MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 134128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019738	CGC	2	6	170982	170987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308514
3002	NC_019738	GTC	2	6	170998	171003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308514
3003	NC_019738	TTC	2	6	171004	171009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308514
3004	NC_019738	GTT	2	6	171039	171044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308514
3005	NC_019738	TGC	2	6	171090	171095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308514
3006	NC_019738	TCC	2	6	171138	171143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308514
3007	NC_019738	GCC	2	6	171196	171201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308514
3008	NC_019738	TTA	2	6	171227	171232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308514
3009	NC_019738	AGA	2	6	171255	171260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308514
3010	NC_019738	ATG	2	6	171269	171274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_019738	TAA	2	6	171291	171296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_019738	GAT	2	6	171348	171353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_019738	AGT	2	6	171385	171390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308515
3014	NC_019738	AGA	2	6	171392	171397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308515
3015	NC_019738	AGAT	2	8	171461	171468	50 %	25 %	25 %	0 %	428308515
3016	NC_019738	GAA	2	6	171529	171534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308515
3017	NC_019738	TGAT	2	8	171608	171615	25 %	50 %	25 %	0 %	428308515
3018	NC_019738	TGT	2	6	171633	171638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308515
3019	NC_019738	GTG	2	6	171649	171654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308515
3020	NC_019738	GGCA	2	8	171674	171681	25 %	0 %	50 %	25 %	428308515
3021	NC_019738	TGG	2	6	171848	171853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308515
3022	NC_019738	CCT	2	6	171974	171979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308515
3023	NC_019738	TGC	2	6	172020	172025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308515
3024	NC_019738	TGA	2	6	172082	172087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308515
3025	NC_019738	GGA	2	6	172336	172341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308515
3026	NC_019738	GCC	2	6	172384	172389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308515
3027	NC_019738	GCT	2	6	172399	172404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308515
3028	NC_019738	ATG	2	6	172451	172456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308515
3029	NC_019738	GCC	2	6	172480	172485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308515
3030	NC_019738	GT	3	6	172502	172507	0 %	50 %	50 %	0 %	428308515
3031	NC_019738	TTG	2	6	172508	172513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308515
3032	NC_019738	GAA	2	6	172522	172527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308515
3033	NC_019738	TTAACG	2	12	172630	172641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428308516
3034	NC_019738	GAAA	2	8	172655	172662	75 %	0 %	25 %	0 %	428308516
3035	NC_019738	A	6	6	172672	172677	100 %	0 %	0 %	0 %	428308516
3036	NC_019738	CTC	2	6	172714	172719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308516
3037	NC_019738	CTA	2	6	172730	172735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308516
3038	NC_019738	TAC	2	6	172788	172793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308516
3039	NC_019738	AGA	2	6	172856	172861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308516
3040	NC_019738	T	6	6	172884	172889	0 %	100 %	0 %	0 %	428308516
3041	NC_019738	TTG	2	6	172923	172928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308516
3042	NC_019738	ATC	2	6	172968	172973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308516
3043	NC_019738	CAGC	2	8	173042	173049	25 %	0 %	25 %	50 %	428308516
3044	NC_019738	T	7	7	173055	173061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_019738	TTAACG	2	12	173071	173082	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3046	NC_019738	ACA	2	6	173151	173156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308517
3047	NC_019738	T	6	6	173231	173236	0 %	100 %	0 %	0 %	428308517
3048	NC_019738	CAT	2	6	173263	173268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308517
3049	NC_019738	GA	3	6	173307	173312	50 %	0 %	50 %	0 %	428308517
3050	NC_019738	CGA	2	6	173353	173358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308517
3051	NC_019738	TACC	2	8	173443	173450	25 %	25 %	0 %	50 %	428308517
3052	NC_019738	TAA	2	6	173452	173457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308517
3053	NC_019738	T	6	6	173504	173509	0 %	100 %	0 %	0 %	428308517
3054	NC_019738	CAC	2	6	173522	173527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308517
3055	NC_019738	AG	3	6	173614	173619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_019738	ACT	2	6	173623	173628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_019738	CAA	2	6	173665	173670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308518
3058	NC_019738	AATT	2	8	173753	173760	50 %	50 %	0 %	0 %	428308518
3059	NC_019738	TGG	2	6	173861	173866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308518
3060	NC_019738	ACCA	2	8	173874	173881	50 %	0 %	0 %	50 %	428308518
3061	NC_019738	A	7	7	173897	173903	100 %	0 %	0 %	0 %	428308518
3062	NC_019738	GCT	2	6	173911	173916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308518
3063	NC_019738	CAT	2	6	173938	173943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308518
3064	NC_019738	TAT	2	6	174124	174129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308518
3065	NC_019738	GAA	2	6	174214	174219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308518
3066	NC_019738	TGTC	2	8	174315	174322	0 %	50 %	25 %	25 %	428308518
3067	NC_019738	GAC	2	6	174333	174338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308518
3068	NC_019738	CTG	2	6	174520	174525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308519
3069	NC_019738	CAG	2	6	174530	174535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308519
3070	NC_019738	AGC	2	6	174560	174565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308519
3071	NC_019738	CTA	2	6	174735	174740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308519
3072	NC_019738	GAG	2	6	174772	174777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308519
3073	NC_019738	ACA	2	6	174804	174809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308519
3074	NC_019738	CGA	2	6	174851	174856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308519
3075	NC_019738	AGA	2	6	174927	174932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308519
3076	NC_019738	TC	3	6	175002	175007	0 %	50 %	0 %	50 %	428308519
3077	NC_019738	GA	3	6	175010	175015	50 %	0 %	50 %	0 %	428308519
3078	NC_019738	GAT	2	6	175027	175032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308519
3079	NC_019738	GGC	2	6	175035	175040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308519
3080	NC_019738	TAA	2	6	175086	175091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308519
3081	NC_019738	GGC	2	6	175242	175247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308519
3082	NC_019738	GCA	2	6	175312	175317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308519
3083	NC_019738	AGC	2	6	175339	175344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308519
3084	NC_019738	A	7	7	175366	175372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_019738	TAAT	2	8	175481	175488	50 %	50 %	0 %	0 %	428308520
3086	NC_019738	TC	3	6	175511	175516	0 %	50 %	0 %	50 %	428308520
3087	NC_019738	GGA	2	6	175524	175529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308520
3088	NC_019738	CT	3	6	175538	175543	0 %	50 %	0 %	50 %	428308520
3089	NC_019738	GCC	2	6	175572	175577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308520
3090	NC_019738	CAC	2	6	175592	175597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308520
3091	NC_019738	GTT	2	6	175618	175623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308520
3092	NC_019738	GAC	2	6	175652	175657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308520
3093	NC_019738	CCT	2	6	175686	175691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308520
3094	NC_019738	TGC	2	6	175728	175733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308520
3095	NC_019738	CAAA	2	8	175771	175778	75 %	0 %	0 %	25 %	428308520
3096	NC_019738	TGC	2	6	175842	175847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308520
3097	NC_019738	GCT	2	6	175852	175857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308520
3098	NC_019738	GTT	2	6	175870	175875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308520
3099	NC_019738	GTT	2	6	175897	175902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308520
3100	NC_019738	TG	3	6	175956	175961	0 %	50 %	50 %	0 %	428308520
3101	NC_019738	AGG	2	6	175985	175990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308520
3102	NC_019738	CTC	2	6	176053	176058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308520
3103	NC_019738	TCA	2	6	176059	176064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308520
3104	NC_019738	ATC	2	6	176152	176157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_019738	AAT	2	6	176158	176163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_019738	CTC	2	6	176185	176190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_019738	G	7	7	176239	176245	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_019738	TCAT	2	8	176274	176281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_019738	ATA	2	6	176430	176435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_019738	GCCA	2	8	176443	176450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_019738	T	7	7	176471	176477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_019738	CCT	2	6	176541	176546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_019738	AGGTA	2	10	176555	176564	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_019738	CAA	2	6	176611	176616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_019738	TTA	2	6	176622	176627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_019738	ATT	2	6	176643	176648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_019738	TGC	2	6	176680	176685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_019738	ATG	2	6	176783	176788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308521
3119	NC_019738	CAA	2	6	176802	176807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308521
3120	NC_019738	CAT	2	6	176988	176993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308521
3121	NC_019738	AGC	2	6	177020	177025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308521
3122	NC_019738	GA	3	6	177071	177076	50 %	0 %	50 %	0 %	428308521
3123	NC_019738	ATG	2	6	177110	177115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308521
3124	NC_019738	AT	3	6	177132	177137	50 %	50 %	0 %	0 %	428308521
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3224	NC_019738	ATTG	2	8	182787	182794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3225	NC_019738	TA	3	6	182807	182812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3235	NC_019738	TAA	2	6	183210	183215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_019738	T	6	6	183262	183267	0 %	100 %	0 %	0 %	428308527
3237	NC_019738	ATT	2	6	183356	183361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308527
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3240	NC_019738	TTG	2	6	183691	183696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308527
3241	NC_019738	GAT	2	6	183842	183847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3242	NC_019738	ATG	2	6	183862	183867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_019738	AACA	2	8	183939	183946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3244	NC_019738	CAGC	2	8	184044	184051	25 %	0 %	25 %	50 %	428308528
3245	NC_019738	CGAC	2	8	184122	184129	25 %	0 %	25 %	50 %	428308528
3246	NC_019738	GT	3	6	184230	184235	0 %	50 %	50 %	0 %	428308528
3247	NC_019738	CGG	2	6	184287	184292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308528
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3499	NC_019738	TTGGT	2	10	198228	198237	0 %	60 %	40 %	0 %	428308541
3500	NC_019738	GTT	2	6	198333	198338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308541

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