MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.01

Total Repeats: 233

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019739	AG	3	6	34	39	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019739	GA	3	6	988	993	50 %	0 %	50 %	0 %	428314407
3	NC_019739	TC	3	6	998	1003	0 %	50 %	0 %	50 %	428314407
4	NC_019739	AT	3	6	1436	1441	50 %	50 %	0 %	0 %	428314407
5	NC_019739	GA	3	6	1748	1753	50 %	0 %	50 %	0 %	428314407
6	NC_019739	GA	3	6	2262	2267	50 %	0 %	50 %	0 %	428314407
7	NC_019739	TC	3	6	3083	3088	0 %	50 %	0 %	50 %	428314408
8	NC_019739	GA	3	6	4513	4518	50 %	0 %	50 %	0 %	428314409
9	NC_019739	AC	3	6	4841	4846	50 %	0 %	0 %	50 %	428314409
10	NC_019739	GA	3	6	5168	5173	50 %	0 %	50 %	0 %	428314409
11	NC_019739	GA	3	6	5984	5989	50 %	0 %	50 %	0 %	428314410
12	NC_019739	GA	3	6	8214	8219	50 %	0 %	50 %	0 %	428314412
13	NC_019739	GA	3	6	8427	8432	50 %	0 %	50 %	0 %	428314412
14	NC_019739	GA	3	6	8477	8482	50 %	0 %	50 %	0 %	428314412
15	NC_019739	AG	3	6	8985	8990	50 %	0 %	50 %	0 %	428314412
16	NC_019739	AT	3	6	9321	9326	50 %	50 %	0 %	0 %	428314412
17	NC_019739	CT	3	6	9422	9427	0 %	50 %	0 %	50 %	428314412
18	NC_019739	CT	3	6	9664	9669	0 %	50 %	0 %	50 %	428314412
19	NC_019739	TG	3	6	10249	10254	0 %	50 %	50 %	0 %	428314413
20	NC_019739	GT	3	6	11471	11476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019739	TC	3	6	11980	11985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019739	CA	4	8	13468	13475	50 %	0 %	0 %	50 %	428314416
23	NC_019739	TC	3	6	14237	14242	0 %	50 %	0 %	50 %	428314418
24	NC_019739	AT	3	6	15091	15096	50 %	50 %	0 %	0 %	428314419
25	NC_019739	AG	3	6	15671	15676	50 %	0 %	50 %	0 %	428314420
26	NC_019739	TC	3	6	16910	16915	0 %	50 %	0 %	50 %	428314421
27	NC_019739	AG	3	6	17148	17153	50 %	0 %	50 %	0 %	428314421
28	NC_019739	TC	3	6	18347	18352	0 %	50 %	0 %	50 %	428314423
29	NC_019739	AC	3	6	18417	18422	50 %	0 %	0 %	50 %	428314423
30	NC_019739	TC	3	6	18623	18628	0 %	50 %	0 %	50 %	428314424
31	NC_019739	GA	3	6	18697	18702	50 %	0 %	50 %	0 %	428314424
32	NC_019739	CG	3	6	19078	19083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019739	CG	3	6	20019	20024	0 %	0 %	50 %	50 %	428314427
34	NC_019739	GA	3	6	20766	20771	50 %	0 %	50 %	0 %	428314427
35	NC_019739	CT	3	6	22235	22240	0 %	50 %	0 %	50 %	428314428
36	NC_019739	AG	3	6	23012	23017	50 %	0 %	50 %	0 %	428314428
37	NC_019739	AG	3	6	23145	23150	50 %	0 %	50 %	0 %	428314428
38	NC_019739	TC	3	6	25215	25220	0 %	50 %	0 %	50 %	428314429
39	NC_019739	TC	3	6	25570	25575	0 %	50 %	0 %	50 %	428314429
40	NC_019739	AT	3	6	26001	26006	50 %	50 %	0 %	0 %	428314429
41	NC_019739	TC	4	8	26134	26141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019739	TA	3	6	26950	26955	50 %	50 %	0 %	0 %	428314430
43	NC_019739	CT	3	6	27152	27157	0 %	50 %	0 %	50 %	428314430
44	NC_019739	GT	3	6	29625	29630	0 %	50 %	50 %	0 %	428314430
45	NC_019739	GT	3	6	29660	29665	0 %	50 %	50 %	0 %	428314430
46	NC_019739	AG	3	6	29727	29732	50 %	0 %	50 %	0 %	428314430
47	NC_019739	TA	3	6	30358	30363	50 %	50 %	0 %	0 %	428314430
48	NC_019739	AG	3	6	31413	31418	50 %	0 %	50 %	0 %	428314430
49	NC_019739	GA	3	6	31443	31448	50 %	0 %	50 %	0 %	428314430
50	NC_019739	TA	3	6	31714	31719	50 %	50 %	0 %	0 %	428314430
51	NC_019739	CT	3	6	32021	32026	0 %	50 %	0 %	50 %	428314430
52	NC_019739	TC	3	6	32082	32087	0 %	50 %	0 %	50 %	428314430
53	NC_019739	GA	3	6	33052	33057	50 %	0 %	50 %	0 %	428314431
54	NC_019739	TC	3	6	34566	34571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019739	CT	3	6	35594	35599	0 %	50 %	0 %	50 %	428314434
56	NC_019739	GA	3	6	36310	36315	50 %	0 %	50 %	0 %	428314434
57	NC_019739	TC	4	8	36579	36586	0 %	50 %	0 %	50 %	428314434
58	NC_019739	TC	3	6	36771	36776	0 %	50 %	0 %	50 %	428314434
59	NC_019739	TC	3	6	38448	38453	0 %	50 %	0 %	50 %	428314435
60	NC_019739	GA	3	6	38782	38787	50 %	0 %	50 %	0 %	428314435
61	NC_019739	AT	3	6	39204	39209	50 %	50 %	0 %	0 %	428314435
62	NC_019739	AG	3	6	39255	39260	50 %	0 %	50 %	0 %	428314435
63	NC_019739	GA	3	6	39485	39490	50 %	0 %	50 %	0 %	428314435
64	NC_019739	AT	3	6	39960	39965	50 %	50 %	0 %	0 %	428314435
65	NC_019739	CT	3	6	41166	41171	0 %	50 %	0 %	50 %	428314435
66	NC_019739	CT	4	8	41263	41270	0 %	50 %	0 %	50 %	428314436
67	NC_019739	TC	4	8	41559	41566	0 %	50 %	0 %	50 %	428314436
68	NC_019739	GA	3	6	42627	42632	50 %	0 %	50 %	0 %	428314436
69	NC_019739	CT	3	6	42825	42830	0 %	50 %	0 %	50 %	428314436
70	NC_019739	AC	3	6	43842	43847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019739	CT	3	6	44732	44737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019739	AG	3	6	44841	44846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019739	AT	3	6	44874	44879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019739	CA	3	6	44894	44899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019739	TC	3	6	44945	44950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019739	CA	3	6	45220	45225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019739	CT	4	8	46138	46145	0 %	50 %	0 %	50 %	428314437
78	NC_019739	TA	3	6	47135	47140	50 %	50 %	0 %	0 %	428314438
79	NC_019739	CT	4	8	50709	50716	0 %	50 %	0 %	50 %	428314442
80	NC_019739	TC	3	6	51374	51379	0 %	50 %	0 %	50 %	428314443
81	NC_019739	GA	3	6	52612	52617	50 %	0 %	50 %	0 %	428314444
82	NC_019739	AC	3	6	52618	52623	50 %	0 %	0 %	50 %	428314444
83	NC_019739	GT	3	6	53298	53303	0 %	50 %	50 %	0 %	428314446
84	NC_019739	TG	3	6	53859	53864	0 %	50 %	50 %	0 %	428314446
85	NC_019739	TG	3	6	54007	54012	0 %	50 %	50 %	0 %	428314446
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88	NC_019739	CT	3	6	55670	55675	0 %	50 %	0 %	50 %	428314448
89	NC_019739	TC	3	6	56212	56217	0 %	50 %	0 %	50 %	428314448
90	NC_019739	GA	3	6	57350	57355	50 %	0 %	50 %	0 %	428314448
91	NC_019739	GA	3	6	57848	57853	50 %	0 %	50 %	0 %	428314449
92	NC_019739	AG	3	6	58690	58695	50 %	0 %	50 %	0 %	428314449
93	NC_019739	TC	3	6	59945	59950	0 %	50 %	0 %	50 %	428314450
94	NC_019739	CT	3	6	60446	60451	0 %	50 %	0 %	50 %	428314450
95	NC_019739	TC	3	6	61135	61140	0 %	50 %	0 %	50 %	428314450
96	NC_019739	CT	3	6	61265	61270	0 %	50 %	0 %	50 %	428314450
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99	NC_019739	CT	3	6	63879	63884	0 %	50 %	0 %	50 %	428314452
100	NC_019739	AG	3	6	63994	63999	50 %	0 %	50 %	0 %	428314452
101	NC_019739	GA	3	6	65274	65279	50 %	0 %	50 %	0 %	428314454
102	NC_019739	AG	3	6	65288	65293	50 %	0 %	50 %	0 %	428314454
103	NC_019739	AC	3	6	65584	65589	50 %	0 %	0 %	50 %	428314454
104	NC_019739	AG	3	6	65704	65709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019739	TC	3	6	65865	65870	0 %	50 %	0 %	50 %	428314455
106	NC_019739	TC	3	6	67168	67173	0 %	50 %	0 %	50 %	428314455
107	NC_019739	TC	3	6	67767	67772	0 %	50 %	0 %	50 %	428314456
108	NC_019739	TC	3	6	68163	68168	0 %	50 %	0 %	50 %	428314457
109	NC_019739	TC	3	6	68336	68341	0 %	50 %	0 %	50 %	428314457
110	NC_019739	TC	3	6	68506	68511	0 %	50 %	0 %	50 %	428314457
111	NC_019739	CT	5	10	68707	68716	0 %	50 %	0 %	50 %	428314457
112	NC_019739	AC	4	8	69019	69026	50 %	0 %	0 %	50 %	428314458
113	NC_019739	CT	3	6	69471	69476	0 %	50 %	0 %	50 %	428314459
114	NC_019739	TG	3	6	70895	70900	0 %	50 %	50 %	0 %	428314460
115	NC_019739	AG	3	6	71211	71216	50 %	0 %	50 %	0 %	428314461
116	NC_019739	GA	3	6	71875	71880	50 %	0 %	50 %	0 %	428314461
117	NC_019739	CT	3	6	72735	72740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019739	CA	3	6	73041	73046	50 %	0 %	0 %	50 %	428314463
119	NC_019739	GC	3	6	73144	73149	0 %	0 %	50 %	50 %	428314463
120	NC_019739	AG	3	6	73155	73160	50 %	0 %	50 %	0 %	428314463
121	NC_019739	CT	3	6	74015	74020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019739	GA	3	6	75134	75139	50 %	0 %	50 %	0 %	428314464
123	NC_019739	CT	3	6	75146	75151	0 %	50 %	0 %	50 %	428314464
124	NC_019739	CA	3	6	76557	76562	50 %	0 %	0 %	50 %	428314466
125	NC_019739	TA	3	6	77209	77214	50 %	50 %	0 %	0 %	428314466
126	NC_019739	AT	3	6	77558	77563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019739	GA	3	6	78348	78353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019739	CT	3	6	78588	78593	0 %	50 %	0 %	50 %	428314468
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130	NC_019739	CT	3	6	80020	80025	0 %	50 %	0 %	50 %	428314470
131	NC_019739	CT	4	8	80567	80574	0 %	50 %	0 %	50 %	428314471
132	NC_019739	AC	3	6	81426	81431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019739	GA	3	6	81685	81690	50 %	0 %	50 %	0 %	428314473
134	NC_019739	AG	3	6	82405	82410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_019739	GA	3	6	87925	87930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019739	TA	3	6	88219	88224	50 %	50 %	0 %	0 %	428314477
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.