MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.03

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019740	TAGA	2	8	104	111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019740	GCAG	2	8	412	419	25 %	0 %	50 %	25 %	428314594
3	NC_019740	ACCG	2	8	1729	1736	25 %	0 %	25 %	50 %	428314597
4	NC_019740	TGAT	2	8	2375	2382	25 %	50 %	25 %	0 %	428314598
5	NC_019740	CGAT	2	8	2841	2848	25 %	25 %	25 %	25 %	428314599
6	NC_019740	AGAA	2	8	3029	3036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019740	TTGA	2	8	3613	3620	25 %	50 %	25 %	0 %	428314602
8	NC_019740	TAGT	2	8	3770	3777	25 %	50 %	25 %	0 %	428314602
9	NC_019740	GCTT	2	8	3953	3960	0 %	50 %	25 %	25 %	428314602
10	NC_019740	TTGC	2	8	4286	4293	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019740	AATT	2	8	5315	5322	50 %	50 %	0 %	0 %	428314603
12	NC_019740	TAAA	2	8	5870	5877	75 %	25 %	0 %	0 %	428314603
13	NC_019740	GAAC	2	8	5892	5899	50 %	0 %	25 %	25 %	428314603
14	NC_019740	AGCG	2	8	6541	6548	25 %	0 %	50 %	25 %	428314603
15	NC_019740	AAAT	2	8	6869	6876	75 %	25 %	0 %	0 %	428314603
16	NC_019740	TTTG	2	8	6994	7001	0 %	75 %	25 %	0 %	428314603
17	NC_019740	GTTG	2	8	7267	7274	0 %	50 %	50 %	0 %	428314603
18	NC_019740	ACTG	2	8	7643	7650	25 %	25 %	25 %	25 %	428314603
19	NC_019740	ATTG	2	8	7979	7986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019740	CTGA	2	8	8187	8194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019740	AATG	2	8	8459	8466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019740	AAAT	2	8	8487	8494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019740	TCAC	2	8	9091	9098	25 %	25 %	0 %	50 %	428314604
24	NC_019740	GTGG	2	8	9232	9239	0 %	25 %	75 %	0 %	428314604
25	NC_019740	TGCC	2	8	9483	9490	0 %	25 %	25 %	50 %	428314604
26	NC_019740	TTCC	2	8	9798	9805	0 %	50 %	0 %	50 %	428314604
27	NC_019740	TCAA	2	8	10303	10310	50 %	25 %	0 %	25 %	428314604
28	NC_019740	CTTT	2	8	11509	11516	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019740	CAAT	2	8	12085	12092	50 %	25 %	0 %	25 %	428314605
30	NC_019740	ACCA	2	8	12526	12533	50 %	0 %	0 %	50 %	428314605
31	NC_019740	TTGC	3	12	12934	12945	0 %	50 %	25 %	25 %	428314605
32	NC_019740	TCAA	2	8	13192	13199	50 %	25 %	0 %	25 %	428314606
33	NC_019740	TAAC	2	8	13434	13441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019740	CTTT	2	8	13783	13790	0 %	75 %	0 %	25 %	428314607
35	NC_019740	ACTG	2	8	13843	13850	25 %	25 %	25 %	25 %	428314607
36	NC_019740	TTGG	2	8	13920	13927	0 %	50 %	50 %	0 %	428314607
37	NC_019740	GTGA	2	8	14833	14840	25 %	25 %	50 %	0 %	428314609
38	NC_019740	TATT	2	8	15395	15402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019740	ACTA	2	8	15905	15912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019740	GTTG	2	8	16332	16339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019740	CAAC	2	8	16657	16664	50 %	0 %	0 %	50 %	428314610
42	NC_019740	CCAC	2	8	17771	17778	25 %	0 %	0 %	75 %	428314611
43	NC_019740	CCAA	2	8	18041	18048	50 %	0 %	0 %	50 %	428314611
44	NC_019740	AGAA	2	8	18111	18118	75 %	0 %	25 %	0 %	428314611
45	NC_019740	GGAG	2	8	18200	18207	25 %	0 %	75 %	0 %	428314611
46	NC_019740	ATTT	2	8	18446	18453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019740	TTCA	2	8	19107	19114	25 %	50 %	0 %	25 %	428314612
48	NC_019740	CTTT	2	8	19689	19696	0 %	75 %	0 %	25 %	428314613
49	NC_019740	TTAA	2	8	20008	20015	50 %	50 %	0 %	0 %	428314613
50	NC_019740	TGGG	2	8	20176	20183	0 %	25 %	75 %	0 %	428314613
51	NC_019740	AACT	2	8	20190	20197	50 %	25 %	0 %	25 %	428314613
52	NC_019740	GAAG	2	8	21355	21362	50 %	0 %	50 %	0 %	428314615
53	NC_019740	AAAT	2	8	21539	21546	75 %	25 %	0 %	0 %	428314615
54	NC_019740	ATGA	2	8	22911	22918	50 %	25 %	25 %	0 %	428314617
55	NC_019740	GAAA	2	8	24231	24238	75 %	0 %	25 %	0 %	428314619
56	NC_019740	ATCC	2	8	24766	24773	25 %	25 %	0 %	50 %	428314619
57	NC_019740	GAAT	2	8	24834	24841	50 %	25 %	25 %	0 %	428314619
58	NC_019740	TTAG	2	8	24951	24958	25 %	50 %	25 %	0 %	428314619
59	NC_019740	AATA	2	8	25634	25641	75 %	25 %	0 %	0 %	428314621
60	NC_019740	CAAC	2	8	26883	26890	50 %	0 %	0 %	50 %	428314622
61	NC_019740	ATCA	2	8	27459	27466	50 %	25 %	0 %	25 %	428314622
62	NC_019740	GTTT	2	8	28693	28700	0 %	75 %	25 %	0 %	428314623
63	NC_019740	TTTG	2	8	28758	28765	0 %	75 %	25 %	0 %	428314623
64	NC_019740	TAAG	2	8	28951	28958	50 %	25 %	25 %	0 %	428314623
65	NC_019740	TTGA	2	8	29029	29036	25 %	50 %	25 %	0 %	428314623
66	NC_019740	CTAC	2	8	29911	29918	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019740	TAAG	2	8	30054	30061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019740	GTAT	2	8	30226	30233	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019740	CTGG	2	8	30269	30276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019740	GTTG	2	8	30365	30372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019740	GGCA	2	8	30933	30940	25 %	0 %	50 %	25 %	428314624
72	NC_019740	GGCA	2	8	31011	31018	25 %	0 %	50 %	25 %	428314624
73	NC_019740	GAAA	2	8	31230	31237	75 %	0 %	25 %	0 %	428314624
74	NC_019740	CCTA	2	8	31919	31926	25 %	25 %	0 %	50 %	428314624
75	NC_019740	GTTG	2	8	31979	31986	0 %	50 %	50 %	0 %	428314624
76	NC_019740	TTTG	2	8	33329	33336	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019740	TGCC	2	8	33920	33927	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019740	AGCA	2	8	35078	35085	50 %	0 %	25 %	25 %	428314625
79	NC_019740	CGAG	2	8	36085	36092	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019740	GGGA	2	8	36759	36766	25 %	0 %	75 %	0 %	428314627
81	NC_019740	CAAC	2	8	37110	37117	50 %	0 %	0 %	50 %	428314627
82	NC_019740	TGGG	2	8	37276	37283	0 %	25 %	75 %	0 %	428314627
83	NC_019740	CGGG	2	8	37467	37474	0 %	0 %	75 %	25 %	428314627
84	NC_019740	GATA	2	8	38041	38048	50 %	25 %	25 %	0 %	428314629
85	NC_019740	GGAA	2	8	38425	38432	50 %	0 %	50 %	0 %	428314629
86	NC_019740	TTCT	2	8	38510	38517	0 %	75 %	0 %	25 %	428314629
87	NC_019740	CAGT	2	8	38532	38539	25 %	25 %	25 %	25 %	428314629
88	NC_019740	AGGG	2	8	38992	38999	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019740	AGTT	2	8	39000	39007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019740	AGGA	2	8	39905	39912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019740	GAAA	2	8	39997	40004	75 %	0 %	25 %	0 %	428314631
92	NC_019740	AAAT	2	8	40232	40239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019740	AACA	2	8	40501	40508	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019740	GAGC	2	8	42514	42521	25 %	0 %	50 %	25 %	428314632
95	NC_019740	CGAC	2	8	42539	42546	25 %	0 %	25 %	50 %	428314632
96	NC_019740	TGAG	2	8	42612	42619	25 %	25 %	50 %	0 %	428314632
97	NC_019740	TGAG	2	8	42813	42820	25 %	25 %	50 %	0 %	428314632
98	NC_019740	AAAT	2	8	43102	43109	75 %	25 %	0 %	0 %	428314632
99	NC_019740	GTTC	2	8	43386	43393	0 %	50 %	25 %	25 %	428314632
100	NC_019740	TCAC	2	8	43978	43985	25 %	25 %	0 %	50 %	428314633
101	NC_019740	TACT	2	8	44068	44075	25 %	50 %	0 %	25 %	428314633
102	NC_019740	TGAA	2	8	44153	44160	50 %	25 %	25 %	0 %	428314633
103	NC_019740	ACAT	2	8	44365	44372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019740	GCAG	2	8	44561	44568	25 %	0 %	50 %	25 %	428314634
105	NC_019740	TTGA	2	8	44764	44771	25 %	50 %	25 %	0 %	428314634
106	NC_019740	GTCG	2	8	45652	45659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019740	TGGT	2	8	45876	45883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019740	CAAT	2	8	45942	45949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019740	TCAA	2	8	46157	46164	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019740	GAAA	2	8	46239	46246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019740	CGGG	2	8	46384	46391	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019740	TATG	2	8	46577	46584	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019740	ATTG	2	8	47166	47173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019740	TGGA	2	8	47820	47827	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019740	TTTC	2	8	48312	48319	0 %	75 %	0 %	25 %	428314635
116	NC_019740	CCTT	2	8	48684	48691	0 %	50 %	0 %	50 %	428314635
117	NC_019740	TTCT	2	8	48735	48742	0 %	75 %	0 %	25 %	428314635
118	NC_019740	ATTA	2	8	48921	48928	50 %	50 %	0 %	0 %	428314635
119	NC_019740	CATC	2	8	49608	49615	25 %	25 %	0 %	50 %	428314636
120	NC_019740	ACCG	2	8	49730	49737	25 %	0 %	25 %	50 %	428314636
121	NC_019740	CTCC	2	8	49745	49752	0 %	25 %	0 %	75 %	428314636
122	NC_019740	CTTA	2	8	49972	49979	25 %	50 %	0 %	25 %	428314636
123	NC_019740	TTTA	2	8	50106	50113	25 %	75 %	0 %	0 %	428314636
124	NC_019740	ATTT	2	8	50533	50540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019740	CCTT	2	8	50600	50607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019740	AACT	2	8	50709	50716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019740	AAGG	2	8	50979	50986	50 %	0 %	50 %	0 %	428314637
128	NC_019740	CAGG	2	8	51168	51175	25 %	0 %	50 %	25 %	428314637
129	NC_019740	ACCA	2	8	51200	51207	50 %	0 %	0 %	50 %	428314637
130	NC_019740	AATT	2	8	51259	51266	50 %	50 %	0 %	0 %	428314637
131	NC_019740	TTGA	2	8	51511	51518	25 %	50 %	25 %	0 %	428314637
132	NC_019740	AGTA	2	8	51756	51763	50 %	25 %	25 %	0 %	428314637
133	NC_019740	TGAA	2	8	51781	51788	50 %	25 %	25 %	0 %	428314637
134	NC_019740	TTAA	2	8	52022	52029	50 %	50 %	0 %	0 %	428314637
135	NC_019740	TGCC	2	8	53219	53226	0 %	25 %	25 %	50 %	428314639
136	NC_019740	TAAG	2	8	53302	53309	50 %	25 %	25 %	0 %	428314640
137	NC_019740	TCCG	2	8	53968	53975	0 %	25 %	25 %	50 %	428314640
138	NC_019740	CCAG	2	8	54023	54030	25 %	0 %	25 %	50 %	428314640
139	NC_019740	GGCA	2	8	55549	55556	25 %	0 %	50 %	25 %	428314641
140	NC_019740	GGCA	2	8	55627	55634	25 %	0 %	50 %	25 %	428314641
141	NC_019740	CCTA	2	8	56535	56542	25 %	25 %	0 %	50 %	428314641
142	NC_019740	GTTG	2	8	56595	56602	0 %	50 %	50 %	0 %	428314641
143	NC_019740	TTTG	2	8	57945	57952	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019740	TGCC	2	8	58536	58543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019740	AGCA	2	8	59694	59701	50 %	0 %	25 %	25 %	428314642
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.