MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylocystis sp. SC2

Total Repeats: 3652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018485	CACGC	2	10	1919	1928	20 %	0 %	20 %	60 %	402770566
2	NC_018485	GGAAT	2	10	2802	2811	40 %	20 %	40 %	0 %	402770567
3	NC_018485	GCGTC	2	10	4674	4683	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_018485	TGGCC	2	10	4712	4721	0 %	20 %	40 %	40 %	402770570
5	NC_018485	GCGCG	2	10	4735	4744	0 %	0 %	60 %	40 %	402770570
6	NC_018485	GCCCA	2	10	5054	5063	20 %	0 %	20 %	60 %	402770570
7	NC_018485	CGAGC	2	10	8696	8705	20 %	0 %	40 %	40 %	402770574
8	NC_018485	CGCGG	2	10	9006	9015	0 %	0 %	60 %	40 %	402770574
9	NC_018485	GCCGC	2	10	12681	12690	0 %	0 %	40 %	60 %	402770578
10	NC_018485	CCGCG	2	10	12744	12753	0 %	0 %	40 %	60 %	402770578
11	NC_018485	GTTCG	2	10	15375	15384	0 %	40 %	40 %	20 %	402770581
12	NC_018485	GTCGC	2	10	16806	16815	0 %	20 %	40 %	40 %	402770582
13	NC_018485	TGGCG	2	10	16943	16952	0 %	20 %	60 %	20 %	402770582
14	NC_018485	TCGCT	2	10	17459	17468	0 %	40 %	20 %	40 %	402770584
15	NC_018485	CGCGG	2	10	17712	17721	0 %	0 %	60 %	40 %	402770584
16	NC_018485	GCGGG	2	10	19281	19290	0 %	0 %	80 %	20 %	402770585
17	NC_018485	CACCC	2	10	21686	21695	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
18	NC_018485	GCGGG	2	10	21788	21797	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018485	GCTCG	2	10	22311	22320	0 %	20 %	40 %	40 %	402770588
20	NC_018485	GGCGC	2	10	24005	24014	0 %	0 %	60 %	40 %	402770589
21	NC_018485	GCGTC	2	10	26080	26089	0 %	20 %	40 %	40 %	402770591
22	NC_018485	TCGTG	2	10	30905	30914	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018485	ATCCC	2	10	34976	34985	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_018485	CGCGG	2	10	37422	37431	0 %	0 %	60 %	40 %	402770597
25	NC_018485	CGGCG	2	10	37568	37577	0 %	0 %	60 %	40 %	402770597
26	NC_018485	TCGCG	2	10	38308	38317	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_018485	GCGCC	2	10	38892	38901	0 %	0 %	40 %	60 %	402770599
28	NC_018485	TGGCG	2	10	39706	39715	0 %	20 %	60 %	20 %	402770599
29	NC_018485	GCCGC	2	10	40675	40684	0 %	0 %	40 %	60 %	402770599
30	NC_018485	AGCGC	2	10	40697	40706	20 %	0 %	40 %	40 %	402770599
31	NC_018485	GCTTC	2	10	40814	40823	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_018485	CGTGG	2	10	41335	41344	0 %	20 %	60 %	20 %	402770600
33	NC_018485	TCGCT	2	10	41799	41808	0 %	40 %	20 %	40 %	402770601
34	NC_018485	CGGAC	2	10	42480	42489	20 %	0 %	40 %	40 %	402770601
35	NC_018485	CGTCG	2	10	43209	43218	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_018485	GCGCC	2	10	43261	43270	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_018485	GCGAC	2	10	44909	44918	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_018485	GCGCC	2	10	47826	47835	0 %	0 %	40 %	60 %	402770606
39	NC_018485	CGGGG	2	10	48543	48552	0 %	0 %	80 %	20 %	402770608
40	NC_018485	AGGGC	2	10	48710	48719	20 %	0 %	60 %	20 %	402770608
41	NC_018485	TCATA	2	10	52929	52938	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018485	TGCCG	2	10	53234	53243	0 %	20 %	40 %	40 %	402770614
43	NC_018485	CGCGG	2	10	53586	53595	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_018485	TCGAC	2	10	54710	54719	20 %	20 %	20 %	40 %	402770615
45	NC_018485	CCTCG	2	10	54839	54848	0 %	20 %	20 %	60 %	402770615
46	NC_018485	GGCGC	2	10	56247	56256	0 %	0 %	60 %	40 %	402770617
47	NC_018485	GCAGG	2	10	56374	56383	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018485	GCCAA	2	10	56816	56825	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_018485	GTTTC	2	10	57717	57726	0 %	60 %	20 %	20 %	402770618
50	NC_018485	GCGCC	2	10	58447	58456	0 %	0 %	40 %	60 %	402770619
51	NC_018485	AGGGA	2	10	59244	59253	40 %	0 %	60 %	0 %	402770620
52	NC_018485	CGCGC	2	10	61177	61186	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_018485	TTTCC	2	10	61525	61534	0 %	60 %	0 %	40 %	402770622
54	NC_018485	ATCGC	2	10	62852	62861	20 %	20 %	20 %	40 %	402770623
55	NC_018485	GCCGG	2	10	63064	63073	0 %	0 %	60 %	40 %	402770623
56	NC_018485	GGCGA	2	10	63394	63403	20 %	0 %	60 %	20 %	402770623
57	NC_018485	CGGCG	2	10	65609	65618	0 %	0 %	60 %	40 %	402770624
58	NC_018485	CGGCG	2	10	65777	65786	0 %	0 %	60 %	40 %	402770624
59	NC_018485	GCCGC	2	10	66456	66465	0 %	0 %	40 %	60 %	402770625
60	NC_018485	AGGCC	2	10	69770	69779	20 %	0 %	40 %	40 %	402770630
61	NC_018485	GGGTG	2	10	69875	69884	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018485	CACCC	2	10	69916	69925	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
63	NC_018485	GGCGA	2	10	70283	70292	20 %	0 %	60 %	20 %	402770631
64	NC_018485	TGTCC	2	10	70682	70691	0 %	40 %	20 %	40 %	402770632
65	NC_018485	CGGCG	2	10	71606	71615	0 %	0 %	60 %	40 %	402770633
66	NC_018485	GGCGC	2	10	72623	72632	0 %	0 %	60 %	40 %	402770633
67	NC_018485	GCAGG	2	10	74038	74047	20 %	0 %	60 %	20 %	402770634
68	NC_018485	GGGCA	2	10	74141	74150	20 %	0 %	60 %	20 %	402770634
69	NC_018485	CGGGG	2	10	74532	74541	0 %	0 %	80 %	20 %	402770635
70	NC_018485	GCGCG	2	10	76914	76923	0 %	0 %	60 %	40 %	402770637
71	NC_018485	GCCCG	2	10	80547	80556	0 %	0 %	40 %	60 %	402770641
72	NC_018485	CGCGC	2	10	80994	81003	0 %	0 %	40 %	60 %	402770642
73	NC_018485	CGGCG	2	10	82066	82075	0 %	0 %	60 %	40 %	402770643
74	NC_018485	CGCGG	2	10	82838	82847	0 %	0 %	60 %	40 %	402770643
75	NC_018485	GCAGC	2	10	83329	83338	20 %	0 %	40 %	40 %	402770643
76	NC_018485	GACGC	2	10	84106	84115	20 %	0 %	40 %	40 %	402770643
77	NC_018485	GGGCG	2	10	84511	84520	0 %	0 %	80 %	20 %	402770643
78	NC_018485	GTCCC	2	10	86217	86226	0 %	20 %	20 %	60 %	402770643
79	NC_018485	CGGCG	2	10	87058	87067	0 %	0 %	60 %	40 %	402770643
80	NC_018485	TCGGC	2	10	89797	89806	0 %	20 %	40 %	40 %	402770647
81	NC_018485	GCGCC	2	10	90180	90189	0 %	0 %	40 %	60 %	402770647
82	NC_018485	GTTGA	2	10	91065	91074	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018485	GCGCC	2	10	92958	92967	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_018485	CAAGG	2	10	93276	93285	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018485	ATTTT	2	10	93768	93777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018485	GCGCC	2	10	94428	94437	0 %	0 %	40 %	60 %	402770653
87	NC_018485	GGCGC	2	10	94605	94614	0 %	0 %	60 %	40 %	402770653
88	NC_018485	GGGCG	2	10	94753	94762	0 %	0 %	80 %	20 %	402770653
89	NC_018485	GGCGA	2	10	97432	97441	20 %	0 %	60 %	20 %	402770655
90	NC_018485	GCTTC	2	10	100736	100745	0 %	40 %	20 %	40 %	402770658
91	NC_018485	GCCGC	2	10	100888	100897	0 %	0 %	40 %	60 %	402770659
92	NC_018485	GCGCC	2	10	101795	101804	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
93	NC_018485	CGGCG	2	10	103003	103012	0 %	0 %	60 %	40 %	402770661
94	NC_018485	CCGCC	2	10	103292	103301	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
95	NC_018485	CGCGC	2	10	106245	106254	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_018485	CGGCG	2	10	106872	106881	0 %	0 %	60 %	40 %	402770666
97	NC_018485	CGGGC	2	10	107724	107733	0 %	0 %	60 %	40 %	402770666
98	NC_018485	CGACG	2	10	107742	107751	20 %	0 %	40 %	40 %	402770666
99	NC_018485	GCGCG	2	10	107982	107991	0 %	0 %	60 %	40 %	402770666
100	NC_018485	GGCGC	2	10	109822	109831	0 %	0 %	60 %	40 %	402770668
101	NC_018485	TCGCC	2	10	110588	110597	0 %	20 %	20 %	60 %	402770668
102	NC_018485	CCCCA	2	10	111110	111119	20 %	0 %	0 %	80 %	402770669
103	NC_018485	GCGCG	2	10	112267	112276	0 %	0 %	60 %	40 %	402770670
104	NC_018485	GCCGC	2	10	112773	112782	0 %	0 %	40 %	60 %	402770670
105	NC_018485	TGAAG	2	10	112798	112807	40 %	20 %	40 %	0 %	402770670
106	NC_018485	AGGCG	2	10	113116	113125	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018485	GATCC	2	10	113167	113176	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_018485	CCCGC	2	10	116007	116016	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
109	NC_018485	AATTG	2	10	116951	116960	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018485	GTCGC	2	10	118541	118550	0 %	20 %	40 %	40 %	402770677
111	NC_018485	CGGCG	2	10	119675	119684	0 %	0 %	60 %	40 %	402770678
112	NC_018485	GGATC	2	10	119949	119958	20 %	20 %	40 %	20 %	402770678
113	NC_018485	CCGCG	2	10	121022	121031	0 %	0 %	40 %	60 %	402770680
114	NC_018485	GCCGC	2	10	122734	122743	0 %	0 %	40 %	60 %	402770682
115	NC_018485	GATTG	2	10	123246	123255	20 %	40 %	40 %	0 %	402770682
116	NC_018485	CGCGG	2	10	123517	123526	0 %	0 %	60 %	40 %	402770682
117	NC_018485	TGCGC	2	10	124725	124734	0 %	20 %	40 %	40 %	402770682
118	NC_018485	ATCAG	2	10	125261	125270	40 %	20 %	20 %	20 %	402770683
119	NC_018485	ACGCC	2	10	125958	125967	20 %	0 %	20 %	60 %	402770685
120	NC_018485	GCGCG	2	10	126313	126322	0 %	0 %	60 %	40 %	402770685
121	NC_018485	GGGAA	2	10	126702	126711	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018485	GCAGC	2	10	127073	127082	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_018485	AAGGA	2	10	131887	131896	60 %	0 %	40 %	0 %	402770688
124	NC_018485	CAGAT	2	10	132562	132571	40 %	20 %	20 %	20 %	402770689
125	NC_018485	CGTGA	2	10	134735	134744	20 %	20 %	40 %	20 %	402770691
126	NC_018485	GTCTT	2	10	134963	134972	0 %	60 %	20 %	20 %	402770691
127	NC_018485	AGATG	2	10	136181	136190	40 %	20 %	40 %	0 %	402770692
128	NC_018485	CCGCT	2	10	136968	136977	0 %	20 %	20 %	60 %	402770692
129	NC_018485	AGACG	2	10	140126	140135	40 %	0 %	40 %	20 %	402770696
130	NC_018485	GGTGC	2	10	141139	141148	0 %	20 %	60 %	20 %	402770697
131	NC_018485	GCGCC	2	10	141638	141647	0 %	0 %	40 %	60 %	402770698
132	NC_018485	AAGAC	2	10	143795	143804	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018485	GCGCC	2	10	145351	145360	0 %	0 %	40 %	60 %	402770704
134	NC_018485	GGCGC	2	10	148185	148194	0 %	0 %	60 %	40 %	402770706
135	NC_018485	TACGG	2	10	148390	148399	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018485	TCGGG	2	10	149606	149615	0 %	20 %	60 %	20 %	402770708
137	NC_018485	CGATC	2	10	150009	150018	20 %	20 %	20 %	40 %	402770709
138	NC_018485	AGCGA	2	10	150355	150364	40 %	0 %	40 %	20 %	402770709
139	NC_018485	CGTTT	2	10	151249	151258	0 %	60 %	20 %	20 %	402770710
140	NC_018485	GCGTC	2	10	159046	159055	0 %	20 %	40 %	40 %	402770714
141	NC_018485	CCCCA	2	10	159922	159931	20 %	0 %	0 %	80 %	402770714
142	NC_018485	CGGGC	2	10	160732	160741	0 %	0 %	60 %	40 %	402770714
143	NC_018485	GACGG	2	10	162368	162377	20 %	0 %	60 %	20 %	402770714
144	NC_018485	GAAGC	2	10	163045	163054	40 %	0 %	40 %	20 %	402770714
145	NC_018485	ATGAG	2	10	163196	163205	40 %	20 %	40 %	0 %	402770714
146	NC_018485	GGCCT	2	10	166165	166174	0 %	20 %	40 %	40 %	402770716
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148	NC_018485	CGCTG	2	10	173945	173954	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_018485	TCCGT	2	10	174515	174524	0 %	40 %	20 %	40 %	402770721
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153	NC_018485	GCGAG	2	10	176709	176718	20 %	0 %	60 %	20 %	402770722
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158	NC_018485	CGCGT	2	10	183072	183081	0 %	20 %	40 %	40 %	402770726
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165	NC_018485	TGCGC	2	10	188669	188678	0 %	20 %	40 %	40 %	402770726
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172	NC_018485	CGGGC	2	10	200091	200100	0 %	0 %	60 %	40 %	402770729
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174	NC_018485	TGGTC	2	10	201159	201168	0 %	40 %	40 %	20 %	402770730
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178	NC_018485	CTGGC	2	10	205135	205144	0 %	20 %	40 %	40 %	402770733
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180	NC_018485	GATCG	2	10	206735	206744	20 %	20 %	40 %	20 %	402770734
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183	NC_018485	TGTCG	2	10	210457	210466	0 %	40 %	40 %	20 %	402770735
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186	NC_018485	GAGTG	2	10	211500	211509	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_018485	CGGCG	2	10	260411	260420	0 %	0 %	60 %	40 %	402770780
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250	NC_018485	TCGTC	2	10	275945	275954	0 %	40 %	20 %	40 %	402770794
251	NC_018485	CGTGC	2	10	277112	277121	0 %	20 %	40 %	40 %	402770795
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254	NC_018485	CCTGG	2	10	280673	280682	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
255	NC_018485	ACCGG	2	10	281727	281736	20 %	0 %	40 %	40 %	402770800
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260	NC_018485	CCAGC	2	10	286179	286188	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
261	NC_018485	GCGCG	2	10	286420	286429	0 %	0 %	60 %	40 %	402770806
262	NC_018485	GCGCC	2	10	287088	287097	0 %	0 %	40 %	60 %	402770807
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264	NC_018485	CCTTG	2	10	290011	290020	0 %	40 %	20 %	40 %	402770808
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266	NC_018485	CCCCT	2	10	290526	290535	0 %	20 %	0 %	80 %	402770809
267	NC_018485	AAGGA	2	10	291257	291266	60 %	0 %	40 %	0 %	402770811
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