MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanoculleus bourgensis MS2

Total Repeats: 1951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018227	TCCTG	2	10	397	406	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_018227	CGGGA	2	10	634	643	20 %	0 %	60 %	20 %	397779167
3	NC_018227	TCCTC	2	10	1062	1071	0 %	40 %	0 %	60 %	397779167
4	NC_018227	GATCG	2	10	1956	1965	20 %	20 %	40 %	20 %	397779168
5	NC_018227	TGAGG	2	10	2205	2214	20 %	20 %	60 %	0 %	397779168
6	NC_018227	CTGTT	2	10	4395	4404	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018227	GCGGT	2	10	5428	5437	0 %	20 %	60 %	20 %	397779170
8	NC_018227	GCCTG	2	10	7110	7119	0 %	20 %	40 %	40 %	397779174
9	NC_018227	GATGC	2	10	7367	7376	20 %	20 %	40 %	20 %	397779174
10	NC_018227	GTCGG	2	10	8476	8485	0 %	20 %	60 %	20 %	397779175
11	NC_018227	GGCGA	2	10	8590	8599	20 %	0 %	60 %	20 %	397779175
12	NC_018227	CGGGA	2	10	12633	12642	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018227	CCGCC	2	10	13184	13193	0 %	0 %	20 %	80 %	397779183
14	NC_018227	CGGCT	2	10	15130	15139	0 %	20 %	40 %	40 %	397779186
15	NC_018227	GGATC	2	10	16690	16699	20 %	20 %	40 %	20 %	397779187
16	NC_018227	TCGGA	2	10	17746	17755	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018227	GCCGG	2	10	17809	17818	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_018227	CGACC	2	10	20036	20045	20 %	0 %	20 %	60 %	397779192
19	NC_018227	GCAGA	2	10	21970	21979	40 %	0 %	40 %	20 %	397779193
20	NC_018227	CGTGG	2	10	21985	21994	0 %	20 %	60 %	20 %	397779193
21	NC_018227	CCCTG	2	10	22049	22058	0 %	20 %	20 %	60 %	397779193
22	NC_018227	CCTCT	2	10	23900	23909	0 %	40 %	0 %	60 %	397779194
23	NC_018227	GTCGA	2	10	25447	25456	20 %	20 %	40 %	20 %	397779195
24	NC_018227	GGGCG	2	10	27902	27911	0 %	0 %	80 %	20 %	397779198
25	NC_018227	CGAGG	2	10	29354	29363	20 %	0 %	60 %	20 %	397779199
26	NC_018227	TCGCC	2	10	30299	30308	0 %	20 %	20 %	60 %	397779200
27	NC_018227	ACCAG	2	10	31427	31436	40 %	0 %	20 %	40 %	397779200
28	NC_018227	CGGGT	2	10	33175	33184	0 %	20 %	60 %	20 %	397779202
29	NC_018227	CGGGG	2	10	33892	33901	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018227	TTCCG	2	10	34409	34418	0 %	40 %	20 %	40 %	397779203
31	NC_018227	AGGTG	2	10	34862	34871	20 %	20 %	60 %	0 %	397779203
32	NC_018227	GATAG	2	10	41606	41615	40 %	20 %	40 %	0 %	397779210
33	NC_018227	GACGT	2	10	43454	43463	20 %	20 %	40 %	20 %	397779211
34	NC_018227	CCGGG	2	10	45959	45968	0 %	0 %	60 %	40 %	397779212
35	NC_018227	TCTGG	2	10	46262	46271	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018227	CGGGG	2	10	51032	51041	0 %	0 %	80 %	20 %	397779220
37	NC_018227	TGCCT	2	10	51765	51774	0 %	40 %	20 %	40 %	397779220
38	NC_018227	GGGCG	2	10	52555	52564	0 %	0 %	80 %	20 %	397779221
39	NC_018227	CGGGG	2	10	52898	52907	0 %	0 %	80 %	20 %	397779221
40	NC_018227	TGCAC	2	10	57014	57023	20 %	20 %	20 %	40 %	397779226
41	NC_018227	CGAGG	2	10	58935	58944	20 %	0 %	60 %	20 %	397779228
42	NC_018227	GGTCA	2	10	59005	59014	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018227	CCGGG	2	10	60858	60867	0 %	0 %	60 %	40 %	397779231
44	NC_018227	GATCA	2	10	63188	63197	40 %	20 %	20 %	20 %	397779233
45	NC_018227	AGGGG	2	10	64492	64501	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018227	AGGGG	2	10	64792	64801	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018227	CGGTC	2	10	65348	65357	0 %	20 %	40 %	40 %	397779235
48	NC_018227	GTCCG	2	10	65376	65385	0 %	20 %	40 %	40 %	397779235
49	NC_018227	AGGTG	2	10	65537	65546	20 %	20 %	60 %	0 %	397779235
50	NC_018227	CGGTT	2	10	65565	65574	0 %	40 %	40 %	20 %	397779235
51	NC_018227	GGTGA	2	10	67759	67768	20 %	20 %	60 %	0 %	397779238
52	NC_018227	CGGAG	2	10	68052	68061	20 %	0 %	60 %	20 %	397779238
53	NC_018227	ATCGA	2	10	69368	69377	40 %	20 %	20 %	20 %	397779240
54	NC_018227	CGGCT	2	10	70072	70081	0 %	20 %	40 %	40 %	397779241
55	NC_018227	ATATC	2	10	70593	70602	40 %	40 %	0 %	20 %	397779242
56	NC_018227	CCGCT	2	10	71186	71195	0 %	20 %	20 %	60 %	397779243
57	NC_018227	GGGGT	2	10	74244	74253	0 %	20 %	80 %	0 %	397779246
58	NC_018227	CCCGG	2	10	75099	75108	0 %	0 %	40 %	60 %	397779247
59	NC_018227	CCGTC	2	10	76138	76147	0 %	20 %	20 %	60 %	397779247
60	NC_018227	CCCGT	2	10	76862	76871	0 %	20 %	20 %	60 %	397779247
61	NC_018227	CCGGG	2	10	79234	79243	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_018227	CCGGT	2	10	79696	79705	0 %	20 %	40 %	40 %	397779248
63	NC_018227	GGTGG	2	10	79943	79952	0 %	20 %	80 %	0 %	397779249
64	NC_018227	GGGAC	2	10	81018	81027	20 %	0 %	60 %	20 %	397779250
65	NC_018227	GGCCA	2	10	81523	81532	20 %	0 %	40 %	40 %	397779250
66	NC_018227	TAATG	2	10	82980	82989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018227	CCCCT	2	10	85537	85546	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
68	NC_018227	GCCGG	2	10	87825	87834	0 %	0 %	60 %	40 %	397779258
69	NC_018227	GGCGA	2	10	88404	88413	20 %	0 %	60 %	20 %	397779258
70	NC_018227	CGAGA	2	10	90767	90776	40 %	0 %	40 %	20 %	397779260
71	NC_018227	GCGGT	2	10	91815	91824	0 %	20 %	60 %	20 %	397779262
72	NC_018227	GCCGG	2	10	92013	92022	0 %	0 %	60 %	40 %	397779262
73	NC_018227	CGCTC	2	10	93350	93359	0 %	20 %	20 %	60 %	397779265
74	NC_018227	ATCGC	2	10	95559	95568	20 %	20 %	20 %	40 %	397779268
75	NC_018227	CGTCC	2	10	95882	95891	0 %	20 %	20 %	60 %	397779268
76	NC_018227	TCCGC	2	10	96780	96789	0 %	20 %	20 %	60 %	397779269
77	NC_018227	CCCGG	2	10	97060	97069	0 %	0 %	40 %	60 %	397779269
78	NC_018227	CCGGT	2	10	97322	97331	0 %	20 %	40 %	40 %	397779269
79	NC_018227	GGGGA	2	10	99668	99677	20 %	0 %	80 %	0 %	397779271
80	NC_018227	TGGGG	2	10	100368	100377	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018227	GGGCA	2	10	101778	101787	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018227	TCCTT	2	10	105977	105986	0 %	60 %	0 %	40 %	397779280
83	NC_018227	AGGGG	2	10	106699	106708	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018227	TCCCC	2	10	107898	107907	0 %	20 %	0 %	80 %	397779282
85	NC_018227	GTGCC	2	10	108127	108136	0 %	20 %	40 %	40 %	397779282
86	NC_018227	GCCCG	2	10	108695	108704	0 %	0 %	40 %	60 %	397779282
87	NC_018227	GGGCG	2	10	110170	110179	0 %	0 %	80 %	20 %	397779284
88	NC_018227	GTTCC	2	10	111200	111209	0 %	40 %	20 %	40 %	397779285
89	NC_018227	CGCGT	2	10	113926	113935	0 %	20 %	40 %	40 %	397779288
90	NC_018227	GGGGC	2	10	116905	116914	0 %	0 %	80 %	20 %	397779292
91	NC_018227	TCCTC	2	10	119974	119983	0 %	40 %	0 %	60 %	397779295
92	NC_018227	CGAAG	2	10	122209	122218	40 %	0 %	40 %	20 %	397779296
93	NC_018227	CCCCT	2	10	122913	122922	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
94	NC_018227	CGTCC	2	10	125964	125973	0 %	20 %	20 %	60 %	397779302
95	NC_018227	GCGGA	2	10	128340	128349	20 %	0 %	60 %	20 %	397779305
96	NC_018227	GCATC	2	10	129365	129374	20 %	20 %	20 %	40 %	397779306
97	NC_018227	CCCGT	2	10	129984	129993	0 %	20 %	20 %	60 %	397779307
98	NC_018227	TCCGG	2	10	130089	130098	0 %	20 %	40 %	40 %	397779307
99	NC_018227	CCCTC	2	10	130507	130516	0 %	20 %	0 %	80 %	397779307
100	NC_018227	GGGTG	2	10	131157	131166	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018227	AGGGG	2	10	131200	131209	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018227	TTCGC	2	10	131244	131253	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_018227	GCTCC	2	10	131324	131333	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_018227	TCGCT	2	10	131370	131379	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_018227	CTTCG	2	10	132325	132334	0 %	40 %	20 %	40 %	397779309
106	NC_018227	ACTCG	2	10	134941	134950	20 %	20 %	20 %	40 %	397779312
107	NC_018227	GGGCC	2	10	136308	136317	0 %	0 %	60 %	40 %	397779314
108	NC_018227	TGATC	2	10	136686	136695	20 %	40 %	20 %	20 %	397779314
109	NC_018227	GACTA	2	10	137698	137707	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018227	GATAT	2	10	142035	142044	40 %	40 %	20 %	0 %	397779320
111	NC_018227	TGAGC	2	10	142831	142840	20 %	20 %	40 %	20 %	397779321
112	NC_018227	TGATC	2	10	144681	144690	20 %	40 %	20 %	20 %	397779321
113	NC_018227	ATCCC	2	10	148621	148630	20 %	20 %	0 %	60 %	397779325
114	NC_018227	CTCGC	2	10	148693	148702	0 %	20 %	20 %	60 %	397779325
115	NC_018227	GCATC	2	10	148803	148812	20 %	20 %	20 %	40 %	397779325
116	NC_018227	CCGCT	2	10	149513	149522	0 %	20 %	20 %	60 %	397779326
117	NC_018227	GAAGC	2	10	151077	151086	40 %	0 %	40 %	20 %	397779327
118	NC_018227	GCGGA	2	10	152042	152051	20 %	0 %	60 %	20 %	397779328
119	NC_018227	GGTCG	2	10	152472	152481	0 %	20 %	60 %	20 %	397779328
120	NC_018227	AACCG	2	10	152690	152699	40 %	0 %	20 %	40 %	397779328
121	NC_018227	CCCTC	2	10	153906	153915	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
122	NC_018227	TTCTG	2	10	157189	157198	0 %	60 %	20 %	20 %	397779332
123	NC_018227	GAAGA	2	10	158762	158771	60 %	0 %	40 %	0 %	397779334
124	NC_018227	GGGAG	2	10	166338	166347	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018227	CACCC	2	10	171935	171944	20 %	0 %	0 %	80 %	397779346
126	NC_018227	TTCCC	2	10	172523	172532	0 %	40 %	0 %	60 %	397779347
127	NC_018227	TTCGG	2	10	173639	173648	0 %	40 %	40 %	20 %	397779347
128	NC_018227	GATGA	2	10	173866	173875	40 %	20 %	40 %	0 %	397779347
129	NC_018227	TGACC	2	10	174631	174640	20 %	20 %	20 %	40 %	397779348
130	NC_018227	CCCGA	2	10	174914	174923	20 %	0 %	20 %	60 %	397779348
131	NC_018227	GCCGG	2	10	176005	176014	0 %	0 %	60 %	40 %	397779348
132	NC_018227	GGACC	2	10	176230	176239	20 %	0 %	40 %	40 %	397779348
133	NC_018227	GTGAG	2	10	176963	176972	20 %	20 %	60 %	0 %	397779349
134	NC_018227	GCCGC	2	10	176986	176995	0 %	0 %	40 %	60 %	397779349
135	NC_018227	AAGGC	2	10	177856	177865	40 %	0 %	40 %	20 %	397779350
136	NC_018227	AAGAT	2	10	178862	178871	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018227	CCCCT	2	10	179000	179009	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
138	NC_018227	TTCCG	2	10	181213	181222	0 %	40 %	20 %	40 %	397779354
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