MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 150819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018612	CGG	2	6	18958	18963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028196
502	NC_018612	AGC	2	6	18969	18974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028196
503	NC_018612	GC	4	8	18973	18980	0 %	0 %	50 %	50 %	406028196
504	NC_018612	CGA	2	6	18986	18991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028196
505	NC_018612	GCCGG	2	10	19000	19009	0 %	0 %	60 %	40 %	406028196
506	NC_018612	GGGC	2	8	19010	19017	0 %	0 %	75 %	25 %	406028196
507	NC_018612	GGT	2	6	19028	19033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028196
508	NC_018612	GCC	2	6	19077	19082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028196
509	NC_018612	GTC	2	6	19086	19091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028196
510	NC_018612	CGC	2	6	19106	19111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028196
511	NC_018612	GGCCC	2	10	19118	19127	0 %	0 %	40 %	60 %	406028196
512	NC_018612	CTGG	2	8	19139	19146	0 %	25 %	50 %	25 %	406028196
513	NC_018612	GGCGG	2	10	19147	19156	0 %	0 %	80 %	20 %	406028196
514	NC_018612	GC	3	6	19167	19172	0 %	0 %	50 %	50 %	406028196
515	NC_018612	CCG	2	6	19174	19179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028196
516	NC_018612	GGC	2	6	19266	19271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028196
517	NC_018612	GCG	3	9	19285	19293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028196
518	NC_018612	AAC	2	6	19361	19366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028196
519	NC_018612	CAA	2	6	19375	19380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028196
520	NC_018612	CGT	2	6	19414	19419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028196
521	NC_018612	CGGCG	2	10	19484	19493	0 %	0 %	60 %	40 %	406028196
522	NC_018612	CGG	2	6	19588	19593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028196
523	NC_018612	GC	3	6	19609	19614	0 %	0 %	50 %	50 %	406028196
524	NC_018612	GCCG	2	8	19657	19664	0 %	0 %	50 %	50 %	406028196
525	NC_018612	CCG	2	6	19768	19773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028196
526	NC_018612	GGT	2	6	19783	19788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028196
527	NC_018612	GGC	2	6	19891	19896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028196
528	NC_018612	GCC	2	6	19925	19930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028196
529	NC_018612	TCC	2	6	19996	20001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028197
530	NC_018612	CGGCG	2	10	20035	20044	0 %	0 %	60 %	40 %	406028197
531	NC_018612	C	6	6	20051	20056	0 %	0 %	0 %	100 %	406028197
532	NC_018612	CCA	2	6	20085	20090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028197
533	NC_018612	GCG	2	6	20148	20153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028197
534	NC_018612	GT	3	6	20154	20159	0 %	50 %	50 %	0 %	406028197
535	NC_018612	CTG	2	6	20230	20235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028197
536	NC_018612	TTAGC	2	10	20268	20277	20 %	40 %	20 %	20 %	406028197
537	NC_018612	GCG	2	6	20286	20291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028197
538	NC_018612	GC	3	6	20297	20302	0 %	0 %	50 %	50 %	406028197
539	NC_018612	GCT	2	6	20304	20309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028197
540	NC_018612	GTG	2	6	20321	20326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028197
541	NC_018612	CCG	2	6	20387	20392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028197
542	NC_018612	CGC	2	6	20404	20409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028197
543	NC_018612	GCG	2	6	20427	20432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028197
544	NC_018612	GGC	2	6	20473	20478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028197
545	NC_018612	GAT	2	6	20488	20493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028197
546	NC_018612	GC	3	6	20557	20562	0 %	0 %	50 %	50 %	406028197
547	NC_018612	CTG	2	6	20638	20643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028197
548	NC_018612	CGGCG	2	10	20725	20734	0 %	0 %	60 %	40 %	406028197
549	NC_018612	GCT	2	6	20739	20744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028197
550	NC_018612	GGT	2	6	20779	20784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028197
551	NC_018612	CGGG	2	8	20805	20812	0 %	0 %	75 %	25 %	406028197
552	NC_018612	TCG	2	6	20855	20860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028197
553	NC_018612	GCA	2	6	20862	20867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028197
554	NC_018612	CGA	2	6	20902	20907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028197
555	NC_018612	CAG	2	6	20908	20913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028197
556	NC_018612	CGA	2	6	20932	20937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028197
557	NC_018612	CGG	2	6	20995	21000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028197
558	NC_018612	GCC	2	6	21001	21006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028197
559	NC_018612	CTG	2	6	21013	21018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028197
560	NC_018612	GGC	2	6	21031	21036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028197
561	NC_018612	CTG	2	6	21037	21042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028197
562	NC_018612	CG	3	6	21045	21050	0 %	0 %	50 %	50 %	406028197
563	NC_018612	GTG	2	6	21059	21064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028197
564	NC_018612	CG	3	6	21078	21083	0 %	0 %	50 %	50 %	406028197
565	NC_018612	GAA	2	6	21097	21102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028197
566	NC_018612	TCG	2	6	21131	21136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028197
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568	NC_018612	CCGC	2	8	21293	21300	0 %	0 %	25 %	75 %	406028197
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570	NC_018612	GC	3	6	21362	21367	0 %	0 %	50 %	50 %	406028197
571	NC_018612	CGG	2	6	21375	21380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028197
572	NC_018612	CAG	2	6	21412	21417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028197
573	NC_018612	GCCG	2	8	21489	21496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_018612	CGG	2	6	21504	21509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_018612	GC	3	6	21516	21521	0 %	0 %	50 %	50 %	406028198
576	NC_018612	GC	3	6	21526	21531	0 %	0 %	50 %	50 %	406028198
577	NC_018612	GAC	2	6	21536	21541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028198
578	NC_018612	GC	3	6	21559	21564	0 %	0 %	50 %	50 %	406028198
579	NC_018612	ACG	2	6	21597	21602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028198
580	NC_018612	GGT	2	6	21625	21630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028198
581	NC_018612	CGA	3	9	21666	21674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028198
582	NC_018612	AAC	2	6	21677	21682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028198
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584	NC_018612	AGC	2	6	21716	21721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028198
585	NC_018612	ACGATG	2	12	21767	21778	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406028198
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588	NC_018612	GAT	2	6	21838	21843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028198
589	NC_018612	GTCG	2	8	21847	21854	0 %	25 %	50 %	25 %	406028198
590	NC_018612	CGG	2	6	21858	21863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028198
591	NC_018612	CCG	2	6	21908	21913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028198
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593	NC_018612	ACCCGG	2	12	21992	22003	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406028198
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596	NC_018612	ACC	3	9	22097	22105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028198
597	NC_018612	ACG	2	6	22110	22115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028198
598	NC_018612	CCGA	2	8	22163	22170	25 %	0 %	25 %	50 %	406028198
599	NC_018612	GCC	2	6	22181	22186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028198
600	NC_018612	GGGGC	2	10	22207	22216	0 %	0 %	80 %	20 %	406028198
601	NC_018612	GAA	2	6	22285	22290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028198
602	NC_018612	AGACC	2	10	22413	22422	40 %	0 %	20 %	40 %	406028198
603	NC_018612	GC	3	6	22447	22452	0 %	0 %	50 %	50 %	406028198
604	NC_018612	AAG	2	6	22472	22477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028198
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609	NC_018612	GCTGA	2	10	22555	22564	20 %	20 %	40 %	20 %	406028198
610	NC_018612	ATC	2	6	22589	22594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028198
611	NC_018612	CAG	2	6	22633	22638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028198
612	NC_018612	GAC	2	6	22690	22695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028198
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614	NC_018612	CAG	2	6	22762	22767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028198
615	NC_018612	CAG	2	6	22798	22803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028198
616	NC_018612	AGG	2	6	22834	22839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018612	CGG	2	6	22852	22857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_018612	TGT	2	6	22867	22872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028199
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621	NC_018612	TGGG	2	8	22997	23004	0 %	25 %	75 %	0 %	406028199
622	NC_018612	G	6	6	23002	23007	0 %	0 %	100 %	0 %	406028199
623	NC_018612	TGG	2	6	23015	23020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028199
624	NC_018612	TGG	2	6	23024	23029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028199
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626	NC_018612	CCG	2	6	23071	23076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028199
627	NC_018612	GC	3	6	23104	23109	0 %	0 %	50 %	50 %	406028199
628	NC_018612	GGC	2	6	23110	23115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028199
629	NC_018612	GCA	2	6	23126	23131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028199
630	NC_018612	GCC	2	6	23181	23186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028199
631	NC_018612	TGGACC	2	12	23200	23211	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	406028199
632	NC_018612	GC	3	6	23298	23303	0 %	0 %	50 %	50 %	406028199
633	NC_018612	CAG	2	6	23346	23351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028199
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645	NC_018612	GCCC	2	8	23575	23582	0 %	0 %	25 %	75 %	406028199
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661	NC_018612	GCG	2	6	24220	24225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028199
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668	NC_018612	CTC	2	6	24386	24391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
669	NC_018612	CCGG	2	8	24396	24403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
670	NC_018612	CAT	2	6	24421	24426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
671	NC_018612	GTC	2	6	24509	24514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028200
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682	NC_018612	GGT	2	6	24989	24994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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733	NC_018612	GCG	2	6	26820	26825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
734	NC_018612	AGGGC	2	10	26826	26835	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
735	NC_018612	GTT	2	6	26903	26908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
736	NC_018612	TAC	2	6	27007	27012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
737	NC_018612	A	6	6	27077	27082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
738	NC_018612	CGA	2	6	27103	27108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028202
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742	NC_018612	GAT	2	6	27194	27199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028202
743	NC_018612	GAC	2	6	27221	27226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028202
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746	NC_018612	CGA	2	6	27289	27294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028202
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748	NC_018612	TCC	2	6	27344	27349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028202
749	NC_018612	CGG	2	6	27459	27464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028202
750	NC_018612	ACG	3	9	27489	27497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028202
751	NC_018612	GTT	2	6	27502	27507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028202
752	NC_018612	CGA	2	6	27588	27593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028203
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754	NC_018612	GCC	2	6	27749	27754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028203
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759	NC_018612	CGT	2	6	27852	27857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028203
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