MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.01

Total Repeats: 2709

< Previous123456Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019739	ACCC	2	8	133886	133893	25 %	0 %	0 %	75 %	428314502
2502	NC_019739	CGC	2	6	133898	133903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314502
2503	NC_019739	CAG	2	6	133918	133923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314502
2504	NC_019739	AGCAAC	3	18	134011	134028	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428314502
2505	NC_019739	CAG	2	6	134037	134042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314502
2506	NC_019739	TAG	2	6	134061	134066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314502
2507	NC_019739	AT	4	8	134126	134133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_019739	GAA	3	9	134230	134238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_019739	TTTTAT	2	12	134245	134256	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_019739	CAT	2	6	134293	134298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_019739	TGT	2	6	134335	134340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_019739	CAAA	2	8	134364	134371	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2513	NC_019739	TAA	2	6	134372	134377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_019739	A	6	6	134392	134397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_019739	CAAC	2	8	134466	134473	50 %	0 %	0 %	50 %	428314503
2516	NC_019739	CTT	2	6	134505	134510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314503
2517	NC_019739	A	6	6	134521	134526	100 %	0 %	0 %	0 %	428314503
2518	NC_019739	TGA	2	6	134605	134610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314503
2519	NC_019739	AG	3	6	134647	134652	50 %	0 %	50 %	0 %	428314503
2520	NC_019739	CA	3	6	134674	134679	50 %	0 %	0 %	50 %	428314503
2521	NC_019739	ACA	2	6	134837	134842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314503
2522	NC_019739	CAA	2	6	134866	134871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314503
2523	NC_019739	AAG	2	6	134875	134880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314503
2524	NC_019739	ACT	2	6	134942	134947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314503
2525	NC_019739	AG	3	6	134971	134976	50 %	0 %	50 %	0 %	428314503
2526	NC_019739	TCTGG	2	10	134997	135006	0 %	40 %	40 %	20 %	428314503
2527	NC_019739	TGC	2	6	135073	135078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314503
2528	NC_019739	AAACA	2	10	135237	135246	80 %	0 %	0 %	20 %	428314503
2529	NC_019739	TC	3	6	135327	135332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2530	NC_019739	AGT	2	6	135355	135360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_019739	CTC	2	6	135381	135386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2532	NC_019739	GAGAG	2	10	135424	135433	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_019739	AGC	2	6	135491	135496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_019739	AAC	2	6	135634	135639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_019739	CGC	2	6	135646	135651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2536	NC_019739	TGG	2	6	135700	135705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_019739	GGATA	2	10	135730	135739	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_019739	ATG	2	6	135746	135751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_019739	TCA	2	6	135805	135810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_019739	T	6	6	135933	135938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_019739	AGCA	2	8	135959	135966	50 %	0 %	25 %	25 %	428314504
2542	NC_019739	AGC	2	6	135979	135984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314504
2543	NC_019739	TCA	2	6	136191	136196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314504
2544	NC_019739	TTA	2	6	136230	136235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314504
2545	NC_019739	AGC	2	6	136267	136272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314504
2546	NC_019739	CTT	2	6	136284	136289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314504
2547	NC_019739	AGT	2	6	136313	136318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314504
2548	NC_019739	AGA	2	6	136399	136404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314504
2549	NC_019739	CTT	2	6	136425	136430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314504
2550	NC_019739	AGC	2	6	136615	136620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314504
2551	NC_019739	GCT	2	6	136745	136750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314504
2552	NC_019739	TGA	2	6	136761	136766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314504
2553	NC_019739	CTC	2	6	136798	136803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314504
2554	NC_019739	AGC	2	6	136804	136809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314504
2555	NC_019739	A	6	6	136892	136897	100 %	0 %	0 %	0 %	428314504
2556	NC_019739	AGCG	2	8	136977	136984	25 %	0 %	50 %	25 %	428314504
2557	NC_019739	AG	3	6	137078	137083	50 %	0 %	50 %	0 %	428314504
2558	NC_019739	T	7	7	137092	137098	0 %	100 %	0 %	0 %	428314504
2559	NC_019739	AG	3	6	137173	137178	50 %	0 %	50 %	0 %	428314504
2560	NC_019739	CTG	2	6	137235	137240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314504
2561	NC_019739	GGC	2	6	137318	137323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314504
2562	NC_019739	TGG	2	6	137377	137382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314504
2563	NC_019739	TAG	2	6	137424	137429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314504
2564	NC_019739	TGC	2	6	137461	137466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314504
2565	NC_019739	AT	3	6	137586	137591	50 %	50 %	0 %	0 %	428314504
2566	NC_019739	A	8	8	137620	137627	100 %	0 %	0 %	0 %	428314504
2567	NC_019739	GA	3	6	137657	137662	50 %	0 %	50 %	0 %	428314504
2568	NC_019739	AAC	2	6	137671	137676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314504
2569	NC_019739	CAA	2	6	137757	137762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314504
2570	NC_019739	TCG	2	6	137979	137984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314505
2571	NC_019739	ATT	2	6	138064	138069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314505
2572	NC_019739	TTG	2	6	138102	138107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314505
2573	NC_019739	TTA	2	6	138113	138118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314505
2574	NC_019739	T	6	6	138143	138148	0 %	100 %	0 %	0 %	428314505
2575	NC_019739	AGC	2	6	138241	138246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314505
2576	NC_019739	T	6	6	138269	138274	0 %	100 %	0 %	0 %	428314505
2577	NC_019739	GCTGTA	3	18	138365	138382	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428314505
2578	NC_019739	GA	3	6	138383	138388	50 %	0 %	50 %	0 %	428314505
2579	NC_019739	GTGCT	2	10	138441	138450	0 %	40 %	40 %	20 %	428314505
2580	NC_019739	TGTT	2	8	138501	138508	0 %	75 %	25 %	0 %	428314505
2581	NC_019739	TTG	2	6	138528	138533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314505
2582	NC_019739	TGGC	2	8	138565	138572	0 %	25 %	50 %	25 %	428314505
2583	NC_019739	TTG	2	6	138627	138632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314505
2584	NC_019739	AGG	2	6	138637	138642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314505
2585	NC_019739	TTG	2	6	138736	138741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314505
2586	NC_019739	AGA	2	6	138790	138795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314505
2587	NC_019739	TCA	2	6	138906	138911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314505
2588	NC_019739	GCTT	2	8	139004	139011	0 %	50 %	25 %	25 %	428314505
2589	NC_019739	AGA	2	6	139102	139107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314505
2590	NC_019739	CGAAA	2	10	139139	139148	60 %	0 %	20 %	20 %	428314505
2591	NC_019739	AAG	2	6	139155	139160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314505
2592	NC_019739	TTA	2	6	139176	139181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314505
2593	NC_019739	ATT	2	6	139187	139192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314505
2594	NC_019739	ATG	2	6	139275	139280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314505
2595	NC_019739	GCT	2	6	139295	139300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314505
2596	NC_019739	AAAAGA	2	12	139510	139521	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428314505
2597	NC_019739	ATT	2	6	139546	139551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314505
2598	NC_019739	CAG	2	6	139565	139570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314505
2599	NC_019739	ACATCA	2	12	139635	139646	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428314505
2600	NC_019739	GTG	2	6	139668	139673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314505
2601	NC_019739	GCC	2	6	139676	139681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314505
2602	NC_019739	TGA	2	6	139846	139851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314505
2603	NC_019739	A	6	6	139936	139941	100 %	0 %	0 %	0 %	428314505
2604	NC_019739	TCA	2	6	140025	140030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314505
2605	NC_019739	TTCC	2	8	140074	140081	0 %	50 %	0 %	50 %	428314506
2606	NC_019739	TAA	2	6	140128	140133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314506
2607	NC_019739	GCTT	2	8	140165	140172	0 %	50 %	25 %	25 %	428314506
2608	NC_019739	AG	3	6	140296	140301	50 %	0 %	50 %	0 %	428314506
2609	NC_019739	AGG	2	6	140321	140326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314506
2610	NC_019739	TTC	2	6	140394	140399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314506
2611	NC_019739	GGGT	2	8	140420	140427	0 %	25 %	75 %	0 %	428314506
2612	NC_019739	AGG	2	6	140453	140458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314506
2613	NC_019739	TGT	2	6	140490	140495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314506
2614	NC_019739	ACA	2	6	140604	140609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314506
2615	NC_019739	CCCAA	2	10	140638	140647	40 %	0 %	0 %	60 %	428314506
2616	NC_019739	GATT	2	8	140686	140693	25 %	50 %	25 %	0 %	428314507
2617	NC_019739	GTG	2	6	140735	140740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314507
2618	NC_019739	GCT	2	6	140760	140765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314507
2619	NC_019739	TCGG	2	8	140811	140818	0 %	25 %	50 %	25 %	428314507
2620	NC_019739	TCC	2	6	140854	140859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314507
2621	NC_019739	AAC	2	6	140860	140865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314507
2622	NC_019739	AAG	2	6	140877	140882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314507
2623	NC_019739	TGC	2	6	140913	140918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314507
2624	NC_019739	TTG	2	6	140988	140993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314507
2625	NC_019739	CCATCC	2	12	141004	141015	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428314507
2626	NC_019739	TCA	2	6	141025	141030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314507
2627	NC_019739	GAA	2	6	141050	141055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314507
2628	NC_019739	TTGC	2	8	141057	141064	0 %	50 %	25 %	25 %	428314507
2629	NC_019739	A	6	6	141092	141097	100 %	0 %	0 %	0 %	428314507
2630	NC_019739	AGTT	2	8	141120	141127	25 %	50 %	25 %	0 %	428314507
2631	NC_019739	GGAG	2	8	141130	141137	25 %	0 %	75 %	0 %	428314507
2632	NC_019739	AAC	2	6	141262	141267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314507
2633	NC_019739	CTG	2	6	141293	141298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314507
2634	NC_019739	GCA	2	6	141340	141345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314507
2635	NC_019739	CTA	3	9	141349	141357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314507
2636	NC_019739	CGC	2	6	141414	141419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314507
2637	NC_019739	GGT	2	6	141439	141444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314507
2638	NC_019739	CT	3	6	141483	141488	0 %	50 %	0 %	50 %	428314507
2639	NC_019739	AAT	2	6	141500	141505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314507
2640	NC_019739	GCT	2	6	141526	141531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314507
2641	NC_019739	TCC	2	6	141546	141551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314507
2642	NC_019739	TAA	2	6	141621	141626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314507
2643	NC_019739	AAGG	2	8	141778	141785	50 %	0 %	50 %	0 %	428314507
2644	NC_019739	GAAG	2	8	141823	141830	50 %	0 %	50 %	0 %	428314507
2645	NC_019739	CAGC	2	8	141857	141864	25 %	0 %	25 %	50 %	428314507
2646	NC_019739	TCA	2	6	141934	141939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314507
2647	NC_019739	TG	3	6	141967	141972	0 %	50 %	50 %	0 %	428314507
2648	NC_019739	TAC	2	6	142010	142015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314507
2649	NC_019739	GAATT	2	10	142126	142135	40 %	40 %	20 %	0 %	428314507
2650	NC_019739	TTG	2	6	142158	142163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314507
2651	NC_019739	CTTG	2	8	142166	142173	0 %	50 %	25 %	25 %	428314507
2652	NC_019739	GCA	2	6	142222	142227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314507
2653	NC_019739	TGGA	2	8	142279	142286	25 %	25 %	50 %	0 %	428314507
2654	NC_019739	CAAG	2	8	142366	142373	50 %	0 %	25 %	25 %	428314508
2655	NC_019739	ACC	2	6	142562	142567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314508
2656	NC_019739	AG	3	6	142572	142577	50 %	0 %	50 %	0 %	428314508
2657	NC_019739	TCCA	2	8	142581	142588	25 %	25 %	0 %	50 %	428314508
2658	NC_019739	CAC	2	6	142694	142699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314508
2659	NC_019739	C	6	6	142905	142910	0 %	0 %	0 %	100 %	428314508
2660	NC_019739	AGC	3	9	142950	142958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314508
2661	NC_019739	CCA	2	6	143022	143027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314508
2662	NC_019739	TGGG	2	8	143035	143042	0 %	25 %	75 %	0 %	428314508
2663	NC_019739	TGT	2	6	143092	143097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314508
2664	NC_019739	GCT	2	6	143120	143125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314508
2665	NC_019739	TGT	3	9	143131	143139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314508
2666	NC_019739	ATTCA	2	10	143166	143175	40 %	40 %	0 %	20 %	428314508
2667	NC_019739	GA	3	6	143193	143198	50 %	0 %	50 %	0 %	428314508
2668	NC_019739	CCTC	2	8	143242	143249	0 %	25 %	0 %	75 %	428314508
2669	NC_019739	AGG	2	6	143321	143326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314508
2670	NC_019739	CTC	2	6	143397	143402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314508
2671	NC_019739	TCA	2	6	143521	143526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314508
2672	NC_019739	TTC	2	6	143610	143615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314508
2673	NC_019739	CT	3	6	143681	143686	0 %	50 %	0 %	50 %	428314508
2674	NC_019739	GCA	2	6	143803	143808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314508
2675	NC_019739	TGACA	2	10	143832	143841	40 %	20 %	20 %	20 %	428314508
2676	NC_019739	TCAAAC	2	12	143890	143901	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428314509
2677	NC_019739	TCA	2	6	143916	143921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314509
2678	NC_019739	ACA	2	6	143929	143934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314509
2679	NC_019739	GCT	2	6	143977	143982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314509
2680	NC_019739	AAT	2	6	144070	144075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314509
2681	NC_019739	TTC	2	6	144200	144205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314510
2682	NC_019739	AAC	2	6	144243	144248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314510
2683	NC_019739	CTT	2	6	144350	144355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314510
2684	NC_019739	TCATC	2	10	144367	144376	20 %	40 %	0 %	40 %	428314510
2685	NC_019739	TCT	2	6	144381	144386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314510
2686	NC_019739	ACTT	2	8	144535	144542	25 %	50 %	0 %	25 %	428314510
2687	NC_019739	ATTGAA	2	12	144574	144585	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428314510
2688	NC_019739	AAT	2	6	144601	144606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314510
2689	NC_019739	AAC	2	6	144612	144617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314510
2690	NC_019739	CTTG	2	8	144653	144660	0 %	50 %	25 %	25 %	428314510
2691	NC_019739	TCT	2	6	144753	144758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314510
2692	NC_019739	TGC	2	6	144887	144892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314510
2693	NC_019739	GAT	2	6	144938	144943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314510
2694	NC_019739	TCTT	2	8	145005	145012	0 %	75 %	0 %	25 %	428314510
2695	NC_019739	CAA	2	6	145045	145050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314510
2696	NC_019739	CAT	2	6	145187	145192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314510
2697	NC_019739	TCAA	2	8	145257	145264	50 %	25 %	0 %	25 %	428314510
2698	NC_019739	CTT	2	6	145276	145281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314510
2699	NC_019739	GTT	2	6	145301	145306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314510
2700	NC_019739	GCC	3	9	145307	145315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314510
2701	NC_019739	TGA	2	6	145333	145338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314510
2702	NC_019739	AC	3	6	145400	145405	50 %	0 %	0 %	50 %	428314510
2703	NC_019739	CTA	2	6	145641	145646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314510
2704	NC_019739	GGGTGG	2	12	145676	145687	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	428314510
2705	NC_019739	T	6	6	145796	145801	0 %	100 %	0 %	0 %	428314510
2706	NC_019739	TAG	2	6	145849	145854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314510
2707	NC_019739	AG	3	6	145916	145921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2708	NC_019739	A	6	6	146020	146025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2709	NC_019739	TGACA	2	10	146030	146039	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

< Previous123456Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.