MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 134128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019738	GTC	2	6	198400	198405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308541
3502	NC_019738	TCCC	2	8	198415	198422	0 %	25 %	0 %	75 %	428308541
3503	NC_019738	GTG	3	9	198496	198504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308541
3504	NC_019738	AC	3	6	198531	198536	50 %	0 %	0 %	50 %	428308541
3505	NC_019738	CTT	2	6	198764	198769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_019738	CCA	2	6	198795	198800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_019738	AGT	2	6	198833	198838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_019738	TATG	2	8	198863	198870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_019738	TC	3	6	198924	198929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_019738	GTAG	2	8	198953	198960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_019738	C	7	7	199008	199014	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3512	NC_019738	CTG	2	6	199386	199391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308542
3513	NC_019738	TGG	2	6	199511	199516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308542
3514	NC_019738	ACC	2	6	199531	199536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308542
3515	NC_019738	GAG	2	6	199563	199568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308542
3516	NC_019738	GTA	2	6	199674	199679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308542
3517	NC_019738	CAT	2	6	199739	199744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308542
3518	NC_019738	TGT	2	6	199759	199764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308542
3519	NC_019738	TGC	2	6	199776	199781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308542
3520	NC_019738	TCAA	2	8	199834	199841	50 %	25 %	0 %	25 %	428308542
3521	NC_019738	GTC	2	6	199882	199887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308542
3522	NC_019738	ACG	2	6	200020	200025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308542
3523	NC_019738	A	6	6	200039	200044	100 %	0 %	0 %	0 %	428308542
3524	NC_019738	ATT	2	6	200059	200064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308542
3525	NC_019738	TTC	2	6	200123	200128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308543
3526	NC_019738	TCG	2	6	200139	200144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308543
3527	NC_019738	TTG	2	6	200183	200188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308543
3528	NC_019738	AATA	2	8	200220	200227	75 %	25 %	0 %	0 %	428308543
3529	NC_019738	CAGC	2	8	200234	200241	25 %	0 %	25 %	50 %	428308543
3530	NC_019738	CCAGC	2	10	200296	200305	20 %	0 %	20 %	60 %	428308543
3531	NC_019738	GAT	2	6	200324	200329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308543
3532	NC_019738	TCG	2	6	200375	200380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308543
3533	NC_019738	AAT	2	6	200389	200394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_019738	CAG	2	6	200396	200401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_019738	CGC	2	6	200425	200430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308544
3536	NC_019738	CAA	2	6	200463	200468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308544
3537	NC_019738	GAAA	2	8	200474	200481	75 %	0 %	25 %	0 %	428308544
3538	NC_019738	ACC	2	6	200531	200536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308544
3539	NC_019738	TAGA	2	8	200544	200551	50 %	25 %	25 %	0 %	428308544
3540	NC_019738	CAG	2	6	200604	200609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308544
3541	NC_019738	CAA	2	6	200612	200617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308544
3542	NC_019738	GAG	2	6	200688	200693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_019738	GTG	2	6	200797	200802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_019738	TAT	2	6	200830	200835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_019738	TGT	2	6	200963	200968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_019738	AAC	2	6	201052	201057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308545
3547	NC_019738	TCGCC	2	10	201069	201078	0 %	20 %	20 %	60 %	428308545
3548	NC_019738	C	7	7	201219	201225	0 %	0 %	0 %	100 %	428308545
3549	NC_019738	TCA	2	6	201251	201256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308545
3550	NC_019738	AAT	2	6	201266	201271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308545
3551	NC_019738	TGT	2	6	201340	201345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308545
3552	NC_019738	AAC	2	6	201506	201511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308545
3553	NC_019738	C	6	6	201574	201579	0 %	0 %	0 %	100 %	428308545
3554	NC_019738	TCC	2	6	201613	201618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308545
3555	NC_019738	GGGCT	2	10	201719	201728	0 %	20 %	60 %	20 %	428308545
3556	NC_019738	G	6	6	201994	201999	0 %	0 %	100 %	0 %	428308546
3557	NC_019738	TG	3	6	202050	202055	0 %	50 %	50 %	0 %	428308546
3558	NC_019738	TTTA	2	8	202206	202213	25 %	75 %	0 %	0 %	428308546
3559	NC_019738	TA	3	6	202223	202228	50 %	50 %	0 %	0 %	428308546
3560	NC_019738	CAA	2	6	202334	202339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308546
3561	NC_019738	TCAT	2	8	202344	202351	25 %	50 %	0 %	25 %	428308546
3562	NC_019738	TAATT	2	10	202369	202378	40 %	60 %	0 %	0 %	428308546
3563	NC_019738	TGAT	2	8	202407	202414	25 %	50 %	25 %	0 %	428308546
3564	NC_019738	CAA	2	6	202460	202465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308546
3565	NC_019738	AAC	2	6	202512	202517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308546
3566	NC_019738	TAG	2	6	202537	202542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308546
3567	NC_019738	CGATT	2	10	202783	202792	20 %	40 %	20 %	20 %	428308546
3568	NC_019738	GCG	2	6	202839	202844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308546
3569	NC_019738	TC	3	6	202883	202888	0 %	50 %	0 %	50 %	428308546
3570	NC_019738	GCA	2	6	202954	202959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308546
3571	NC_019738	TAT	2	6	202978	202983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308546
3572	NC_019738	TG	3	6	203045	203050	0 %	50 %	50 %	0 %	428308546
3573	NC_019738	GAA	2	6	203090	203095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308546
3574	NC_019738	CTT	2	6	203185	203190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308546
3575	NC_019738	TGAA	2	8	203202	203209	50 %	25 %	25 %	0 %	428308546
3576	NC_019738	TGG	2	6	203424	203429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308546
3577	NC_019738	ACC	2	6	203433	203438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308546
3578	NC_019738	GT	3	6	203442	203447	0 %	50 %	50 %	0 %	428308546
3579	NC_019738	AG	3	6	203470	203475	50 %	0 %	50 %	0 %	428308546
3580	NC_019738	CAA	2	6	203513	203518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308546
3581	NC_019738	GCCA	2	8	203629	203636	25 %	0 %	25 %	50 %	428308546
3582	NC_019738	TAC	2	6	203699	203704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308546
3583	NC_019738	AAGATT	2	12	203753	203764	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428308546
3584	NC_019738	GGA	2	6	203827	203832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308546
3585	NC_019738	AAG	2	6	203847	203852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308546
3586	NC_019738	GCA	2	6	203866	203871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308546
3587	NC_019738	AAC	2	6	203883	203888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308546
3588	NC_019738	GA	3	6	203898	203903	50 %	0 %	50 %	0 %	428308546
3589	NC_019738	GGC	2	6	203965	203970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308546
3590	NC_019738	GAT	2	6	203998	204003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308546
3591	NC_019738	AAGCT	2	10	204191	204200	40 %	20 %	20 %	20 %	428308547
3592	NC_019738	GAC	2	6	204274	204279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308547
3593	NC_019738	ATC	2	6	204299	204304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308547
3594	NC_019738	CAT	2	6	204337	204342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308547
3595	NC_019738	CCT	2	6	204343	204348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308547
3596	NC_019738	GCGGAT	2	12	204403	204414	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428308547
3597	NC_019738	CAG	2	6	204583	204588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308547
3598	NC_019738	CAA	2	6	204598	204603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308547
3599	NC_019738	GCG	2	6	204647	204652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308547
3600	NC_019738	GGTG	2	8	204719	204726	0 %	25 %	75 %	0 %	428308547
3601	NC_019738	ACA	2	6	204895	204900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308547
3602	NC_019738	GAA	2	6	204904	204909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308547
3603	NC_019738	GCT	2	6	204985	204990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308547
3604	NC_019738	GGA	2	6	205029	205034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308547
3605	NC_019738	TGA	2	6	205116	205121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308547
3606	NC_019738	CAC	2	6	205122	205127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308547
3607	NC_019738	A	8	8	205153	205160	100 %	0 %	0 %	0 %	428308547
3608	NC_019738	ACAA	2	8	205197	205204	75 %	0 %	0 %	25 %	428308547
3609	NC_019738	GAT	2	6	205230	205235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308547
3610	NC_019738	TGA	2	6	205245	205250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308547
3611	NC_019738	CAC	2	6	205251	205256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308547
3612	NC_019738	GA	3	6	205284	205289	50 %	0 %	50 %	0 %	428308547
3613	NC_019738	GGC	2	6	205458	205463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308547
3614	NC_019738	AGAA	2	8	205538	205545	75 %	0 %	25 %	0 %	428308547
3615	NC_019738	CACAA	2	10	205590	205599	60 %	0 %	0 %	40 %	428308547
3616	NC_019738	ACG	2	6	205627	205632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308547
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3618	NC_019738	AGA	2	6	205740	205745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308547
3619	NC_019738	GA	4	8	205776	205783	50 %	0 %	50 %	0 %	428308547
3620	NC_019738	T	6	6	205786	205791	0 %	100 %	0 %	0 %	428308547
3621	NC_019738	AG	3	6	205934	205939	50 %	0 %	50 %	0 %	428308547
3622	NC_019738	GGAGT	2	10	206060	206069	20 %	20 %	60 %	0 %	428308547
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