MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 chromosome

Total Repeats: 6012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018289	ACCAC	2	10	1397	1406	40 %	0 %	0 %	60 %	399984433
2	NC_018289	GGCTG	2	10	2123	2132	0 %	20 %	60 %	20 %	399984435
3	NC_018289	CGTGT	2	10	3484	3493	0 %	40 %	40 %	20 %	399984436
4	NC_018289	CGGCG	2	10	4812	4821	0 %	0 %	60 %	40 %	399984437
5	NC_018289	CGCGG	2	10	5502	5511	0 %	0 %	60 %	40 %	399984438
6	NC_018289	CGGCC	2	10	5549	5558	0 %	0 %	40 %	60 %	399984438
7	NC_018289	TGGTC	2	10	6965	6974	0 %	40 %	40 %	20 %	399984439
8	NC_018289	AGGCG	2	10	8284	8293	20 %	0 %	60 %	20 %	399984440
9	NC_018289	GCAGC	2	10	8332	8341	20 %	0 %	40 %	40 %	399984440
10	NC_018289	CCAGT	2	10	9172	9181	20 %	20 %	20 %	40 %	399984440
11	NC_018289	TGGTC	2	10	9436	9445	0 %	40 %	40 %	20 %	399984440
12	NC_018289	CGGTG	2	10	10240	10249	0 %	20 %	60 %	20 %	399984440
13	NC_018289	GGTCC	2	10	11154	11163	0 %	20 %	40 %	40 %	399984441
14	NC_018289	GGTTA	2	10	12000	12009	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018289	CCCGG	2	10	12268	12277	0 %	0 %	40 %	60 %	399984443
16	NC_018289	CGCGC	2	10	12855	12864	0 %	0 %	40 %	60 %	399984444
17	NC_018289	CGCGC	2	10	16538	16547	0 %	0 %	40 %	60 %	399984447
18	NC_018289	GTCGA	2	10	17441	17450	20 %	20 %	40 %	20 %	399984449
19	NC_018289	CGCAA	2	10	18167	18176	40 %	0 %	20 %	40 %	399984449
20	NC_018289	CGCGG	2	10	18447	18456	0 %	0 %	60 %	40 %	399984449
21	NC_018289	GTCGA	2	10	19504	19513	20 %	20 %	40 %	20 %	399984450
22	NC_018289	CCCGG	2	10	19861	19870	0 %	0 %	40 %	60 %	399984450
23	NC_018289	CGGCC	2	10	21633	21642	0 %	0 %	40 %	60 %	399984451
24	NC_018289	GGCCG	2	10	22996	23005	0 %	0 %	60 %	40 %	399984451
25	NC_018289	GCCGC	2	10	23611	23620	0 %	0 %	40 %	60 %	399984451
26	NC_018289	CCGCA	2	10	25238	25247	20 %	0 %	20 %	60 %	399984451
27	NC_018289	CGCAC	2	10	27570	27579	20 %	0 %	20 %	60 %	399984451
28	NC_018289	GGCGC	2	10	28582	28591	0 %	0 %	60 %	40 %	399984451
29	NC_018289	CTGGC	2	10	31522	31531	0 %	20 %	40 %	40 %	399984451
30	NC_018289	CCGCA	2	10	32171	32180	20 %	0 %	20 %	60 %	399984451
31	NC_018289	CGGCA	2	10	32240	32249	20 %	0 %	40 %	40 %	399984451
32	NC_018289	CGCTG	2	10	33504	33513	0 %	20 %	40 %	40 %	399984451
33	NC_018289	CCGCG	2	10	34476	34485	0 %	0 %	40 %	60 %	399984451
34	NC_018289	CGGGG	2	10	36697	36706	0 %	0 %	80 %	20 %	399984451
35	NC_018289	CCGAC	2	10	36857	36866	20 %	0 %	20 %	60 %	399984451
36	NC_018289	CGCAC	3	15	37113	37127	20 %	0 %	20 %	60 %	399984451
37	NC_018289	CGGCG	2	10	37800	37809	0 %	0 %	60 %	40 %	399984451
38	NC_018289	CGGGC	2	10	39107	39116	0 %	0 %	60 %	40 %	399984451
39	NC_018289	CGCGG	2	10	41523	41532	0 %	0 %	60 %	40 %	399984451
40	NC_018289	CCGGT	2	10	42676	42685	0 %	20 %	40 %	40 %	399984451
41	NC_018289	CGACG	2	10	43044	43053	20 %	0 %	40 %	40 %	399984451
42	NC_018289	CAACC	2	10	45221	45230	40 %	0 %	0 %	60 %	399984454
43	NC_018289	GCCCC	2	10	46791	46800	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
44	NC_018289	GTCAG	2	10	48021	48030	20 %	20 %	40 %	20 %	399984458
45	NC_018289	CCAGC	2	10	48412	48421	20 %	0 %	20 %	60 %	399984459
46	NC_018289	CGGGC	2	10	49344	49353	0 %	0 %	60 %	40 %	399984460
47	NC_018289	GGCGT	2	10	49450	49459	0 %	20 %	60 %	20 %	399984460
48	NC_018289	CCAGC	2	10	49958	49967	20 %	0 %	20 %	60 %	399984461
49	NC_018289	GCCTG	2	10	50383	50392	0 %	20 %	40 %	40 %	399984461
50	NC_018289	CGGCG	2	10	52450	52459	0 %	0 %	60 %	40 %	399984462
51	NC_018289	AAGTG	2	10	55126	55135	40 %	20 %	40 %	0 %	399984464
52	NC_018289	GGGGC	2	10	55207	55216	0 %	0 %	80 %	20 %	399984464
53	NC_018289	CAGCC	2	10	56347	56356	20 %	0 %	20 %	60 %	399984465
54	NC_018289	TGGCG	2	10	57588	57597	0 %	20 %	60 %	20 %	399984466
55	NC_018289	AGGTC	2	10	59253	59262	20 %	20 %	40 %	20 %	399984467
56	NC_018289	TGGCG	2	10	60218	60227	0 %	20 %	60 %	20 %	399984469
57	NC_018289	GGTCG	2	10	60672	60681	0 %	20 %	60 %	20 %	399984471
58	NC_018289	GAGCT	2	10	63554	63563	20 %	20 %	40 %	20 %	399984475
59	NC_018289	ACCGC	2	10	63881	63890	20 %	0 %	20 %	60 %	399984475
60	NC_018289	TGCGC	2	10	64828	64837	0 %	20 %	40 %	40 %	399984475
61	NC_018289	ACCGC	3	15	65955	65969	20 %	0 %	20 %	60 %	399984476
62	NC_018289	CGGCG	2	10	66038	66047	0 %	0 %	60 %	40 %	399984476
63	NC_018289	GGCGC	2	10	67563	67572	0 %	0 %	60 %	40 %	399984476
64	NC_018289	CCGTT	2	10	68232	68241	0 %	40 %	20 %	40 %	399984477
65	NC_018289	ATCGC	2	10	70265	70274	20 %	20 %	20 %	40 %	399984479
66	NC_018289	GGGGC	2	10	70423	70432	0 %	0 %	80 %	20 %	399984480
67	NC_018289	CCGCG	2	10	70699	70708	0 %	0 %	40 %	60 %	399984480
68	NC_018289	CGTCG	2	10	70733	70742	0 %	20 %	40 %	40 %	399984480
69	NC_018289	GGTCC	2	10	71204	71213	0 %	20 %	40 %	40 %	399984480
70	NC_018289	GCCCC	2	10	72803	72812	0 %	0 %	20 %	80 %	399984482
71	NC_018289	CGCTG	2	10	73290	73299	0 %	20 %	40 %	40 %	399984482
72	NC_018289	GCGCC	2	10	74907	74916	0 %	0 %	40 %	60 %	399984484
73	NC_018289	GGCAG	2	10	76449	76458	20 %	0 %	60 %	20 %	399984485
74	NC_018289	GCCGC	2	10	76802	76811	0 %	0 %	40 %	60 %	399984485
75	NC_018289	GCTCG	2	10	77256	77265	0 %	20 %	40 %	40 %	399984485
76	NC_018289	GCACC	2	10	77501	77510	20 %	0 %	20 %	60 %	399984485
77	NC_018289	CCGCG	2	10	78847	78856	0 %	0 %	40 %	60 %	399984487
78	NC_018289	GGCGC	2	10	80172	80181	0 %	0 %	60 %	40 %	399984489
79	NC_018289	ACCTC	2	10	81558	81567	20 %	20 %	0 %	60 %	399984490
80	NC_018289	TCGGT	2	10	82056	82065	0 %	40 %	40 %	20 %	399984490
81	NC_018289	ATCCG	2	10	82084	82093	20 %	20 %	20 %	40 %	399984490
82	NC_018289	GTGCT	2	10	82292	82301	0 %	40 %	40 %	20 %	399984490
83	NC_018289	ACCCC	2	10	85031	85040	20 %	0 %	0 %	80 %	399984492
84	NC_018289	GCCGC	2	10	85110	85119	0 %	0 %	40 %	60 %	399984492
85	NC_018289	CCGGT	2	10	86157	86166	0 %	20 %	40 %	40 %	399984492
86	NC_018289	CCGGC	2	10	87278	87287	0 %	0 %	40 %	60 %	399984494
87	NC_018289	CCGCG	2	10	88274	88283	0 %	0 %	40 %	60 %	399984494
88	NC_018289	GCCCG	2	10	89719	89728	0 %	0 %	40 %	60 %	399984497
89	NC_018289	CTCGG	2	10	90080	90089	0 %	20 %	40 %	40 %	399984497
90	NC_018289	TTGTG	2	10	93474	93483	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018289	CCCAC	2	10	96044	96053	20 %	0 %	0 %	80 %	399984500
92	NC_018289	GCCGC	2	10	96089	96098	0 %	0 %	40 %	60 %	399984500
93	NC_018289	TCGGC	2	10	97985	97994	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_018289	GCCGA	2	10	100755	100764	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_018289	GCGAC	2	10	101490	101499	20 %	0 %	40 %	40 %	399984505
96	NC_018289	CCGCG	2	10	101620	101629	0 %	0 %	40 %	60 %	399984505
97	NC_018289	CCATC	2	10	101760	101769	20 %	20 %	0 %	60 %	399984505
98	NC_018289	GCGGA	2	10	106451	106460	20 %	0 %	60 %	20 %	399984509
99	NC_018289	GCCGA	2	10	106571	106580	20 %	0 %	40 %	40 %	399984509
100	NC_018289	GTGAG	2	10	108014	108023	20 %	20 %	60 %	0 %	399984510
101	NC_018289	GCTGG	2	10	108075	108084	0 %	20 %	60 %	20 %	399984510
102	NC_018289	CAGCG	2	10	110032	110041	20 %	0 %	40 %	40 %	399984512
103	NC_018289	CACGC	2	10	110840	110849	20 %	0 %	20 %	60 %	399984512
104	NC_018289	TCGGC	2	10	110961	110970	0 %	20 %	40 %	40 %	399984512
105	NC_018289	CGGCG	2	10	111145	111154	0 %	0 %	60 %	40 %	399984512
106	NC_018289	GGCCG	2	10	111172	111181	0 %	0 %	60 %	40 %	399984512
107	NC_018289	GCACC	2	10	111722	111731	20 %	0 %	20 %	60 %	399984513
108	NC_018289	CGGCA	2	10	111964	111973	20 %	0 %	40 %	40 %	399984513
109	NC_018289	CGCTG	2	10	114955	114964	0 %	20 %	40 %	40 %	399984515
110	NC_018289	ATCCG	2	10	115755	115764	20 %	20 %	20 %	40 %	399984516
111	NC_018289	CGGCG	2	10	116024	116033	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_018289	GCGCT	2	10	117360	117369	0 %	20 %	40 %	40 %	399984517
113	NC_018289	TCGGA	2	10	118233	118242	20 %	20 %	40 %	20 %	399984518
114	NC_018289	TGCTC	2	10	118326	118335	0 %	40 %	20 %	40 %	399984518
115	NC_018289	CCGCG	2	10	121465	121474	0 %	0 %	40 %	60 %	399984521
116	NC_018289	CCATT	2	10	121689	121698	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_018289	GCTCA	2	10	126140	126149	20 %	20 %	20 %	40 %	399984526
118	NC_018289	GCCGG	2	10	126167	126176	0 %	0 %	60 %	40 %	399984526
119	NC_018289	GTCAG	2	10	127498	127507	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018289	CAGCT	2	10	129612	129621	20 %	20 %	20 %	40 %	399984529
121	NC_018289	CGTGA	2	10	130078	130087	20 %	20 %	40 %	20 %	399984530
122	NC_018289	CCGCA	2	10	133075	133084	20 %	0 %	20 %	60 %	399984532
123	NC_018289	GCGTC	2	10	133397	133406	0 %	20 %	40 %	40 %	399984533
124	NC_018289	GCGCG	2	10	136523	136532	0 %	0 %	60 %	40 %	399984535
125	NC_018289	GCCGA	2	10	137145	137154	20 %	0 %	40 %	40 %	399984535
126	NC_018289	GCCGC	2	10	140387	140396	0 %	0 %	40 %	60 %	399984539
127	NC_018289	GGCCG	2	10	140456	140465	0 %	0 %	60 %	40 %	399984540
128	NC_018289	CGACG	2	10	141421	141430	20 %	0 %	40 %	40 %	399984541
129	NC_018289	GATCG	2	10	142041	142050	20 %	20 %	40 %	20 %	399984542
130	NC_018289	ACACC	2	10	142897	142906	40 %	0 %	0 %	60 %	399984543
131	NC_018289	TCCCG	2	10	144821	144830	0 %	20 %	20 %	60 %	399984546
132	NC_018289	CGGCC	2	10	146790	146799	0 %	0 %	40 %	60 %	399984549
133	NC_018289	GCAGG	2	10	146979	146988	20 %	0 %	60 %	20 %	399984549
134	NC_018289	CGCAC	2	10	150019	150028	20 %	0 %	20 %	60 %	399984552
135	NC_018289	CGGAC	2	10	151884	151893	20 %	0 %	40 %	40 %	399984554
136	NC_018289	CGCGG	2	10	152694	152703	0 %	0 %	60 %	40 %	399984555
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