MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 109593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_018078	CGA	2	6	166040	166045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430550
4003	NC_018078	TCG	2	6	166150	166155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430551
4004	NC_018078	GC	3	6	166162	166167	0 %	0 %	50 %	50 %	392430551
4005	NC_018078	CG	3	6	166185	166190	0 %	0 %	50 %	50 %	392430551
4006	NC_018078	CGA	2	6	166223	166228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430551
4007	NC_018078	CGA	2	6	166298	166303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430551
4008	NC_018078	CTA	2	6	166307	166312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430551
4009	NC_018078	TG	3	6	166314	166319	0 %	50 %	50 %	0 %	392430551
4010	NC_018078	TCCC	2	8	166346	166353	0 %	25 %	0 %	75 %	392430551
4011	NC_018078	CAG	2	6	166436	166441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430551
4012	NC_018078	GTC	2	6	166456	166461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430551
4013	NC_018078	GAA	2	6	166482	166487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430551
4014	NC_018078	GGC	2	6	166535	166540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430551
4015	NC_018078	TGC	2	6	166552	166557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430551
4016	NC_018078	ACG	2	6	166567	166572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430551
4017	NC_018078	CCG	2	6	166582	166587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430551
4018	NC_018078	TG	4	8	166594	166601	0 %	50 %	50 %	0 %	392430551
4019	NC_018078	CGG	3	9	166613	166621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430551
4020	NC_018078	GGTG	2	8	166712	166719	0 %	25 %	75 %	0 %	392430551
4021	NC_018078	CGA	2	6	166721	166726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430551
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4028	NC_018078	CGGTGC	2	12	166870	166881	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392430551
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4030	NC_018078	GTTGG	2	10	167009	167018	0 %	40 %	60 %	0 %	392430551
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4035	NC_018078	AT	3	6	167321	167326	50 %	50 %	0 %	0 %	392430552
4036	NC_018078	TCG	2	6	167437	167442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430552
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4039	NC_018078	GCG	2	6	167484	167489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430552
4040	NC_018078	GAT	2	6	167608	167613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430553
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4050	NC_018078	TGC	2	6	168115	168120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430554
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4052	NC_018078	CGC	2	6	168164	168169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430554
4053	NC_018078	GCGTG	2	10	168175	168184	0 %	20 %	60 %	20 %	392430554
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4064	NC_018078	GTG	2	6	168543	168548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430554
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4069	NC_018078	GACGCC	2	12	168681	168692	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392430554
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4073	NC_018078	CGA	2	6	168755	168760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430554
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4093	NC_018078	CAG	2	6	169479	169484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430555
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4104	NC_018078	GCCG	2	8	169899	169906	0 %	0 %	50 %	50 %	392430555
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4108	NC_018078	TCG	2	6	170038	170043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430555
4109	NC_018078	CCGCC	2	10	170099	170108	0 %	0 %	20 %	80 %	392430555
4110	NC_018078	CGT	2	6	170109	170114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430555
4111	NC_018078	CG	3	6	170137	170142	0 %	0 %	50 %	50 %	392430555
4112	NC_018078	GCC	2	6	170163	170168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430555
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4117	NC_018078	CAG	2	6	170471	170476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_018078	CCG	2	6	170512	170517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_018078	GCG	2	6	170522	170527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4121	NC_018078	TCG	2	6	170586	170591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430556
4122	NC_018078	GGTA	2	8	170707	170714	25 %	25 %	50 %	0 %	392430556
4123	NC_018078	GTG	2	6	170725	170730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430556
4124	NC_018078	CGG	2	6	170787	170792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430556
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4140	NC_018078	ACTT	2	8	171449	171456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4141	NC_018078	GCATG	2	10	171462	171471	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4173	NC_018078	TA	3	6	173101	173106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4174	NC_018078	AT	3	6	173112	173117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4213	NC_018078	GAG	2	6	174760	174765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4238	NC_018078	CGG	2	6	175714	175719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430562
4239	NC_018078	GTT	2	6	175724	175729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430562
4240	NC_018078	GCC	2	6	175742	175747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430562
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4242	NC_018078	CGC	2	6	175803	175808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430562
4243	NC_018078	CGG	2	6	175830	175835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430562
4244	NC_018078	GTG	2	6	175838	175843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430562
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4272	NC_018078	CAG	2	6	177362	177367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4343	NC_018078	TAG	2	6	179990	179995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430565
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4345	NC_018078	CGT	2	6	180113	180118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430565
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4347	NC_018078	TTCAT	2	10	180238	180247	20 %	60 %	0 %	20 %	392430565
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4349	NC_018078	GGT	2	6	180375	180380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430565
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4485	NC_018078	ACC	2	6	185319	185324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430571
4486	NC_018078	GTG	2	6	185370	185375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430571
4487	NC_018078	CGC	2	6	185387	185392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430571
4488	NC_018078	ATC	2	6	185394	185399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430571
4489	NC_018078	TCG	2	6	185425	185430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430571
4490	NC_018078	ATC	2	6	185451	185456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430571
4491	NC_018078	GGC	2	6	185461	185466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430571
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4493	NC_018078	TGC	2	6	185506	185511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430571
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4500	NC_018078	CGG	3	9	185707	185715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430571

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