MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 109764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018143	TGC	2	6	63610	63615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671839
1502	NC_018143	GCC	2	6	63636	63641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671839
1503	NC_018143	TCG	2	6	63663	63668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671839
1504	NC_018143	GAC	2	6	63710	63715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671839
1505	NC_018143	GCC	2	6	63729	63734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671839
1506	NC_018143	GCC	2	6	63737	63742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671839
1507	NC_018143	GT	3	6	63788	63793	0 %	50 %	50 %	0 %	397671839
1508	NC_018143	TCA	2	6	63864	63869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671839
1509	NC_018143	TAC	2	6	63881	63886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671839
1510	NC_018143	AAGG	2	8	63888	63895	50 %	0 %	50 %	0 %	397671839
1511	NC_018143	AGG	3	9	63893	63901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_018143	CCT	2	6	63929	63934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397671840
1513	NC_018143	CGC	2	6	64014	64019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671840
1514	NC_018143	TCG	3	9	64087	64095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671840
1515	NC_018143	CAT	2	6	64124	64129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671840
1516	NC_018143	CCA	2	6	64138	64143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671840
1517	NC_018143	CAG	2	6	64314	64319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671840
1518	NC_018143	C	6	6	64346	64351	0 %	0 %	0 %	100 %	397671840
1519	NC_018143	GC	3	6	64406	64411	0 %	0 %	50 %	50 %	397671840
1520	NC_018143	GCG	2	6	64430	64435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671840
1521	NC_018143	CAG	2	6	64443	64448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671840
1522	NC_018143	CGC	2	6	64449	64454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671840
1523	NC_018143	CCGATC	2	12	64531	64542	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397671840
1524	NC_018143	AACC	2	8	64665	64672	50 %	0 %	0 %	50 %	397671840
1525	NC_018143	ACT	2	6	64683	64688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671840
1526	NC_018143	GCT	2	6	64808	64813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671840
1527	NC_018143	CGA	2	6	64916	64921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671840
1528	NC_018143	TCG	2	6	64976	64981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_018143	GCT	2	6	65023	65028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671841
1530	NC_018143	CGGA	2	8	65029	65036	25 %	0 %	50 %	25 %	397671841
1531	NC_018143	ACC	2	6	65051	65056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671841
1532	NC_018143	GGC	2	6	65061	65066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671841
1533	NC_018143	CCG	2	6	65085	65090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671841
1534	NC_018143	ACTTCA	2	12	65335	65346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671841
1535	NC_018143	CGG	2	6	65377	65382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_018143	TGCCG	2	10	65478	65487	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1537	NC_018143	GCC	2	6	65530	65535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_018143	GTC	2	6	65628	65633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671842
1539	NC_018143	ATT	2	6	65661	65666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397671842
1540	NC_018143	TCA	2	6	65681	65686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671842
1541	NC_018143	CG	3	6	65701	65706	0 %	0 %	50 %	50 %	397671842
1542	NC_018143	CCT	2	6	65719	65724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397671842
1543	NC_018143	CGG	2	6	65853	65858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671842
1544	NC_018143	CGC	2	6	65866	65871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671842
1545	NC_018143	GC	3	6	65870	65875	0 %	0 %	50 %	50 %	397671842
1546	NC_018143	CCG	2	6	65885	65890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671842
1547	NC_018143	CCG	2	6	65951	65956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671842
1548	NC_018143	CGG	2	6	65965	65970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671842
1549	NC_018143	GCG	2	6	65993	65998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671842
1550	NC_018143	GGC	2	6	66001	66006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671842
1551	NC_018143	CGA	2	6	66144	66149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671842
1552	NC_018143	TCG	2	6	66153	66158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671842
1553	NC_018143	GCTG	2	8	66294	66301	0 %	25 %	50 %	25 %	397671842
1554	NC_018143	GCC	2	6	66317	66322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671842
1555	NC_018143	CG	5	10	66347	66356	0 %	0 %	50 %	50 %	397671842
1556	NC_018143	ACC	2	6	66386	66391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671842
1557	NC_018143	GGCGA	2	10	66410	66419	20 %	0 %	60 %	20 %	397671842
1558	NC_018143	CAC	2	6	66541	66546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671842
1559	NC_018143	GC	3	6	66558	66563	0 %	0 %	50 %	50 %	397671842
1560	NC_018143	CGGA	2	8	66603	66610	25 %	0 %	50 %	25 %	397671842
1561	NC_018143	CGTCGG	2	12	66733	66744	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_018143	GGT	2	6	66818	66823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_018143	TGC	2	6	66856	66861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_018143	GCC	2	6	66959	66964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671843
1565	NC_018143	GCC	2	6	66974	66979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671843
1566	NC_018143	CTGG	2	8	67026	67033	0 %	25 %	50 %	25 %	397671843
1567	NC_018143	TTC	2	6	67042	67047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397671843
1568	NC_018143	GAC	2	6	67076	67081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671843
1569	NC_018143	CGG	2	6	67140	67145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671843
1570	NC_018143	AAC	2	6	67205	67210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671843
1571	NC_018143	ACG	2	6	67314	67319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671843
1572	NC_018143	CCA	2	6	67320	67325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671843
1573	NC_018143	CGGG	2	8	67327	67334	0 %	0 %	75 %	25 %	397671843
1574	NC_018143	CGCC	2	8	67344	67351	0 %	0 %	25 %	75 %	397671843
1575	NC_018143	CGGC	2	8	67386	67393	0 %	0 %	50 %	50 %	397671843
1576	NC_018143	CGGT	2	8	67422	67429	0 %	25 %	50 %	25 %	397671843
1577	NC_018143	GCG	2	6	67449	67454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671843
1578	NC_018143	CGTCGG	2	12	67503	67514	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397671843
1579	NC_018143	TGC	2	6	67518	67523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671843
1580	NC_018143	ACC	2	6	67557	67562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671843
1581	NC_018143	GCGGTG	2	12	67584	67595	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	397671843
1582	NC_018143	CGT	2	6	67657	67662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671843
1583	NC_018143	CCG	2	6	67728	67733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671843
1584	NC_018143	CCGG	2	8	67808	67815	0 %	0 %	50 %	50 %	397671843
1585	NC_018143	GGC	2	6	67820	67825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671843
1586	NC_018143	GGC	2	6	67831	67836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671843
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1588	NC_018143	CGC	2	6	67941	67946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671843
1589	NC_018143	CGG	2	6	67957	67962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671843
1590	NC_018143	ACG	2	6	67976	67981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671843
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1592	NC_018143	GC	3	6	68076	68081	0 %	0 %	50 %	50 %	397671843
1593	NC_018143	GGC	2	6	68228	68233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671843
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1595	NC_018143	AGC	2	6	68358	68363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671843
1596	NC_018143	CTG	2	6	68463	68468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_018143	CTG	2	6	68482	68487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_018143	GCC	3	9	68506	68514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_018143	GCC	2	6	68529	68534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_018143	TCG	2	6	68582	68587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_018143	AGG	2	6	68606	68611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_018143	CTG	2	6	68668	68673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671844
1603	NC_018143	GGCA	2	8	68679	68686	25 %	0 %	50 %	25 %	397671844
1604	NC_018143	TGC	2	6	68702	68707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671844
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1606	NC_018143	TGG	2	6	68831	68836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671844
1607	NC_018143	TGCT	2	8	68846	68853	0 %	50 %	25 %	25 %	397671844
1608	NC_018143	CTG	2	6	68860	68865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671844
1609	NC_018143	TCGC	2	8	68871	68878	0 %	25 %	25 %	50 %	397671844
1610	NC_018143	CGA	2	6	68895	68900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671844
1611	NC_018143	GCCG	2	8	68945	68952	0 %	0 %	50 %	50 %	397671844
1612	NC_018143	GGTGT	2	10	68986	68995	0 %	40 %	60 %	0 %	397671844
1613	NC_018143	TTCG	2	8	69009	69016	0 %	50 %	25 %	25 %	397671844
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1615	NC_018143	CGGT	2	8	69121	69128	0 %	25 %	50 %	25 %	397671844
1616	NC_018143	CGG	2	6	69195	69200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671844
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1619	NC_018143	TGG	2	6	69404	69409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671844
1620	NC_018143	TG	3	6	69422	69427	0 %	50 %	50 %	0 %	397671844
1621	NC_018143	GCC	2	6	69481	69486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671844
1622	NC_018143	CTG	2	6	69490	69495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671844
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1624	NC_018143	CGC	2	6	69564	69569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671844
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