MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 109593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018078	CGC	2	6	147836	147841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430531
3502	NC_018078	GCG	2	6	147862	147867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430531
3503	NC_018078	TCC	2	6	147908	147913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_018078	GTG	2	6	147935	147940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_018078	CAG	2	6	147946	147951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_018078	GTA	2	6	147955	147960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_018078	GCC	2	6	147980	147985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_018078	GGGTC	2	10	147994	148003	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3509	NC_018078	AGT	2	6	148009	148014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_018078	CGT	2	6	148028	148033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_018078	GC	3	6	148124	148129	0 %	0 %	50 %	50 %	392430532
3512	NC_018078	GCG	2	6	148142	148147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430532
3513	NC_018078	CAC	2	6	148199	148204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430532
3514	NC_018078	ATC	2	6	148216	148221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430532
3515	NC_018078	CGA	2	6	148233	148238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430532
3516	NC_018078	CGT	2	6	148291	148296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430532
3517	NC_018078	CGG	2	6	148314	148319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430532
3518	NC_018078	TGG	2	6	148413	148418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430532
3519	NC_018078	GCC	2	6	148495	148500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_018078	GCGT	2	8	148574	148581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3521	NC_018078	GGT	2	6	148594	148599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_018078	GC	3	6	148609	148614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_018078	GCC	2	6	148640	148645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430533
3524	NC_018078	GAC	2	6	148714	148719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430533
3525	NC_018078	GGGTCA	2	12	148773	148784	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392430533
3526	NC_018078	TCG	2	6	148824	148829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430533
3527	NC_018078	TAC	2	6	148880	148885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430533
3528	NC_018078	GTC	2	6	148919	148924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430533
3529	NC_018078	CGA	2	6	148936	148941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430533
3530	NC_018078	ATC	2	6	148952	148957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430533
3531	NC_018078	GAA	2	6	148992	148997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430534
3532	NC_018078	CCG	2	6	149009	149014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430534
3533	NC_018078	CGA	2	6	149028	149033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430534
3534	NC_018078	CAAG	2	8	149058	149065	50 %	0 %	25 %	25 %	392430534
3535	NC_018078	AGG	2	6	149066	149071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430534
3536	NC_018078	GC	3	6	149140	149145	0 %	0 %	50 %	50 %	392430534
3537	NC_018078	GGC	2	6	149170	149175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430534
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3539	NC_018078	GGT	2	6	149217	149222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430534
3540	NC_018078	GC	3	6	149260	149265	0 %	0 %	50 %	50 %	392430534
3541	NC_018078	GCT	2	6	149289	149294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430534
3542	NC_018078	CGA	2	6	149307	149312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430534
3543	NC_018078	GCC	2	6	149366	149371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_018078	GGT	2	6	149469	149474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_018078	CTCGGT	2	12	149505	149516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_018078	GTC	2	6	149605	149610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_018078	GGT	2	6	149631	149636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430535
3548	NC_018078	GCGG	2	8	149640	149647	0 %	0 %	75 %	25 %	392430535
3549	NC_018078	GT	3	6	149657	149662	0 %	50 %	50 %	0 %	392430535
3550	NC_018078	TGG	2	6	149695	149700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430535
3551	NC_018078	ATCGG	2	10	149724	149733	20 %	20 %	40 %	20 %	392430535
3552	NC_018078	GCC	2	6	149751	149756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430535
3553	NC_018078	ACC	2	6	149769	149774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430535
3554	NC_018078	CGG	2	6	149806	149811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430535
3555	NC_018078	GGC	3	9	149867	149875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430535
3556	NC_018078	TCA	2	6	149879	149884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430535
3557	NC_018078	GCC	2	6	149928	149933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430535
3558	NC_018078	AGC	3	9	149947	149955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430535
3559	NC_018078	CCCA	2	8	149976	149983	25 %	0 %	0 %	75 %	392430535
3560	NC_018078	GCT	2	6	149987	149992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430535
3561	NC_018078	CGG	2	6	150047	150052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430535
3562	NC_018078	G	6	6	150057	150062	0 %	0 %	100 %	0 %	392430535
3563	NC_018078	GGC	2	6	150078	150083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430535
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3605	NC_018078	GCGG	2	8	150784	150791	0 %	0 %	75 %	25 %	392430536
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3623	NC_018078	GGC	2	6	151135	151140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430536
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3658	NC_018078	ACC	2	6	152541	152546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3659	NC_018078	GCCG	2	8	152548	152555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3660	NC_018078	ATTGG	2	10	152560	152569	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3738	NC_018078	CGCC	2	8	155837	155844	0 %	0 %	25 %	75 %	392430539
3739	NC_018078	CCGG	2	8	155861	155868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3740	NC_018078	GCGT	3	12	155889	155900	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3741	NC_018078	GA	3	6	155933	155938	50 %	0 %	50 %	0 %	392430540
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3987	NC_018078	CGC	3	9	165653	165661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430550
3988	NC_018078	CG	3	6	165664	165669	0 %	0 %	50 %	50 %	392430550
3989	NC_018078	GCA	2	6	165686	165691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430550
3990	NC_018078	CGG	2	6	165724	165729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430550
3991	NC_018078	CAT	2	6	165731	165736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430550
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