	AT	3	6	65106	65111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019740	CA	3	6	65603	65608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019740	AT	3	6	67341	67346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019740	CT	3	6	69110	69115	0 %	50 %	0 %	50 %	428314650
90	NC_019740	CT	3	6	69438	69443	0 %	50 %	0 %	50 %	428314650
91	NC_019740	CT	3	6	71548	71553	0 %	50 %	0 %	50 %	428314651
92	NC_019740	AC	3	6	72590	72595	50 %	0 %	0 %	50 %	428314652
93	NC_019740	AT	3	6	73014	73019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019740	AT	4	8	73175	73182	50 %	50 %	0 %	0 %	428314653
95	NC_019740	TA	3	6	75025	75030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019740	CT	3	6	75052	75057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019740	CA	5	10	75390	75399	50 %	0 %	0 %	50 %	428314657
98	NC_019740	CA	3	6	77604	77609	50 %	0 %	0 %	50 %	428314660
99	NC_019740	CT	3	6	78333	78338	0 %	50 %	0 %	50 %	428314660
100	NC_019740	AG	3	6	79615	79620	50 %	0 %	50 %	0 %	428314661
101	NC_019740	GA	3	6	80087	80092	50 %	0 %	50 %	0 %	428314662
102	NC_019740	CA	3	6	80143	80148	50 %	0 %	0 %	50 %	428314662
103	NC_019740	TA	3	6	83401	83406	50 %	50 %	0 %	0 %	428314663
104	NC_019740	TA	3	6	83524	83529	50 %	50 %	0 %	0 %	428314663
105	NC_019740	TA	3	6	83848	83853	50 %	50 %	0 %	0 %	428314663
106	NC_019740	CT	3	6	86442	86447	0 %	50 %	0 %	50 %	428314664
107	NC_019740	GA	4	8	88366	88373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019740	TC	3	6	88534	88539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019740	AG	3	6	88705	88710	50 %	0 %	50 %	0 %	428314665
110	NC_019740	TG	3	6	88958	88963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019740	TG	3	6	90415	90420	0 %	50 %	50 %	0 %	428314668
112	NC_019740	CA	3	6	91712	91717	50 %	0 %	0 %	50 %	428314669

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.