MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 109764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018143	GAG	2	6	228223	228228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397671981
5502	NC_018143	GC	3	6	228271	228276	0 %	0 %	50 %	50 %	397671981
5503	NC_018143	CGG	2	6	228291	228296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671981
5504	NC_018143	CAACGC	2	12	228298	228309	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	397671981
5505	NC_018143	GTT	2	6	228345	228350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671981
5506	NC_018143	GAC	2	6	228358	228363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5507	NC_018143	AGG	2	6	228404	228409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397671981
5508	NC_018143	TGC	2	6	228410	228415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5509	NC_018143	CGC	2	6	228454	228459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671981
5510	NC_018143	CGA	2	6	228531	228536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5511	NC_018143	GT	3	6	228625	228630	0 %	50 %	50 %	0 %	397671981
5512	NC_018143	GCA	2	6	228663	228668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5513	NC_018143	CACC	2	8	228700	228707	25 %	0 %	0 %	75 %	397671981
5514	NC_018143	CGC	2	6	228724	228729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671981
5515	NC_018143	CTG	2	6	228730	228735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5516	NC_018143	CTG	2	6	228766	228771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5517	NC_018143	TGG	2	6	228773	228778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671981
5518	NC_018143	CTG	2	6	228799	228804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5519	NC_018143	CGC	2	6	228844	228849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671981
5520	NC_018143	TGG	2	6	228868	228873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671981
5521	NC_018143	CGT	2	6	228981	228986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5522	NC_018143	GCCTGG	2	12	229004	229015	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397671981
5523	NC_018143	GAC	2	6	229027	229032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671981
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5525	NC_018143	GTG	2	6	229123	229128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671981
5526	NC_018143	TGG	2	6	229145	229150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671981
5527	NC_018143	GCT	2	6	229152	229157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671981
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5530	NC_018143	CGG	2	6	229307	229312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671981
5531	NC_018143	GAC	2	6	229378	229383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5532	NC_018143	GCT	2	6	229413	229418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5533	NC_018143	TAC	2	6	229426	229431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671981
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5535	NC_018143	TCGG	2	8	229513	229520	0 %	25 %	50 %	25 %	397671981
5536	NC_018143	TGT	2	6	229553	229558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671981
5537	NC_018143	CGA	2	6	229590	229595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671981
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5540	NC_018143	GCT	2	6	229635	229640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5541	NC_018143	CGT	2	6	229655	229660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5542	NC_018143	CGG	2	6	229664	229669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671981
5543	NC_018143	GTG	2	6	229691	229696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671981
5544	NC_018143	CCGG	2	8	229774	229781	0 %	0 %	50 %	50 %	397671981
5545	NC_018143	GGT	2	6	229788	229793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671981
5546	NC_018143	TCG	2	6	229796	229801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5547	NC_018143	TGG	2	6	229838	229843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671981
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5552	NC_018143	GTG	2	6	230224	230229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671981
5553	NC_018143	CACCCT	2	12	230238	230249	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	397671981
5554	NC_018143	GAC	2	6	230262	230267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5555	NC_018143	GCT	2	6	230371	230376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671981
5556	NC_018143	GGC	2	6	230400	230405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671981
5557	NC_018143	AACT	2	8	230623	230630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5558	NC_018143	TGT	2	6	230763	230768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_018143	GGAA	2	8	230798	230805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_018143	CAC	2	6	230806	230811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_018143	G	6	6	230813	230818	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_018143	GAG	2	6	230864	230869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_018143	TCC	2	6	230874	230879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_018143	GGT	2	6	230926	230931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671982
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5584	NC_018143	GGCCG	2	10	231560	231569	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5585	NC_018143	GTG	2	6	231581	231586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_018143	ACAT	2	8	231617	231624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5587	NC_018143	GCG	2	6	231639	231644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5594	NC_018143	GCT	2	6	231869	231874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671983
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5598	NC_018143	CG	3	6	232001	232006	0 %	0 %	50 %	50 %	397671983
5599	NC_018143	GCG	2	6	232011	232016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671983
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5622	NC_018143	CGT	2	6	232828	232833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671984
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5986	NC_018143	CCA	3	9	247641	247649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671994
5987	NC_018143	GCG	2	6	247652	247657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671994
5988	NC_018143	TCG	2	6	247676	247681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671994
5989	NC_018143	CCAC	2	8	247770	247777	25 %	0 %	0 %	75 %	397671994
5990	NC_018143	ACC	2	6	247784	247789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671994
5991	NC_018143	CGGC	2	8	247853	247860	0 %	0 %	50 %	50 %	397671994
5992	NC_018143	CAG	2	6	247882	247887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671994
5993	NC_018143	CGGC	2	8	247930	247937	0 %	0 %	50 %	50 %	397671994
5994	NC_018143	TCA	3	9	248109	248117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671994
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5998	NC_018143	GCA	2	6	248237	248242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671995
5999	NC_018143	GCCG	2	8	248286	248293	0 %	0 %	50 %	50 %	397671995
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